More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_0095 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_0095  chromosome replication initiation inhibitor protein  100 
 
 		 304 aa  610  9.999999999999999e-175  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.720683 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0149  chromosome replication initiation inhibitor protein  88.78 
 
 		 304 aa  538  9.999999999999999e-153  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.898117  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0132  chromosome replication initiation inhibitor protein  79.24 
 
 		 305 aa  459  9.999999999999999e-129  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.350257 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0072  chromosome replication initiation inhibitor protein  75.99 
 
 		 303 aa  445  1.0000000000000001e-124  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.608118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0091  chromosome replication initiation inhibitor protein  75.99 
 
 		 303 aa  445  1.0000000000000001e-124  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.730131  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_5010  chromosome replication initiation inhibitor protein  72.79 
 
 		 305 aa  418  1e-116  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.501331  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0399  chromosome replication initiation inhibitor protein  73.26 
 
 		 302 aa  411  1e-114  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0947  chromosome replication initiation inhibitor protein  56.03 
 
 		 311 aa  313  1.9999999999999998e-84  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3518  chromosome replication initiation inhibitor protein  55.36 
 
 		 312 aa  296  2e-79  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3474  chromosome replication initiation inhibitor protein  41.42 
 
 		 316 aa  219  5e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0982  LysR family transcriptional regulator  40.2 
 
 		 300 aa  211  2e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3749  transcriptional regulator, ArgP, LysR family  41.72 
 
 		 303 aa  209  4e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1844  chromosome replication initiation inhibitor protein  38.33 
 
 		 295 aa  209  5e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.225634  normal  0.103464 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2987  chromosome replication initiation inhibitor protein  40.27 
 
 		 299 aa  209  6e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1698  chromosome replication initiation inhibitor protein  38.87 
 
 		 309 aa  207  1e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.52148  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5362  chromosome replication initiation inhibitor protein  40.13 
 
 		 301 aa  207  2e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.217291  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4815  chromosome replication initiation inhibitor protein  40.13 
 
 		 301 aa  206  3e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.173708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5388  chromosome replication initiation inhibitor protein  40.13 
 
 		 301 aa  206  4e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4796  chromosome replication initiation inhibitor protein  40.13 
 
 		 301 aa  206  4e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.43549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5473  chromosome replication initiation inhibitor protein  40.13 
 
 		 301 aa  206  4e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.259043  normal  0.391167 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0180  chromosome replication initiation inhibitor protein  39.8 
 
 		 301 aa  205  6e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.240236 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3312  chromosome replication initiation inhibitor protein  39.8 
 
 		 301 aa  205  1e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.028913  normal  0.162228 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2594  chromosome replication initiation inhibitor protein  37.17 
 
 		 311 aa  203  3e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000186754  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2146  chromosome replication initiation inhibitor protein  38.61 
 
 		 323 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1772  chromosome replication initiation inhibitor protein  37.92 
 
 		 325 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.188561  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0336  chromosome replication initiation inhibitor protein  37.92 
 
 		 325 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1788  chromosome replication initiation inhibitor protein  36.84 
 
 		 311 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000405332  unclonable  0.00000000000392786 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0429  chromosome replication initiation inhibitor protein  37.92 
 
 		 325 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1833  chromosome replication initiation inhibitor protein  37.92 
 
 		 325 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.565601  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2671  chromosome replication initiation inhibitor protein  36.51 
 
 		 311 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000215658  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1126  chromosome replication initiation inhibitor protein  37.92 
 
 		 325 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0698805  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0835  chromosome replication initiation inhibitor protein  37.92 
 
 		 319 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0738995  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2099  chromosome replication initiation inhibitor protein  37.92 
 
 		 325 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2173  chromosome replication initiation inhibitor protein  36.4 
 
 		 297 aa  199  7e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.342879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1974  chromosome replication initiation inhibitor protein  36.82 
 
 		 296 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0576454  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2866  chromosome replication initiation inhibitor protein  37.79 
 
 		 306 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3699  chromosome replication initiation inhibitor protein  39.86 
 
 		 297 aa  198  1.0000000000000001e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.792839 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2416  chromosome replication initiation inhibitor protein  38.46 
 
 		 305 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.343193  hitchhiker  0.00112785 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2344  chromosome replication initiation inhibitor protein  37.79 
 
 		 305 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0367629  hitchhiker  0.0000000918792 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2358  chromosome replication initiation inhibitor protein  38.13 
 
 		 302 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.17613  normal  0.155084 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1652  chromosome replication initiation inhibitor protein  37.79 
 
 		 305 aa  196  3e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.963239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2556  chromosome replication initiation inhibitor protein  36.77 
 
 		 311 aa  195  6e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000319404  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2384  transcriptional regulator, ArgP, LysR family  41.16 
 
 		 298 aa  195  7e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.758933 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2836  chromosome replication initiation inhibitor protein  38.54 
 
 		 301 aa  191  1e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.284111  normal  0.240548 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0050  chromosome replication initiation inhibitor protein  38.57 
 
 		 297 aa  189  4e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2434  chromosome replication initiation inhibitor protein  35.69 
 
 		 295 aa  189  4e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.609977  hitchhiker  0.000411507 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0036  chromosome replication initiation inhibitor protein  38.23 
 
 		 297 aa  188  8e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2058  chromosome replication initiation inhibitor protein  38 
 
 		 303 aa  187  1e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.215595  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3863  chromosome replication initiation inhibitor protein  40.48 
 
 		 298 aa  187  1e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.807931 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1337  chromosome replication initiation inhibitor protein  37.58 
 
 		 290 aa  187  1e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.449997  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2433  chromosome replication initiation inhibitor protein  38.23 
 
 		 302 aa  187  2e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0030  chromosome replication initiation inhibitor protein  37.54 
 
 		 297 aa  186  4e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1183  chromosome replication initiation inhibitor protein  37.54 
 
 		 297 aa  186  4e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.893969  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1463  chromosome replication initiation inhibitor protein  37.54 
 
 		 297 aa  186  4e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0036  chromosome replication initiation inhibitor protein  37.54 
 
 		 297 aa  186  4e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0034  chromosome replication initiation inhibitor protein  37.88 
 
 		 297 aa  185  8e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4491  chromosome replication initiation inhibitor protein  38.8 
 
 		 309 aa  185  8e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.965976 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1829  chromosome replication initiation inhibitor protein  37.46 
 
 		 297 aa  185  9e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.999172  hitchhiker  0.00188164 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1538  chromosome replication initiation inhibitor protein  37.04 
 
 		 297 aa  185  9e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4934  chromosome replication initiation inhibitor protein  37.54 
 
 		 298 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.72562  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0880  chromosome replication initiation inhibitor protein  37.72 
 
 		 284 aa  182  6e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2509  chromosome replication initiation inhibitor protein  38.26 
 
 		 303 aa  181  1e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3445  transcriptional regulator, ArgP, LysR family  36.82 
 
 		 321 aa  181  1e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1116  chromosome replication initiation inhibitor protein  38.54 
 
 		 297 aa  181  2e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.472937 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3693  chromosome replication initiation inhibitor protein  38.21 
 
 		 306 aa  180  2e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2123  chromosome replication initiation inhibitor protein  37.74 
 
 		 320 aa  180  2.9999999999999997e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.876879 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2144  chromosome replication initiation inhibitor protein  37.5 
 
 		 297 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.184842 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2388  chromosome replication initiation inhibitor protein  36.49 
 
 		 297 aa  179  4e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00311135  hitchhiker  0.00401295 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3162  chromosome replication initiation inhibitor protein  38.05 
 
 		 303 aa  179  5.999999999999999e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2012  chromosome replication initiation inhibitor protein  40.48 
 
 		 298 aa  178  1e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4483  chromosome replication initiation inhibitor protein  37.87 
 
 		 297 aa  178  1e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.111794 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5298  chromosome replication initiation inhibitor protein  36.7 
 
 		 297 aa  177  2e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1650  chromosome replication initiation inhibitor protein  38.89 
 
 		 298 aa  177  3e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.216692  normal  0.124746 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56740  chromosome replication initiation inhibitor protein  36.84 
 
 		 300 aa  176  3e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1175  chromosome replication initiation inhibitor protein  40.07 
 
 		 297 aa  176  4e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.578075  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6516  chromosome replication initiation inhibitor protein  37 
 
 		 310 aa  176  5e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0983  chromosome replication initiation inhibitor protein  36.96 
 
 		 296 aa  176  6e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00028343 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0917  chromosome replication initiation inhibitor protein  35.88 
 
 		 296 aa  175  7e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2085  chromosome replication initiation inhibitor protein  36.11 
 
 		 299 aa  174  9.999999999999999e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2670  chromosome replication initiation inhibitor protein  35.33 
 
 		 310 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.265415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0956  chromosome replication initiation inhibitor protein  35.55 
 
 		 296 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.480683  normal  0.474013 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1573  chromosome replication initiation inhibitor protein  36.1 
 
 		 318 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.187685  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1904  chromosome replication initiation inhibitor protein  38.27 
 
 		 289 aa  173  2.9999999999999996e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.188746 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1704  chromosome replication initiation inhibitor protein  39.45 
 
 		 298 aa  172  5e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.305056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12016  chromosome replication initiation inhibitor protein  38.89 
 
 		 303 aa  172  5.999999999999999e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3862  chromosome replication initiation inhibitor protein  40.07 
 
 		 299 aa  172  6.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1745  chromosome replication initiation inhibitor protein  35.55 
 
 		 317 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.307823  normal  0.718712 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3139  chromosome replication initiation inhibitor protein  36.03 
 
 		 297 aa  171  9e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.677329  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3099  transcriptional regulator LysR family  36.36 
 
 		 301 aa  172  9e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.109242  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0711  chromosome replication initiation inhibitor protein  38.18 
 
 		 308 aa  171  2e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4471  chromosome replication initiation inhibitor protein  35.55 
 
 		 296 aa  171  2e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.134322 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5007  chromosome replication initiation inhibitor protein  36.03 
 
 		 297 aa  171  2e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.633447  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5123  chromosome replication initiation inhibitor protein  36.24 
 
 		 297 aa  170  3e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4487  chromosome replication initiation inhibitor protein  36.24 
 
 		 297 aa  170  3e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5736  chromosome replication initiation inhibitor protein  36.24 
 
 		 297 aa  170  3e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.18075 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0665  transcriptional regulator, LysR family  38.7 
 
 		 299 aa  170  3e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.409403  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3148  chromosome replication initiation inhibitor protein  36.03 
 
 		 297 aa  169  4e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.99123  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1507  chromosome replication initiation inhibitor protein  36.73 
 
 		 297 aa  169  6e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2962  chromosome replication initiation inhibitor protein  36.03 
 
 		 297 aa  169  6e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2242  transcriptional regulator, LysR family  39.64 
 
 		 292 aa  169  6e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.124201  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>