More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_7420 on replicon NC_010627
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010627  Bphy_7420  chromosome replication initiation inhibitor protein  100 
 
 		 311 aa  624  1e-178  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.766586  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3168  chromosome replication initiation inhibitor protein  77.18 
 
 		 301 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.780444  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0880  chromosome replication initiation inhibitor protein  50.72 
 
 		 284 aa  273  3e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6516  chromosome replication initiation inhibitor protein  50 
 
 		 310 aa  273  3e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2670  chromosome replication initiation inhibitor protein  46.62 
 
 		 310 aa  272  4.0000000000000004e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.265415  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1745  chromosome replication initiation inhibitor protein  46.9 
 
 		 317 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.307823  normal  0.718712 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2987  chromosome replication initiation inhibitor protein  39.13 
 
 		 299 aa  205  8e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3699  chromosome replication initiation inhibitor protein  40.86 
 
 		 297 aa  201  1.9999999999999998e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.792839 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2058  chromosome replication initiation inhibitor protein  40.26 
 
 		 303 aa  199  6e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.215595  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4491  chromosome replication initiation inhibitor protein  39.8 
 
 		 309 aa  196  5.000000000000001e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.965976 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2173  chromosome replication initiation inhibitor protein  36.58 
 
 		 297 aa  192  6e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.342879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1974  chromosome replication initiation inhibitor protein  37.41 
 
 		 296 aa  192  9e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0576454  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1844  chromosome replication initiation inhibitor protein  37.63 
 
 		 295 aa  191  1e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.225634  normal  0.103464 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3312  chromosome replication initiation inhibitor protein  39.59 
 
 		 301 aa  190  2e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.028913  normal  0.162228 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4815  chromosome replication initiation inhibitor protein  39.25 
 
 		 301 aa  189  7e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.173708  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2866  chromosome replication initiation inhibitor protein  36.27 
 
 		 306 aa  186  4e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0180  chromosome replication initiation inhibitor protein  38.57 
 
 		 301 aa  186  4e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.240236 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2434  chromosome replication initiation inhibitor protein  35.14 
 
 		 295 aa  186  5e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.609977  hitchhiker  0.000411507 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5362  chromosome replication initiation inhibitor protein  38.57 
 
 		 301 aa  186  6e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.217291  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4796  chromosome replication initiation inhibitor protein  38.57 
 
 		 301 aa  185  7e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.43549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5388  chromosome replication initiation inhibitor protein  38.57 
 
 		 301 aa  185  7e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5473  chromosome replication initiation inhibitor protein  38.57 
 
 		 301 aa  185  7e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.259043  normal  0.391167 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2146  chromosome replication initiation inhibitor protein  38.1 
 
 		 323 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0429  chromosome replication initiation inhibitor protein  38.62 
 
 		 325 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1772  chromosome replication initiation inhibitor protein  38.62 
 
 		 325 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.188561  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0336  chromosome replication initiation inhibitor protein  38.62 
 
 		 325 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3749  transcriptional regulator, ArgP, LysR family  38.62 
 
 		 303 aa  182  7e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2671  chromosome replication initiation inhibitor protein  35.26 
 
 		 311 aa  182  7e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000215658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2594  chromosome replication initiation inhibitor protein  35.26 
 
 		 311 aa  182  8.000000000000001e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000186754  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1833  chromosome replication initiation inhibitor protein  38.28 
 
 		 325 aa  181  1e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.565601  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0835  chromosome replication initiation inhibitor protein  38.28 
 
 		 319 aa  181  1e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0738995  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1126  chromosome replication initiation inhibitor protein  38.28 
 
 		 325 aa  181  1e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0698805  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1698  chromosome replication initiation inhibitor protein  36.33 
 
 		 309 aa  181  1e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.52148  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2099  chromosome replication initiation inhibitor protein  38.28 
 
 		 325 aa  181  1e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1788  chromosome replication initiation inhibitor protein  35.26 
 
 		 311 aa  181  2e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000405332  unclonable  0.00000000000392786 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1652  chromosome replication initiation inhibitor protein  35.39 
 
 		 305 aa  179  7e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.963239  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2344  chromosome replication initiation inhibitor protein  35.39 
 
 		 305 aa  178  8e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0367629  hitchhiker  0.0000000918792 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2416  chromosome replication initiation inhibitor protein  36.04 
 
 		 305 aa  178  8e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.343193  hitchhiker  0.00112785 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2556  chromosome replication initiation inhibitor protein  34.62 
 
 		 311 aa  177  2e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000319404  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2358  chromosome replication initiation inhibitor protein  37 
 
 		 302 aa  176  3e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.17613  normal  0.155084 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3445  transcriptional regulator, ArgP, LysR family  32.89 
 
 		 321 aa  166  4e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2433  chromosome replication initiation inhibitor protein  34.45 
 
 		 302 aa  166  5e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1175  chromosome replication initiation inhibitor protein  38.44 
 
 		 297 aa  164  1.0000000000000001e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.578075  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1116  chromosome replication initiation inhibitor protein  38 
 
 		 297 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.472937 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3099  transcriptional regulator LysR family  35.37 
 
 		 301 aa  163  4.0000000000000004e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.109242  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0072  chromosome replication initiation inhibitor protein  36.18 
 
 		 303 aa  163  4.0000000000000004e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.608118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0091  chromosome replication initiation inhibitor protein  36.18 
 
 		 303 aa  163  4.0000000000000004e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.730131  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3693  chromosome replication initiation inhibitor protein  36.33 
 
 		 306 aa  162  5.0000000000000005e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3474  chromosome replication initiation inhibitor protein  36.61 
 
 		 316 aa  162  5.0000000000000005e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2962  chromosome replication initiation inhibitor protein  35.74 
 
 		 297 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0034  chromosome replication initiation inhibitor protein  33.68 
 
 		 298 aa  162  9e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0132  chromosome replication initiation inhibitor protein  36.2 
 
 		 305 aa  161  1e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.350257 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1337  chromosome replication initiation inhibitor protein  35.56 
 
 		 290 aa  160  2e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.449997  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1829  chromosome replication initiation inhibitor protein  36.23 
 
 		 297 aa  160  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.999172  hitchhiker  0.00188164 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2388  chromosome replication initiation inhibitor protein  35.22 
 
 		 297 aa  160  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00311135  hitchhiker  0.00401295 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0982  LysR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 300 aa  160  3e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4135  chromosome replication initiation inhibitor protein  34.08 
 
 		 298 aa  160  4e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.931472  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5298  chromosome replication initiation inhibitor protein  33.67 
 
 		 297 aa  156  3e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3148  chromosome replication initiation inhibitor protein  33.57 
 
 		 297 aa  156  4e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.99123  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1507  chromosome replication initiation inhibitor protein  34.89 
 
 		 297 aa  156  4e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0095  chromosome replication initiation inhibitor protein  35.14 
 
 		 304 aa  156  4e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.720683 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0036  chromosome replication initiation inhibitor protein  34.45 
 
 		 297 aa  155  8e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3139  chromosome replication initiation inhibitor protein  32.99 
 
 		 297 aa  155  8e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.677329  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1473  chromosome replication initiation inhibitor protein  31.84 
 
 		 297 aa  155  1e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0050  chromosome replication initiation inhibitor protein  34.45 
 
 		 297 aa  155  1e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0149  chromosome replication initiation inhibitor protein  34.8 
 
 		 304 aa  154  2e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.898117  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0399  chromosome replication initiation inhibitor protein  35.9 
 
 		 302 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2144  chromosome replication initiation inhibitor protein  34.32 
 
 		 297 aa  153  5e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.184842 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0034  chromosome replication initiation inhibitor protein  33.78 
 
 		 297 aa  152  5e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5007  chromosome replication initiation inhibitor protein  33.21 
 
 		 297 aa  152  5e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.633447  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4487  chromosome replication initiation inhibitor protein  32.65 
 
 		 297 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1538  chromosome replication initiation inhibitor protein  34.11 
 
 		 297 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3162  chromosome replication initiation inhibitor protein  34.98 
 
 		 303 aa  152  5.9999999999999996e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5123  chromosome replication initiation inhibitor protein  32.65 
 
 		 297 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5736  chromosome replication initiation inhibitor protein  32.65 
 
 		 297 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.18075 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1904  chromosome replication initiation inhibitor protein  37.17 
 
 		 289 aa  152  5.9999999999999996e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.188746 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0030  chromosome replication initiation inhibitor protein  34.11 
 
 		 297 aa  152  7e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002477  chromosome initiation inhibitor  32.43 
 
 		 298 aa  152  7e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0036  chromosome replication initiation inhibitor protein  34.11 
 
 		 297 aa  152  7e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1183  chromosome replication initiation inhibitor protein  34.11 
 
 		 297 aa  152  7e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.893969  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1463  chromosome replication initiation inhibitor protein  34.11 
 
 		 297 aa  152  7e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3409  transcriptional regulator ArgP, LysR family  34.47 
 
 		 299 aa  151  1e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.305012  normal  0.0118196 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2836  chromosome replication initiation inhibitor protein  34.24 
 
 		 301 aa  151  1e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.284111  normal  0.240548 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2509  chromosome replication initiation inhibitor protein  34.65 
 
 		 303 aa  149  4e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03558  chromosome replication initiation inhibitor protein  31.62 
 
 		 313 aa  149  6e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2384  transcriptional regulator, ArgP, LysR family  37.15 
 
 		 298 aa  149  8e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.758933 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1891  chromosome replication initiation inhibitor protein  37.09 
 
 		 306 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2974  chromosome replication initiation inhibitor protein  33 
 
 		 303 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0658  chromosome replication initiation inhibitor protein  33.78 
 
 		 310 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.117033  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2774  chromosome replication initiation inhibitor protein  34.02 
 
 		 295 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2012  chromosome replication initiation inhibitor protein  37.23 
 
 		 298 aa  147  3e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0364  chromosome replication initiation inhibitor protein  34.58 
 
 		 304 aa  146  5e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4934  chromosome replication initiation inhibitor protein  34.33 
 
 		 298 aa  146  5e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.72562  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0354  chromosome replication initiation inhibitor protein  34.58 
 
 		 304 aa  146  5e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.757564  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2085  chromosome replication initiation inhibitor protein  32.43 
 
 		 299 aa  146  5e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_5010  chromosome replication initiation inhibitor protein  33.82 
 
 		 305 aa  145  6e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.501331  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0983  chromosome replication initiation inhibitor protein  34.11 
 
 		 296 aa  145  6e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00028343 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3925  chromosome replication initiation inhibitor protein  33.1 
 
 		 297 aa  145  7.0000000000000006e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.567079  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3821  chromosome replication initiation inhibitor protein  32.77 
 
 		 302 aa  145  8.000000000000001e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.353961  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0854  chromosome replication initiation inhibitor protein  32.77 
 
 		 302 aa  145  8.000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00300239  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>