More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_0213 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_1124  RNA-binding S1 domain-containing protein  57.88 
 
 		 724 aa  820    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0235  S1 RNA-binding domain-containing protein  49.03 
 
 		 761 aa  662    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.707301  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1676  S1 RNA-binding domain-containing protein  58 
 
 		 716 aa  869    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0275  S1 RNA-binding domain-containing protein  70.61 
 
 		 722 aa  1040    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.302481  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0732  transcriptional accessory protein Tex, putative  53.74 
 
 		 720 aa  709    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0270  S1 RNA binding domain protein  69.92 
 
 		 722 aa  1045    Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00390714  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0241  S1 RNA-binding domain-containing protein  70.61 
 
 		 724 aa  1040    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0227  transcription accessory protein  70.61 
 
 		 724 aa  1040    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.409701  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0229  transcription accessory protein  70.47 
 
 		 724 aa  1040    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3940  RNA binding S1 domain protein  51.87 
 
 		 721 aa  687    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0267  S1 RNA binding domain protein  70.61 
 
 		 722 aa  1041    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0457  RNA-binding S1 domain-containing protein  54.2 
 
 		 713 aa  778    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1770  RNA binding S1 domain protein  57.93 
 
 		 718 aa  845    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.133357  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1181  RNA-binding S1 domain-containing protein  46.67 
 
 		 720 aa  645    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2100  RNA-binding S1 domain-containing protein  57.62 
 
 		 716 aa  839    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0300977  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0289  S1 RNA binding domain protein  70.47 
 
 		 724 aa  1051    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.032333  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0241  RNA-binding S1 domain-containing protein  69.92 
 
 		 722 aa  1045    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0577162  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0908  transcriptional accessory protein  48.68 
 
 		 759 aa  638    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.0000000000000019173  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4944  RNA binding S1 domain protein  47.96 
 
 		 718 aa  645    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.840168 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0182  RNA binding S1  50.49 
 
 		 757 aa  676    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.000000000267713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2137  RNA-binding S1 domain-containing protein  57.62 
 
 		 716 aa  839    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.580609  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0255  s1 RNA-binding domain-containing protein  70.47 
 
 		 722 aa  1039    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.914514  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3345  RNA-binding S1 domain-containing protein  49.08 
 
 		 706 aa  666    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0233  RNA-binding S1 domain-containing protein  69.22 
 
 		 722 aa  1026    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.712365  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0379  RNA-binding S1 domain-containing protein  55.05 
 
 		 713 aa  791    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0908299 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1469  RNA binding S1 domain protein  51.9 
 
 		 717 aa  728    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0286  RNA-binding S1 domain-containing protein  52.22 
 
 		 726 aa  756    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000736156  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0213  RNA binding S1 domain protein  100 
 
 		 728 aa  1472    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.231146  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0338  RNA-binding S1 domain-containing protein  55.89 
 
 		 722 aa  788    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2544  RNA binding S1 domain protein  48.31 
 
 		 762 aa  638    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.493353  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1095  RNA binding S1 domain protein  47.99 
 
 		 762 aa  651    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2426  RNA-binding protein  53.36 
 
 		 720 aa  758    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2136  transcription accessory protein  53.22 
 
 		 720 aa  755    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1540  RNA-binding S1 domain-containing protein  54.77 
 
 		 713 aa  778    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0319  transcriptional accessory protein  52.92 
 
 		 713 aa  727    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1283  transcriptional accessory protein  49.11 
 
 		 730 aa  706    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0716  transcriptional regulator  53.79 
 
 		 710 aa  717    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0450  RNA-binding S1 domain-containing protein  54.93 
 
 		 722 aa  780    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.806006  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2849  RNA binding S1 domain protein  47.35 
 
 		 719 aa  637    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0610  RNA binding S1 domain protein  51.04 
 
 		 727 aa  733    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5055  S1 RNA binding domain protein  69.64 
 
 		 722 aa  1036    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0346453  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2252  RNA-binding S1 domain-containing protein  48.95 
 
 		 757 aa  636    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000694259  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1955  RNA binding S1  57.14 
 
 		 718 aa  832    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1685  RNA-binding S1 domain-containing protein  48.66 
 
 		 723 aa  665    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0479  RNA-binding S1 domain-containing protein  55 
 
 		 712 aa  799    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00985663  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1388  RNA binding S1 domain protein  58.33 
 
 		 721 aa  834    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000247935  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1094  Tex-like protein protein-like protein  81.55 
 
 		 721 aa  1162    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00510  RNA binding S1 domain protein  61.1 
 
 		 722 aa  851    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.000000000000209068  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0354  RNA binding S1 domain protein  55.73 
 
 		 718 aa  811    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3247  RNA binding S1 domain protein  47.35 
 
 		 719 aa  637    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.140684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2288  hypothetical protein  46.12 
 
 		 773 aa  634  1e-180  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001874  transcription accessory protein  45.57 
 
 		 773 aa  633  1e-180  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00618  transcriptional accessory protein  45.47 
 
 		 766 aa  622  1e-177  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1339  RNA binding S1  46.77 
 
 		 802 aa  619  1e-176  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1303  RNA binding S1  46.07 
 
 		 765 aa  620  1e-176  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.493241  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1085  RNA binding S1 domain protein  48.8 
 
 		 705 aa  619  1e-176  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.972092 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2628  Tex-like protein protein-like protein  46.5 
 
 		 801 aa  620  1e-176  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.168465  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1012  tex protein, putative  46.19 
 
 		 817 aa  617  1e-175  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3912  RNA binding S1 domain protein  47.02 
 
 		 777 aa  615  1e-175  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2527  RNA binding S1 domain protein  46.94 
 
 		 782 aa  615  1e-175  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.197314  hitchhiker  0.0000000921984 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1609  S1 RNA-binding domain-containing protein  47.21 
 
 		 781 aa  617  1e-175  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.217486  normal  0.534196 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1406  RNA-binding S1 domain-containing protein  47 
 
 		 780 aa  618  1e-175  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.252881  decreased coverage  0.0000000874326 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1232  RNA binding S1  46.55 
 
 		 787 aa  615  1e-175  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.821312  normal  0.0934617 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4713  putative transcriptional accessory protein  47.27 
 
 		 773 aa  615  1e-175  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2912  Tex-like protein  45.35 
 
 		 797 aa  615  1e-175  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.336311 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2413  RNA binding S1 domain protein  45.96 
 
 		 736 aa  615  9.999999999999999e-175  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.746859  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1623  putative transcription accessory protein  47.45 
 
 		 779 aa  612  9.999999999999999e-175  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1534  RNA binding S1  45.98 
 
 		 719 aa  613  9.999999999999999e-175  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.264491  normal  0.667441 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6302  RNA binding S1 domain protein  46.76 
 
 		 760 aa  612  9.999999999999999e-175  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.820559  normal  0.459443 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0320  RNA binding S1 domain protein  47.33 
 
 		 775 aa  615  9.999999999999999e-175  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03211  hypothetical protein  46.79 
 
 		 773 aa  612  9.999999999999999e-175  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0306  RNA-binding S1 domain-containing protein  46.92 
 
 		 773 aa  613  9.999999999999999e-175  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0742204 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3881  protein yhgF  46.92 
 
 		 773 aa  613  9.999999999999999e-175  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03259  predicted transcriptional accessory protein  46.77 
 
 		 772 aa  611  1e-173  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0306  RNA binding S1 domain protein  46.79 
 
 		 773 aa  611  1e-173  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1924  RNA binding S1 domain protein  46.79 
 
 		 777 aa  609  1e-173  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0525601 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3702  putative transcriptional accessory protein  46.24 
 
 		 776 aa  610  1e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3777  putative transcriptional accessory protein  46.37 
 
 		 776 aa  609  1e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0735  RNA binding S1 domain protein  46.1 
 
 		 773 aa  610  1e-173  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.122852  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3705  putative transcriptional accessory protein  46.24 
 
 		 776 aa  610  1e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3873  putative transcriptional accessory protein  46.24 
 
 		 776 aa  609  1e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3688  putative transcriptional accessory protein  46.51 
 
 		 773 aa  611  1e-173  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.913461 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3786  putative transcriptional accessory protein  46.79 
 
 		 773 aa  612  1e-173  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2338  S1 RNA-binding domain-containing protein  47.95 
 
 		 754 aa  611  1e-173  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.156081  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1596  RNA binding S1 domain protein  46.92 
 
 		 788 aa  609  1e-173  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.702606  normal  0.0459363 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3604  protein yhgF  46.79 
 
 		 773 aa  612  1e-173  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5424  RNA binding S1 domain protein  45.5 
 
 		 763 aa  607  9.999999999999999e-173  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4104  Tex-like protein protein-like protein  46.79 
 
 		 777 aa  608  9.999999999999999e-173  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1680  RNA binding S1 domain-containing protein  46.41 
 
 		 784 aa  608  9.999999999999999e-173  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.162131 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3811  putative transcriptional accessory protein  46.24 
 
 		 776 aa  608  9.999999999999999e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.912817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3541  general secretion pathway protein J  46.09 
 
 		 772 aa  603  1.0000000000000001e-171  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.489396  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0240  RNA binding S1 domain protein  46.71 
 
 		 780 aa  605  1.0000000000000001e-171  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2668  RNA binding S1 domain-containing protein  45.98 
 
 		 783 aa  603  1.0000000000000001e-171  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.427217  normal  0.51511 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3028  RNA binding S1 domain protein  47.24 
 
 		 754 aa  601  1e-170  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0100  RNA binding S1:resolvase, RNase H-like fold  45.61 
 
 		 777 aa  600  1e-170  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3820  RNA-binding S1 domain-containing protein  45.96 
 
 		 776 aa  601  1e-170  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3982  hypothetical protein  45.79 
 
 		 791 aa  598  1e-170  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3743  hypothetical protein  45.79 
 
 		 791 aa  599  1e-170  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1091  putative tex protein  46.66 
 
 		 774 aa  601  1e-170  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.27369  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1819  putative tex protein  46.66 
 
 		 774 aa  601  1e-170  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>