More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_4012 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_4012  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 		 284 aa  555  1e-157  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.725863 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0665  transcriptional regulator, LysR family  61.67 
 
 		 299 aa  327  2.0000000000000001e-88  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.409403  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1650  chromosome replication initiation inhibitor protein  55.83 
 
 		 298 aa  283  2.0000000000000002e-75  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.216692  normal  0.124746 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2242  transcriptional regulator, LysR family  56.63 
 
 		 292 aa  275  6e-73  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.124201  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21240  transcriptional regulator, ArgP family  52.43 
 
 		 300 aa  267  1e-70  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.100515 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3485  transcriptional regulator, ArgP, LysR family  55.27 
 
 		 299 aa  249  3e-65  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.493863 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2384  transcriptional regulator, ArgP, LysR family  52.25 
 
 		 298 aa  248  1e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.758933 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3123  chromosome replication initiation inhibitor protein  50.52 
 
 		 298 aa  246  4.9999999999999997e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.714101  hitchhiker  0.0033883 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3409  transcriptional regulator ArgP, LysR family  49.66 
 
 		 299 aa  245  6.999999999999999e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.305012  normal  0.0118196 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5932  chromosome replication initiation inhibitor protein  47.35 
 
 		 315 aa  237  2e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.112757 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5075  chromosome replication initiation inhibitor protein  49.82 
 
 		 288 aa  229  3e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0393  chromosome replication initiation inhibitor protein  47.06 
 
 		 293 aa  225  7e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0158  transcriptional regulator, ArgP, LysR family  46.24 
 
 		 292 aa  223  3e-57  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.804974 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4431  chromosome replication initiation inhibitor protein  50.69 
 
 		 293 aa  223  3e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.615047  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4638  transcriptional regulator, ArgP family  43.54 
 
 		 302 aa  221  8e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.199138  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0180  chromosome replication initiation inhibitor protein  46.08 
 
 		 301 aa  218  1e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.240236 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4796  chromosome replication initiation inhibitor protein  46.42 
 
 		 301 aa  217  1e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.43549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5388  chromosome replication initiation inhibitor protein  46.42 
 
 		 301 aa  217  1e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5473  chromosome replication initiation inhibitor protein  46.42 
 
 		 301 aa  217  1e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.259043  normal  0.391167 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1573  chromosome replication initiation inhibitor protein  45.24 
 
 		 318 aa  214  9.999999999999999e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.187685  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0269  chromosome replication initiation inhibitor protein  47.7 
 
 		 315 aa  214  9.999999999999999e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.875741 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1175  chromosome replication initiation inhibitor protein  46.58 
 
 		 297 aa  211  7.999999999999999e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.578075  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2836  chromosome replication initiation inhibitor protein  43.3 
 
 		 301 aa  211  1e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.284111  normal  0.240548 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0354  chromosome replication initiation inhibitor protein  48.06 
 
 		 304 aa  211  1e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.757564  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0364  chromosome replication initiation inhibitor protein  48.06 
 
 		 304 aa  211  1e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0375  chromosome replication initiation inhibitor protein  46.64 
 
 		 289 aa  210  2e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.868101 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4815  chromosome replication initiation inhibitor protein  45.39 
 
 		 301 aa  209  3e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.173708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2987  chromosome replication initiation inhibitor protein  42.76 
 
 		 299 aa  210  3e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5362  chromosome replication initiation inhibitor protein  45.39 
 
 		 301 aa  208  7e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.217291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0343  chromosome replication initiation inhibitor protein  47.7 
 
 		 304 aa  208  8e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3162  chromosome replication initiation inhibitor protein  44.03 
 
 		 303 aa  205  6e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0036  chromosome replication initiation inhibitor protein  42.07 
 
 		 297 aa  205  8e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0050  chromosome replication initiation inhibitor protein  42.07 
 
 		 297 aa  204  1e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2509  chromosome replication initiation inhibitor protein  43.99 
 
 		 303 aa  204  1e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3312  chromosome replication initiation inhibitor protein  44.71 
 
 		 301 aa  204  2e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.028913  normal  0.162228 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0362  chromosome replication initiation inhibitor protein  47.41 
 
 		 289 aa  203  2e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0453473 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1538  chromosome replication initiation inhibitor protein  41.72 
 
 		 297 aa  202  5e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0982  LysR family transcriptional regulator  45.24 
 
 		 300 aa  202  6e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4249  chromosome replication initiation inhibitor protein  48.62 
 
 		 298 aa  202  6e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.373423  normal  0.150215 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3862  chromosome replication initiation inhibitor protein  48.45 
 
 		 299 aa  202  7e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0030  chromosome replication initiation inhibitor protein  41.72 
 
 		 297 aa  202  7e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1463  chromosome replication initiation inhibitor protein  41.72 
 
 		 297 aa  202  7e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0036  chromosome replication initiation inhibitor protein  41.72 
 
 		 297 aa  202  7e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1183  chromosome replication initiation inhibitor protein  41.72 
 
 		 297 aa  202  7e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.893969  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5298  chromosome replication initiation inhibitor protein  42.91 
 
 		 297 aa  201  9e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2146  chromosome replication initiation inhibitor protein  43 
 
 		 323 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0429  chromosome replication initiation inhibitor protein  43.3 
 
 		 325 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0034  chromosome replication initiation inhibitor protein  42.52 
 
 		 297 aa  198  7e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1772  chromosome replication initiation inhibitor protein  42.61 
 
 		 325 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.188561  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5007  chromosome replication initiation inhibitor protein  42.16 
 
 		 297 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.633447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0336  chromosome replication initiation inhibitor protein  42.61 
 
 		 325 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2085  chromosome replication initiation inhibitor protein  39.31 
 
 		 299 aa  196  3e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1833  chromosome replication initiation inhibitor protein  42.61 
 
 		 325 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.565601  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1829  chromosome replication initiation inhibitor protein  40.77 
 
 		 297 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.999172  hitchhiker  0.00188164 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2099  chromosome replication initiation inhibitor protein  42.61 
 
 		 325 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1126  chromosome replication initiation inhibitor protein  42.61 
 
 		 325 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0698805  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3474  chromosome replication initiation inhibitor protein  43.23 
 
 		 316 aa  196  4.0000000000000005e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0835  chromosome replication initiation inhibitor protein  42.61 
 
 		 319 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0738995  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3148  chromosome replication initiation inhibitor protein  42.16 
 
 		 297 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.99123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12016  chromosome replication initiation inhibitor protein  45.14 
 
 		 303 aa  195  6e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4487  chromosome replication initiation inhibitor protein  40.83 
 
 		 297 aa  194  2e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3099  transcriptional regulator LysR family  43.75 
 
 		 301 aa  193  2e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.109242  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5123  chromosome replication initiation inhibitor protein  40.83 
 
 		 297 aa  194  2e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5736  chromosome replication initiation inhibitor protein  40.83 
 
 		 297 aa  194  2e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.18075 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2358  chromosome replication initiation inhibitor protein  42.71 
 
 		 302 aa  192  8e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.17613  normal  0.155084 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3139  chromosome replication initiation inhibitor protein  40.83 
 
 		 297 aa  191  1e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.677329  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2344  chromosome replication initiation inhibitor protein  38.03 
 
 		 305 aa  190  2e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0367629  hitchhiker  0.0000000918792 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2416  chromosome replication initiation inhibitor protein  38.03 
 
 		 305 aa  190  2e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.343193  hitchhiker  0.00112785 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1652  chromosome replication initiation inhibitor protein  38.03 
 
 		 305 aa  190  2e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.963239  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2866  chromosome replication initiation inhibitor protein  38.38 
 
 		 306 aa  189  5.999999999999999e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3749  transcriptional regulator, ArgP, LysR family  44.13 
 
 		 303 aa  189  5.999999999999999e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1085  chromosome replication initiation inhibitor protein  42.12 
 
 		 301 aa  187  2e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0282228  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1507  chromosome replication initiation inhibitor protein  41.99 
 
 		 297 aa  187  2e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3693  chromosome replication initiation inhibitor protein  45.02 
 
 		 306 aa  186  3e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2144  chromosome replication initiation inhibitor protein  41.11 
 
 		 297 aa  186  4e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.184842 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2974  chromosome replication initiation inhibitor protein  39.12 
 
 		 303 aa  186  5e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4178  chromosome replication initiation inhibitor protein  48.11 
 
 		 299 aa  185  6e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.257723  normal  0.264843 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1698  chromosome replication initiation inhibitor protein  38.14 
 
 		 309 aa  185  6e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.52148  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2962  chromosome replication initiation inhibitor protein  41.99 
 
 		 297 aa  185  9e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2434  chromosome replication initiation inhibitor protein  37.55 
 
 		 295 aa  185  9e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.609977  hitchhiker  0.000411507 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4371  chromosome replication initiation inhibitor protein  45.65 
 
 		 305 aa  184  1.0000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3863  chromosome replication initiation inhibitor protein  45.64 
 
 		 298 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.807931 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22020  transcriptional regulator  45.61 
 
 		 307 aa  184  1.0000000000000001e-45  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1399  chromosome replication initiation inhibitor protein  44.04 
 
 		 300 aa  182  4.0000000000000006e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2594  chromosome replication initiation inhibitor protein  38.36 
 
 		 311 aa  182  5.0000000000000004e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000186754  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11860  transcriptional regulator, ArgP family  43.39 
 
 		 313 aa  182  5.0000000000000004e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0109539  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1891  chromosome replication initiation inhibitor protein  42.96 
 
 		 306 aa  181  9.000000000000001e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0658  chromosome replication initiation inhibitor protein  41.2 
 
 		 310 aa  181  1e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.117033  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0195  transcriptional regulator, ArgP, LysR family  44.1 
 
 		 297 aa  180  2e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0559  chromosome replication initiation inhibitor protein  41.67 
 
 		 297 aa  180  2e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2671  chromosome replication initiation inhibitor protein  37.33 
 
 		 311 aa  181  2e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000215658  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1788  chromosome replication initiation inhibitor protein  37.33 
 
 		 311 aa  180  2e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000405332  unclonable  0.00000000000392786 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2123  chromosome replication initiation inhibitor protein  41.08 
 
 		 320 aa  179  4e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.876879 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2173  chromosome replication initiation inhibitor protein  35.74 
 
 		 297 aa  179  4.999999999999999e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.342879  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1704  chromosome replication initiation inhibitor protein  45.86 
 
 		 298 aa  179  5.999999999999999e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.305056  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3684  chromosome replication initiation inhibitor protein  41.11 
 
 		 297 aa  178  8e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1974  chromosome replication initiation inhibitor protein  36.69 
 
 		 296 aa  178  9e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0576454  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3878  chromosome replication initiation inhibitor protein  40.77 
 
 		 297 aa  178  1e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0857  chromosome replication initiation inhibitor protein  41.38 
 
 		 302 aa  177  1e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3821  chromosome replication initiation inhibitor protein  41.38 
 
 		 302 aa  177  1e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.353961  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>