More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5075 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_5075  chromosome replication initiation inhibitor protein  100 
 
 		 288 aa  567  1e-160  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3409  transcriptional regulator ArgP, LysR family  52.84 
 
 		 299 aa  283  2.0000000000000002e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.305012  normal  0.0118196 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5932  chromosome replication initiation inhibitor protein  53.8 
 
 		 315 aa  282  5.000000000000001e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.112757 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1650  chromosome replication initiation inhibitor protein  50.55 
 
 		 298 aa  243  1.9999999999999999e-63  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.216692  normal  0.124746 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2384  transcriptional regulator, ArgP, LysR family  49.48 
 
 		 298 aa  243  1.9999999999999999e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.758933 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4012  transcriptional regulator, LysR family  49.82 
 
 		 284 aa  229  4e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.725863 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2242  transcriptional regulator, LysR family  49.45 
 
 		 292 aa  223  3e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.124201  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0665  transcriptional regulator, LysR family  46.83 
 
 		 299 aa  219  3.9999999999999997e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.409403  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21240  transcriptional regulator, ArgP family  48.7 
 
 		 300 aa  208  7e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.100515 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0393  chromosome replication initiation inhibitor protein  43.6 
 
 		 293 aa  206  4e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4431  chromosome replication initiation inhibitor protein  46.48 
 
 		 293 aa  205  8e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.615047  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3123  chromosome replication initiation inhibitor protein  42.61 
 
 		 298 aa  202  4e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.714101  hitchhiker  0.0033883 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3485  transcriptional regulator, ArgP, LysR family  50.38 
 
 		 299 aa  200  1.9999999999999998e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.493863 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0158  transcriptional regulator, ArgP, LysR family  44.04 
 
 		 292 aa  197  2.0000000000000003e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.804974 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0982  LysR family transcriptional regulator  44.41 
 
 		 300 aa  195  7e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0195  transcriptional regulator, ArgP, LysR family  45.49 
 
 		 297 aa  193  3e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2085  chromosome replication initiation inhibitor protein  36.3 
 
 		 299 aa  192  4e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0343  chromosome replication initiation inhibitor protein  43.49 
 
 		 304 aa  190  2e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1891  chromosome replication initiation inhibitor protein  42.11 
 
 		 306 aa  189  4e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0354  chromosome replication initiation inhibitor protein  43.69 
 
 		 304 aa  189  4e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.757564  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0364  chromosome replication initiation inhibitor protein  43.69 
 
 		 304 aa  189  4e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2974  chromosome replication initiation inhibitor protein  39.73 
 
 		 303 aa  189  5e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0269  chromosome replication initiation inhibitor protein  41.96 
 
 		 315 aa  188  1e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.875741 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12016  chromosome replication initiation inhibitor protein  42.91 
 
 		 303 aa  187  2e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2144  chromosome replication initiation inhibitor protein  38 
 
 		 297 aa  186  5e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.184842 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3862  chromosome replication initiation inhibitor protein  43.1 
 
 		 299 aa  185  8e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1085  chromosome replication initiation inhibitor protein  40.77 
 
 		 301 aa  183  3e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0282228  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2388  chromosome replication initiation inhibitor protein  38.67 
 
 		 297 aa  183  3e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00311135  hitchhiker  0.00401295 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3863  chromosome replication initiation inhibitor protein  44.78 
 
 		 298 aa  183  3e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.807931 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4164  chromosome replication initiation inhibitor protein  39.53 
 
 		 299 aa  182  6e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.221393  normal  0.317315 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0362  chromosome replication initiation inhibitor protein  44.11 
 
 		 289 aa  181  1e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0453473 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0375  chromosome replication initiation inhibitor protein  41.73 
 
 		 289 aa  181  1e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.868101 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3099  transcriptional regulator LysR family  41.63 
 
 		 301 aa  181  1e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.109242  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4249  chromosome replication initiation inhibitor protein  45.27 
 
 		 298 aa  181  1e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.373423  normal  0.150215 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4178  chromosome replication initiation inhibitor protein  44.33 
 
 		 299 aa  179  4.999999999999999e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.257723  normal  0.264843 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1507  chromosome replication initiation inhibitor protein  42.51 
 
 		 297 aa  177  1e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1175  chromosome replication initiation inhibitor protein  41.34 
 
 		 297 aa  177  2e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.578075  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2962  chromosome replication initiation inhibitor protein  41.11 
 
 		 297 aa  177  2e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4638  transcriptional regulator, ArgP family  37.12 
 
 		 302 aa  176  4e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.199138  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2434  chromosome replication initiation inhibitor protein  37.87 
 
 		 295 aa  176  5e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.609977  hitchhiker  0.000411507 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2671  chromosome replication initiation inhibitor protein  38.24 
 
 		 311 aa  176  5e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000215658  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1788  chromosome replication initiation inhibitor protein  38.24 
 
 		 311 aa  176  6e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000405332  unclonable  0.00000000000392786 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4796  chromosome replication initiation inhibitor protein  39.72 
 
 		 301 aa  175  8e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.43549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5388  chromosome replication initiation inhibitor protein  39.72 
 
 		 301 aa  175  8e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5473  chromosome replication initiation inhibitor protein  39.72 
 
 		 301 aa  175  8e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.259043  normal  0.391167 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1829  chromosome replication initiation inhibitor protein  41.85 
 
 		 297 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.999172  hitchhiker  0.00188164 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4815  chromosome replication initiation inhibitor protein  38.79 
 
 		 301 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.173708  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0180  chromosome replication initiation inhibitor protein  38.43 
 
 		 301 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.240236 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2594  chromosome replication initiation inhibitor protein  37.91 
 
 		 311 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000186754  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5362  chromosome replication initiation inhibitor protein  39.36 
 
 		 301 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.217291  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2509  chromosome replication initiation inhibitor protein  40.41 
 
 		 303 aa  173  2.9999999999999996e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1844  chromosome replication initiation inhibitor protein  37.5 
 
 		 295 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.225634  normal  0.103464 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2556  chromosome replication initiation inhibitor protein  37.71 
 
 		 311 aa  172  3.9999999999999995e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000319404  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2836  chromosome replication initiation inhibitor protein  38.23 
 
 		 301 aa  172  3.9999999999999995e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.284111  normal  0.240548 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3162  chromosome replication initiation inhibitor protein  40.62 
 
 		 303 aa  172  3.9999999999999995e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0036  chromosome replication initiation inhibitor protein  39.24 
 
 		 297 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22020  transcriptional regulator  42.37 
 
 		 307 aa  171  9e-42  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2146  chromosome replication initiation inhibitor protein  38.79 
 
 		 323 aa  171  1e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3312  chromosome replication initiation inhibitor protein  38.79 
 
 		 301 aa  171  1e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.028913  normal  0.162228 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1704  chromosome replication initiation inhibitor protein  43.02 
 
 		 298 aa  170  2e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.305056  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2344  chromosome replication initiation inhibitor protein  36.24 
 
 		 305 aa  171  2e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0367629  hitchhiker  0.0000000918792 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2416  chromosome replication initiation inhibitor protein  36.24 
 
 		 305 aa  170  2e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.343193  hitchhiker  0.00112785 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0429  chromosome replication initiation inhibitor protein  38.79 
 
 		 325 aa  170  2e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1652  chromosome replication initiation inhibitor protein  37.25 
 
 		 305 aa  171  2e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.963239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0050  chromosome replication initiation inhibitor protein  39.24 
 
 		 297 aa  171  2e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1126  chromosome replication initiation inhibitor protein  38.79 
 
 		 325 aa  170  3e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0698805  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1833  chromosome replication initiation inhibitor protein  38.79 
 
 		 325 aa  170  3e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.565601  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1538  chromosome replication initiation inhibitor protein  38.19 
 
 		 297 aa  170  3e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2099  chromosome replication initiation inhibitor protein  38.79 
 
 		 325 aa  170  3e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0835  chromosome replication initiation inhibitor protein  38.79 
 
 		 319 aa  170  3e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0738995  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2012  chromosome replication initiation inhibitor protein  43.02 
 
 		 298 aa  169  4e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1772  chromosome replication initiation inhibitor protein  38.43 
 
 		 325 aa  169  6e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.188561  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0034  chromosome replication initiation inhibitor protein  38.68 
 
 		 297 aa  169  6e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0336  chromosome replication initiation inhibitor protein  38.43 
 
 		 325 aa  169  6e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0036  chromosome replication initiation inhibitor protein  38.19 
 
 		 297 aa  169  7e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20750  transcriptional regulator  41.11 
 
 		 291 aa  169  7e-41  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.888774  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0030  chromosome replication initiation inhibitor protein  38.19 
 
 		 297 aa  169  7e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1698  chromosome replication initiation inhibitor protein  36.09 
 
 		 309 aa  169  7e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.52148  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1183  chromosome replication initiation inhibitor protein  38.19 
 
 		 297 aa  169  7e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.893969  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1463  chromosome replication initiation inhibitor protein  38.19 
 
 		 297 aa  169  7e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3445  transcriptional regulator, ArgP, LysR family  39.37 
 
 		 321 aa  168  9e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2866  chromosome replication initiation inhibitor protein  35.91 
 
 		 306 aa  167  1e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0658  chromosome replication initiation inhibitor protein  38.21 
 
 		 310 aa  168  1e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.117033  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1904  chromosome replication initiation inhibitor protein  41.79 
 
 		 289 aa  168  1e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.188746 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1399  chromosome replication initiation inhibitor protein  41.67 
 
 		 300 aa  167  2e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1974  chromosome replication initiation inhibitor protein  34.14 
 
 		 296 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0576454  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2358  chromosome replication initiation inhibitor protein  39.22 
 
 		 302 aa  167  2.9999999999999998e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.17613  normal  0.155084 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3693  chromosome replication initiation inhibitor protein  40.91 
 
 		 306 aa  166  5e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0711  chromosome replication initiation inhibitor protein  41.61 
 
 		 308 aa  165  8e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5298  chromosome replication initiation inhibitor protein  38.58 
 
 		 297 aa  165  8e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2173  chromosome replication initiation inhibitor protein  34.56 
 
 		 297 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.342879  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4487  chromosome replication initiation inhibitor protein  37.45 
 
 		 297 aa  163  3e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4371  chromosome replication initiation inhibitor protein  41.7 
 
 		 305 aa  163  3e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5123  chromosome replication initiation inhibitor protein  37.45 
 
 		 297 aa  163  3e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5736  chromosome replication initiation inhibitor protein  37.45 
 
 		 297 aa  163  3e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.18075 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5007  chromosome replication initiation inhibitor protein  37.83 
 
 		 297 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.633447  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3148  chromosome replication initiation inhibitor protein  37.83 
 
 		 297 aa  161  1e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.99123  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2987  chromosome replication initiation inhibitor protein  35.07 
 
 		 299 aa  161  1e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3518  chromosome replication initiation inhibitor protein  39.77 
 
 		 312 aa  159  5e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3139  chromosome replication initiation inhibitor protein  36.7 
 
 		 297 aa  158  9e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.677329  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>