More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_2058 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_2058  chromosome replication initiation inhibitor protein  100 
 
 		 303 aa  607  1e-173  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.215595  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4491  chromosome replication initiation inhibitor protein  71.1 
 
 		 309 aa  402  1e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.965976 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3699  chromosome replication initiation inhibitor protein  70.67 
 
 		 297 aa  390  1e-107  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.792839 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2987  chromosome replication initiation inhibitor protein  43.56 
 
 		 299 aa  236  3e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2866  chromosome replication initiation inhibitor protein  42.21 
 
 		 306 aa  224  2e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3474  chromosome replication initiation inhibitor protein  42.81 
 
 		 316 aa  224  2e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1652  chromosome replication initiation inhibitor protein  39.1 
 
 		 305 aa  224  2e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.963239  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2344  chromosome replication initiation inhibitor protein  39.42 
 
 		 305 aa  221  9e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0367629  hitchhiker  0.0000000918792 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2416  chromosome replication initiation inhibitor protein  39.42 
 
 		 305 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.343193  hitchhiker  0.00112785 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2670  chromosome replication initiation inhibitor protein  40.73 
 
 		 310 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.265415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2671  chromosome replication initiation inhibitor protein  40.82 
 
 		 311 aa  219  6e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000215658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1844  chromosome replication initiation inhibitor protein  39.34 
 
 		 295 aa  218  7.999999999999999e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.225634  normal  0.103464 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2556  chromosome replication initiation inhibitor protein  40.75 
 
 		 311 aa  218  7.999999999999999e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000319404  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1698  chromosome replication initiation inhibitor protein  39.38 
 
 		 309 aa  218  1e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.52148  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4796  chromosome replication initiation inhibitor protein  39.93 
 
 		 301 aa  218  1e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.43549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5388  chromosome replication initiation inhibitor protein  39.93 
 
 		 301 aa  218  1e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5473  chromosome replication initiation inhibitor protein  39.93 
 
 		 301 aa  218  1e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.259043  normal  0.391167 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0180  chromosome replication initiation inhibitor protein  39.6 
 
 		 301 aa  217  2e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.240236 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1974  chromosome replication initiation inhibitor protein  38.82 
 
 		 296 aa  217  2e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0576454  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2594  chromosome replication initiation inhibitor protein  39.8 
 
 		 311 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000186754  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3749  transcriptional regulator, ArgP, LysR family  43.71 
 
 		 303 aa  216  2.9999999999999998e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1788  chromosome replication initiation inhibitor protein  40.14 
 
 		 311 aa  216  5e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000405332  unclonable  0.00000000000392786 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2358  chromosome replication initiation inhibitor protein  41.5 
 
 		 302 aa  216  5e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.17613  normal  0.155084 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2173  chromosome replication initiation inhibitor protein  38.93 
 
 		 297 aa  215  8e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.342879  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5362  chromosome replication initiation inhibitor protein  39.53 
 
 		 301 aa  215  9e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.217291  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3312  chromosome replication initiation inhibitor protein  39.27 
 
 		 301 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.028913  normal  0.162228 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4815  chromosome replication initiation inhibitor protein  39.93 
 
 		 301 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.173708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2434  chromosome replication initiation inhibitor protein  39.64 
 
 		 295 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.609977  hitchhiker  0.000411507 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2146  chromosome replication initiation inhibitor protein  39.53 
 
 		 323 aa  212  5.999999999999999e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1772  chromosome replication initiation inhibitor protein  39.2 
 
 		 325 aa  211  1e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.188561  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0429  chromosome replication initiation inhibitor protein  39.2 
 
 		 325 aa  211  1e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0336  chromosome replication initiation inhibitor protein  39.2 
 
 		 325 aa  211  1e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1833  chromosome replication initiation inhibitor protein  38.87 
 
 		 325 aa  209  6e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.565601  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0835  chromosome replication initiation inhibitor protein  38.87 
 
 		 319 aa  209  6e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0738995  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2099  chromosome replication initiation inhibitor protein  38.87 
 
 		 325 aa  209  6e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1126  chromosome replication initiation inhibitor protein  38.87 
 
 		 325 aa  209  6e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0698805  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0880  chromosome replication initiation inhibitor protein  43.84 
 
 		 284 aa  208  1e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1745  chromosome replication initiation inhibitor protein  39.8 
 
 		 317 aa  206  4e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.307823  normal  0.718712 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1829  chromosome replication initiation inhibitor protein  40.59 
 
 		 297 aa  206  4e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.999172  hitchhiker  0.00188164 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6516  chromosome replication initiation inhibitor protein  40.86 
 
 		 310 aa  202  4e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3139  chromosome replication initiation inhibitor protein  40.71 
 
 		 297 aa  199  5e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.677329  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2962  chromosome replication initiation inhibitor protein  42.35 
 
 		 297 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0132  chromosome replication initiation inhibitor protein  41.81 
 
 		 305 aa  197  1.0000000000000001e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.350257 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1507  chromosome replication initiation inhibitor protein  41.07 
 
 		 297 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5007  chromosome replication initiation inhibitor protein  40.57 
 
 		 297 aa  196  3e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.633447  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3148  chromosome replication initiation inhibitor protein  40.57 
 
 		 297 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.99123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0050  chromosome replication initiation inhibitor protein  39.22 
 
 		 297 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5123  chromosome replication initiation inhibitor protein  39.86 
 
 		 297 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4487  chromosome replication initiation inhibitor protein  39.86 
 
 		 297 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5736  chromosome replication initiation inhibitor protein  39.86 
 
 		 297 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.18075 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2836  chromosome replication initiation inhibitor protein  39.93 
 
 		 301 aa  195  6e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.284111  normal  0.240548 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0343  chromosome replication initiation inhibitor protein  41.8 
 
 		 304 aa  195  9e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5298  chromosome replication initiation inhibitor protein  40.78 
 
 		 297 aa  194  1e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2085  chromosome replication initiation inhibitor protein  38.7 
 
 		 299 aa  194  1e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0036  chromosome replication initiation inhibitor protein  38.49 
 
 		 297 aa  195  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0072  chromosome replication initiation inhibitor protein  38.89 
 
 		 303 aa  194  2e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.608118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0354  chromosome replication initiation inhibitor protein  42.62 
 
 		 304 aa  193  2e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.757564  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0091  chromosome replication initiation inhibitor protein  38.89 
 
 		 303 aa  194  2e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.730131  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0364  chromosome replication initiation inhibitor protein  42.62 
 
 		 304 aa  193  2e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0030  chromosome replication initiation inhibitor protein  39.22 
 
 		 297 aa  193  3e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0036  chromosome replication initiation inhibitor protein  39.22 
 
 		 297 aa  193  3e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1183  chromosome replication initiation inhibitor protein  39.22 
 
 		 297 aa  193  3e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.893969  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1463  chromosome replication initiation inhibitor protein  39.22 
 
 		 297 aa  193  3e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1538  chromosome replication initiation inhibitor protein  38.49 
 
 		 297 aa  192  6e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3518  chromosome replication initiation inhibitor protein  41.11 
 
 		 312 aa  192  7e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0034  chromosome replication initiation inhibitor protein  38.49 
 
 		 297 aa  192  7e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1175  chromosome replication initiation inhibitor protein  40.94 
 
 		 297 aa  191  1e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.578075  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_5010  chromosome replication initiation inhibitor protein  41.05 
 
 		 305 aa  190  2.9999999999999997e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.501331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3123  chromosome replication initiation inhibitor protein  38.28 
 
 		 298 aa  188  9e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.714101  hitchhiker  0.0033883 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3168  chromosome replication initiation inhibitor protein  39.6 
 
 		 301 aa  188  1e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.780444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0095  chromosome replication initiation inhibitor protein  38 
 
 		 304 aa  187  1e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.720683 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1337  chromosome replication initiation inhibitor protein  38.49 
 
 		 290 aa  187  2e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.449997  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3162  chromosome replication initiation inhibitor protein  39.74 
 
 		 303 aa  186  5e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1573  chromosome replication initiation inhibitor protein  39.41 
 
 		 318 aa  186  5e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.187685  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4361  chromosome initiation inhibitor  38.46 
 
 		 299 aa  186  6e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0149  chromosome replication initiation inhibitor protein  38 
 
 		 304 aa  184  1.0000000000000001e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.898117  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3445  transcriptional regulator, ArgP, LysR family  37.67 
 
 		 321 aa  183  3e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2433  chromosome replication initiation inhibitor protein  39.15 
 
 		 302 aa  183  4.0000000000000006e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2509  chromosome replication initiation inhibitor protein  39.4 
 
 		 303 aa  182  5.0000000000000004e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0947  chromosome replication initiation inhibitor protein  39.86 
 
 		 311 aa  182  5.0000000000000004e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0665  transcriptional regulator, LysR family  41.39 
 
 		 299 aa  182  5.0000000000000004e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.409403  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1650  chromosome replication initiation inhibitor protein  38.8 
 
 		 298 aa  180  2e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.216692  normal  0.124746 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4057  chromosome replication initiation inhibitor protein  37.92 
 
 		 299 aa  181  2e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12016  chromosome replication initiation inhibitor protein  39.6 
 
 		 303 aa  179  4e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2123  chromosome replication initiation inhibitor protein  39.21 
 
 		 320 aa  179  4.999999999999999e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.876879 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7420  chromosome replication initiation inhibitor protein  39.93 
 
 		 311 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.766586  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1116  chromosome replication initiation inhibitor protein  38.59 
 
 		 297 aa  177  2e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.472937 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4934  chromosome replication initiation inhibitor protein  41.07 
 
 		 298 aa  177  2e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.72562  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0857  chromosome replication initiation inhibitor protein  36.88 
 
 		 302 aa  177  2e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3821  chromosome replication initiation inhibitor protein  36.88 
 
 		 302 aa  177  2e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.353961  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3925  chromosome replication initiation inhibitor protein  36.88 
 
 		 297 aa  177  2e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.567079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0854  chromosome replication initiation inhibitor protein  36.88 
 
 		 302 aa  177  2e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00300239  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2388  chromosome replication initiation inhibitor protein  38.87 
 
 		 297 aa  177  3e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00311135  hitchhiker  0.00401295 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0982  LysR family transcriptional regulator  37.42 
 
 		 300 aa  176  3e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56740  chromosome replication initiation inhibitor protein  40.36 
 
 		 300 aa  176  4e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3862  chromosome replication initiation inhibitor protein  40 
 
 		 299 aa  175  7e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3863  chromosome replication initiation inhibitor protein  39.43 
 
 		 298 aa  175  9e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.807931 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4249  chromosome replication initiation inhibitor protein  40.46 
 
 		 298 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.373423  normal  0.150215 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3099  transcriptional regulator LysR family  38.82 
 
 		 301 aa  174  1.9999999999999998e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.109242  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3878  chromosome replication initiation inhibitor protein  36.88 
 
 		 297 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>