More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_1704 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_1704  chromosome replication initiation inhibitor protein  100 
 
 		 298 aa  588  1e-167  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.305056  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2012  chromosome replication initiation inhibitor protein  95.47 
 
 		 298 aa  509  1e-143  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3693  chromosome replication initiation inhibitor protein  82.21 
 
 		 306 aa  476  1e-133  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3863  chromosome replication initiation inhibitor protein  85.66 
 
 		 298 aa  475  1e-133  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.807931 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2974  chromosome replication initiation inhibitor protein  52.53 
 
 		 303 aa  316  3e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3162  chromosome replication initiation inhibitor protein  55.81 
 
 		 303 aa  315  5e-85  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4371  chromosome replication initiation inhibitor protein  62.07 
 
 		 305 aa  315  5e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2509  chromosome replication initiation inhibitor protein  55.81 
 
 		 303 aa  315  9e-85  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2144  chromosome replication initiation inhibitor protein  53.87 
 
 		 297 aa  312  3.9999999999999997e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.184842 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2388  chromosome replication initiation inhibitor protein  52.86 
 
 		 297 aa  312  5.999999999999999e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00311135  hitchhiker  0.00401295 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3862  chromosome replication initiation inhibitor protein  55.03 
 
 		 299 aa  311  7.999999999999999e-84  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4249  chromosome replication initiation inhibitor protein  55.74 
 
 		 298 aa  310  2e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.373423  normal  0.150215 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2836  chromosome replication initiation inhibitor protein  52.19 
 
 		 301 aa  307  2.0000000000000002e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.284111  normal  0.240548 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4164  chromosome replication initiation inhibitor protein  51.51 
 
 		 299 aa  304  1.0000000000000001e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.221393  normal  0.317315 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1573  chromosome replication initiation inhibitor protein  52.96 
 
 		 318 aa  296  2e-79  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.187685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4178  chromosome replication initiation inhibitor protein  55.7 
 
 		 299 aa  294  1e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.257723  normal  0.264843 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0658  chromosome replication initiation inhibitor protein  49.17 
 
 		 310 aa  292  4e-78  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.117033  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1399  chromosome replication initiation inhibitor protein  53.69 
 
 		 300 aa  285  4e-76  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3099  transcriptional regulator LysR family  51.86 
 
 		 301 aa  282  5.000000000000001e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.109242  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2962  chromosome replication initiation inhibitor protein  49.82 
 
 		 297 aa  275  5e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1829  chromosome replication initiation inhibitor protein  48.07 
 
 		 297 aa  275  7e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.999172  hitchhiker  0.00188164 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1507  chromosome replication initiation inhibitor protein  49.82 
 
 		 297 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0036  chromosome replication initiation inhibitor protein  47.72 
 
 		 297 aa  272  4.0000000000000004e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0982  LysR family transcriptional regulator  53.85 
 
 		 300 aa  271  1e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0050  chromosome replication initiation inhibitor protein  47.72 
 
 		 297 aa  271  1e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1904  chromosome replication initiation inhibitor protein  52.9 
 
 		 289 aa  271  1e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.188746 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0711  chromosome replication initiation inhibitor protein  52.54 
 
 		 308 aa  269  5e-71  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0034  chromosome replication initiation inhibitor protein  47.89 
 
 		 297 aa  268  5.9999999999999995e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5298  chromosome replication initiation inhibitor protein  47.47 
 
 		 297 aa  268  7e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1538  chromosome replication initiation inhibitor protein  47.72 
 
 		 297 aa  266  2e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0036  chromosome replication initiation inhibitor protein  47.72 
 
 		 297 aa  265  5e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0030  chromosome replication initiation inhibitor protein  47.72 
 
 		 297 aa  265  5e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1183  chromosome replication initiation inhibitor protein  47.72 
 
 		 297 aa  265  5e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.893969  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1463  chromosome replication initiation inhibitor protein  47.72 
 
 		 297 aa  265  5e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5007  chromosome replication initiation inhibitor protein  46.8 
 
 		 297 aa  264  1e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.633447  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1175  chromosome replication initiation inhibitor protein  50 
 
 		 297 aa  263  2e-69  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.578075  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2774  chromosome replication initiation inhibitor protein  50.86 
 
 		 295 aa  263  3e-69  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4487  chromosome replication initiation inhibitor protein  46.13 
 
 		 297 aa  262  4e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5123  chromosome replication initiation inhibitor protein  46.13 
 
 		 297 aa  262  4e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5736  chromosome replication initiation inhibitor protein  46.13 
 
 		 297 aa  262  4e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.18075 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3139  chromosome replication initiation inhibitor protein  46.13 
 
 		 297 aa  262  4.999999999999999e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.677329  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3148  chromosome replication initiation inhibitor protein  46.46 
 
 		 297 aa  261  8.999999999999999e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.99123  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1891  chromosome replication initiation inhibitor protein  49.66 
 
 		 306 aa  256  3e-67  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4483  chromosome replication initiation inhibitor protein  47.44 
 
 		 297 aa  247  1e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.111794 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4057  chromosome replication initiation inhibitor protein  46.74 
 
 		 299 aa  247  2e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1116  chromosome replication initiation inhibitor protein  48.51 
 
 		 297 aa  246  3e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.472937 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4934  chromosome replication initiation inhibitor protein  47.32 
 
 		 298 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.72562  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4361  chromosome initiation inhibitor  46.69 
 
 		 299 aa  242  5e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2433  chromosome replication initiation inhibitor protein  44.92 
 
 		 302 aa  241  1e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0983  chromosome replication initiation inhibitor protein  47.06 
 
 		 296 aa  239  4e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00028343 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4471  chromosome replication initiation inhibitor protein  46.6 
 
 		 296 aa  238  8e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.134322 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56740  chromosome replication initiation inhibitor protein  46.31 
 
 		 300 aa  237  1e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0917  chromosome replication initiation inhibitor protein  47.2 
 
 		 296 aa  236  3e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0956  chromosome replication initiation inhibitor protein  47.2 
 
 		 296 aa  236  3e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.480683  normal  0.474013 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1085  chromosome replication initiation inhibitor protein  45.27 
 
 		 301 aa  234  1.0000000000000001e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0282228  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2987  chromosome replication initiation inhibitor protein  42.67 
 
 		 299 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3123  chromosome replication initiation inhibitor protein  45.12 
 
 		 298 aa  231  1e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.714101  hitchhiker  0.0033883 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1844  chromosome replication initiation inhibitor protein  43.29 
 
 		 295 aa  230  2e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.225634  normal  0.103464 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1652  chromosome replication initiation inhibitor protein  44.56 
 
 		 305 aa  230  2e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.963239  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2173  chromosome replication initiation inhibitor protein  41.55 
 
 		 297 aa  229  3e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.342879  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2344  chromosome replication initiation inhibitor protein  44.21 
 
 		 305 aa  229  5e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0367629  hitchhiker  0.0000000918792 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2416  chromosome replication initiation inhibitor protein  44.21 
 
 		 305 aa  228  1e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.343193  hitchhiker  0.00112785 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2085  chromosome replication initiation inhibitor protein  41.03 
 
 		 299 aa  227  2e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2434  chromosome replication initiation inhibitor protein  42.23 
 
 		 295 aa  226  5.0000000000000005e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.609977  hitchhiker  0.000411507 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12016  chromosome replication initiation inhibitor protein  45.7 
 
 		 303 aa  224  1e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2866  chromosome replication initiation inhibitor protein  43.26 
 
 		 306 aa  223  2e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1698  chromosome replication initiation inhibitor protein  42.96 
 
 		 309 aa  224  2e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.52148  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1337  chromosome replication initiation inhibitor protein  42.71 
 
 		 290 aa  223  4e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.449997  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2594  chromosome replication initiation inhibitor protein  42.16 
 
 		 311 aa  223  4e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000186754  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3409  transcriptional regulator ArgP, LysR family  42.28 
 
 		 299 aa  223  4e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.305012  normal  0.0118196 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2671  chromosome replication initiation inhibitor protein  41.81 
 
 		 311 aa  221  8e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000215658  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1788  chromosome replication initiation inhibitor protein  41.81 
 
 		 311 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000405332  unclonable  0.00000000000392786 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1974  chromosome replication initiation inhibitor protein  38.38 
 
 		 296 aa  218  7e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0576454  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2556  chromosome replication initiation inhibitor protein  41.46 
 
 		 311 aa  218  1e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000319404  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0354  chromosome replication initiation inhibitor protein  46.15 
 
 		 304 aa  217  2e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.757564  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0364  chromosome replication initiation inhibitor protein  46.15 
 
 		 304 aa  217  2e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0343  chromosome replication initiation inhibitor protein  45.8 
 
 		 304 aa  216  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1650  chromosome replication initiation inhibitor protein  44.52 
 
 		 298 aa  214  9.999999999999999e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.216692  normal  0.124746 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2358  chromosome replication initiation inhibitor protein  39.66 
 
 		 302 aa  210  2e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.17613  normal  0.155084 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3474  chromosome replication initiation inhibitor protein  42.76 
 
 		 316 aa  207  2e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3699  chromosome replication initiation inhibitor protein  42.95 
 
 		 297 aa  207  2e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.792839 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0375  chromosome replication initiation inhibitor protein  42.18 
 
 		 289 aa  204  1e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.868101 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4012  transcriptional regulator, LysR family  46.05 
 
 		 284 aa  202  5e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.725863 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4638  transcriptional regulator, ArgP family  40.8 
 
 		 302 aa  202  5e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.199138  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0072  chromosome replication initiation inhibitor protein  39.66 
 
 		 303 aa  202  7e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.608118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0091  chromosome replication initiation inhibitor protein  39.66 
 
 		 303 aa  202  7e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.730131  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11860  transcriptional regulator, ArgP family  40.07 
 
 		 313 aa  199  3e-50  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0109539  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3445  transcriptional regulator, ArgP, LysR family  41.08 
 
 		 321 aa  199  5e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0132  chromosome replication initiation inhibitor protein  42.46 
 
 		 305 aa  199  6e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.350257 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0362  chromosome replication initiation inhibitor protein  44.07 
 
 		 289 aa  199  6e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0453473 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3749  transcriptional regulator, ArgP, LysR family  41.22 
 
 		 303 aa  198  7.999999999999999e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2123  chromosome replication initiation inhibitor protein  40.69 
 
 		 320 aa  198  9e-50  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.876879 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0180  chromosome replication initiation inhibitor protein  39.8 
 
 		 301 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.240236 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4431  chromosome replication initiation inhibitor protein  45.7 
 
 		 293 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.615047  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2384  transcriptional regulator, ArgP, LysR family  39.31 
 
 		 298 aa  196  3e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.758933 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5362  chromosome replication initiation inhibitor protein  39.8 
 
 		 301 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.217291  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4796  chromosome replication initiation inhibitor protein  39.8 
 
 		 301 aa  194  1e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.43549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5388  chromosome replication initiation inhibitor protein  39.8 
 
 		 301 aa  194  1e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5473  chromosome replication initiation inhibitor protein  39.8 
 
 		 301 aa  194  1e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.259043  normal  0.391167 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0269  chromosome replication initiation inhibitor protein  44.12 
 
 		 315 aa  193  2e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.875741 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>