109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4779 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_4779  carboxymuconolactone decarboxylase  100 
 
 		 229 aa  457  9.999999999999999e-129  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2975  alkylhydroperoxidase  47.24 
 
 		 217 aa  175  6e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7089  carboxymuconolactone decarboxylase  35.79 
 
 		 190 aa  112  3e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1053  carboxymuconolactone decarboxylase  40.85 
 
 		 187 aa  112  3e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2163  carboxymuconolactone decarboxylase  34.74 
 
 		 194 aa  109  3e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.175503  normal  0.568346 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1632  carboxymuconolactone decarboxylase  34.97 
 
 		 190 aa  109  4.0000000000000004e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.543997 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3712  carboxymuconolactone decarboxylase  34.57 
 
 		 193 aa  105  5e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5137  alkylhydroperoxidase AhpD core  36.61 
 
 		 185 aa  102  3e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5226  alkylhydroperoxidase  36.61 
 
 		 185 aa  102  3e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.528293 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5518  alkylhydroperoxidase  36.61 
 
 		 185 aa  102  3e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.707884 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3746  carboxymuconolactone decarboxylase  36.96 
 
 		 176 aa  100  1e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.444516  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3819  carboxymuconolactone decarboxylase  36.96 
 
 		 176 aa  100  1e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.89884 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3758  carboxymuconolactone decarboxylase  36.96 
 
 		 176 aa  100  1e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.284023  normal  0.718458 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2440  carboxymuconolactone decarboxylase  34.22 
 
 		 176 aa  100  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4212  carboxymuconolactone decarboxylase  35.83 
 
 		 176 aa  99  6e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0509659  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4181  carboxymuconolactone decarboxylase  34.55 
 
 		 173 aa  98.2  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.917886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3707  carboxymuconolactone decarboxylase  34.05 
 
 		 176 aa  96.7  3e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3780  carboxymuconolactone decarboxylase  34.05 
 
 		 176 aa  96.7  3e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.422655  normal  0.467747 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3720  carboxymuconolactone decarboxylase  33.51 
 
 		 176 aa  95.5  7e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2473  carboxymuconolactone decarboxylase  34.05 
 
 		 178 aa  94.4  1e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.227868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3214  carboxymuconolactone decarboxylase  34.03 
 
 		 193 aa  94.4  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2330  carboxymuconolactone decarboxylase  30.65 
 
 		 200 aa  90.5  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.464442  normal  0.410951 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3120  Carboxymuconolactone decarboxylase  37.25 
 
 		 220 aa  90.1  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.104846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0319  Carboxymuconolactone decarboxylase  39.19 
 
 		 186 aa  87.4  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11564  hypothetical protein  32.45 
 
 		 188 aa  80.5  0.00000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1801  carboxymuconolactone decarboxylase  35.25 
 
 		 189 aa  80.1  0.00000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.198722 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4316  carboxymuconolactone decarboxylase  32.26 
 
 		 229 aa  78.2  0.00000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.44347 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0757  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  34.21 
 
 		 178 aa  74.7  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1245  Carboxymuconolactone decarboxylase  37.41 
 
 		 178 aa  74.3  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0281  carboxymuconolactone decarboxylase  31.62 
 
 		 214 aa  73.6  0.000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.209486  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3226  carboxymuconolactone decarboxylase  34.38 
 
 		 190 aa  72.8  0.000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.732993  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3288  carboxymuconolactone decarboxylase  34.38 
 
 		 190 aa  72.8  0.000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.93763  normal  0.56019 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3237  carboxymuconolactone decarboxylase  34.38 
 
 		 190 aa  72.8  0.000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0525831  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7422  hypothetical protein  27.75 
 
 		 186 aa  72.4  0.000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.752552  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0110  carboxymuconolactone decarboxylase  37.1 
 
 		 179 aa  72  0.000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.819214  normal  0.0623628 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6281  carboxymuconolactone decarboxylase  34.09 
 
 		 179 aa  71.2  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00558931  normal  0.0302802 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5095  carboxymuconolactone decarboxylase  35.29 
 
 		 190 aa  70.5  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.468539 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0111  carboxymuconolactone decarboxylase  28.75 
 
 		 174 aa  70.1  0.00000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.75447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4627  carboxymuconolactone decarboxylase  35.48 
 
 		 183 aa  68.9  0.00000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2839  carboxymuconolactone decarboxylase  37.6 
 
 		 187 aa  68.9  0.00000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.242216  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5304  carboxymuconolactone decarboxylase  34.17 
 
 		 191 aa  68.9  0.00000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.377989  normal  0.661983 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3670  Carboxymuconolactone decarboxylase  36.11 
 
 		 172 aa  67  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.681155  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0960  carboxymuconolactone decarboxylase  35.11 
 
 		 180 aa  67  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0633  carboxymuconolactone decarboxylase  29.73 
 
 		 178 aa  66.6  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.934772  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0646  carboxymuconolactone decarboxylase  29.73 
 
 		 178 aa  66.6  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.825839 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0626  carboxymuconolactone decarboxylase  29.73 
 
 		 178 aa  66.6  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.459666  normal  0.287262 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1659  carboxymuconolactone decarboxylase  33.33 
 
 		 183 aa  65.1  0.0000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.413809  normal  0.9764 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3973  transposase  32.35 
 
 		 213 aa  64.7  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.112408  normal  0.276962 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0798  carboxymuconolactone decarboxylase  29.94 
 
 		 180 aa  63.2  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.629789  normal  0.833566 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1934  hypothetical protein  29.66 
 
 		 174 aa  62.4  0.000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000792468  normal  0.160018 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1658  carboxymuconolactone decarboxylase  29.41 
 
 		 187 aa  62.4  0.000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.565944  normal  0.978426 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2405  carboxymuconolactone decarboxylase  30.14 
 
 		 184 aa  62  0.000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.315014 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2075  Carboxymuconolactone decarboxylase  30.23 
 
 		 180 aa  61.6  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.138932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4644  hypothetical protein  28.17 
 
 		 177 aa  60.1  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.350838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7488  carboxymuconolactone decarboxylase  34.92 
 
 		 186 aa  58.9  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2478  Carboxymuconolactone decarboxylase  28.77 
 
 		 226 aa  58.5  0.00000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00157967  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6226  carboxymuconolactone decarboxylase  29.77 
 
 		 184 aa  57.8  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.676342  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2949  hypothetical protein  27.27 
 
 		 194 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2233  Carboxymuconolactone decarboxylase  29.1 
 
 		 193 aa  55.8  0.0000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04023  4-carboxymuconolactone decarboxylase family protein (AFU_orthologue; AFUA_1G03690)  29.75 
 
 		 179 aa  55.5  0.0000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.573475  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0988  hypothetical protein  26.71 
 
 		 186 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05232  4-carboxymuconolactone decarboxylase family protein (AFU_orthologue; AFUA_6G11590)  30.43 
 
 		 234 aa  54.7  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0846359 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2914  carboxymuconolactone decarboxylase  27.74 
 
 		 189 aa  53.9  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0137  carboxymuconolactone decarboxylase  32.14 
 
 		 185 aa  53.5  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1906  uncharacterized peroxidase-related enzyme  25.45 
 
 		 180 aa  52.8  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0226007  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0805  carboxymuconolactone decarboxylase  24.64 
 
 		 188 aa  52.4  0.000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1193  carboxymuconolactone decarboxylase  28.57 
 
 		 180 aa  50.4  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.739413  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0594  hypothetical protein  31.37 
 
 		 211 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1956  hypothetical protein  25.39 
 
 		 184 aa  49.7  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0715147  normal  0.617384 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0971  hypothetical protein  24.58 
 
 		 170 aa  50.1  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000637227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3819  Carboxymuconolactone decarboxylase  28.7 
 
 		 210 aa  50.1  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.632879  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3436  hypothetical protein  27.32 
 
 		 184 aa  49.3  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0851  Carboxymuconolactone decarboxylase  27.94 
 
 		 185 aa  49.7  0.00004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3497  carboxymuconolactone decarboxylase  25.39 
 
 		 184 aa  48.9  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10471  hypothetical protein  34 
 
 		 190 aa  48.9  0.00006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6153  Carboxymuconolactone decarboxylase  26.4 
 
 		 191 aa  48.9  0.00007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1361  carboxymuconolactone decarboxylase  30.84 
 
 		 172 aa  48.5  0.00009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0029  alkylhydroperoxidase  28.57 
 
 		 144 aa  48.1  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.622456  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3980  carboxymuconolactone decarboxylase  25.39 
 
 		 184 aa  48.1  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.395763  normal  0.33482 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2958  carboxymuconolactone decarboxylase  28.57 
 
 		 186 aa  47.4  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0231766 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4279  carboxymuconolactone decarboxylase  26.8 
 
 		 184 aa  47  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.445226  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4087  carboxymuconolactone decarboxylase  26.8 
 
 		 184 aa  47  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0028  carboxymuconolactone decarboxylase  25.85 
 
 		 185 aa  47.4  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4499  carboxymuconolactone decarboxylase  30.43 
 
 		 184 aa  47.4  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.414463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0015  carboxymuconolactone decarboxylase  27.59 
 
 		 173 aa  46.6  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00130633  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3805  carboxymuconolactone decarboxylase  32.43 
 
 		 179 aa  46.2  0.0004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.565066 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2144  carboxymuconolactone decarboxylase  32.32 
 
 		 173 aa  46.2  0.0005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.547762  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1746  alkylhydroperoxidase  24.27 
 
 		 147 aa  45.8  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0138346  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0272  alkylhydroperoxidase  24.41 
 
 		 150 aa  45.1  0.0008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.300614  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2093  hypothetical protein  28.23 
 
 		 187 aa  44.7  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0291682  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1482  hypothetical protein  28.23 
 
 		 187 aa  44.7  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1121  hypothetical protein  28.23 
 
 		 187 aa  44.7  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1401  hypothetical protein  28.23 
 
 		 187 aa  44.7  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3153  hypothetical protein  28.23 
 
 		 193 aa  44.7  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2386  4-carboxymuconolactone decarboxylase  28.23 
 
 		 193 aa  44.7  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0186  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  32.95 
 
 		 159 aa  45.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3128  alkylhydroperoxidase AhpD core  28.57 
 
 		 163 aa  43.9  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0304479  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1057  carboxymuconolactone decarboxylase  27.73 
 
 		 181 aa  43.9  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.506281 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1334  hypothetical protein  25.45 
 
 		 207 aa  43.9  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.256445 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3916  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  28.18 
 
 		 143 aa  43.9  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0761488 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>