96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5729 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_5729  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 712 aa  1373    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2549  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.01 
 
 		 680 aa  300  8e-80  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0511571  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6921  hypothetical protein  34.96 
 
 		 659 aa  260  5.0000000000000005e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2862  WD-40 repeat-containing protein  31.58 
 
 		 1229 aa  171  6e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.411367  normal  0.0157624 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1091  WD-40 repeat-containing protein  29.33 
 
 		 1402 aa  127  7e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2012  WD-40 repeat-containing protein  28.16 
 
 		 1236 aa  121  4.9999999999999996e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.583097  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1160  WD40 repeat, subgroup  28.88 
 
 		 1217 aa  117  5e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3572  diguanylate cyclase  23.23 
 
 		 902 aa  72.4  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3910  WD-40 repeat-containing protein  29.34 
 
 		 1152 aa  70.1  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3207  WD-40 repeat-containing protein  30.23 
 
 		 1157 aa  68.2  0.0000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.357908 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2167  serine/threonine protein kinase  29.82 
 
 		 973 aa  67  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.037734  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0571  serine/threonine protein kinase  30.21 
 
 		 965 aa  66.2  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.616948 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1092  serine/threonine protein kinase  30.47 
 
 		 969 aa  66.6  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1191  serine/threonine protein kinase  30.47 
 
 		 969 aa  65.9  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3825  serine/threonine protein kinase  28.49 
 
 		 1014 aa  65.9  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.445982  normal  0.0369399 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0928  serine/threonine protein kinase  28.07 
 
 		 1005 aa  65.5  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1225  serine/threonine protein kinase  30.47 
 
 		 897 aa  65.5  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.692846  normal  0.0133766 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1422  serine/threonine protein kinase  30.06 
 
 		 1046 aa  65.1  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2824  serine/threonine protein kinase  27.78 
 
 		 1020 aa  65.5  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.533566  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1433  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  32.17 
 
 		 1583 aa  64.3  0.000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1432  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  29.25 
 
 		 1609 aa  63.2  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6182  serine/threonine protein kinase  31.43 
 
 		 1314 aa  62.8  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0261102 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5302  serine/threonine protein kinase  26.81 
 
 		 972 aa  63.2  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0174  hypothetical protein  50 
 
 		 787 aa  62.4  0.00000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2159  serine/threonine protein kinase  28.04 
 
 		 1353 aa  62.4  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5405  hypothetical protein  24.1 
 
 		 1073 aa  62  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4789  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  30.17 
 
 		 1623 aa  62  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.702991  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1417  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  31.58 
 
 		 1598 aa  62  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3823  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  29.97 
 
 		 1617 aa  61.6  0.00000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0782446 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4807  serine/threonine protein kinase  27.73 
 
 		 1078 aa  61.2  0.00000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.551353  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3099  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  30.15 
 
 		 1599 aa  60.1  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.392467 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3296  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  30.51 
 
 		 1547 aa  59.3  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.558559 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1418  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  33.95 
 
 		 1607 aa  58.9  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0633  WD-40 repeat protein  43.08 
 
 		 1183 aa  59.3  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1024  hypothetical protein  26.87 
 
 		 1026 aa  58.5  0.0000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0000341432  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0112  WD-40 repeat protein  21.79 
 
 		 1236 aa  57.8  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0636944 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2184  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  26.59 
 
 		 1240 aa  57  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.653337  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3295  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  49.33 
 
 		 1398 aa  56.2  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0372  serine/threonine protein kinase  29.48 
 
 		 1032 aa  56.2  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.904942 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01092  transcriptional regulator  47.62 
 
 		 1092 aa  56.6  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.974377  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2215  serine/threonine protein kinase  44.05 
 
 		 1152 aa  55.5  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.62111 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6551  serine/threonine protein kinase  31.58 
 
 		 1013 aa  54.7  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.285307 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6918  transcriptional regulator, XRE family  26.87 
 
 		 1334 aa  54.3  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00260237  hitchhiker  0.000100378 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1272  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  30.06 
 
 		 1190 aa  54.3  0.000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000159501 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1435  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  46.67 
 
 		 1626 aa  54.3  0.000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2751  WD-40 repeat-containing protein  29.77 
 
 		 1355 aa  53.9  0.000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.865283 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0944  transcriptional regulatory protein-like protein  38.81 
 
 		 1131 aa  53.5  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.80445  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0565  WD-40 repeat protein  28.66 
 
 		 1264 aa  52.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5605  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  34.16 
 
 		 1823 aa  52.8  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.899312  normal  0.15288 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0430  putative transcriptional regulator, CadC  42.19 
 
 		 1074 aa  52.8  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0582  WD-40 repeat protein  28.66 
 
 		 1264 aa  52.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3444  WD-40 repeat protein  48.28 
 
 		 1308 aa  52.8  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.777666  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0735  serine/threonine protein kinase  32.72 
 
 		 698 aa  53.1  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1620  TPR repeat-containing protein  26.06 
 
 		 900 aa  52.4  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2104  WD-40 repeat-containing protein  26.01 
 
 		 1552 aa  52  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.581911  normal  0.024962 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6476  serine/threonine protein kinase  42.11 
 
 		 1187 aa  51.6  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2526  tetratricopeptide TPR_2  25.91 
 
 		 1154 aa  51.6  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.240995 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  26.98 
 
 		 1686 aa  51.6  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5262  hypothetical protein  24.51 
 
 		 1432 aa  51.2  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.435656  hitchhiker  0.00193947 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0799  transcriptional regulator, CadC  35.29 
 
 		 1102 aa  51.2  0.00007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  24.57 
 
 		 1760 aa  50.8  0.00008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0276  WD-40 repeat-containing protein  29.06 
 
 		 994 aa  50.4  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.741402 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3451  WD40 repeat, subgroup  44.62 
 
 		 1357 aa  49.7  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1578  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  34.38 
 
 		 602 aa  48.9  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000346283  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3115  TPR repeat-containing protein  35.96 
 
 		 284 aa  48.5  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000023055  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4252  WD-40 repeat-containing protein  27.87 
 
 		 1424 aa  48.1  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.501692  normal  0.871737 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4287  HEAT repeat-domain-containing protein-like protein  29.72 
 
 		 1194 aa  48.1  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.248989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0573  transcriptional activator domain-containing protein  26.69 
 
 		 1699 aa  47.8  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.836093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7085  WD-40 repeat-containing protein  26.47 
 
 		 1265 aa  47.8  0.0008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2911  transcriptional regulator, SARP family  37.5 
 
 		 885 aa  47.4  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00504446  hitchhiker  0.0000384659 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4295  WD-40 repeat-containing protein  31.52 
 
 		 1399 aa  46.6  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1841  WD-40 repeat-containing protein  25.9 
 
 		 1661 aa  47  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2232  serine/threonine protein kinase  28.07 
 
 		 1085 aa  47  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.235062  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2382  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.24 
 
 		 778 aa  47.4  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3197  O-GlcNAc transferase, p110 subunit  25 
 
 		 395 aa  47.4  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.187148  normal  0.017581 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1793  transcriptional regulator, XRE family  43.33 
 
 		 901 aa  46.6  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.03808  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0402  transcriptional regulator, CadC  40.58 
 
 		 1124 aa  47  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2814  hypothetical protein  37.7 
 
 		 1043 aa  47.4  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1544  transcriptional regulator, CadC  36.51 
 
 		 1089 aa  45.8  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2580  lysine decarboxylase transcriptional regulator, CadC  36.76 
 
 		 1063 aa  46.2  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1699  transcriptional regulator  36.76 
 
 		 1075 aa  46.2  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3123  hypothetical protein  46.43 
 
 		 1392 aa  46.2  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2647  lysine decarboxylase transcriptional regulator, CadC  36.76 
 
 		 1075 aa  46.6  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.15837  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2301  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  31.36 
 
 		 806 aa  46.6  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19711  hypothetical protein  23.38 
 
 		 865 aa  46.6  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.372007  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2755  transcriptional regulator  36.76 
 
 		 1080 aa  46.6  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.647625  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2224  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  27.78 
 
 		 884 aa  45.4  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1517  transcriptional regulator, CadC  36.51 
 
 		 1067 aa  45.1  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1508  transcriptional regulator, CadC  36.51 
 
 		 1089 aa  45.1  0.005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.76281  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1855  sulfotransferase  28.46 
 
 		 725 aa  45.1  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1874  hypothetical protein  32.16 
 
 		 374 aa  45.1  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  25.19 
 
 		 878 aa  44.7  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1415  transcriptional regulator, CadC  27.06 
 
 		 1092 aa  44.3  0.007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.931625  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1376  TPR repeat-containing protein  27.24 
 
 		 1261 aa  44.3  0.008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0670144  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  25.26 
 
 		 1711 aa  44.3  0.008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2419  TPR repeat-containing protein  26.5 
 
 		 792 aa  43.9  0.01  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0484292  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>