More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_11860 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_11860  transcriptional regulator, ArgP family  100 
 
 		 313 aa  617  1e-176  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0109539  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4638  transcriptional regulator, ArgP family  46.32 
 
 		 302 aa  246  4.9999999999999997e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.199138  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3123  chromosome replication initiation inhibitor protein  46.03 
 
 		 298 aa  226  4e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.714101  hitchhiker  0.0033883 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0665  transcriptional regulator, LysR family  46.31 
 
 		 299 aa  223  3e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.409403  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3409  transcriptional regulator ArgP, LysR family  41.75 
 
 		 299 aa  206  3e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.305012  normal  0.0118196 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0354  chromosome replication initiation inhibitor protein  44.73 
 
 		 304 aa  206  5e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.757564  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0364  chromosome replication initiation inhibitor protein  44.73 
 
 		 304 aa  206  5e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2144  chromosome replication initiation inhibitor protein  39.19 
 
 		 297 aa  201  9e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.184842 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2384  transcriptional regulator, ArgP, LysR family  43.45 
 
 		 298 aa  201  9.999999999999999e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.758933 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0343  chromosome replication initiation inhibitor protein  43.64 
 
 		 304 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2388  chromosome replication initiation inhibitor protein  39.53 
 
 		 297 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00311135  hitchhiker  0.00401295 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2974  chromosome replication initiation inhibitor protein  36.91 
 
 		 303 aa  196  6e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1650  chromosome replication initiation inhibitor protein  44.95 
 
 		 298 aa  195  6e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.216692  normal  0.124746 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0982  LysR family transcriptional regulator  39.45 
 
 		 300 aa  194  2e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2242  transcriptional regulator, LysR family  44.33 
 
 		 292 aa  194  2e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.124201  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1085  chromosome replication initiation inhibitor protein  38.93 
 
 		 301 aa  193  4e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0282228  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0158  transcriptional regulator, ArgP, LysR family  40.77 
 
 		 292 aa  192  5e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.804974 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3863  chromosome replication initiation inhibitor protein  41.67 
 
 		 298 aa  192  9e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.807931 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4164  chromosome replication initiation inhibitor protein  38.31 
 
 		 299 aa  192  9e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.221393  normal  0.317315 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0393  chromosome replication initiation inhibitor protein  39.93 
 
 		 293 aa  190  2.9999999999999997e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4249  chromosome replication initiation inhibitor protein  41.22 
 
 		 298 aa  187  2e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.373423  normal  0.150215 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1175  chromosome replication initiation inhibitor protein  36.96 
 
 		 297 aa  186  6e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.578075  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1704  chromosome replication initiation inhibitor protein  40.07 
 
 		 298 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.305056  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3099  transcriptional regulator LysR family  39.32 
 
 		 301 aa  184  2.0000000000000003e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.109242  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1507  chromosome replication initiation inhibitor protein  38.75 
 
 		 297 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3693  chromosome replication initiation inhibitor protein  38.85 
 
 		 306 aa  183  4.0000000000000006e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3862  chromosome replication initiation inhibitor protein  40.54 
 
 		 299 aa  183  4.0000000000000006e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4012  transcriptional regulator, LysR family  43.39 
 
 		 284 aa  182  6e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.725863 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3485  transcriptional regulator, ArgP, LysR family  44.53 
 
 		 299 aa  182  8.000000000000001e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.493863 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2012  chromosome replication initiation inhibitor protein  40.41 
 
 		 298 aa  181  1e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0658  chromosome replication initiation inhibitor protein  37.87 
 
 		 310 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.117033  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2962  chromosome replication initiation inhibitor protein  37.72 
 
 		 297 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0362  chromosome replication initiation inhibitor protein  40.07 
 
 		 289 aa  178  1e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0453473 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2358  chromosome replication initiation inhibitor protein  36.42 
 
 		 302 aa  177  1e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.17613  normal  0.155084 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2836  chromosome replication initiation inhibitor protein  36.75 
 
 		 301 aa  177  2e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.284111  normal  0.240548 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2085  chromosome replication initiation inhibitor protein  36.08 
 
 		 299 aa  177  2e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0375  chromosome replication initiation inhibitor protein  40.64 
 
 		 289 aa  176  3e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.868101 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1399  chromosome replication initiation inhibitor protein  40.07 
 
 		 300 aa  175  7e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12016  chromosome replication initiation inhibitor protein  38.44 
 
 		 303 aa  175  9.999999999999999e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0269  chromosome replication initiation inhibitor protein  40.27 
 
 		 315 aa  174  9.999999999999999e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.875741 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4431  chromosome replication initiation inhibitor protein  43.45 
 
 		 293 aa  174  9.999999999999999e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.615047  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21240  transcriptional regulator, ArgP family  40 
 
 		 300 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.100515 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5007  chromosome replication initiation inhibitor protein  37.21 
 
 		 297 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.633447  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4487  chromosome replication initiation inhibitor protein  36.49 
 
 		 297 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5123  chromosome replication initiation inhibitor protein  36.49 
 
 		 297 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5736  chromosome replication initiation inhibitor protein  36.49 
 
 		 297 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.18075 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3148  chromosome replication initiation inhibitor protein  37.21 
 
 		 297 aa  171  1e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.99123  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3139  chromosome replication initiation inhibitor protein  36.82 
 
 		 297 aa  171  1e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.677329  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1829  chromosome replication initiation inhibitor protein  35.96 
 
 		 297 aa  171  2e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.999172  hitchhiker  0.00188164 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5298  chromosome replication initiation inhibitor protein  36.82 
 
 		 297 aa  171  2e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4178  chromosome replication initiation inhibitor protein  40.64 
 
 		 299 aa  169  4e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.257723  normal  0.264843 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0091  chromosome replication initiation inhibitor protein  37.12 
 
 		 303 aa  167  1e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.730131  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0072  chromosome replication initiation inhibitor protein  37.12 
 
 		 303 aa  167  1e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.608118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2509  chromosome replication initiation inhibitor protein  36.36 
 
 		 303 aa  167  2e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3162  chromosome replication initiation inhibitor protein  36.36 
 
 		 303 aa  167  2e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0132  chromosome replication initiation inhibitor protein  37.16 
 
 		 305 aa  167  2.9999999999999998e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.350257 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1904  chromosome replication initiation inhibitor protein  39.86 
 
 		 289 aa  165  9e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.188746 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0034  chromosome replication initiation inhibitor protein  35.14 
 
 		 297 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3749  transcriptional regulator, ArgP, LysR family  35.52 
 
 		 303 aa  163  4.0000000000000004e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3684  chromosome replication initiation inhibitor protein  37.02 
 
 		 297 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3925  chromosome replication initiation inhibitor protein  37.11 
 
 		 297 aa  162  8.000000000000001e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.567079  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0399  chromosome replication initiation inhibitor protein  37.46 
 
 		 302 aa  162  8.000000000000001e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0518  chromosome replication initiation inhibitor protein  36.68 
 
 		 297 aa  161  1e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1891  chromosome replication initiation inhibitor protein  37.1 
 
 		 306 aa  161  1e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0559  chromosome replication initiation inhibitor protein  36.68 
 
 		 297 aa  161  1e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3878  chromosome replication initiation inhibitor protein  36.68 
 
 		 297 aa  160  2e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0036  chromosome replication initiation inhibitor protein  34.12 
 
 		 297 aa  160  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4371  chromosome replication initiation inhibitor protein  36.68 
 
 		 305 aa  160  3e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0711  chromosome replication initiation inhibitor protein  36.92 
 
 		 308 aa  159  4e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0050  chromosome replication initiation inhibitor protein  34.12 
 
 		 297 aa  159  4e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0857  chromosome replication initiation inhibitor protein  36.68 
 
 		 302 aa  158  1e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3821  chromosome replication initiation inhibitor protein  36.68 
 
 		 302 aa  158  1e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.353961  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0854  chromosome replication initiation inhibitor protein  36.68 
 
 		 302 aa  158  1e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00300239  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02747  chromosome replication initiation inhibitor protein  36.33 
 
 		 297 aa  157  2e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0777  transcriptional regulator, ArgP, LysR family  36.33 
 
 		 297 aa  157  2e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3243  chromosome replication initiation inhibitor protein  36.33 
 
 		 297 aa  157  2e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.361223  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02710  hypothetical protein  36.33 
 
 		 297 aa  157  2e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4212  chromosome replication initiation inhibitor protein  36.33 
 
 		 297 aa  157  2e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.307213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3074  chromosome replication initiation inhibitor protein  36.33 
 
 		 297 aa  157  2e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.093516  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3336  chromosome replication initiation inhibitor protein  36.33 
 
 		 297 aa  157  2e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3052  chromosome replication initiation inhibitor protein  36.33 
 
 		 297 aa  157  2e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0794  chromosome replication initiation inhibitor protein  36.33 
 
 		 297 aa  157  2e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1573  chromosome replication initiation inhibitor protein  36.33 
 
 		 318 aa  157  3e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.187685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2774  chromosome replication initiation inhibitor protein  34.8 
 
 		 295 aa  156  5.0000000000000005e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5932  chromosome replication initiation inhibitor protein  38.74 
 
 		 315 aa  155  7e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.112757 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1126  chromosome replication initiation inhibitor protein  35.23 
 
 		 325 aa  154  2e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0698805  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1833  chromosome replication initiation inhibitor protein  35.23 
 
 		 325 aa  154  2e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.565601  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1538  chromosome replication initiation inhibitor protein  33.11 
 
 		 297 aa  154  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3302  chromosome replication initiation inhibitor protein  36.08 
 
 		 297 aa  154  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.779303  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3225  chromosome replication initiation inhibitor protein  36.08 
 
 		 297 aa  154  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0441076  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3299  chromosome replication initiation inhibitor protein  36.08 
 
 		 297 aa  154  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.335083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2434  chromosome replication initiation inhibitor protein  33.11 
 
 		 295 aa  154  2e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.609977  hitchhiker  0.000411507 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2099  chromosome replication initiation inhibitor protein  35.23 
 
 		 325 aa  154  2e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0835  chromosome replication initiation inhibitor protein  35.23 
 
 		 319 aa  154  2e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0738995  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3237  chromosome replication initiation inhibitor protein  36.08 
 
 		 297 aa  154  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3334  chromosome replication initiation inhibitor protein  35.64 
 
 		 297 aa  153  2.9999999999999998e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.197754  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3404  chromosome replication initiation inhibitor protein  36.08 
 
 		 297 aa  153  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.269089  normal  0.216257 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2987  chromosome replication initiation inhibitor protein  34.11 
 
 		 299 aa  153  4e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1463  chromosome replication initiation inhibitor protein  33.11 
 
 		 297 aa  153  5e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0036  chromosome replication initiation inhibitor protein  33.11 
 
 		 297 aa  153  5e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>