More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_3474 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_3474  chromosome replication initiation inhibitor protein  100 
 
 		 316 aa  634    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2358  chromosome replication initiation inhibitor protein  47.3 
 
 		 302 aa  250  2e-65  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.17613  normal  0.155084 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1698  chromosome replication initiation inhibitor protein  42.72 
 
 		 309 aa  250  3e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.52148  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2866  chromosome replication initiation inhibitor protein  42.9 
 
 		 306 aa  249  6e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2556  chromosome replication initiation inhibitor protein  42.59 
 
 		 311 aa  247  2e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000319404  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1652  chromosome replication initiation inhibitor protein  44.3 
 
 		 305 aa  246  3e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.963239  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2416  chromosome replication initiation inhibitor protein  43.99 
 
 		 305 aa  246  4e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.343193  hitchhiker  0.00112785 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2594  chromosome replication initiation inhibitor protein  42.59 
 
 		 311 aa  246  4.9999999999999997e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000186754  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2344  chromosome replication initiation inhibitor protein  43.99 
 
 		 305 aa  245  6e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0367629  hitchhiker  0.0000000918792 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2671  chromosome replication initiation inhibitor protein  42.28 
 
 		 311 aa  245  6.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000215658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2434  chromosome replication initiation inhibitor protein  42.04 
 
 		 295 aa  245  6.999999999999999e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.609977  hitchhiker  0.000411507 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1788  chromosome replication initiation inhibitor protein  42.28 
 
 		 311 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000405332  unclonable  0.00000000000392786 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2987  chromosome replication initiation inhibitor protein  44.41 
 
 		 299 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2123  chromosome replication initiation inhibitor protein  48.48 
 
 		 320 aa  242  6e-63  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.876879 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2173  chromosome replication initiation inhibitor protein  40.76 
 
 		 297 aa  240  2e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.342879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1844  chromosome replication initiation inhibitor protein  45.42 
 
 		 295 aa  240  2.9999999999999997e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.225634  normal  0.103464 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3749  transcriptional regulator, ArgP, LysR family  45.6 
 
 		 303 aa  238  8e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1974  chromosome replication initiation inhibitor protein  42.71 
 
 		 296 aa  237  2e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0576454  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0091  chromosome replication initiation inhibitor protein  41.48 
 
 		 303 aa  224  2e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.730131  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2058  chromosome replication initiation inhibitor protein  42.81 
 
 		 303 aa  224  2e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.215595  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0072  chromosome replication initiation inhibitor protein  41.48 
 
 		 303 aa  224  2e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.608118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0132  chromosome replication initiation inhibitor protein  43.6 
 
 		 305 aa  221  1.9999999999999999e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.350257 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0095  chromosome replication initiation inhibitor protein  41.42 
 
 		 304 aa  219  5e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.720683 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1573  chromosome replication initiation inhibitor protein  44.83 
 
 		 318 aa  218  1e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.187685  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0149  chromosome replication initiation inhibitor protein  40.78 
 
 		 304 aa  216  2.9999999999999998e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.898117  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3684  chromosome replication initiation inhibitor protein  41.08 
 
 		 297 aa  214  9.999999999999999e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3878  chromosome replication initiation inhibitor protein  40.76 
 
 		 297 aa  212  4.9999999999999996e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2509  chromosome replication initiation inhibitor protein  45.17 
 
 		 303 aa  211  9e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0559  chromosome replication initiation inhibitor protein  40.76 
 
 		 297 aa  211  9e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0518  chromosome replication initiation inhibitor protein  41.08 
 
 		 297 aa  211  1e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3162  chromosome replication initiation inhibitor protein  45.17 
 
 		 303 aa  211  1e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56740  chromosome replication initiation inhibitor protein  41.61 
 
 		 300 aa  209  4e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4934  chromosome replication initiation inhibitor protein  41.61 
 
 		 298 aa  209  7e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.72562  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4057  chromosome replication initiation inhibitor protein  40.71 
 
 		 299 aa  208  9e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3925  chromosome replication initiation inhibitor protein  40.76 
 
 		 297 aa  208  1e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.567079  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3445  transcriptional regulator, ArgP, LysR family  39.81 
 
 		 321 aa  208  1e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3699  chromosome replication initiation inhibitor protein  44.37 
 
 		 297 aa  208  1e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.792839 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2836  chromosome replication initiation inhibitor protein  43.1 
 
 		 301 aa  207  2e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.284111  normal  0.240548 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2962  chromosome replication initiation inhibitor protein  39.68 
 
 		 297 aa  207  2e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_5010  chromosome replication initiation inhibitor protein  42.21 
 
 		 305 aa  207  3e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.501331  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0880  chromosome replication initiation inhibitor protein  40.13 
 
 		 284 aa  206  4e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0034  chromosome replication initiation inhibitor protein  38.73 
 
 		 297 aa  205  6e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0034  chromosome replication initiation inhibitor protein  36.62 
 
 		 298 aa  205  1e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0857  chromosome replication initiation inhibitor protein  40.45 
 
 		 302 aa  203  3e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3139  chromosome replication initiation inhibitor protein  38.1 
 
 		 297 aa  203  3e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.677329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0854  chromosome replication initiation inhibitor protein  40.45 
 
 		 302 aa  203  3e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00300239  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3821  chromosome replication initiation inhibitor protein  40.45 
 
 		 302 aa  203  3e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.353961  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4471  chromosome replication initiation inhibitor protein  40.32 
 
 		 296 aa  203  3e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.134322 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0036  chromosome replication initiation inhibitor protein  37.78 
 
 		 297 aa  203  4e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4487  chromosome replication initiation inhibitor protein  37.78 
 
 		 297 aa  202  7e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5123  chromosome replication initiation inhibitor protein  37.78 
 
 		 297 aa  202  7e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0983  chromosome replication initiation inhibitor protein  40.26 
 
 		 296 aa  202  7e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00028343 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5736  chromosome replication initiation inhibitor protein  37.78 
 
 		 297 aa  202  7e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.18075 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3099  transcriptional regulator LysR family  41.91 
 
 		 301 aa  202  8e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.109242  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5298  chromosome replication initiation inhibitor protein  38.1 
 
 		 297 aa  202  8e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0050  chromosome replication initiation inhibitor protein  37.78 
 
 		 297 aa  201  9e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1473  chromosome replication initiation inhibitor protein  35.03 
 
 		 297 aa  202  9e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3148  chromosome replication initiation inhibitor protein  38.1 
 
 		 297 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.99123  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5007  chromosome replication initiation inhibitor protein  38.1 
 
 		 297 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.633447  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02747  chromosome replication initiation inhibitor protein  39.17 
 
 		 297 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0777  transcriptional regulator, ArgP, LysR family  39.17 
 
 		 297 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3243  chromosome replication initiation inhibitor protein  39.17 
 
 		 297 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.361223  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3074  chromosome replication initiation inhibitor protein  39.17 
 
 		 297 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.093516  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4212  chromosome replication initiation inhibitor protein  39.17 
 
 		 297 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.307213  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02710  hypothetical protein  39.17 
 
 		 297 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3052  chromosome replication initiation inhibitor protein  39.17 
 
 		 297 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3336  chromosome replication initiation inhibitor protein  39.17 
 
 		 297 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0794  chromosome replication initiation inhibitor protein  39.17 
 
 		 297 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1337  chromosome replication initiation inhibitor protein  39.17 
 
 		 290 aa  200  3e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.449997  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3225  chromosome replication initiation inhibitor protein  39.49 
 
 		 297 aa  199  5e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0441076  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3299  chromosome replication initiation inhibitor protein  39.49 
 
 		 297 aa  199  5e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.335083  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3302  chromosome replication initiation inhibitor protein  39.49 
 
 		 297 aa  199  5e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.779303  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3237  chromosome replication initiation inhibitor protein  39.49 
 
 		 297 aa  199  5e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1829  chromosome replication initiation inhibitor protein  38.1 
 
 		 297 aa  199  5e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.999172  hitchhiker  0.00188164 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3404  chromosome replication initiation inhibitor protein  39.49 
 
 		 297 aa  199  7e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.269089  normal  0.216257 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0917  chromosome replication initiation inhibitor protein  40.32 
 
 		 296 aa  198  7.999999999999999e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0956  chromosome replication initiation inhibitor protein  40.32 
 
 		 296 aa  198  7.999999999999999e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.480683  normal  0.474013 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3334  chromosome replication initiation inhibitor protein  40.13 
 
 		 297 aa  198  1.0000000000000001e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.197754  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4361  chromosome initiation inhibitor  38.78 
 
 		 299 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4491  chromosome replication initiation inhibitor protein  41.84 
 
 		 309 aa  198  1.0000000000000001e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.965976 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1116  chromosome replication initiation inhibitor protein  40.06 
 
 		 297 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.472937 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3518  chromosome replication initiation inhibitor protein  41.05 
 
 		 312 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1507  chromosome replication initiation inhibitor protein  38.1 
 
 		 297 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3409  transcriptional regulator ArgP, LysR family  40.48 
 
 		 299 aa  197  2.0000000000000003e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.305012  normal  0.0118196 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1538  chromosome replication initiation inhibitor protein  37.46 
 
 		 297 aa  197  3e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0982  LysR family transcriptional regulator  41.75 
 
 		 300 aa  197  3e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4012  transcriptional regulator, LysR family  43.23 
 
 		 284 aa  196  4.0000000000000005e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.725863 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0030  chromosome replication initiation inhibitor protein  37.46 
 
 		 297 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1463  chromosome replication initiation inhibitor protein  37.46 
 
 		 297 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0036  chromosome replication initiation inhibitor protein  37.46 
 
 		 297 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1183  chromosome replication initiation inhibitor protein  37.46 
 
 		 297 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.893969  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1704  chromosome replication initiation inhibitor protein  44.33 
 
 		 298 aa  196  6e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.305056  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4483  chromosome replication initiation inhibitor protein  40.67 
 
 		 297 aa  194  1e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.111794 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3862  chromosome replication initiation inhibitor protein  41.91 
 
 		 299 aa  194  2e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002477  chromosome initiation inhibitor  36.13 
 
 		 298 aa  194  2e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0399  chromosome replication initiation inhibitor protein  39.8 
 
 		 302 aa  193  3e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5362  chromosome replication initiation inhibitor protein  40.07 
 
 		 301 aa  193  3e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.217291  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3312  chromosome replication initiation inhibitor protein  39.4 
 
 		 301 aa  192  5e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.028913  normal  0.162228 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3863  chromosome replication initiation inhibitor protein  42.67 
 
 		 298 aa  192  5e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.807931 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4796  chromosome replication initiation inhibitor protein  41.18 
 
 		 301 aa  192  7e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.43549  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>