225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0655 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_0655  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 273 aa  527  1e-149  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.121363  n/a   
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4327  ABC-2 type transporter  46.21 
 
 		 272 aa  218  1e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3737  ABC-2 type transporter  42.06 
 
 		 294 aa  176  5e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2829  daunorubicin resistance protein C  39.17 
 
 		 287 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.212712  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2873  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit C  39.17 
 
 		 287 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.716211  normal  0.118774 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2858  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit C  39.17 
 
 		 287 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.375686  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3387  multidrug ABC transporter inner membrane protein  38.87 
 
 		 281 aa  172  5.999999999999999e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.169242 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12952  daunorubicin-dim-transport integral membrane protein ABC transporter drrC  36.99 
 
 		 276 aa  169  6e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3120  multidrug ABC transporter inner membrane protein  37.25 
 
 		 284 aa  157  3e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.561291  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1473  hypothetical protein  33.06 
 
 		 269 aa  115  6e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.377134  normal  0.24112 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4992  ABC-2 type transporter  31.25 
 
 		 270 aa  106  4e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.402209  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3107  ABC-2 type transporter  33.62 
 
 		 264 aa  105  7e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3167  ABC-2 type transporter  33.62 
 
 		 264 aa  105  7e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.804555 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23570  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  28.35 
 
 		 267 aa  105  1e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.24456  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1755  ABC-2 type transporter  33.46 
 
 		 264 aa  102  5e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.586856  decreased coverage  0.00328589 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0340  ABC-2 type transporter  29.55 
 
 		 273 aa  101  1e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.171685  hitchhiker  0.00234396 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5259  ABC-2 type transporter  29.7 
 
 		 277 aa  99.8  4e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0674  ABC-2 type transporter  29.83 
 
 		 272 aa  99  7e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.890968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4551  ABC-2 type transporter  30.04 
 
 		 264 aa  93.6  3e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.442888  normal  0.0220595 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1122  ABC-2 type transporter  28.74 
 
 		 285 aa  92.4  8e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.408605  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0058  ABC-2 type transporter  28.35 
 
 		 271 aa  91.7  1e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0393  ABC-2 type transporter  30.12 
 
 		 274 aa  88.6  1e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4081  ABC-2 type transporter  28.73 
 
 		 274 aa  87.4  2e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.431533 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1384  ABC-2 type transporter  30.38 
 
 		 269 aa  85.1  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.78336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2016  ABC-2 type transporter  32.65 
 
 		 268 aa  82.4  0.000000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6787  ABC-2 type transporter  27.69 
 
 		 268 aa  80.9  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000212784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4183  ABC-2 type transporter  27.57 
 
 		 269 aa  80.1  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.013923  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2864  ABC-2 type transporter  28.44 
 
 		 290 aa  78.6  0.0000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3132  ABC-2 type transporter  26.25 
 
 		 248 aa  78.6  0.0000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.571081  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1622  ABC-2 type transporter  31.43 
 
 		 278 aa  78.2  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0918  ABC-2 type transporter  27.16 
 
 		 254 aa  78.2  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1754  ABC-2 type transporter  29.75 
 
 		 250 aa  77.8  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00326384 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2775  ABC-2 type transporter  28.33 
 
 		 278 aa  77.4  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00783625  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2021  hypothetical protein  28.69 
 
 		 289 aa  76.6  0.0000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.290119  normal  0.988573 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4106  ABC-2 type transporter  25.43 
 
 		 293 aa  75.9  0.0000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3137  ABC-2 type transporter  31.7 
 
 		 277 aa  75.5  0.0000000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.428202  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6375  ABC-2 type transporter  26.03 
 
 		 247 aa  75.1  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1878  ABC-2 type transporter  28.31 
 
 		 273 aa  74.7  0.000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0042  ABC-2 type transporter  30.98 
 
 		 266 aa  75.1  0.000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1697  ABC-2 type transporter  27.75 
 
 		 271 aa  74.3  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35420  ABC-type multidrug transport system, permease component  30.54 
 
 		 257 aa  74.7  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1448  putative ABC transporter transmembrane protein  31.43 
 
 		 252 aa  73.9  0.000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7215  ABC transporter (permease)  27.05 
 
 		 247 aa  73.6  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.284415 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0959  ABC-2 type transporter  25.41 
 
 		 256 aa  73.2  0.000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00197586  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4656  ABC-2 type transporter  27.31 
 
 		 285 aa  72.8  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.890125  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1123  ABC-2 type transporter  29.03 
 
 		 257 aa  73.2  0.000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1123  ABC-2 type transporter  30.17 
 
 		 275 aa  72.8  0.000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1034  ABC-2 type transporter  28.05 
 
 		 254 aa  72.8  0.000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.489208  normal  0.0976555 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0096  ABC-2 type transporter  29.3 
 
 		 247 aa  72.4  0.000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0363  ABC-2 type transporter  26.25 
 
 		 289 aa  72.4  0.000000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8873  ABC-2 type transporter  27.35 
 
 		 270 aa  72.4  0.000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.53633  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4761  ABC-2 type transporter  26.85 
 
 		 261 aa  71.6  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000109025  hitchhiker  0.000621886 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0654  ABC-2 type transporter  26.81 
 
 		 270 aa  71.6  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.122619  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2065  ABC-2 type transporter  27.54 
 
 		 254 aa  70.9  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4190  ABC-2 type transporter  27.33 
 
 		 257 aa  71.2  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4170  ABC-2 type transporter  26.25 
 
 		 270 aa  70.5  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1258  ABC-2 type transporter  30.33 
 
 		 300 aa  70.5  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1686  hypothetical protein  27.19 
 
 		 280 aa  70.1  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0542  ABC-2 type transporter  27.02 
 
 		 253 aa  70.5  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2716  ABC-2 type transporter  27.59 
 
 		 254 aa  70.1  0.00000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5588  ABC-2 type transporter  26.69 
 
 		 261 aa  69.7  0.00000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0895  ABC-2 type transporter  25.42 
 
 		 266 aa  69.3  0.00000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1351  ABC-2 type transporter  28.87 
 
 		 272 aa  69.3  0.00000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0414359  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3103  ABC transporter protein  27.35 
 
 		 280 aa  68.9  0.00000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00849207 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2897  ABC-2 type transporter  25.93 
 
 		 274 aa  68.9  0.00000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.643507  normal  0.323486 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3882  ABC-2 type transporter  30.74 
 
 		 278 aa  68.9  0.00000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.214261 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5081  ABC transporter related protein  25.2 
 
 		 260 aa  68.2  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.630665  normal  0.675914 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1684  ABC-2 type transporter  27.35 
 
 		 251 aa  68.6  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1937  ABC-2 type transporter  25.61 
 
 		 284 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.008119  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3893  ABC-2 type transporter  26.89 
 
 		 242 aa  67.8  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0012751  normal  0.0102027 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6250  ABC-2 type transporter  28.87 
 
 		 285 aa  67.8  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.243116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8859  ABC transporter permease  26.12 
 
 		 253 aa  67.8  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00340  ABC-type multidrug transport system, permease component  30.67 
 
 		 259 aa  67  0.0000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.15345 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1448  ABC-2 type transporter  26.92 
 
 		 251 aa  66.6  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0318973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3922  ABC-2 type transporter  26.56 
 
 		 266 aa  66.6  0.0000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0348636  normal  0.0335688 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0937  ABC-2 type transporter  25.51 
 
 		 269 aa  66.6  0.0000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0014  ABC-2 type transporter  25.11 
 
 		 304 aa  66.2  0.0000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3166  ABC-2 type transporter  30.21 
 
 		 245 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.591825 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3106  ABC-2 type transporter  33.54 
 
 		 229 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0213  ABC transporter permease  27.33 
 
 		 257 aa  63.9  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1839  ABC-2 type transporter  25.51 
 
 		 266 aa  64.3  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4795  ABC-2 type transporter  25.5 
 
 		 284 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.597944 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0375  ABC-2 type transporter  27.68 
 
 		 264 aa  63.9  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.133292  hitchhiker  0.00534901 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07250  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  27.02 
 
 		 265 aa  64.3  0.000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.307058 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3239  ABC transporter efflux permease  23.36 
 
 		 249 aa  63.9  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3149  ABC transporter efflux permease; daunorubicin resistance transmembrane protein  23.55 
 
 		 249 aa  63.9  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0286068  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3492  ABC transporter permease  23.36 
 
 		 249 aa  63.9  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.799548  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3453  ABC transporter, efflux permease protein  23.36 
 
 		 249 aa  63.9  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3547  ABC-2 type transporter  28.4 
 
 		 259 aa  63.2  0.000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.369986 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1504  ABC-2 type transporter  25.91 
 
 		 272 aa  63.2  0.000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.457097  normal  0.179064 
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4328  ABC-2 type transporter  28.14 
 
 		 259 aa  63.5  0.000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1808  ABC transporter, efflux permease protein  25.81 
 
 		 249 aa  63.2  0.000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0966  ABC-2 type transporter  28 
 
 		 259 aa  62.8  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4674  ABC-2 type transporter  26.75 
 
 		 276 aa  63.2  0.000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.348942  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3467  ABC transporter, efflux permease protein  24.18 
 
 		 249 aa  62.8  0.000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000810233  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1189  ABC-2 type transporter  24.4 
 
 		 263 aa  62.4  0.000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000916915 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1352  ABC-2 type transporter  26.72 
 
 		 254 aa  62.4  0.000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.137638  normal  0.090478 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0497  ABC-2 type transporter  22.18 
 
 		 286 aa  62.4  0.000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.779296  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2939  ABC-2 type transporter  26.96 
 
 		 286 aa  62  0.000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.27677 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4638  ABC-2 type transporter  24.56 
 
 		 282 aa  61.6  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.619797  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>