More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6195 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_6195  luciferase family protein  100 
 
 		 323 aa  658    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0105566 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2530  luciferase-like protein  37.27 
 
 		 321 aa  161  1e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2575  luciferase family protein  37.27 
 
 		 321 aa  161  1e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.11005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2567  luciferase family protein  37.27 
 
 		 321 aa  161  1e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2521  luciferase-like monooxygenase  32.02 
 
 		 364 aa  144  2e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00896395  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0972  luciferase-like protein  32.53 
 
 		 342 aa  137  2e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1301  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase and related flavin-dependent oxidoreductase  31.1 
 
 		 336 aa  119  7.999999999999999e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.350981  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3900  Luciferase-like, subgroup  30.93 
 
 		 335 aa  109  5e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.310372  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2704  Luciferase-like monooxygenase  37.36 
 
 		 362 aa  108  9.000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.682555  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0532  luciferase-like protein  37.3 
 
 		 346 aa  106  5e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2881  luciferase-like protein  40.12 
 
 		 334 aa  105  8e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4444  Luciferase-like, subgroup  27.78 
 
 		 328 aa  105  1e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.155072  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2701  Luciferase-like monooxygenase  28.57 
 
 		 328 aa  102  8e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00906967  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2522  luciferase-like monooxygenase  30.06 
 
 		 374 aa  102  9e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0436016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1774  alkanal monooxygenase  27.78 
 
 		 371 aa  95.5  1e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0539243  normal  0.0415142 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4241  luciferase family protein  28.53 
 
 		 331 aa  94  3e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00842618  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3219  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  34.97 
 
 		 299 aa  92  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.58554  normal  0.82683 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3175  Luciferase-like monooxygenase  35.54 
 
 		 278 aa  90.9  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0012092 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0704  luciferase family protein  25.23 
 
 		 346 aa  89  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0169592 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2703  Luciferase-like monooxygenase  31.72 
 
 		 341 aa  88.6  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.190412  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0734  luciferase-like monooxygenase  25.84 
 
 		 364 aa  87.8  2e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1042  luciferase family protein  31.88 
 
 		 358 aa  87.8  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.548372  normal  0.0698642 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4006  luciferase-like protein  26.55 
 
 		 364 aa  86.7  5e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2098  luciferase family protein  32.02 
 
 		 309 aa  86.7  6e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.463112 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1793  alkanal monooxygenase  26.05 
 
 		 362 aa  84.7  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.476726 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3907  luciferase family protein  27.35 
 
 		 734 aa  84.7  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.139361  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4178  Luciferase-like monooxygenase  31.58 
 
 		 344 aa  84  0.000000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3525  Luciferase-like monooxygenase  34.29 
 
 		 291 aa  84  0.000000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.011869  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4624  luciferase family protein  30.06 
 
 		 306 aa  83.6  0.000000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3368  luciferase family protein  32.37 
 
 		 278 aa  83.2  0.000000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.852738  normal  0.168989 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0388  Luciferase-like, subgroup  25.21 
 
 		 365 aa  82.8  0.000000000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.178333 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4140  luciferase-like  37.4 
 
 		 354 aa  82.8  0.000000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.784966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2322  luciferase family protein  32.96 
 
 		 281 aa  82.8  0.000000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4238  luciferase family protein  33.18 
 
 		 345 aa  81.3  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.140286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4400  Luciferase-like monooxygenase  30.04 
 
 		 286 aa  81.3  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7375  Luciferase-like monooxygenase  32.62 
 
 		 282 aa  81.3  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.758616 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6834  luciferase family protein  37.67 
 
 		 327 aa  81.6  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0339  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  33.1 
 
 		 314 aa  81.3  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4460  luciferase-like protein  30.53 
 
 		 344 aa  81.3  0.00000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2368  Luciferase-like, subgroup  27.75 
 
 		 341 aa  80.5  0.00000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0029  Luciferase-like monooxygenase  31.03 
 
 		 346 aa  80.5  0.00000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5598  luciferase-like protein  32.28 
 
 		 294 aa  80.9  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2315  Luciferase-like monooxygenase  34.12 
 
 		 343 aa  80.5  0.00000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.447599  normal  0.644094 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4901  luciferase family protein  32.56 
 
 		 341 aa  80.9  0.00000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0086  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  33.33 
 
 		 313 aa  80.1  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6860  flavin-dependent oxidoreductase  37.93 
 
 		 352 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.515247  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05590  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  40 
 
 		 372 aa  79.7  0.00000000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.404895  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2104  luciferase family protein  24.2 
 
 		 353 aa  79.3  0.00000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0027  Luciferase-like monooxygenase  32.35 
 
 		 345 aa  79  0.00000000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.844059  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2278  luciferase  38.6 
 
 		 345 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0442763  normal  0.0103665 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0703  luciferase-like  23.99 
 
 		 378 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00489666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1675  luciferase family protein  25.29 
 
 		 362 aa  78.6  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.79214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3549  luciferase-like monooxygenase  32.08 
 
 		 343 aa  77.8  0.0000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2588  bacterial luciferase family protein  27.27 
 
 		 345 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.143367  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3478  luciferase family protein  26.54 
 
 		 347 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7310  monooxygenase  31.82 
 
 		 355 aa  77.4  0.0000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5219  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  33.53 
 
 		 304 aa  77.4  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5502  Luciferase-like monooxygenase  32.8 
 
 		 363 aa  76.6  0.0000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.86603  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0369  luciferase-like protein  31.64 
 
 		 307 aa  76.6  0.0000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0907338  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5600  luciferase-like protein  27.64 
 
 		 341 aa  76.6  0.0000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0953  putative luciferase-like monooxygenase  25.15 
 
 		 348 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0164  Luciferase-like monooxygenase  32.56 
 
 		 334 aa  76.3  0.0000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0157  Luciferase-like monooxygenase  32.56 
 
 		 334 aa  75.5  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.966319 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2745  luciferase family protein  43 
 
 		 405 aa  75.5  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.266873  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2260  luciferase family protein  32.14 
 
 		 347 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.294332  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34610  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  24.85 
 
 		 365 aa  75.5  0.000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.767315  normal  0.560922 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4850  hypothetical protein  28.71 
 
 		 347 aa  75.1  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.401256 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2334  Luciferase-like monooxygenase  34.94 
 
 		 304 aa  75.1  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0649051  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3263  luciferase-like  26.65 
 
 		 347 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.712407  normal  0.0317231 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3263  luciferase family protein  27.78 
 
 		 327 aa  75.1  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.187514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0573  luciferase family protein  25.66 
 
 		 421 aa  75.1  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3644  luciferase family protein  33.09 
 
 		 346 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.130748  normal  0.102583 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2265  luciferase family protein  33.09 
 
 		 346 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0291  luciferase-like protein  30.29 
 
 		 283 aa  73.9  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.336423  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2087  luciferase family protein  33.09 
 
 		 346 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0147979  normal  0.63736 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4198  Luciferase-like monooxygenase  34.78 
 
 		 376 aa  74.3  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6808  luciferase family protein  34.29 
 
 		 324 aa  74.3  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0301  luciferase family protein  30.29 
 
 		 283 aa  73.9  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.422839 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0282  luciferase family protein  30.29 
 
 		 283 aa  73.9  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2288  Luciferase-like monooxygenase  21.78 
 
 		 369 aa  73.9  0.000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000270787 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2829  Luciferase-like, subgroup  25.11 
 
 		 388 aa  73.6  0.000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.783781  hitchhiker  0.00301376 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4328  luciferase family protein  30.88 
 
 		 299 aa  73.2  0.000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.315112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2017  luciferase family protein  25.22 
 
 		 352 aa  72.8  0.000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.473194 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7171  monooxygenase  32.39 
 
 		 348 aa  72.8  0.000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21228  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0087  Luciferase-like monooxygenase  36.13 
 
 		 355 aa  72.8  0.000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3119  Luciferase-like monooxygenase  35.51 
 
 		 299 aa  72.4  0.000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.460925  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2551  luciferase family protein  21.43 
 
 		 374 aa  72.4  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.726432  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30470  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  24.69 
 
 		 366 aa  72  0.00000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.267791 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3707  Luciferase-like monooxygenase  25.51 
 
 		 377 aa  71.2  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3067  Luciferase-like monooxygenase  29.68 
 
 		 408 aa  70.9  0.00000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7516  putative alkanal monooxygenase  25.96 
 
 		 345 aa  70.5  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0890739  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6103  luciferase family protein  26.94 
 
 		 367 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0931091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1069  luciferase family protein  32.47 
 
 		 308 aa  70.9  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.322448 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4156  alkanal monooxygenase  26.29 
 
 		 353 aa  70.5  0.00000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.215497  normal  0.0257057 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1041  luciferase-like protein  32.99 
 
 		 308 aa  70.1  0.00000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.655824  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3405  luciferase-like protein  29.2 
 
 		 333 aa  70.1  0.00000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0849  luciferase family protein  29.41 
 
 		 293 aa  70.1  0.00000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.713393  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1057  luciferase family protein  32.99 
 
 		 308 aa  70.1  0.00000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.191696 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3538  Luciferase-like, subgroup  36.2 
 
 		 278 aa  70.1  0.00000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.240263  normal  0.716857 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4027  luciferase family protein  26.46 
 
 		 306 aa  70.1  0.00000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.826665 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>