More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5932 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_5932  chromosome replication initiation inhibitor protein  100 
 
 		 315 aa  627  1e-179  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.112757 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3409  transcriptional regulator ArgP, LysR family  54.87 
 
 		 299 aa  299  3e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.305012  normal  0.0118196 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5075  chromosome replication initiation inhibitor protein  53.8 
 
 		 288 aa  288  1e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2384  transcriptional regulator, ArgP, LysR family  48.23 
 
 		 298 aa  258  8e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.758933 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0665  transcriptional regulator, LysR family  48.56 
 
 		 299 aa  252  7e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.409403  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4012  transcriptional regulator, LysR family  47.68 
 
 		 284 aa  243  3.9999999999999997e-63  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.725863 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1650  chromosome replication initiation inhibitor protein  51.24 
 
 		 298 aa  240  2e-62  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.216692  normal  0.124746 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2242  transcriptional regulator, LysR family  49.33 
 
 		 292 aa  235  7e-61  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.124201  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3123  chromosome replication initiation inhibitor protein  41.85 
 
 		 298 aa  231  1e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.714101  hitchhiker  0.0033883 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21240  transcriptional regulator, ArgP family  44.34 
 
 		 300 aa  222  4.9999999999999996e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.100515 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0269  chromosome replication initiation inhibitor protein  41.72 
 
 		 315 aa  215  5.9999999999999996e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.875741 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2974  chromosome replication initiation inhibitor protein  40.65 
 
 		 303 aa  212  7e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0354  chromosome replication initiation inhibitor protein  43.09 
 
 		 304 aa  212  7.999999999999999e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.757564  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0364  chromosome replication initiation inhibitor protein  43.09 
 
 		 304 aa  212  7.999999999999999e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0343  chromosome replication initiation inhibitor protein  42.48 
 
 		 304 aa  211  1e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2144  chromosome replication initiation inhibitor protein  41.38 
 
 		 297 aa  211  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.184842 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0393  chromosome replication initiation inhibitor protein  44.3 
 
 		 293 aa  208  1e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2836  chromosome replication initiation inhibitor protein  38.89 
 
 		 301 aa  207  2e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.284111  normal  0.240548 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4638  transcriptional regulator, ArgP family  41.4 
 
 		 302 aa  205  7e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.199138  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3485  transcriptional regulator, ArgP, LysR family  46.64 
 
 		 299 aa  203  3e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.493863 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0982  LysR family transcriptional regulator  42.18 
 
 		 300 aa  203  4e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2509  chromosome replication initiation inhibitor protein  40.13 
 
 		 303 aa  198  9e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0180  chromosome replication initiation inhibitor protein  37.86 
 
 		 301 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.240236 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3162  chromosome replication initiation inhibitor protein  40.91 
 
 		 303 aa  198  1.0000000000000001e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2085  chromosome replication initiation inhibitor protein  37.01 
 
 		 299 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1085  chromosome replication initiation inhibitor protein  39.53 
 
 		 301 aa  197  2.0000000000000003e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0282228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3862  chromosome replication initiation inhibitor protein  42.27 
 
 		 299 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3099  transcriptional regulator LysR family  41.61 
 
 		 301 aa  197  2.0000000000000003e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.109242  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0034  chromosome replication initiation inhibitor protein  40.94 
 
 		 297 aa  197  3e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3312  chromosome replication initiation inhibitor protein  37.86 
 
 		 301 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.028913  normal  0.162228 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5298  chromosome replication initiation inhibitor protein  40.56 
 
 		 297 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5362  chromosome replication initiation inhibitor protein  39.16 
 
 		 301 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.217291  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4796  chromosome replication initiation inhibitor protein  38.51 
 
 		 301 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.43549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5388  chromosome replication initiation inhibitor protein  38.51 
 
 		 301 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5473  chromosome replication initiation inhibitor protein  38.51 
 
 		 301 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.259043  normal  0.391167 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4249  chromosome replication initiation inhibitor protein  41.96 
 
 		 298 aa  196  6e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.373423  normal  0.150215 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5123  chromosome replication initiation inhibitor protein  40.21 
 
 		 297 aa  195  7e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4487  chromosome replication initiation inhibitor protein  40.21 
 
 		 297 aa  195  7e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5736  chromosome replication initiation inhibitor protein  40.21 
 
 		 297 aa  195  7e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.18075 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4815  chromosome replication initiation inhibitor protein  38.19 
 
 		 301 aa  195  9e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.173708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12016  chromosome replication initiation inhibitor protein  40.45 
 
 		 303 aa  195  1e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1891  chromosome replication initiation inhibitor protein  39.67 
 
 		 306 aa  194  1e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0158  transcriptional regulator, ArgP, LysR family  42.52 
 
 		 292 aa  194  1e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.804974 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4431  chromosome replication initiation inhibitor protein  44.33 
 
 		 293 aa  194  2e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.615047  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3139  chromosome replication initiation inhibitor protein  40.21 
 
 		 297 aa  193  3e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.677329  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5007  chromosome replication initiation inhibitor protein  40.56 
 
 		 297 aa  193  3e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.633447  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1829  chromosome replication initiation inhibitor protein  40.07 
 
 		 297 aa  192  4e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.999172  hitchhiker  0.00188164 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0036  chromosome replication initiation inhibitor protein  38.26 
 
 		 297 aa  192  6e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0375  chromosome replication initiation inhibitor protein  42.25 
 
 		 289 aa  192  6e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.868101 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2146  chromosome replication initiation inhibitor protein  39.16 
 
 		 323 aa  192  7e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2962  chromosome replication initiation inhibitor protein  39.67 
 
 		 297 aa  192  9e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3148  chromosome replication initiation inhibitor protein  40.56 
 
 		 297 aa  191  1e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.99123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0050  chromosome replication initiation inhibitor protein  38.26 
 
 		 297 aa  191  1e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1175  chromosome replication initiation inhibitor protein  42.5 
 
 		 297 aa  191  1e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.578075  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2388  chromosome replication initiation inhibitor protein  40.57 
 
 		 297 aa  191  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00311135  hitchhiker  0.00401295 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1507  chromosome replication initiation inhibitor protein  40.2 
 
 		 297 aa  191  2e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3699  chromosome replication initiation inhibitor protein  39.94 
 
 		 297 aa  189  7e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.792839 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4178  chromosome replication initiation inhibitor protein  43.14 
 
 		 299 aa  188  1e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.257723  normal  0.264843 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1772  chromosome replication initiation inhibitor protein  38.31 
 
 		 325 aa  188  1e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.188561  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0429  chromosome replication initiation inhibitor protein  38.31 
 
 		 325 aa  188  1e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0336  chromosome replication initiation inhibitor protein  38.31 
 
 		 325 aa  188  1e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1833  chromosome replication initiation inhibitor protein  38.31 
 
 		 325 aa  187  2e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.565601  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1538  chromosome replication initiation inhibitor protein  38.59 
 
 		 297 aa  187  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2099  chromosome replication initiation inhibitor protein  38.31 
 
 		 325 aa  187  2e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1126  chromosome replication initiation inhibitor protein  38.31 
 
 		 325 aa  187  2e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0698805  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1573  chromosome replication initiation inhibitor protein  38.89 
 
 		 318 aa  187  2e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.187685  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0835  chromosome replication initiation inhibitor protein  38.31 
 
 		 319 aa  187  2e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0738995  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4164  chromosome replication initiation inhibitor protein  40.2 
 
 		 299 aa  187  2e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.221393  normal  0.317315 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1704  chromosome replication initiation inhibitor protein  40.96 
 
 		 298 aa  186  3e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.305056  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1463  chromosome replication initiation inhibitor protein  38.59 
 
 		 297 aa  186  4e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0030  chromosome replication initiation inhibitor protein  38.59 
 
 		 297 aa  186  4e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1183  chromosome replication initiation inhibitor protein  38.59 
 
 		 297 aa  186  4e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.893969  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0036  chromosome replication initiation inhibitor protein  38.59 
 
 		 297 aa  186  4e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4371  chromosome replication initiation inhibitor protein  42.81 
 
 		 305 aa  185  1.0000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3693  chromosome replication initiation inhibitor protein  41.55 
 
 		 306 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20750  transcriptional regulator  39.74 
 
 		 291 aa  184  2.0000000000000003e-45  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.888774  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0362  chromosome replication initiation inhibitor protein  40.54 
 
 		 289 aa  183  3e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0453473 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2012  chromosome replication initiation inhibitor protein  41.36 
 
 		 298 aa  182  5.0000000000000004e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3474  chromosome replication initiation inhibitor protein  37.86 
 
 		 316 aa  182  5.0000000000000004e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3863  chromosome replication initiation inhibitor protein  40.34 
 
 		 298 aa  182  7e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.807931 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1399  chromosome replication initiation inhibitor protein  39.6 
 
 		 300 aa  180  2.9999999999999997e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0195  transcriptional regulator, ArgP, LysR family  40.88 
 
 		 297 aa  180  2.9999999999999997e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0658  chromosome replication initiation inhibitor protein  39.14 
 
 		 310 aa  179  5.999999999999999e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.117033  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4491  chromosome replication initiation inhibitor protein  39.24 
 
 		 309 aa  179  5.999999999999999e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.965976 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3518  chromosome replication initiation inhibitor protein  40.14 
 
 		 312 aa  178  1e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1116  chromosome replication initiation inhibitor protein  38.1 
 
 		 297 aa  176  5e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.472937 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2344  chromosome replication initiation inhibitor protein  34.85 
 
 		 305 aa  175  9e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0367629  hitchhiker  0.0000000918792 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0983  chromosome replication initiation inhibitor protein  36.84 
 
 		 296 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00028343 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3445  transcriptional regulator, ArgP, LysR family  36.57 
 
 		 321 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0880  chromosome replication initiation inhibitor protein  36.45 
 
 		 284 aa  174  9.999999999999999e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1652  chromosome replication initiation inhibitor protein  35.5 
 
 		 305 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.963239  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1904  chromosome replication initiation inhibitor protein  42.24 
 
 		 289 aa  174  9.999999999999999e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.188746 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2123  chromosome replication initiation inhibitor protein  38.82 
 
 		 320 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.876879 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2416  chromosome replication initiation inhibitor protein  34.85 
 
 		 305 aa  173  3.9999999999999995e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.343193  hitchhiker  0.00112785 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4471  chromosome replication initiation inhibitor protein  36.99 
 
 		 296 aa  172  5.999999999999999e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.134322 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2987  chromosome replication initiation inhibitor protein  35.46 
 
 		 299 aa  172  7.999999999999999e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4934  chromosome replication initiation inhibitor protein  38.1 
 
 		 298 aa  171  1e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.72562  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1974  chromosome replication initiation inhibitor protein  34.71 
 
 		 296 aa  171  1e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0576454  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2866  chromosome replication initiation inhibitor protein  34.53 
 
 		 306 aa  171  2e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3749  transcriptional regulator, ArgP, LysR family  36.1 
 
 		 303 aa  170  2e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>