More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_0880 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_0880  chromosome replication initiation inhibitor protein  100 
 
 		 284 aa  582  1.0000000000000001e-165  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1745  chromosome replication initiation inhibitor protein  52.65 
 
 		 317 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.307823  normal  0.718712 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2670  chromosome replication initiation inhibitor protein  51.06 
 
 		 310 aa  280  1e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.265415  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6516  chromosome replication initiation inhibitor protein  51.94 
 
 		 310 aa  281  1e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3168  chromosome replication initiation inhibitor protein  51.09 
 
 		 301 aa  258  9e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.780444  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7420  chromosome replication initiation inhibitor protein  50.72 
 
 		 311 aa  252  5.000000000000001e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.766586  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2358  chromosome replication initiation inhibitor protein  43.66 
 
 		 302 aa  224  2e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.17613  normal  0.155084 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2987  chromosome replication initiation inhibitor protein  43.48 
 
 		 299 aa  223  2e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1844  chromosome replication initiation inhibitor protein  41.3 
 
 		 295 aa  222  7e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.225634  normal  0.103464 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2173  chromosome replication initiation inhibitor protein  42.03 
 
 		 297 aa  221  9e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.342879  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3749  transcriptional regulator, ArgP, LysR family  43.42 
 
 		 303 aa  220  1.9999999999999999e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2434  chromosome replication initiation inhibitor protein  40.58 
 
 		 295 aa  216  2e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.609977  hitchhiker  0.000411507 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2594  chromosome replication initiation inhibitor protein  40.34 
 
 		 311 aa  211  9e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000186754  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2671  chromosome replication initiation inhibitor protein  40 
 
 		 311 aa  211  1e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000215658  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1788  chromosome replication initiation inhibitor protein  40 
 
 		 311 aa  210  3e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000405332  unclonable  0.00000000000392786 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3312  chromosome replication initiation inhibitor protein  40.35 
 
 		 301 aa  209  3e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.028913  normal  0.162228 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2388  chromosome replication initiation inhibitor protein  40.51 
 
 		 297 aa  209  4e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00311135  hitchhiker  0.00401295 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1974  chromosome replication initiation inhibitor protein  38.04 
 
 		 296 aa  209  4e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0576454  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2866  chromosome replication initiation inhibitor protein  40 
 
 		 306 aa  209  5e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0132  chromosome replication initiation inhibitor protein  42.91 
 
 		 305 aa  208  9e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.350257 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0091  chromosome replication initiation inhibitor protein  40.73 
 
 		 303 aa  208  9e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.730131  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0072  chromosome replication initiation inhibitor protein  40.73 
 
 		 303 aa  208  9e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.608118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2058  chromosome replication initiation inhibitor protein  43.84 
 
 		 303 aa  208  1e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.215595  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1698  chromosome replication initiation inhibitor protein  40.42 
 
 		 309 aa  207  2e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.52148  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2344  chromosome replication initiation inhibitor protein  40 
 
 		 305 aa  207  2e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0367629  hitchhiker  0.0000000918792 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2416  chromosome replication initiation inhibitor protein  40 
 
 		 305 aa  207  2e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.343193  hitchhiker  0.00112785 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1652  chromosome replication initiation inhibitor protein  40 
 
 		 305 aa  207  2e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.963239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2556  chromosome replication initiation inhibitor protein  39.66 
 
 		 311 aa  207  2e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000319404  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0180  chromosome replication initiation inhibitor protein  39.65 
 
 		 301 aa  206  4e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.240236 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3474  chromosome replication initiation inhibitor protein  40.13 
 
 		 316 aa  206  4e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4796  chromosome replication initiation inhibitor protein  39.3 
 
 		 301 aa  204  1e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.43549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5388  chromosome replication initiation inhibitor protein  39.3 
 
 		 301 aa  204  1e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2144  chromosome replication initiation inhibitor protein  40.15 
 
 		 297 aa  204  1e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.184842 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5473  chromosome replication initiation inhibitor protein  39.3 
 
 		 301 aa  204  1e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.259043  normal  0.391167 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3699  chromosome replication initiation inhibitor protein  41.84 
 
 		 297 aa  204  2e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.792839 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4815  chromosome replication initiation inhibitor protein  40.07 
 
 		 301 aa  204  2e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.173708  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5362  chromosome replication initiation inhibitor protein  38.6 
 
 		 301 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.217291  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4491  chromosome replication initiation inhibitor protein  40.69 
 
 		 309 aa  199  3.9999999999999996e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.965976 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_5010  chromosome replication initiation inhibitor protein  38.41 
 
 		 305 aa  197  2.0000000000000003e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.501331  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2146  chromosome replication initiation inhibitor protein  38.41 
 
 		 323 aa  196  3e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1116  chromosome replication initiation inhibitor protein  39.19 
 
 		 297 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.472937 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3123  chromosome replication initiation inhibitor protein  41.11 
 
 		 298 aa  194  1e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.714101  hitchhiker  0.0033883 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1772  chromosome replication initiation inhibitor protein  38.99 
 
 		 325 aa  192  4e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.188561  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0429  chromosome replication initiation inhibitor protein  38.99 
 
 		 325 aa  192  4e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0336  chromosome replication initiation inhibitor protein  38.99 
 
 		 325 aa  192  4e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3445  transcriptional regulator, ArgP, LysR family  39.22 
 
 		 321 aa  192  5e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3099  transcriptional regulator LysR family  39.63 
 
 		 301 aa  190  2e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.109242  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0835  chromosome replication initiation inhibitor protein  38.63 
 
 		 319 aa  190  2e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0738995  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1833  chromosome replication initiation inhibitor protein  38.63 
 
 		 325 aa  190  2e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.565601  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2099  chromosome replication initiation inhibitor protein  38.63 
 
 		 325 aa  190  2e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1126  chromosome replication initiation inhibitor protein  38.63 
 
 		 325 aa  190  2e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0698805  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4934  chromosome replication initiation inhibitor protein  38.46 
 
 		 298 aa  189  5.999999999999999e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.72562  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0034  chromosome replication initiation inhibitor protein  36.62 
 
 		 298 aa  188  7e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4057  chromosome replication initiation inhibitor protein  37 
 
 		 299 aa  187  1e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2123  chromosome replication initiation inhibitor protein  39.87 
 
 		 320 aa  187  1e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.876879 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2433  chromosome replication initiation inhibitor protein  37.96 
 
 		 302 aa  187  2e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1904  chromosome replication initiation inhibitor protein  39.85 
 
 		 289 aa  187  2e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.188746 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4483  chromosome replication initiation inhibitor protein  38.55 
 
 		 297 aa  186  3e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.111794 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1473  chromosome replication initiation inhibitor protein  35.34 
 
 		 297 aa  186  4e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4361  chromosome initiation inhibitor  35.9 
 
 		 299 aa  185  6e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2962  chromosome replication initiation inhibitor protein  36.82 
 
 		 297 aa  185  6e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0399  chromosome replication initiation inhibitor protein  38.52 
 
 		 302 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56740  chromosome replication initiation inhibitor protein  37.36 
 
 		 300 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4487  chromosome replication initiation inhibitor protein  36.93 
 
 		 297 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4135  chromosome replication initiation inhibitor protein  36.82 
 
 		 298 aa  184  2.0000000000000003e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.931472  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0149  chromosome replication initiation inhibitor protein  37.8 
 
 		 304 aa  184  2.0000000000000003e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.898117  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5123  chromosome replication initiation inhibitor protein  36.93 
 
 		 297 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5736  chromosome replication initiation inhibitor protein  36.93 
 
 		 297 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.18075 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3139  chromosome replication initiation inhibitor protein  36.59 
 
 		 297 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.677329  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2012  chromosome replication initiation inhibitor protein  40.51 
 
 		 298 aa  182  5.0000000000000004e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0034  chromosome replication initiation inhibitor protein  39.21 
 
 		 297 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0095  chromosome replication initiation inhibitor protein  37.72 
 
 		 304 aa  182  5.0000000000000004e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.720683 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0036  chromosome replication initiation inhibitor protein  38.49 
 
 		 297 aa  182  7e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0983  chromosome replication initiation inhibitor protein  36.63 
 
 		 296 aa  181  1e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00028343 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1507  chromosome replication initiation inhibitor protein  37.63 
 
 		 297 aa  181  1e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4471  chromosome replication initiation inhibitor protein  36.63 
 
 		 296 aa  181  1e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.134322 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2974  chromosome replication initiation inhibitor protein  36.86 
 
 		 303 aa  180  2e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4164  chromosome replication initiation inhibitor protein  37.96 
 
 		 299 aa  181  2e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.221393  normal  0.317315 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5298  chromosome replication initiation inhibitor protein  37.37 
 
 		 297 aa  180  2e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3862  chromosome replication initiation inhibitor protein  36.84 
 
 		 299 aa  180  2e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5007  chromosome replication initiation inhibitor protein  36.59 
 
 		 297 aa  181  2e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.633447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0050  chromosome replication initiation inhibitor protein  38.13 
 
 		 297 aa  180  2e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3148  chromosome replication initiation inhibitor protein  36.59 
 
 		 297 aa  179  4e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.99123  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1538  chromosome replication initiation inhibitor protein  37.77 
 
 		 297 aa  179  4e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3409  transcriptional regulator ArgP, LysR family  36.59 
 
 		 299 aa  179  4.999999999999999e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.305012  normal  0.0118196 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1829  chromosome replication initiation inhibitor protein  37.28 
 
 		 297 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.999172  hitchhiker  0.00188164 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1183  chromosome replication initiation inhibitor protein  37.41 
 
 		 297 aa  177  1e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.893969  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0030  chromosome replication initiation inhibitor protein  37.41 
 
 		 297 aa  177  1e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03558  chromosome replication initiation inhibitor protein  35.79 
 
 		 313 aa  177  1e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1463  chromosome replication initiation inhibitor protein  37.41 
 
 		 297 aa  177  1e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0036  chromosome replication initiation inhibitor protein  37.41 
 
 		 297 aa  177  1e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3693  chromosome replication initiation inhibitor protein  37.96 
 
 		 306 aa  177  2e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3518  chromosome replication initiation inhibitor protein  38.87 
 
 		 312 aa  177  2e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2774  chromosome replication initiation inhibitor protein  37.73 
 
 		 295 aa  177  2e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0917  chromosome replication initiation inhibitor protein  35.77 
 
 		 296 aa  176  3e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1704  chromosome replication initiation inhibitor protein  39.78 
 
 		 298 aa  176  3e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.305056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0956  chromosome replication initiation inhibitor protein  35.77 
 
 		 296 aa  176  3e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.480683  normal  0.474013 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0947  chromosome replication initiation inhibitor protein  37.32 
 
 		 311 aa  176  4e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4249  chromosome replication initiation inhibitor protein  36.84 
 
 		 298 aa  176  4e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.373423  normal  0.150215 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002477  chromosome initiation inhibitor  35.92 
 
 		 298 aa  176  6e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>