More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0949 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_0949  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 		 292 aa  570  1e-161  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.634879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3502  LysR family transcriptional regulator  50 
 
 		 310 aa  248  8e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3381  transcriptional regulator, LysR family  50.34 
 
 		 296 aa  226  4e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0639  LysR family transcriptional regulator  49.13 
 
 		 296 aa  224  1e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.87643  normal  0.130782 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1350  transcriptional regulator, LysR family  45.61 
 
 		 303 aa  224  1e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3271  LysR family transcriptional regulator  44.75 
 
 		 298 aa  213  3.9999999999999995e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0045725 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01219  putative LysR-family transcriptional regulator  39.31 
 
 		 302 aa  200  1.9999999999999998e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2825  LysR family transcriptional regulator  36.39 
 
 		 297 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0726357  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1156  transcriptional regulator, LysR family  36.77 
 
 		 308 aa  140  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3536  transcriptional regulator, LysR family  37.89 
 
 		 318 aa  133  3e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.246229  normal  0.724782 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1578  transcriptional regulator, LysR family  32.65 
 
 		 298 aa  122  6e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.492151  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3361  transcriptional regulator, LysR family  35.71 
 
 		 298 aa  120  3e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0107379  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1832  LysR family transcriptional regulator  33.21 
 
 		 298 aa  120  3e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2423  LysR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 316 aa  115  8.999999999999998e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.537567  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2747  transcriptional regulator, LysR family  27.4 
 
 		 305 aa  88.6  1e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.437645  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5716  transcriptional regulator LysR family  28.37 
 
 		 299 aa  84  0.000000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0340323  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5907  transcriptional regulator LysR family  29.62 
 
 		 305 aa  81.6  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3787  transcriptional regulator, LysR family  27.61 
 
 		 300 aa  80.1  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3526  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  27.55 
 
 		 301 aa  79.3  0.00000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.33739  normal  0.82105 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4434  LysR family transcriptional regulator  25.96 
 
 		 301 aa  75.1  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.774237  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0310  transcriptional regulator, LysR family  40 
 
 		 287 aa  73.6  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.76271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2171  LysR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 304 aa  73.9  0.000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1256  LysR family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 310 aa  73.2  0.000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.196796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1251  LysR family transcriptional regulator  27.24 
 
 		 300 aa  72.8  0.000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.255094 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2450  LysR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 305 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2961  LysR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 292 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0923221 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0758  LysR family transcriptional regulator  42.05 
 
 		 301 aa  70.5  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.733983  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2080  transcriptional regulator, LysR family  34.91 
 
 		 295 aa  70.5  0.00000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2861  LysR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 306 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.147603  normal  0.198863 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2711  LysR family transcriptional regulator  27.38 
 
 		 292 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0049  LysR family transcriptional regulator  26.28 
 
 		 295 aa  70.5  0.00000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4317  transcriptional regulator, LysR family  31.16 
 
 		 293 aa  70.1  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.257312  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2369  transcriptional regulator, LysR family  30.28 
 
 		 308 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3613  LysR family transcriptional regulator  29.28 
 
 		 297 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.435791  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1115  transcriptional regulator, LysR family  27.75 
 
 		 301 aa  69.7  0.00000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4116  transcriptional regulator, LysR family  25.75 
 
 		 300 aa  69.7  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1048  LysR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 310 aa  70.1  0.00000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.540636  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0095  chromosome replication initiation inhibitor protein  28.79 
 
 		 304 aa  69.7  0.00000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.720683 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0714  LysR family transcriptional regulator  23.02 
 
 		 298 aa  69.3  0.00000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0727  LysR family transcriptional regulator  23.02 
 
 		 298 aa  69.3  0.00000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1879  transcriptional regulator, LysR family  25.17 
 
 		 283 aa  69.3  0.00000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0397318  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6304  LysR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 306 aa  68.9  0.00000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0631  LysR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 296 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1096  transcriptional regulator, LysR family  27.14 
 
 		 297 aa  68.6  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.000448558  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2063  transcriptional regulator, LysR family  30.37 
 
 		 295 aa  68.2  0.0000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.656887 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6041  LysR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 308 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0756462  hitchhiker  0.00133745 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3612  transcriptional regulator, LysR family  32.56 
 
 		 296 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5763  LysR family transcriptional regulator  38.74 
 
 		 316 aa  68.6  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1122  LysR family transcriptional regulator  38.74 
 
 		 311 aa  68.2  0.0000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2377  LysR family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 298 aa  68.2  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.120288  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5630  LysR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 302 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0341867 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5847  LysR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 302 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.632072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3358  LysR family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 293 aa  68.2  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47270  LysR family transcriptional regulator  25.61 
 
 		 303 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0029  LysR family transcriptional regulator  54.22 
 
 		 305 aa  67.8  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3572  LysR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 312 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.439946  hitchhiker  0.00313021 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0406  LysR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 305 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4227  LysR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 345 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1345  transcriptional regulator, LysR family  26.8 
 
 		 300 aa  68.2  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0839604  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2381  LysR family transcriptional regulator  27.76 
 
 		 308 aa  67.8  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.128975  normal  0.338305 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2946  LysR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 306 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1086  LysR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 310 aa  67.4  0.0000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.404999  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2804  transcriptional regulator, LysR family  28.43 
 
 		 301 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.860406  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1855  transcriptional regulator, LysR family  26.67 
 
 		 308 aa  67  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0944  LysR family transcriptional regulator  25.97 
 
 		 293 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2455  LysR family transcriptional regulator  24.5 
 
 		 295 aa  67  0.0000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.271486  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0785  LysR family transcriptional regulator  28.52 
 
 		 311 aa  67  0.0000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1542  LysR family transcriptional regulator  30 
 
 		 296 aa  67.4  0.0000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.222997  normal  0.870899 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3467  LysR family transcriptional regulator  29.72 
 
 		 308 aa  67  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.39067 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2482  LysR family transcriptional regulator  27.86 
 
 		 303 aa  67.4  0.0000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.134269  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2998  LysR family transcriptional regulator  30.74 
 
 		 306 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.167105  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1937  LysR family transcriptional regulator  25.59 
 
 		 291 aa  67  0.0000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0761  LysR family transcriptional regulator  29 
 
 		 306 aa  66.6  0.0000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4334  LysR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 302 aa  66.6  0.0000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.199355 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3711  LysR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 302 aa  67  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.282395  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4657  LysR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 302 aa  67  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.501857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1997  LysR family transcriptional regulator  23.81 
 
 		 290 aa  67  0.0000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000823864  normal  0.228125 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2879  LysR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 305 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.105069 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3732  transcriptional regulator, LysR family  31.36 
 
 		 300 aa  66.6  0.0000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000560912  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2722  LysR family transcriptional regulator  25.9 
 
 		 304 aa  66.6  0.0000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6471  transcriptional regulator, LysR family  27.46 
 
 		 297 aa  66.6  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3266  LysR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 293 aa  66.6  0.0000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.817799 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1544  LysR family transcriptional regulator  45.57 
 
 		 309 aa  66.6  0.0000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0431  LysR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 327 aa  66.2  0.0000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.919761 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2973  LysR family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 306 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.329734 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0994  transcriptional regulator, LysR family  31.55 
 
 		 327 aa  65.9  0.0000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.414086  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5586  LysR family transcriptional regulator  32.7 
 
 		 333 aa  65.9  0.0000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.861314  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2338  LysR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 306 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.152044  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9253  transcriptional regulator LysR family  27.06 
 
 		 307 aa  65.9  0.0000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.321574  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2952  LysR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 306 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00119284  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1297  LysR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 304 aa  65.9  0.0000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.496743  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02110  trpBA operon transcriptional regulator, LysR family; TrpI  37.5 
 
 		 318 aa  65.9  0.0000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.625987  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0724  LysR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 327 aa  65.9  0.0000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.546759 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5279  LysR family transcriptional regulator  26.94 
 
 		 305 aa  65.9  0.0000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.7008 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0102  LysR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 305 aa  65.5  0.0000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2055  LysR family transcriptional regulator  25.2 
 
 		 302 aa  65.1  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.505103  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6772  transcriptional regulator, LysR family  26.82 
 
 		 296 aa  65.1  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0999  DNA-binding transcriptional activator GcvA  27.61 
 
 		 305 aa  65.1  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000272283  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2590  nitrogen assimilation transcriptional regulator  26.38 
 
 		 307 aa  65.5  0.000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0824  LysR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 309 aa  65.1  0.000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>