More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0983 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0983  hypothetical protein  100 
 
 		 218 aa  439  9.999999999999999e-123  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.208742  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1509  Rhs element Vgr protein  47.73 
 
 		 239 aa  189  2e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0769  Rhs element Vgr protein  44.71 
 
 		 248 aa  186  2e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3666  Rhs element Vgr protein  36.89 
 
 		 226 aa  147  1.0000000000000001e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.408922  decreased coverage  0.0000749166 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2817  Rhs element Vgr protein  37.99 
 
 		 593 aa  147  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1663  Rhs element Vgr protein  40.61 
 
 		 589 aa  146  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.485896  normal  0.191701 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1626  Rhs element Vgr protein  39.65 
 
 		 592 aa  144  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0131276 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1953  Rhs element Vgr protein  44.08 
 
 		 275 aa  141  8e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0926  Rhs element Vgr protein  39.17 
 
 		 587 aa  135  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.91076  normal  0.482817 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3684  Rhs element Vgr protein  39.59 
 
 		 247 aa  134  9.999999999999999e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.149401  hitchhiker  0.000521794 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1732  Rhs element Vgr protein  35.32 
 
 		 641 aa  132  3e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00520263 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1906  Rhs element Vgr protein  36.09 
 
 		 606 aa  132  3.9999999999999996e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0194585  hitchhiker  0.0014616 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3822  Rhs element Vgr protein  37.84 
 
 		 578 aa  130  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.112104  normal  0.0443202 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2267  Rhs element Vgr protein  36.97 
 
 		 610 aa  127  1.0000000000000001e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.267374  hitchhiker  0.000675551 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3260  Rhs element Vgr protein  38.42 
 
 		 602 aa  120  1.9999999999999998e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.386521  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0660  hypothetical protein  38.1 
 
 		 605 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.279373 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3665  Rhs element Vgr protein  37.68 
 
 		 245 aa  117  9.999999999999999e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.412379  hitchhiker  0.000248141 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5894  Rhs element Vgr protein  35.71 
 
 		 615 aa  115  6e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1051  Rhs element Vgr protein  35.71 
 
 		 594 aa  115  6e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1042  phosphoserine phosphatase SerB  35.35 
 
 		 565 aa  113  2.0000000000000002e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3609  Rhs element Vgr protein  34.48 
 
 		 574 aa  113  3e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000128418 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5384  Rhs element Vgr protein  35.4 
 
 		 602 aa  112  3e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3043  Rhs element Vgr protein  38.42 
 
 		 229 aa  112  4.0000000000000004e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000160638 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2550  Rhs element Vgr protein  37.95 
 
 		 589 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1682  Rhs element Vgr protein  37.95 
 
 		 589 aa  108  5e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2555  hypothetical protein  32.3 
 
 		 273 aa  108  8.000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000216389 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26590  hypothetical protein  35.27 
 
 		 599 aa  103  2e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0848935  normal  0.672502 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4864  Rhs element Vgr protein  34.67 
 
 		 599 aa  102  4e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0846936  normal  0.155196 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3931  Rhs element Vgr protein  32.98 
 
 		 616 aa  97.8  1e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.410968  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6416  Rhs element Vgr protein  29.41 
 
 		 617 aa  97.1  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2462  hypothetical protein  29.73 
 
 		 595 aa  96.3  3e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1080  hypothetical protein  29.57 
 
 		 599 aa  95.5  5e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.752206 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5250  Rhs element Vgr protein  33.03 
 
 		 596 aa  94.7  9e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00012293 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4109  Rhs element Vgr protein  27.43 
 
 		 576 aa  94.7  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0273732 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4015  Rhs element Vgr protein  31.11 
 
 		 602 aa  92.8  3e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.211679  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0369  Rhs element Vgr protein  30.93 
 
 		 596 aa  92.4  4e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3155  Rhs element Vgr protein  31.92 
 
 		 581 aa  92  7e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3927  Rhs element Vgr protein  32.24 
 
 		 604 aa  90.9  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00332693  hitchhiker  0.00450013 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4390  Rhs element Vgr protein  32.02 
 
 		 652 aa  90.9  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.86257  normal  0.698434 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0669  Rhs element Vgr protein  33.95 
 
 		 576 aa  90.5  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1138  hypothetical protein  30.65 
 
 		 270 aa  90.5  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1868  hypothetical protein  30.87 
 
 		 216 aa  86.7  2e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1748  hypothetical protein  34.57 
 
 		 275 aa  86.7  3e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.499382  normal  0.986681 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000029  hypothetical protein  29.31 
 
 		 611 aa  86.3  3e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2094  Rhs element Vgr protein  29.38 
 
 		 646 aa  84.7  9e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.730907  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0676  Rhs element Vgr protein  27.14 
 
 		 596 aa  83.6  0.000000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3003  Rhs element Vgr protein  31.84 
 
 		 598 aa  82.8  0.000000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3415  Rhs element Vgr protein  30.65 
 
 		 669 aa  80.9  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.960838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33960  hypothetical protein  27.03 
 
 		 668 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000148732  normal  0.101757 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1726  Rhs element Vgr protein  40.35 
 
 		 642 aa  80.1  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1875  hypothetical protein  33.5 
 
 		 212 aa  79.7  0.00000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.133633  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2888  hypothetical protein  26.48 
 
 		 668 aa  79.7  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.882104  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2360  Rhs element Vgr protein  29.44 
 
 		 618 aa  79.7  0.00000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3177  Rhs family protein  32.02 
 
 		 697 aa  79.3  0.00000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0043  Rhs element Vgr protein  28.44 
 
 		 320 aa  79.3  0.00000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2945  Rhs element Vgr protein  32.18 
 
 		 589 aa  79  0.00000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.703955  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1538  two component LuxR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 621 aa  79  0.00000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4983  Rhs element Vgr protein  29.76 
 
 		 614 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2744  type VI secretion system Vgr family protein  36.03 
 
 		 851 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01965  hypothetical protein  27.88 
 
 		 771 aa  76.6  0.0000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0838  Rhs element Vgr protein  28.44 
 
 		 697 aa  75.9  0.0000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50870  Rhs element Vgr protein  27.15 
 
 		 668 aa  75.9  0.0000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0536  type VI secretion system Vgr family protein  26.77 
 
 		 792 aa  75.9  0.0000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2357  type VI secretion system Vgr family protein  28.31 
 
 		 619 aa  75.1  0.0000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.116837 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2014  type VI secretion system Vgr family protein  27.4 
 
 		 753 aa  74.3  0.000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.758033  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1145  Rhs element Vgr protein  40 
 
 		 706 aa  74.7  0.000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1781  hypothetical protein  31.36 
 
 		 222 aa  74.3  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3430  putative VGR-related protein  35.77 
 
 		 921 aa  73.6  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2254  Rhs element Vgr protein  33.33 
 
 		 875 aa  73.9  0.000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6682  type VI secretion system Vgr family protein  28.9 
 
 		 1057 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3019  type VI secretion system Vgr family protein  28.25 
 
 		 1048 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.103132  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0204  Rhs element Vgr protein  33.33 
 
 		 869 aa  73.2  0.000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0650  Rhs element Vgr protein  28.51 
 
 		 727 aa  73.2  0.000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0732792  normal  0.0253872 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2959  hypothetical protein  34.29 
 
 		 644 aa  73.2  0.000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0027443 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3589  Rhs element Vgr protein  26.86 
 
 		 612 aa  73.2  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.512863 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2760  type VI secretion system Vgr family protein  26.32 
 
 		 613 aa  72.8  0.000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.68949 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3558  type VI secretion system Vgr family protein  34.29 
 
 		 782 aa  72.8  0.000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.125148  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3429  Rhs element Vgr protein  34.29 
 
 		 782 aa  72.8  0.000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2274  Rhs element Vgr protein  33.33 
 
 		 871 aa  72.4  0.000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0391  Rhs element Vgr protein  31.13 
 
 		 1094 aa  72  0.000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.437245 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0394  Rhs element Vgr protein  45.88 
 
 		 811 aa  72  0.000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.787309 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0129  Rhs element Vgr protein  29.83 
 
 		 872 aa  72  0.000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.176404  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1036  Rhs element Vgr protein  32.85 
 
 		 748 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.288355  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0445  Rhs element Vgr protein  32.85 
 
 		 748 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0322  Rhs-family protein  28.79 
 
 		 730 aa  70.9  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0393811 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1613  Rhs element Vgr protein  29.38 
 
 		 858 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2081  Rhs element Vgr protein  32.85 
 
 		 763 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0741  Rhs element Vgr protein  32.85 
 
 		 748 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0319  Rhs family protein  28.79 
 
 		 729 aa  70.9  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.946115  normal  0.027027 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2618  Rhs element Vgr protein  27.32 
 
 		 618 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.576781 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0166  Rhs element Vgr protein  29.38 
 
 		 930 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.275346  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0796  Rhs element Vgr protein  32.85 
 
 		 763 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0143  Rhs element Vgr protein  29.38 
 
 		 896 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.420233  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0707  Rhs element Vgr protein  32.85 
 
 		 763 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2010  Rhs element Vgr protein  32.85 
 
 		 748 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05870  hypothetical protein  32.59 
 
 		 692 aa  70.9  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0446  Rhs element Vgr protein  32.19 
 
 		 762 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.232565  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2082  Rhs element Vgr protein  32.19 
 
 		 762 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1035  Rhs element Vgr protein  32.19 
 
 		 762 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.508183  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1894  Rhs element Vgr protein  32.12 
 
 		 763 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>