More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6394 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_6394  nitroreductase  100 
 
 		 280 aa  553  1e-157  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.130468 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3917  nitroreductase  38.6 
 
 		 221 aa  135  6.0000000000000005e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0265412  normal  0.0438071 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1262  nitroreductase  38.6 
 
 		 225 aa  125  6e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.88  normal  0.0140866 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5547  nitroreductase  39.34 
 
 		 241 aa  125  9e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5314  nitroreductase  36.28 
 
 		 226 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4933  nitroreductase  36.28 
 
 		 226 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.850383  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5021  nitroreductase  36.28 
 
 		 226 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.227652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3382  nitroreductase  35.32 
 
 		 234 aa  105  9e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.385821 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0106  nitroreductase  34.32 
 
 		 223 aa  104  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0309697  normal  0.07675 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3115  nitroreductase  33.94 
 
 		 239 aa  100  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.029346  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4320  nitroreductase  32.31 
 
 		 224 aa  99.4  6e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2909  nitroreductase  30.28 
 
 		 206 aa  94  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2480  putative ribonuclease BN  34.42 
 
 		 546 aa  91.3  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.422158  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2126  nitroreductase  29.58 
 
 		 176 aa  90.1  4e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2581  nitroreductase  34.55 
 
 		 236 aa  89.7  5e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00210488  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4099  nitroreductase  31.78 
 
 		 217 aa  86.7  4e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0805  nitroreductase  33.67 
 
 		 218 aa  84.7  0.000000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1524  nitroreductase  32.71 
 
 		 223 aa  84.3  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0196672  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4527  Nitroreductase-like protein  31.6 
 
 		 215 aa  84  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.435373  normal  0.468539 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2149  nitroreductase  30.23 
 
 		 225 aa  83.2  0.000000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00130487  normal  0.0184861 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3515  nitroreductase  30.33 
 
 		 186 aa  82.8  0.000000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00093713  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4023  nitroreductase  32.85 
 
 		 202 aa  81.6  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.479853  normal  0.746138 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2525  nitroreductase family protein  30.85 
 
 		 167 aa  80.5  0.00000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.208181  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1207  nitroreductase  27.72 
 
 		 165 aa  80.5  0.00000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0777981  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0123  nitroreductase  31.6 
 
 		 184 aa  79.3  0.00000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1241  nitroreductase  32.39 
 
 		 186 aa  77.4  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3640  nitroreductase  31.58 
 
 		 228 aa  77.4  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.913499 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1532  nitroreductase  30.33 
 
 		 213 aa  77.4  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.24948  normal  0.391496 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0797  nitroreductase  28.07 
 
 		 230 aa  76.6  0.0000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0707  nitroreductase  27.5 
 
 		 177 aa  75.9  0.0000000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2835  nitroreductase  32.86 
 
 		 186 aa  75.1  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000042093  hitchhiker  0.00000000000000316815 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1184  nitroreductase  31.8 
 
 		 213 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1201  nitroreductase  31.8 
 
 		 213 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.223399  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1074  nitroreductase  29.56 
 
 		 167 aa  74.3  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00616634 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1211  nitroreductase  30.18 
 
 		 213 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.120576 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29770  nitroreductase  30.3 
 
 		 241 aa  73.6  0.000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1590  nitroreductase  30.28 
 
 		 287 aa  73.9  0.000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000230699  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4554  nitroreductase  29.25 
 
 		 219 aa  72.8  0.000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.644271  normal  0.2444 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1352  nitroreductase  29.61 
 
 		 206 aa  72  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.160233  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2164  nitroreductase  30.37 
 
 		 190 aa  71.6  0.00000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4892  nitroreductase  32.24 
 
 		 213 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.967064  normal  0.0361814 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1344  nitroreductase  28.17 
 
 		 178 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2187  nitroreductase  29.85 
 
 		 173 aa  69.7  0.00000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.530109 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0221  nitroreductase  25.24 
 
 		 180 aa  69.7  0.00000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.602782  normal  0.0189765 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0217  nitroreductase family protein  29.95 
 
 		 188 aa  69.3  0.00000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13404  oxidoreductase  29.44 
 
 		 214 aa  68.9  0.00000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.15844e-25  normal  0.575826 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2262  nitroreductase  29.52 
 
 		 169 aa  68.9  0.00000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000575294  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  32.37 
 
 		 174 aa  67  0.0000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0337  nitroreductase  28.57 
 
 		 218 aa  67  0.0000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11180  nitroreductase  27.32 
 
 		 176 aa  67.4  0.0000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2325  nitroreductase  26.73 
 
 		 170 aa  67.4  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000978378  hitchhiker  0.00152148 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2354  nitroreductase  27.05 
 
 		 190 aa  66.6  0.0000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0174097  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0787  nitroreductase family protein  31.58 
 
 		 177 aa  65.9  0.0000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0290068  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3978  nitroreductase  34.12 
 
 		 209 aa  64.7  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0811138 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1752  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  29.57 
 
 		 217 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  25 
 
 		 170 aa  65.1  0.000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1834  nitroreductase  29.15 
 
 		 190 aa  64.7  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000154259  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2554  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  31.03 
 
 		 225 aa  63.5  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.216999  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5045  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  29.41 
 
 		 584 aa  63.2  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.87863  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2837  nitroreductase  27.7 
 
 		 194 aa  63.2  0.000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000111277  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0734  nitroreductase family protein  25.48 
 
 		 183 aa  62.8  0.000000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4232  nitroreductase  28.64 
 
 		 214 aa  62.8  0.000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.502325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0545  nitroreductase  27.36 
 
 		 172 aa  62.8  0.000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.361368  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0372  nitroreductase  28.97 
 
 		 178 aa  62.8  0.000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2465  nitroreductase  23.35 
 
 		 202 aa  62.8  0.000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.3868  normal  0.0443653 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1376  nitroreductase  27.23 
 
 		 194 aa  62.4  0.000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.10349 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0973  nitroreductase  33.5 
 
 		 348 aa  62.4  0.000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0534  nitroreductase  28.71 
 
 		 166 aa  62  0.000000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2855  nitroreductase  28.64 
 
 		 191 aa  62  0.000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.151785 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1674  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  28.76 
 
 		 216 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.505053  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33110  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase protein  30.36 
 
 		 216 aa  61.6  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00411999  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0019  nitroreductase  27.23 
 
 		 196 aa  61.6  0.00000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1379  NADPH-flavin oxidoreductase  29.69 
 
 		 174 aa  62  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4924  nitroreductase  49.21 
 
 		 222 aa  61.6  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5013  nitroreductase  49.21 
 
 		 222 aa  61.6  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4045  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  28.76 
 
 		 216 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1212  nitroreductase  29.95 
 
 		 176 aa  60.8  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.411819  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1856  nitroreductase  26.67 
 
 		 350 aa  61.2  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1459  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  32.23 
 
 		 240 aa  61.2  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2559  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  31.63 
 
 		 275 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0540417  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2975  nitroreductase  28.36 
 
 		 169 aa  60.5  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.522963 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3679  nitroreductase  28.44 
 
 		 216 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.033589 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1226  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  27.51 
 
 		 222 aa  60.5  0.00000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4116  hypothetical protein  29.65 
 
 		 218 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47750  hypothetical protein  32.08 
 
 		 218 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.327948  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1158  nitroreductase  28.36 
 
 		 169 aa  60.5  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000244648  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1649  nitroreductase  25.76 
 
 		 274 aa  60.1  0.00000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0893  nitroreductase  28.65 
 
 		 187 aa  60.1  0.00000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0202115  hitchhiker  0.00000963559 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06664  nitroreductase A  27.09 
 
 		 257 aa  59.7  0.00000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0115  Cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  26.91 
 
 		 218 aa  59.7  0.00000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1474  nitroreductase  27.1 
 
 		 334 aa  59.7  0.00000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5306  nitroreductase  47.62 
 
 		 222 aa  59.3  0.00000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1137  nitroreductase  32.7 
 
 		 209 aa  59.3  0.00000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.038928 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1513  nitroreductase  28.06 
 
 		 180 aa  59.3  0.00000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000744029 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1643  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  28.64 
 
 		 216 aa  59.3  0.00000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.462353  normal  0.0151841 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0721  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  29.6 
 
 		 249 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0629951  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1233  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  29.09 
 
 		 216 aa  58.9  0.00000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.643127  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1682  nitroreductase family protein  25.5 
 
 		 244 aa  58.9  0.00000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1528  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  24.75 
 
 		 244 aa  58.9  0.00000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.165515  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1647  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  24.75 
 
 		 244 aa  58.9  0.00000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>