More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_1904 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_1904  chromosome replication initiation inhibitor protein  100 
 
 		 289 aa  565  1e-160  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.188746 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1891  chromosome replication initiation inhibitor protein  53.5 
 
 		 306 aa  286  2.9999999999999996e-76  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0711  chromosome replication initiation inhibitor protein  55.93 
 
 		 308 aa  271  1e-71  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2388  chromosome replication initiation inhibitor protein  49.13 
 
 		 297 aa  269  2.9999999999999997e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00311135  hitchhiker  0.00401295 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3099  transcriptional regulator LysR family  52.5 
 
 		 301 aa  267  1e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.109242  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2974  chromosome replication initiation inhibitor protein  46.15 
 
 		 303 aa  266  2e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3863  chromosome replication initiation inhibitor protein  52 
 
 		 298 aa  263  2e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.807931 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1704  chromosome replication initiation inhibitor protein  51.39 
 
 		 298 aa  259  4e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.305056  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2144  chromosome replication initiation inhibitor protein  46.71 
 
 		 297 aa  259  5.0000000000000005e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.184842 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3693  chromosome replication initiation inhibitor protein  51.62 
 
 		 306 aa  258  9e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2774  chromosome replication initiation inhibitor protein  51.58 
 
 		 295 aa  257  1e-67  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2509  chromosome replication initiation inhibitor protein  48.83 
 
 		 303 aa  257  1e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3162  chromosome replication initiation inhibitor protein  48.83 
 
 		 303 aa  256  3e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2012  chromosome replication initiation inhibitor protein  51.04 
 
 		 298 aa  255  6e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2836  chromosome replication initiation inhibitor protein  47 
 
 		 301 aa  253  2.0000000000000002e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.284111  normal  0.240548 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3862  chromosome replication initiation inhibitor protein  50.17 
 
 		 299 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4249  chromosome replication initiation inhibitor protein  49.83 
 
 		 298 aa  252  4.0000000000000004e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.373423  normal  0.150215 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4164  chromosome replication initiation inhibitor protein  46.71 
 
 		 299 aa  249  4e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.221393  normal  0.317315 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2962  chromosome replication initiation inhibitor protein  47.3 
 
 		 297 aa  248  6e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1829  chromosome replication initiation inhibitor protein  44.93 
 
 		 297 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.999172  hitchhiker  0.00188164 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4178  chromosome replication initiation inhibitor protein  51.18 
 
 		 299 aa  241  7e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.257723  normal  0.264843 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1507  chromosome replication initiation inhibitor protein  45.95 
 
 		 297 aa  241  1e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0050  chromosome replication initiation inhibitor protein  43.92 
 
 		 297 aa  233  3e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0034  chromosome replication initiation inhibitor protein  43.92 
 
 		 297 aa  232  6e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0036  chromosome replication initiation inhibitor protein  43.58 
 
 		 297 aa  232  7.000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1573  chromosome replication initiation inhibitor protein  45.33 
 
 		 318 aa  231  1e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.187685  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1183  chromosome replication initiation inhibitor protein  43.92 
 
 		 297 aa  230  2e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.893969  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0030  chromosome replication initiation inhibitor protein  43.92 
 
 		 297 aa  230  2e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0036  chromosome replication initiation inhibitor protein  43.92 
 
 		 297 aa  230  2e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1463  chromosome replication initiation inhibitor protein  43.92 
 
 		 297 aa  230  2e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3148  chromosome replication initiation inhibitor protein  43.69 
 
 		 297 aa  229  4e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.99123  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1538  chromosome replication initiation inhibitor protein  43.58 
 
 		 297 aa  229  6e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5298  chromosome replication initiation inhibitor protein  43.34 
 
 		 297 aa  228  8e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4487  chromosome replication initiation inhibitor protein  43.34 
 
 		 297 aa  227  2e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5123  chromosome replication initiation inhibitor protein  43.34 
 
 		 297 aa  227  2e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5007  chromosome replication initiation inhibitor protein  43.34 
 
 		 297 aa  227  2e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.633447  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5736  chromosome replication initiation inhibitor protein  43.34 
 
 		 297 aa  227  2e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.18075 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0658  chromosome replication initiation inhibitor protein  42.95 
 
 		 310 aa  224  2e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.117033  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3139  chromosome replication initiation inhibitor protein  42.66 
 
 		 297 aa  223  4e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.677329  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2433  chromosome replication initiation inhibitor protein  45.58 
 
 		 302 aa  222  7e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0917  chromosome replication initiation inhibitor protein  45.3 
 
 		 296 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0956  chromosome replication initiation inhibitor protein  45.3 
 
 		 296 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.480683  normal  0.474013 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0343  chromosome replication initiation inhibitor protein  44.72 
 
 		 304 aa  218  1e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1399  chromosome replication initiation inhibitor protein  47.46 
 
 		 300 aa  217  2e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4483  chromosome replication initiation inhibitor protein  43.58 
 
 		 297 aa  217  2e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.111794 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4471  chromosome replication initiation inhibitor protein  44.93 
 
 		 296 aa  217  2e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.134322 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0354  chromosome replication initiation inhibitor protein  45.07 
 
 		 304 aa  217  2e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.757564  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0364  chromosome replication initiation inhibitor protein  45.07 
 
 		 304 aa  217  2e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0983  chromosome replication initiation inhibitor protein  44.59 
 
 		 296 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00028343 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56740  chromosome replication initiation inhibitor protein  44.71 
 
 		 300 aa  216  4e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1844  chromosome replication initiation inhibitor protein  43.7 
 
 		 295 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.225634  normal  0.103464 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4934  chromosome replication initiation inhibitor protein  44.71 
 
 		 298 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.72562  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2085  chromosome replication initiation inhibitor protein  40.55 
 
 		 299 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1116  chromosome replication initiation inhibitor protein  44.56 
 
 		 297 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.472937 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4057  chromosome replication initiation inhibitor protein  43.92 
 
 		 299 aa  211  7.999999999999999e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0982  LysR family transcriptional regulator  43.77 
 
 		 300 aa  211  7.999999999999999e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12016  chromosome replication initiation inhibitor protein  43.6 
 
 		 303 aa  211  1e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1175  chromosome replication initiation inhibitor protein  44.48 
 
 		 297 aa  210  3e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.578075  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3123  chromosome replication initiation inhibitor protein  42.62 
 
 		 298 aa  209  5e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.714101  hitchhiker  0.0033883 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4371  chromosome replication initiation inhibitor protein  46.15 
 
 		 305 aa  208  7e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4361  chromosome initiation inhibitor  42.23 
 
 		 299 aa  208  8e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0362  chromosome replication initiation inhibitor protein  46.1 
 
 		 289 aa  208  9e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0453473 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3409  transcriptional regulator ArgP, LysR family  43.01 
 
 		 299 aa  206  4e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.305012  normal  0.0118196 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1337  chromosome replication initiation inhibitor protein  41.75 
 
 		 290 aa  206  4e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.449997  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2173  chromosome replication initiation inhibitor protein  38.89 
 
 		 297 aa  204  1e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.342879  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0375  chromosome replication initiation inhibitor protein  42.61 
 
 		 289 aa  204  1e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.868101 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2987  chromosome replication initiation inhibitor protein  40.74 
 
 		 299 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2434  chromosome replication initiation inhibitor protein  39.56 
 
 		 295 aa  200  3e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.609977  hitchhiker  0.000411507 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2358  chromosome replication initiation inhibitor protein  40.48 
 
 		 302 aa  197  1.0000000000000001e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.17613  normal  0.155084 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2866  chromosome replication initiation inhibitor protein  39.5 
 
 		 306 aa  196  3e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1698  chromosome replication initiation inhibitor protein  39.1 
 
 		 309 aa  196  3e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.52148  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2594  chromosome replication initiation inhibitor protein  38.36 
 
 		 311 aa  195  9e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000186754  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1788  chromosome replication initiation inhibitor protein  38.01 
 
 		 311 aa  194  1e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000405332  unclonable  0.00000000000392786 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2671  chromosome replication initiation inhibitor protein  38.01 
 
 		 311 aa  194  1e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000215658  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2344  chromosome replication initiation inhibitor protein  39.01 
 
 		 305 aa  194  2e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0367629  hitchhiker  0.0000000918792 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2416  chromosome replication initiation inhibitor protein  39.01 
 
 		 305 aa  194  2e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.343193  hitchhiker  0.00112785 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2242  transcriptional regulator, LysR family  43.64 
 
 		 292 aa  194  2e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.124201  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1652  chromosome replication initiation inhibitor protein  39.01 
 
 		 305 aa  194  2e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.963239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2123  chromosome replication initiation inhibitor protein  44.22 
 
 		 320 aa  192  7e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.876879 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1085  chromosome replication initiation inhibitor protein  40.47 
 
 		 301 aa  191  1e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0282228  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2384  transcriptional regulator, ArgP, LysR family  38.64 
 
 		 298 aa  190  2e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.758933 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1650  chromosome replication initiation inhibitor protein  41.81 
 
 		 298 aa  189  5.999999999999999e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.216692  normal  0.124746 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2556  chromosome replication initiation inhibitor protein  37.33 
 
 		 311 aa  189  7e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000319404  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20750  transcriptional regulator  44.1 
 
 		 291 aa  188  8e-47  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.888774  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0880  chromosome replication initiation inhibitor protein  39.85 
 
 		 284 aa  187  2e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3749  transcriptional regulator, ArgP, LysR family  42.36 
 
 		 303 aa  187  2e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1974  chromosome replication initiation inhibitor protein  35.55 
 
 		 296 aa  187  2e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0576454  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4638  transcriptional regulator, ArgP family  40.14 
 
 		 302 aa  187  3e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.199138  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3445  transcriptional regulator, ArgP, LysR family  39.6 
 
 		 321 aa  186  3e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4491  chromosome replication initiation inhibitor protein  43.96 
 
 		 309 aa  186  4e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.965976 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0132  chromosome replication initiation inhibitor protein  41.28 
 
 		 305 aa  186  5e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.350257 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3474  chromosome replication initiation inhibitor protein  41.58 
 
 		 316 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0072  chromosome replication initiation inhibitor protein  37.33 
 
 		 303 aa  183  4.0000000000000006e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.608118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0091  chromosome replication initiation inhibitor protein  37.33 
 
 		 303 aa  183  4.0000000000000006e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.730131  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3699  chromosome replication initiation inhibitor protein  42.12 
 
 		 297 aa  182  4.0000000000000006e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.792839 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0665  transcriptional regulator, LysR family  40.41 
 
 		 299 aa  180  2e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.409403  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3312  chromosome replication initiation inhibitor protein  38.38 
 
 		 301 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.028913  normal  0.162228 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5362  chromosome replication initiation inhibitor protein  38.18 
 
 		 301 aa  179  4e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.217291  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0180  chromosome replication initiation inhibitor protein  37.84 
 
 		 301 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.240236 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4815  chromosome replication initiation inhibitor protein  38.18 
 
 		 301 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.173708  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>