More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_2469 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_2469  SNF2-related protein  100 
 
 		 1120 aa  2276    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0994  SNF2-related:helicase-like:Zinc finger, SWIM-type  50 
 
 		 1142 aa  1044    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.424079 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1748  SNF2-related protein  95 
 
 		 1120 aa  2171    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2733  SNF2-related protein  55.47 
 
 		 1164 aa  833    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000591247  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4402  non-specific serine/threonine protein kinase  42.94 
 
 		 1164 aa  881    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.218588  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2303  SNF2-related protein  41.05 
 
 		 1112 aa  399  1e-109  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.646715  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3980  non-specific serine/threonine protein kinase  40.78 
 
 		 1068 aa  379  1e-103  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.863358  normal  0.858201 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1766  non-specific serine/threonine protein kinase  37.92 
 
 		 1055 aa  374  1e-102  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2473  SNF2-related protein  43.84 
 
 		 1362 aa  374  1e-102  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.356302  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1744  SNF2-related protein  43.63 
 
 		 1386 aa  370  1e-100  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3874  Non-specific serine/threonine protein kinase  37.2 
 
 		 1261 aa  367  1e-100  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.646878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5226  non-specific serine/threonine protein kinase  42.48 
 
 		 1021 aa  365  2e-99  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4161  SNF2-related protein  34.73 
 
 		 964 aa  363  8e-99  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000285202 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6180  SNF2-related protein  40.53 
 
 		 1003 aa  360  7e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4580  Non-specific serine/threonine protein kinase  39.63 
 
 		 982 aa  360  9.999999999999999e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.407175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2601  SNF2-related protein  42.48 
 
 		 1086 aa  357  8.999999999999999e-97  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0789  Non-specific serine/threonine protein kinase  40.37 
 
 		 1069 aa  356  1e-96  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.412315 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0114  SNF2-related protein  43.13 
 
 		 1080 aa  356  1e-96  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1368  SNF2-related protein  37.01 
 
 		 1073 aa  355  2e-96  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1144  SNF2-related protein  40.37 
 
 		 1071 aa  355  2e-96  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00377305  normal  0.635598 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0884  SNF2-related protein  39.36 
 
 		 1068 aa  354  4e-96  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00950493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1502  non-specific serine/threonine protein kinase  38.73 
 
 		 1073 aa  354  5e-96  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2228  SNF2-related  37.75 
 
 		 1088 aa  354  5.9999999999999994e-96  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1471  non-specific serine/threonine protein kinase  38.77 
 
 		 1073 aa  353  8e-96  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.698518  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1466  non-specific serine/threonine protein kinase  39.06 
 
 		 1073 aa  353  1e-95  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5008  Non-specific serine/threonine protein kinase  41.68 
 
 		 1403 aa  353  1e-95  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2881  Non-specific serine/threonine protein kinase  38.92 
 
 		 1073 aa  352  2e-95  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.596708  hitchhiker  0.0027523 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1539  Non-specific serine/threonine protein kinase  39.84 
 
 		 1091 aa  352  2e-95  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00041445  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23220  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  39.1 
 
 		 1110 aa  352  2e-95  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.211943  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3404  Snf2 family protein  40.28 
 
 		 1134 aa  352  3e-95  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.698  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0596  SNF2-related protein  33.64 
 
 		 1250 aa  351  4e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.160311  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3870  SNF2-related:helicase, C-terminal:SWIM Zn-finger  43.32 
 
 		 1091 aa  350  8e-95  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0433  SNF2-related protein  37.41 
 
 		 1130 aa  349  2e-94  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.735104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1564  DEAD/DEAH box helicase-like  38.87 
 
 		 1068 aa  349  2e-94  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.666232  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1651  Snf2 family protein  35.23 
 
 		 1070 aa  346  1e-93  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0265  Non-specific serine/threonine protein kinase  41.41 
 
 		 1129 aa  346  1e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.355266  normal  0.1182 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3350  SNF2-related protein  36.79 
 
 		 1127 aa  345  2e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.932326  normal  0.174859 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2687  SNF2-related protein  35.34 
 
 		 1082 aa  345  2.9999999999999997e-93  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.846523  unclonable  0.000081012 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0516  Non-specific serine/threonine protein kinase  38.75 
 
 		 1104 aa  344  5e-93  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0578806 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2620  SNF2-related protein  35.34 
 
 		 1082 aa  343  8e-93  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00228348 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0327  SNF2-related protein  43.53 
 
 		 1354 aa  342  2e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.19544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0283  SNF2-related protein  37.66 
 
 		 1062 aa  342  2e-92  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1060  Non-specific serine/threonine protein kinase  41.93 
 
 		 1113 aa  342  2.9999999999999998e-92  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.28014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0942  DNA helicase, SNF2/RAD54 family  41.93 
 
 		 1113 aa  342  2.9999999999999998e-92  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3627  SNF2 family DNA/RNA helicase  39.02 
 
 		 977 aa  342  2.9999999999999998e-92  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53900  helicase  43.66 
 
 		 663 aa  342  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.027485  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2795  SNF2-related protein  35.02 
 
 		 1082 aa  340  7e-92  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.320066 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6251  SNF2-related protein  36.51 
 
 		 959 aa  340  8e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.971738  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1793  SNF2-related protein  42.03 
 
 		 985 aa  339  9.999999999999999e-92  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00186852  normal  0.607723 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1663  non-specific serine/threonine protein kinase  44.66 
 
 		 1108 aa  338  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0559989  normal  0.741306 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0035  Non-specific serine/threonine protein kinase  39.61 
 
 		 1112 aa  339  1.9999999999999998e-91  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4719  helicase  43.45 
 
 		 773 aa  338  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.218177  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1894  SNF2-related:helicase, C-terminal:SWIM Zn-finger  40.75 
 
 		 914 aa  338  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.437669 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21150  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  38.66 
 
 		 1143 aa  337  5.999999999999999e-91  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0464  Non-specific serine/threonine protein kinase  38.1 
 
 		 1139 aa  336  1e-90  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000898251  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2099  helicase/SNF2 family domain protein  40.54 
 
 		 918 aa  336  1e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1300  SNF2-related protein  38.04 
 
 		 1070 aa  336  1e-90  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2451  SNF2-related protein  38.96 
 
 		 1087 aa  335  3e-90  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0905  non-specific serine/threonine protein kinase  39 
 
 		 1120 aa  335  3e-90  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3516  Non-specific serine/threonine protein kinase  36.82 
 
 		 1160 aa  335  3e-90  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0485319 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0430  Non-specific serine/threonine protein kinase  38.62 
 
 		 1068 aa  335  4e-90  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.218151  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0373  SNF2-related protein  36.51 
 
 		 1159 aa  335  4e-90  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2580  non-specific serine/threonine protein kinase  39.11 
 
 		 1069 aa  334  5e-90  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00984411  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3328  non-specific serine/threonine protein kinase  41.15 
 
 		 1066 aa  333  8e-90  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3798  SNF2-related protein  37.54 
 
 		 1154 aa  333  9e-90  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2499  Non-specific serine/threonine protein kinase  40.43 
 
 		 1082 aa  333  1e-89  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000806643  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2599  SNF2-related  35.29 
 
 		 1437 aa  333  1e-89  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3472  SNF2-related protein  38.04 
 
 		 1100 aa  333  2e-89  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4987  Non-specific serine/threonine protein kinase  40.88 
 
 		 1155 aa  332  2e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.894116  normal  0.0382537 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18000  DEAD box and SNF-like helicase domain-containing protein  40.07 
 
 		 1357 aa  331  4e-89  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.153374  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2408  SNF2-related  40.34 
 
 		 1163 aa  331  4e-89  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.644608  normal  0.0402994 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1148  putative helicase  36.55 
 
 		 1069 aa  330  9e-89  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0135217  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0770  SNF2-related protein  37.67 
 
 		 1081 aa  330  1.0000000000000001e-88  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0986  DNA/RNA helicase, SNF2  36.17 
 
 		 1069 aa  330  1.0000000000000001e-88  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1597  Snf2/Rad54 family helicase  36.77 
 
 		 1084 aa  329  2.0000000000000001e-88  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.154649  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3931  SNF2-related  37.42 
 
 		 1178 aa  328  5e-88  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0053  SNF2-related protein  36.99 
 
 		 1141 aa  327  7e-88  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1878  Snf2/Rad54 family helicase  36.89 
 
 		 1084 aa  327  7e-88  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.456033  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1664  putative helicase  40.93 
 
 		 1150 aa  327  9e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0566301 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0176  SNF2-related protein  41.65 
 
 		 777 aa  326  1e-87  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.461992 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1673  SNF2-related  36.87 
 
 		 1048 aa  325  3e-87  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.115641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3239  non-specific serine/threonine protein kinase  41.25 
 
 		 876 aa  325  3e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3458  SNF2-related protein  38.83 
 
 		 1077 aa  324  4e-87  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0801  hypothetical protein  39.66 
 
 		 1088 aa  325  4e-87  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0664  SNF2-related protein  37.95 
 
 		 1125 aa  324  5e-87  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3868  SNF2-like  40.7 
 
 		 896 aa  324  5e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0772  hypothetical protein  39.45 
 
 		 1088 aa  323  9.000000000000001e-87  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0138  SNF2-related protein  43.32 
 
 		 903 aa  323  9.000000000000001e-87  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.021253  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0285  Non-specific serine/threonine protein kinase  39.8 
 
 		 1102 aa  322  1.9999999999999998e-86  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30090  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  42.68 
 
 		 1227 aa  322  1.9999999999999998e-86  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10820  helicase protein  43.39 
 
 		 872 aa  323  1.9999999999999998e-86  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1047  Non-specific serine/threonine protein kinase  43.01 
 
 		 1028 aa  322  3e-86  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00746664  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2833  SNF2-related protein  42.2 
 
 		 991 aa  322  3e-86  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3506  non-specific serine/threonine protein kinase  39.74 
 
 		 848 aa  321  5e-86  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1892  SNF2-related protein  36.42 
 
 		 1161 aa  321  6e-86  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.500803 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0020  Non-specific serine/threonine protein kinase  33.78 
 
 		 950 aa  321  6e-86  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0104  SNF2-related protein  40.66 
 
 		 1086 aa  320  7.999999999999999e-86  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0547  SNF2-related:helicase, C-terminal  40.2 
 
 		 988 aa  319  1e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.122481  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1444  SNF2-related protein  36.24 
 
 		 891 aa  320  1e-85  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.629941  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0208  SNF2 helicase-related protein  40.46 
 
 		 1209 aa  318  3e-85  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>