More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_0399 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_0399  chromosome replication initiation inhibitor protein  100 
 
 		 302 aa  607  1e-173  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0095  chromosome replication initiation inhibitor protein  72.85 
 
 		 304 aa  435  1e-121  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.720683 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0132  chromosome replication initiation inhibitor protein  73.61 
 
 		 305 aa  431  1e-119  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.350257 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0149  chromosome replication initiation inhibitor protein  71.05 
 
 		 304 aa  425  1e-118  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.898117  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0091  chromosome replication initiation inhibitor protein  72.15 
 
 		 303 aa  424  1e-118  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.730131  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0072  chromosome replication initiation inhibitor protein  72.15 
 
 		 303 aa  424  1e-118  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.608118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_5010  chromosome replication initiation inhibitor protein  68.79 
 
 		 305 aa  397  1e-109  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.501331  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0947  chromosome replication initiation inhibitor protein  52.13 
 
 		 311 aa  278  6e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3518  chromosome replication initiation inhibitor protein  52.25 
 
 		 312 aa  271  1e-71  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3749  transcriptional regulator, ArgP, LysR family  42.76 
 
 		 303 aa  215  5.9999999999999996e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5388  chromosome replication initiation inhibitor protein  40.74 
 
 		 301 aa  211  9e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4796  chromosome replication initiation inhibitor protein  40.74 
 
 		 301 aa  211  9e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.43549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5473  chromosome replication initiation inhibitor protein  40.74 
 
 		 301 aa  211  9e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.259043  normal  0.391167 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2146  chromosome replication initiation inhibitor protein  39.73 
 
 		 323 aa  211  1e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3312  chromosome replication initiation inhibitor protein  40.4 
 
 		 301 aa  211  2e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.028913  normal  0.162228 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2358  chromosome replication initiation inhibitor protein  40.89 
 
 		 302 aa  210  2e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.17613  normal  0.155084 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3474  chromosome replication initiation inhibitor protein  40.65 
 
 		 316 aa  208  9e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4815  chromosome replication initiation inhibitor protein  40.74 
 
 		 301 aa  207  1e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.173708  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0180  chromosome replication initiation inhibitor protein  40.07 
 
 		 301 aa  207  2e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.240236 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5362  chromosome replication initiation inhibitor protein  40.74 
 
 		 301 aa  207  2e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.217291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0429  chromosome replication initiation inhibitor protein  38.72 
 
 		 325 aa  205  8e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4934  chromosome replication initiation inhibitor protein  41.91 
 
 		 298 aa  205  9e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.72562  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0982  LysR family transcriptional regulator  41.2 
 
 		 300 aa  204  1e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1772  chromosome replication initiation inhibitor protein  38.38 
 
 		 325 aa  203  3e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.188561  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0336  chromosome replication initiation inhibitor protein  38.38 
 
 		 325 aa  203  3e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2099  chromosome replication initiation inhibitor protein  38.38 
 
 		 325 aa  202  5e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1833  chromosome replication initiation inhibitor protein  38.38 
 
 		 325 aa  202  5e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.565601  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1126  chromosome replication initiation inhibitor protein  38.38 
 
 		 325 aa  202  5e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0698805  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0835  chromosome replication initiation inhibitor protein  38.38 
 
 		 319 aa  202  5e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0738995  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2433  chromosome replication initiation inhibitor protein  40.13 
 
 		 302 aa  202  8e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2987  chromosome replication initiation inhibitor protein  39.67 
 
 		 299 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1337  chromosome replication initiation inhibitor protein  38.78 
 
 		 290 aa  200  3e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.449997  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1116  chromosome replication initiation inhibitor protein  42.14 
 
 		 297 aa  198  7.999999999999999e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.472937 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56740  chromosome replication initiation inhibitor protein  41.18 
 
 		 300 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1844  chromosome replication initiation inhibitor protein  37.67 
 
 		 295 aa  196  3e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.225634  normal  0.103464 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0354  chromosome replication initiation inhibitor protein  42.12 
 
 		 304 aa  196  5.000000000000001e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.757564  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0364  chromosome replication initiation inhibitor protein  42.12 
 
 		 304 aa  196  5.000000000000001e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0343  chromosome replication initiation inhibitor protein  41.78 
 
 		 304 aa  195  9e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4164  chromosome replication initiation inhibitor protein  40.27 
 
 		 299 aa  192  4e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.221393  normal  0.317315 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1829  chromosome replication initiation inhibitor protein  38.49 
 
 		 297 aa  192  5e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.999172  hitchhiker  0.00188164 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0880  chromosome replication initiation inhibitor protein  38.19 
 
 		 284 aa  192  5e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1745  chromosome replication initiation inhibitor protein  39.71 
 
 		 317 aa  192  6e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.307823  normal  0.718712 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2388  chromosome replication initiation inhibitor protein  38.74 
 
 		 297 aa  191  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00311135  hitchhiker  0.00401295 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4483  chromosome replication initiation inhibitor protein  40.54 
 
 		 297 aa  191  1e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.111794 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2836  chromosome replication initiation inhibitor protein  38.13 
 
 		 301 aa  190  2e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.284111  normal  0.240548 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2384  transcriptional regulator, ArgP, LysR family  40 
 
 		 298 aa  191  2e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.758933 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4057  chromosome replication initiation inhibitor protein  39.86 
 
 		 299 aa  191  2e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3863  chromosome replication initiation inhibitor protein  41.67 
 
 		 298 aa  191  2e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.807931 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0375  chromosome replication initiation inhibitor protein  39.8 
 
 		 289 aa  190  2e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.868101 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2123  chromosome replication initiation inhibitor protein  40.2 
 
 		 320 aa  190  2.9999999999999997e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.876879 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2144  chromosome replication initiation inhibitor protein  37.79 
 
 		 297 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.184842 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2012  chromosome replication initiation inhibitor protein  42.36 
 
 		 298 aa  189  5e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3862  chromosome replication initiation inhibitor protein  40.62 
 
 		 299 aa  188  8e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4249  chromosome replication initiation inhibitor protein  40.62 
 
 		 298 aa  187  2e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.373423  normal  0.150215 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0036  chromosome replication initiation inhibitor protein  37.07 
 
 		 297 aa  187  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2173  chromosome replication initiation inhibitor protein  35.94 
 
 		 297 aa  187  2e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.342879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1698  chromosome replication initiation inhibitor protein  37.63 
 
 		 309 aa  186  3e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.52148  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0983  chromosome replication initiation inhibitor protein  38.98 
 
 		 296 aa  186  3e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00028343 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3699  chromosome replication initiation inhibitor protein  39.39 
 
 		 297 aa  186  4e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.792839 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0050  chromosome replication initiation inhibitor protein  36.73 
 
 		 297 aa  186  5e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1175  chromosome replication initiation inhibitor protein  40.4 
 
 		 297 aa  186  6e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.578075  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4361  chromosome initiation inhibitor  38.85 
 
 		 299 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1704  chromosome replication initiation inhibitor protein  41.32 
 
 		 298 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.305056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2974  chromosome replication initiation inhibitor protein  37.04 
 
 		 303 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3693  chromosome replication initiation inhibitor protein  39.8 
 
 		 306 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0034  chromosome replication initiation inhibitor protein  37.07 
 
 		 297 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2962  chromosome replication initiation inhibitor protein  37.84 
 
 		 297 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12016  chromosome replication initiation inhibitor protein  39.26 
 
 		 303 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3445  transcriptional regulator, ArgP, LysR family  37.14 
 
 		 321 aa  183  3e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0956  chromosome replication initiation inhibitor protein  38.64 
 
 		 296 aa  183  3e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.480683  normal  0.474013 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0917  chromosome replication initiation inhibitor protein  38.64 
 
 		 296 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1974  chromosome replication initiation inhibitor protein  34.68 
 
 		 296 aa  182  5.0000000000000004e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0576454  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1399  chromosome replication initiation inhibitor protein  40.91 
 
 		 300 aa  181  1e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4178  chromosome replication initiation inhibitor protein  40.43 
 
 		 299 aa  181  1e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.257723  normal  0.264843 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2058  chromosome replication initiation inhibitor protein  39.34 
 
 		 303 aa  181  1e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.215595  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1507  chromosome replication initiation inhibitor protein  37.93 
 
 		 297 aa  181  2e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5298  chromosome replication initiation inhibitor protein  37.41 
 
 		 297 aa  180  2e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1538  chromosome replication initiation inhibitor protein  36.73 
 
 		 297 aa  180  2e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4638  transcriptional regulator, ArgP family  37 
 
 		 302 aa  181  2e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.199138  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2434  chromosome replication initiation inhibitor protein  36.23 
 
 		 295 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.609977  hitchhiker  0.000411507 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1650  chromosome replication initiation inhibitor protein  39.12 
 
 		 298 aa  180  2.9999999999999997e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.216692  normal  0.124746 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4471  chromosome replication initiation inhibitor protein  37.97 
 
 		 296 aa  179  4e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.134322 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0158  transcriptional regulator, ArgP, LysR family  38.33 
 
 		 292 aa  179  4.999999999999999e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.804974 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0030  chromosome replication initiation inhibitor protein  36.39 
 
 		 297 aa  179  7e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0036  chromosome replication initiation inhibitor protein  36.39 
 
 		 297 aa  179  7e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1183  chromosome replication initiation inhibitor protein  36.39 
 
 		 297 aa  179  7e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.893969  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1463  chromosome replication initiation inhibitor protein  36.39 
 
 		 297 aa  179  7e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3409  transcriptional regulator ArgP, LysR family  37.37 
 
 		 299 aa  178  8e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.305012  normal  0.0118196 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2085  chromosome replication initiation inhibitor protein  36.21 
 
 		 299 aa  178  8e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2509  chromosome replication initiation inhibitor protein  38.31 
 
 		 303 aa  178  9e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0362  chromosome replication initiation inhibitor protein  40.36 
 
 		 289 aa  178  1e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0453473 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3162  chromosome replication initiation inhibitor protein  38.31 
 
 		 303 aa  178  1e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4487  chromosome replication initiation inhibitor protein  36.73 
 
 		 297 aa  178  1e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5123  chromosome replication initiation inhibitor protein  36.73 
 
 		 297 aa  178  1e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5736  chromosome replication initiation inhibitor protein  36.73 
 
 		 297 aa  178  1e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.18075 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0711  chromosome replication initiation inhibitor protein  38.99 
 
 		 308 aa  177  2e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2670  chromosome replication initiation inhibitor protein  35.38 
 
 		 310 aa  177  2e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.265415  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6516  chromosome replication initiation inhibitor protein  37.77 
 
 		 310 aa  177  2e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3139  chromosome replication initiation inhibitor protein  36.73 
 
 		 297 aa  176  3e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.677329  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4491  chromosome replication initiation inhibitor protein  39 
 
 		 309 aa  176  3e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.965976 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>