More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4431 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_4431  chromosome replication initiation inhibitor protein  100 
 
 		 293 aa  570  1e-161  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.615047  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0269  chromosome replication initiation inhibitor protein  54.39 
 
 		 315 aa  288  8e-77  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.875741 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22020  transcriptional regulator  50.69 
 
 		 307 aa  241  9e-63  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20750  transcriptional regulator  50.17 
 
 		 291 aa  239  2.9999999999999997e-62  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.888774  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0195  transcriptional regulator, ArgP, LysR family  50.17 
 
 		 297 aa  235  7e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0665  transcriptional regulator, LysR family  50.68 
 
 		 299 aa  231  9e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.409403  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3409  transcriptional regulator ArgP, LysR family  44.59 
 
 		 299 aa  231  1e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.305012  normal  0.0118196 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2384  transcriptional regulator, ArgP, LysR family  48.6 
 
 		 298 aa  225  6e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.758933 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4012  transcriptional regulator, LysR family  50.69 
 
 		 284 aa  223  3e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.725863 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21240  transcriptional regulator, ArgP family  47.72 
 
 		 300 aa  217  2e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.100515 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3123  chromosome replication initiation inhibitor protein  44.93 
 
 		 298 aa  216  2.9999999999999998e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.714101  hitchhiker  0.0033883 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0364  chromosome replication initiation inhibitor protein  48.25 
 
 		 304 aa  215  9e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0354  chromosome replication initiation inhibitor protein  48.25 
 
 		 304 aa  215  9e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.757564  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0343  chromosome replication initiation inhibitor protein  47.55 
 
 		 304 aa  210  2e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0375  chromosome replication initiation inhibitor protein  47.32 
 
 		 289 aa  207  1e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.868101 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1650  chromosome replication initiation inhibitor protein  46.96 
 
 		 298 aa  207  2e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.216692  normal  0.124746 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5075  chromosome replication initiation inhibitor protein  46.48 
 
 		 288 aa  205  8e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4638  transcriptional regulator, ArgP family  41.53 
 
 		 302 aa  204  1e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.199138  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2242  transcriptional regulator, LysR family  48.03 
 
 		 292 aa  201  9.999999999999999e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.124201  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1175  chromosome replication initiation inhibitor protein  43 
 
 		 297 aa  198  9e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.578075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0158  transcriptional regulator, ArgP, LysR family  44.41 
 
 		 292 aa  197  1.0000000000000001e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.804974 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2085  chromosome replication initiation inhibitor protein  40.75 
 
 		 299 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12016  chromosome replication initiation inhibitor protein  44.76 
 
 		 303 aa  195  7e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0982  LysR family transcriptional regulator  43.84 
 
 		 300 aa  192  8e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4796  chromosome replication initiation inhibitor protein  40.48 
 
 		 301 aa  189  4e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.43549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5388  chromosome replication initiation inhibitor protein  40.48 
 
 		 301 aa  189  4e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5473  chromosome replication initiation inhibitor protein  40.48 
 
 		 301 aa  189  4e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.259043  normal  0.391167 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1891  chromosome replication initiation inhibitor protein  43.2 
 
 		 306 aa  189  5e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0362  chromosome replication initiation inhibitor protein  46.55 
 
 		 289 aa  189  5.999999999999999e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0453473 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3485  transcriptional regulator, ArgP, LysR family  49.43 
 
 		 299 aa  188  7e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.493863 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0180  chromosome replication initiation inhibitor protein  39.8 
 
 		 301 aa  187  2e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.240236 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5932  chromosome replication initiation inhibitor protein  42.11 
 
 		 315 aa  187  2e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.112757 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5362  chromosome replication initiation inhibitor protein  40.4 
 
 		 301 aa  186  3e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.217291  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4815  chromosome replication initiation inhibitor protein  39.8 
 
 		 301 aa  186  3e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.173708  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3312  chromosome replication initiation inhibitor protein  39.8 
 
 		 301 aa  185  7e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.028913  normal  0.162228 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1085  chromosome replication initiation inhibitor protein  42.47 
 
 		 301 aa  185  7e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0282228  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0393  chromosome replication initiation inhibitor protein  40.96 
 
 		 293 aa  184  1.0000000000000001e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3445  transcriptional regulator, ArgP, LysR family  40.55 
 
 		 321 aa  183  2.0000000000000003e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3162  chromosome replication initiation inhibitor protein  41.38 
 
 		 303 aa  183  3e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1974  chromosome replication initiation inhibitor protein  36.36 
 
 		 296 aa  182  4.0000000000000006e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0576454  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3099  transcriptional regulator LysR family  44.25 
 
 		 301 aa  182  7e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.109242  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2509  chromosome replication initiation inhibitor protein  41.18 
 
 		 303 aa  181  9.000000000000001e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3518  chromosome replication initiation inhibitor protein  43.98 
 
 		 312 aa  181  1e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2416  chromosome replication initiation inhibitor protein  37.84 
 
 		 305 aa  178  8e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.343193  hitchhiker  0.00112785 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1573  chromosome replication initiation inhibitor protein  41.2 
 
 		 318 aa  178  1e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.187685  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3693  chromosome replication initiation inhibitor protein  44.71 
 
 		 306 aa  178  1e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3139  chromosome replication initiation inhibitor protein  39.66 
 
 		 297 aa  177  1e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.677329  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5298  chromosome replication initiation inhibitor protein  40.68 
 
 		 297 aa  177  2e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1507  chromosome replication initiation inhibitor protein  40.48 
 
 		 297 aa  177  2e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2836  chromosome replication initiation inhibitor protein  38.64 
 
 		 301 aa  177  2e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.284111  normal  0.240548 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2344  chromosome replication initiation inhibitor protein  37.5 
 
 		 305 aa  177  2e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0367629  hitchhiker  0.0000000918792 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1829  chromosome replication initiation inhibitor protein  38.89 
 
 		 297 aa  176  3e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.999172  hitchhiker  0.00188164 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4249  chromosome replication initiation inhibitor protein  44.56 
 
 		 298 aa  176  4e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.373423  normal  0.150215 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3863  chromosome replication initiation inhibitor protein  44.68 
 
 		 298 aa  176  4e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.807931 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4487  chromosome replication initiation inhibitor protein  39 
 
 		 297 aa  176  5e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5123  chromosome replication initiation inhibitor protein  39 
 
 		 297 aa  176  5e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5736  chromosome replication initiation inhibitor protein  39 
 
 		 297 aa  176  5e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.18075 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1652  chromosome replication initiation inhibitor protein  37.5 
 
 		 305 aa  176  5e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.963239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0429  chromosome replication initiation inhibitor protein  38.85 
 
 		 325 aa  176  6e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1772  chromosome replication initiation inhibitor protein  38.85 
 
 		 325 aa  176  6e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.188561  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0336  chromosome replication initiation inhibitor protein  38.85 
 
 		 325 aa  176  6e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0034  chromosome replication initiation inhibitor protein  38.41 
 
 		 297 aa  175  8e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3749  transcriptional regulator, ArgP, LysR family  40.48 
 
 		 303 aa  174  9.999999999999999e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0030  chromosome replication initiation inhibitor protein  37.72 
 
 		 297 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1183  chromosome replication initiation inhibitor protein  37.72 
 
 		 297 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.893969  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0050  chromosome replication initiation inhibitor protein  37.76 
 
 		 297 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1463  chromosome replication initiation inhibitor protein  37.72 
 
 		 297 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2146  chromosome replication initiation inhibitor protein  39.19 
 
 		 323 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0036  chromosome replication initiation inhibitor protein  37.72 
 
 		 297 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11860  transcriptional regulator, ArgP family  43.45 
 
 		 313 aa  174  9.999999999999999e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0109539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2774  chromosome replication initiation inhibitor protein  42.5 
 
 		 295 aa  174  9.999999999999999e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0947  chromosome replication initiation inhibitor protein  40.73 
 
 		 311 aa  175  9.999999999999999e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1704  chromosome replication initiation inhibitor protein  44.88 
 
 		 298 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.305056  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5007  chromosome replication initiation inhibitor protein  39.32 
 
 		 297 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.633447  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1833  chromosome replication initiation inhibitor protein  38.51 
 
 		 325 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.565601  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2099  chromosome replication initiation inhibitor protein  38.51 
 
 		 325 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2962  chromosome replication initiation inhibitor protein  40.77 
 
 		 297 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1126  chromosome replication initiation inhibitor protein  38.51 
 
 		 325 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0698805  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3148  chromosome replication initiation inhibitor protein  39.32 
 
 		 297 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.99123  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0835  chromosome replication initiation inhibitor protein  38.51 
 
 		 319 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0738995  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1538  chromosome replication initiation inhibitor protein  37.37 
 
 		 297 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0036  chromosome replication initiation inhibitor protein  37.41 
 
 		 297 aa  172  5e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2866  chromosome replication initiation inhibitor protein  37.46 
 
 		 306 aa  172  5.999999999999999e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2433  chromosome replication initiation inhibitor protein  41.09 
 
 		 302 aa  172  5.999999999999999e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3862  chromosome replication initiation inhibitor protein  43.3 
 
 		 299 aa  171  1e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2987  chromosome replication initiation inhibitor protein  36.99 
 
 		 299 aa  171  1e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2594  chromosome replication initiation inhibitor protein  37.83 
 
 		 311 aa  171  2e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000186754  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2671  chromosome replication initiation inhibitor protein  37.17 
 
 		 311 aa  170  3e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000215658  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2012  chromosome replication initiation inhibitor protein  44.17 
 
 		 298 aa  169  4e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1698  chromosome replication initiation inhibitor protein  36.81 
 
 		 309 aa  169  4e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.52148  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1116  chromosome replication initiation inhibitor protein  40.07 
 
 		 297 aa  169  4e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.472937 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2556  chromosome replication initiation inhibitor protein  37.42 
 
 		 311 aa  169  5e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000319404  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1399  chromosome replication initiation inhibitor protein  42.86 
 
 		 300 aa  169  6e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1788  chromosome replication initiation inhibitor protein  37.05 
 
 		 311 aa  168  1e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000405332  unclonable  0.00000000000392786 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0711  chromosome replication initiation inhibitor protein  44.29 
 
 		 308 aa  168  1e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4491  chromosome replication initiation inhibitor protein  40.68 
 
 		 309 aa  167  2e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.965976 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1904  chromosome replication initiation inhibitor protein  43.7 
 
 		 289 aa  167  2e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.188746 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0658  chromosome replication initiation inhibitor protein  38.36 
 
 		 310 aa  166  5e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.117033  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4471  chromosome replication initiation inhibitor protein  39.79 
 
 		 296 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.134322 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3474  chromosome replication initiation inhibitor protein  37.74 
 
 		 316 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>