More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0195 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_0195  transcriptional regulator, ArgP, LysR family  100 
 
 		 297 aa  589  1e-167  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0269  chromosome replication initiation inhibitor protein  49.32 
 
 		 315 aa  252  5.000000000000001e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.875741 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4431  chromosome replication initiation inhibitor protein  50.17 
 
 		 293 aa  235  7e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.615047  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0354  chromosome replication initiation inhibitor protein  45.27 
 
 		 304 aa  209  5e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.757564  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0364  chromosome replication initiation inhibitor protein  45.27 
 
 		 304 aa  209  5e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3409  transcriptional regulator ArgP, LysR family  43.23 
 
 		 299 aa  207  2e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.305012  normal  0.0118196 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2384  transcriptional regulator, ArgP, LysR family  44.93 
 
 		 298 aa  206  5e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.758933 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0343  chromosome replication initiation inhibitor protein  44.59 
 
 		 304 aa  204  1e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3123  chromosome replication initiation inhibitor protein  45.57 
 
 		 298 aa  204  1e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.714101  hitchhiker  0.0033883 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12016  chromosome replication initiation inhibitor protein  43.1 
 
 		 303 aa  203  2e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20750  transcriptional regulator  45.83 
 
 		 291 aa  201  9e-51  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.888774  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5075  chromosome replication initiation inhibitor protein  45.49 
 
 		 288 aa  193  3e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0158  transcriptional regulator, ArgP, LysR family  41.96 
 
 		 292 aa  190  2e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.804974 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1829  chromosome replication initiation inhibitor protein  44.52 
 
 		 297 aa  189  4e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.999172  hitchhiker  0.00188164 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2962  chromosome replication initiation inhibitor protein  44.88 
 
 		 297 aa  189  4e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0375  chromosome replication initiation inhibitor protein  41.89 
 
 		 289 aa  188  7e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.868101 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3485  transcriptional regulator, ArgP, LysR family  47.96 
 
 		 299 aa  188  1e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.493863 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0362  chromosome replication initiation inhibitor protein  43.62 
 
 		 289 aa  186  4e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0453473 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21240  transcriptional regulator, ArgP family  46.18 
 
 		 300 aa  186  4e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.100515 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1507  chromosome replication initiation inhibitor protein  44.52 
 
 		 297 aa  186  4e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22020  transcriptional regulator  44.11 
 
 		 307 aa  184  1.0000000000000001e-45  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5298  chromosome replication initiation inhibitor protein  41.58 
 
 		 297 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4638  transcriptional regulator, ArgP family  42.67 
 
 		 302 aa  181  9.000000000000001e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.199138  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4012  transcriptional regulator, LysR family  44.1 
 
 		 284 aa  180  2e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.725863 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1085  chromosome replication initiation inhibitor protein  42.09 
 
 		 301 aa  179  4e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0282228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0050  chromosome replication initiation inhibitor protein  40.33 
 
 		 297 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0036  chromosome replication initiation inhibitor protein  40.86 
 
 		 297 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3139  chromosome replication initiation inhibitor protein  40.92 
 
 		 297 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.677329  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0034  chromosome replication initiation inhibitor protein  41.53 
 
 		 297 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4487  chromosome replication initiation inhibitor protein  40.59 
 
 		 297 aa  177  1e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5123  chromosome replication initiation inhibitor protein  40.59 
 
 		 297 aa  177  1e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5736  chromosome replication initiation inhibitor protein  40.59 
 
 		 297 aa  177  1e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.18075 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5932  chromosome replication initiation inhibitor protein  39.53 
 
 		 315 aa  177  1e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.112757 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2242  transcriptional regulator, LysR family  44.96 
 
 		 292 aa  176  3e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.124201  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0030  chromosome replication initiation inhibitor protein  40.33 
 
 		 297 aa  176  5e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1183  chromosome replication initiation inhibitor protein  40.33 
 
 		 297 aa  176  5e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.893969  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0036  chromosome replication initiation inhibitor protein  40.33 
 
 		 297 aa  176  5e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1463  chromosome replication initiation inhibitor protein  40.33 
 
 		 297 aa  176  5e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1538  chromosome replication initiation inhibitor protein  40.86 
 
 		 297 aa  176  6e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1650  chromosome replication initiation inhibitor protein  41.36 
 
 		 298 aa  175  7e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.216692  normal  0.124746 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3148  chromosome replication initiation inhibitor protein  40.59 
 
 		 297 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.99123  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5007  chromosome replication initiation inhibitor protein  40.59 
 
 		 297 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.633447  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2085  chromosome replication initiation inhibitor protein  36.21 
 
 		 299 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0982  LysR family transcriptional regulator  41.86 
 
 		 300 aa  173  3.9999999999999995e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0393  chromosome replication initiation inhibitor protein  42.41 
 
 		 293 aa  172  5.999999999999999e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3162  chromosome replication initiation inhibitor protein  41 
 
 		 303 aa  172  6.999999999999999e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2509  chromosome replication initiation inhibitor protein  41 
 
 		 303 aa  172  6.999999999999999e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1175  chromosome replication initiation inhibitor protein  40.2 
 
 		 297 aa  171  2e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.578075  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2987  chromosome replication initiation inhibitor protein  39.14 
 
 		 299 aa  170  3e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0665  transcriptional regulator, LysR family  40.2 
 
 		 299 aa  169  3e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.409403  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1399  chromosome replication initiation inhibitor protein  43.55 
 
 		 300 aa  167  2e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1844  chromosome replication initiation inhibitor protein  38.82 
 
 		 295 aa  167  2e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.225634  normal  0.103464 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2774  chromosome replication initiation inhibitor protein  43.67 
 
 		 295 aa  166  4e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3099  transcriptional regulator LysR family  39.12 
 
 		 301 aa  165  9e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.109242  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1904  chromosome replication initiation inhibitor protein  42 
 
 		 289 aa  165  9e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.188746 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1891  chromosome replication initiation inhibitor protein  38.85 
 
 		 306 aa  163  4.0000000000000004e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2836  chromosome replication initiation inhibitor protein  37.29 
 
 		 301 aa  162  6e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.284111  normal  0.240548 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2434  chromosome replication initiation inhibitor protein  38.81 
 
 		 295 aa  162  8.000000000000001e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.609977  hitchhiker  0.000411507 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1788  chromosome replication initiation inhibitor protein  37.62 
 
 		 311 aa  162  9e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000405332  unclonable  0.00000000000392786 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3749  transcriptional regulator, ArgP, LysR family  39.1 
 
 		 303 aa  161  1e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4249  chromosome replication initiation inhibitor protein  43.23 
 
 		 298 aa  160  2e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.373423  normal  0.150215 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2556  chromosome replication initiation inhibitor protein  37.62 
 
 		 311 aa  161  2e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000319404  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2671  chromosome replication initiation inhibitor protein  37.62 
 
 		 311 aa  160  2e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000215658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2594  chromosome replication initiation inhibitor protein  37.62 
 
 		 311 aa  160  3e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000186754  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1974  chromosome replication initiation inhibitor protein  34.67 
 
 		 296 aa  159  6e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0576454  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3225  chromosome replication initiation inhibitor protein  37.89 
 
 		 297 aa  159  8e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0441076  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3302  chromosome replication initiation inhibitor protein  37.89 
 
 		 297 aa  159  8e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.779303  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3299  chromosome replication initiation inhibitor protein  37.89 
 
 		 297 aa  159  8e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.335083  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3237  chromosome replication initiation inhibitor protein  37.89 
 
 		 297 aa  159  8e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3334  chromosome replication initiation inhibitor protein  38.1 
 
 		 297 aa  158  9e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.197754  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0559  chromosome replication initiation inhibitor protein  37.89 
 
 		 297 aa  158  1e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3445  transcriptional regulator, ArgP, LysR family  37.87 
 
 		 321 aa  158  1e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4796  chromosome replication initiation inhibitor protein  37.28 
 
 		 301 aa  158  1e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.43549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4491  chromosome replication initiation inhibitor protein  38.44 
 
 		 309 aa  158  1e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.965976 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2173  chromosome replication initiation inhibitor protein  37.5 
 
 		 297 aa  158  1e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.342879  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0518  chromosome replication initiation inhibitor protein  38.25 
 
 		 297 aa  158  1e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5388  chromosome replication initiation inhibitor protein  37.28 
 
 		 301 aa  158  1e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5473  chromosome replication initiation inhibitor protein  37.28 
 
 		 301 aa  158  1e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.259043  normal  0.391167 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3404  chromosome replication initiation inhibitor protein  37.89 
 
 		 297 aa  158  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.269089  normal  0.216257 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1698  chromosome replication initiation inhibitor protein  37.34 
 
 		 309 aa  157  2e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.52148  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3862  chromosome replication initiation inhibitor protein  43.19 
 
 		 299 aa  157  2e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0857  chromosome replication initiation inhibitor protein  37.89 
 
 		 302 aa  157  2e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0854  chromosome replication initiation inhibitor protein  37.89 
 
 		 302 aa  157  2e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00300239  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3821  chromosome replication initiation inhibitor protein  37.89 
 
 		 302 aa  157  2e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.353961  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2866  chromosome replication initiation inhibitor protein  37.34 
 
 		 306 aa  156  3e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0180  chromosome replication initiation inhibitor protein  36.59 
 
 		 301 aa  156  3e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.240236 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0034  chromosome replication initiation inhibitor protein  35.05 
 
 		 298 aa  157  3e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02747  chromosome replication initiation inhibitor protein  37.89 
 
 		 297 aa  156  4e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0777  transcriptional regulator, ArgP, LysR family  37.89 
 
 		 297 aa  156  4e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3052  chromosome replication initiation inhibitor protein  37.89 
 
 		 297 aa  156  4e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02710  hypothetical protein  37.89 
 
 		 297 aa  156  4e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3312  chromosome replication initiation inhibitor protein  36.93 
 
 		 301 aa  156  4e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.028913  normal  0.162228 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0794  chromosome replication initiation inhibitor protein  37.89 
 
 		 297 aa  156  4e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4212  chromosome replication initiation inhibitor protein  37.89 
 
 		 297 aa  156  4e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.307213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3074  chromosome replication initiation inhibitor protein  37.89 
 
 		 297 aa  156  4e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.093516  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3336  chromosome replication initiation inhibitor protein  37.89 
 
 		 297 aa  156  4e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3243  chromosome replication initiation inhibitor protein  37.89 
 
 		 297 aa  156  4e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.361223  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3925  chromosome replication initiation inhibitor protein  37.89 
 
 		 297 aa  155  7e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.567079  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4815  chromosome replication initiation inhibitor protein  36.93 
 
 		 301 aa  155  7e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.173708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3518  chromosome replication initiation inhibitor protein  40.15 
 
 		 312 aa  155  8e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>