115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3983 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_3983  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 161 aa  318  1.9999999999999998e-86  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.189936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2431  NUDIX hydrolase  54.68 
 
 		 148 aa  151  2.9999999999999998e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.960036  normal  0.286625 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5627  NUDIX hydrolase  44.36 
 
 		 156 aa  108  3e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0133288  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00160  ADP-ribose pyrophosphatase  33.09 
 
 		 143 aa  65.5  0.0000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.119195 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3433  NUDIX hydrolase  31.76 
 
 		 300 aa  60.5  0.000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2293  mutator MutT protein  27.74 
 
 		 129 aa  52.8  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.192428  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06372  hypothetical protein  34.15 
 
 		 132 aa  50.4  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3918  NUDIX hydrolase  44.64 
 
 		 136 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.49136  normal  0.198135 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1777  NAD(+) diphosphatase  39.73 
 
 		 282 aa  48.5  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2424  MutT/Nudix family protein  32.1 
 
 		 148 aa  48.1  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.919203  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2691  mutT/nudix family protein  32.1 
 
 		 148 aa  48.1  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000651612 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5306  NUDIX hydrolase  52 
 
 		 156 aa  48.1  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.838276  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7955  hypothetical protein  40.68 
 
 		 172 aa  48.1  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2596  mutator MutT protein  51.72 
 
 		 132 aa  47.8  0.00006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.202287  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2714  mutT/nudix family protein  32.1 
 
 		 148 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0283427  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2492  mutT/nudix family protein  30.86 
 
 		 148 aa  47  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.802073  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2453  MutT/Nudix family protein  33.33 
 
 		 148 aa  46.6  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0206727  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2463  NUDIX hydrolase  38.71 
 
 		 148 aa  46.6  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.101073  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2742  mutT/nudix family protein  33.33 
 
 		 148 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000947125  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4181  mutT/nudix family protein  31.25 
 
 		 136 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.487882  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3001  NUDIX hydrolase  40.79 
 
 		 134 aa  46.2  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.759496  normal  0.595772 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2699  mutT/nudix family protein  37.1 
 
 		 148 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2611  mutT/nudix family protein  38.71 
 
 		 148 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000504287 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1907  NUDIX hydrolase  29.57 
 
 		 149 aa  45.4  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.397506  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0808  NUDIX hydrolase  31.58 
 
 		 136 aa  45.4  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.291918  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1398  NUDIX hydrolase  30.77 
 
 		 153 aa  45.1  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1257  NUDIX hydrolase  42.86 
 
 		 146 aa  45.1  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3564  mutator MutT protein  48.28 
 
 		 132 aa  44.7  0.0005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3636  mutT/nudix family protein  26.67 
 
 		 147 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5229  NUDIX hydrolase  38.81 
 
 		 135 aa  44.7  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.354161  normal  0.044426 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3416  mutT/nudix family protein  26.67 
 
 		 147 aa  44.7  0.0006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3685  mutT/nudix family protein  26.67 
 
 		 147 aa  44.7  0.0006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.293788  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3019  NUDIX hydrolase  44.83 
 
 		 139 aa  44.7  0.0006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0809676 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25790  ADP-ribose pyrophosphatase  41.51 
 
 		 130 aa  44.7  0.0006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1062  NUDIX hydrolase  41.07 
 
 		 137 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3967  MutT/nudix family protein  35 
 
 		 146 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.447658  normal  0.0696331 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2967  NUDIX hydrolase  46.43 
 
 		 142 aa  43.9  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.668202  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1166  NTP pyrophosphohydrolase  46.55 
 
 		 132 aa  43.5  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0463  NUDIX hydrolase  35.38 
 
 		 135 aa  43.5  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1163  NUDIX hydrolase  27.27 
 
 		 139 aa  43.5  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.997199 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2828  mutator MutT protein  46.55 
 
 		 132 aa  43.5  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.623153  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0645  NUDIX hydrolase  34.07 
 
 		 153 aa  43.9  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0664584 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1757  NUDIX hydrolase  40.85 
 
 		 144 aa  43.9  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.207601  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1103  NUDIX hydrolase  41.07 
 
 		 137 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.440474 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1350  NUDIX hydrolase  41.18 
 
 		 143 aa  43.5  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.246365  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1617  NUDIX hydrolase  29.85 
 
 		 132 aa  43.5  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000267139  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4350  NUDIX hydrolase  41.07 
 
 		 137 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.199934  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3058  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 134 aa  43.5  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3935  NUDIX hydrolase  43.33 
 
 		 180 aa  43.9  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.445815  hitchhiker  0.00928201 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1790  NUDIX hydrolase  26.95 
 
 		 168 aa  43.9  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000145412  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0925  NUDIX hydrolase  31.68 
 
 		 159 aa  43.5  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3377  MutT/Nudix family protein  25.56 
 
 		 147 aa  42.7  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3327  MutT/Nudix family protein  25.56 
 
 		 147 aa  43.1  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1810  NUDIX family hydrolase  48.98 
 
 		 160 aa  43.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.610714  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2676  mutT/nudix family protein  29.87 
 
 		 136 aa  43.1  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.870264  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0782  MutT/nudix family protein, putative  31.94 
 
 		 171 aa  42.7  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.180522  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19205  hypothetical protein  43.1 
 
 		 152 aa  42.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.764994 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2758  NUDIX hydrolase  46.55 
 
 		 132 aa  43.1  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1657  hypothetical protein  43.1 
 
 		 152 aa  43.1  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.745316  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3311  NUDIX hydrolase  33.93 
 
 		 147 aa  43.1  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.585247  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1092  NUDIX hydrolase  41.07 
 
 		 137 aa  43.1  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0227714  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4321  NUDIX hydrolase  39.13 
 
 		 291 aa  42.7  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8438  NUDIX hydrolase  27.56 
 
 		 157 aa  43.1  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.370098 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1208  NUDIX hydrolase  34.57 
 
 		 145 aa  42.4  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00522859  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0393  NUDIX hydrolase  44.64 
 
 		 151 aa  42  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0143853  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5809  NUDIX hydrolase  32.47 
 
 		 143 aa  42  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.180379  decreased coverage  0.0027447 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2482  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 138 aa  42.4  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1476  NUDIX hydrolase  35.14 
 
 		 155 aa  42  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1584  mutT/nudix family protein  32.14 
 
 		 147 aa  42.4  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0325451 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02110  NUDIX family protein  30.48 
 
 		 399 aa  42.4  0.003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3644  mutT/nudix family protein  25.56 
 
 		 147 aa  42  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3868  NUDIX hydrolase  40.58 
 
 		 327 aa  41.6  0.004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.558102  normal  0.492262 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3039  Protein of unknown function DUF2029  37.31 
 
 		 570 aa  42  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1918  NUDIX hydrolase  41.67 
 
 		 177 aa  42  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2661  NUDIX hydrolase  43.55 
 
 		 147 aa  42  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3873  NUDIX hydrolase  34.07 
 
 		 147 aa  41.6  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.666215  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2041  8-oxo-dGTPase  41.82 
 
 		 162 aa  41.2  0.005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0592  hypothetical protein  27.91 
 
 		 316 aa  41.6  0.005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4163  NUDIX hydrolase  37.1 
 
 		 133 aa  41.6  0.005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.2349  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0794  NUDIX family hydrolase  30.56 
 
 		 171 aa  41.2  0.005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.147035  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1319  ADP-ribose pyrophosphatase  26.51 
 
 		 148 aa  41.6  0.005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0720149  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1370  NUDIX hydrolase  31.18 
 
 		 141 aa  41.6  0.005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3464  NUDIX hydrolase  35.82 
 
 		 188 aa  41.6  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.918471  hitchhiker  0.00303424 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2108  NUDIX hydrolase  38.71 
 
 		 157 aa  41.6  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000452555  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0096  NUDIX hydrolase  35.9 
 
 		 141 aa  41.2  0.006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0757202  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0229  putative MutT family protein  37.5 
 
 		 141 aa  41.2  0.006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0029  NUDIX hydrolase  43.64 
 
 		 137 aa  41.2  0.006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.999066 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2278  NUDIX hydrolase  33.85 
 
 		 134 aa  41.2  0.006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.369324  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0830  NUDIX hydrolase  32.54 
 
 		 291 aa  41.2  0.006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1340  NUDIX hydrolase  32.29 
 
 		 171 aa  41.2  0.006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.902443 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1495  NUDIX hydrolase  38.98 
 
 		 149 aa  41.2  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0340127 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3733  mutT/nudix family protein  32.14 
 
 		 147 aa  41.2  0.006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.412613  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0488  NUDIX hydrolase  32.14 
 
 		 131 aa  40.8  0.007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.262793  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0501  NUDIX hydrolase  32.14 
 
 		 131 aa  40.8  0.007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0370899  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2221  NUDIX hydrolase  47.73 
 
 		 146 aa  41.2  0.007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.25917 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5001  NUDIX hydrolase  51.16 
 
 		 156 aa  40.8  0.007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1264  NUDIX hydrolase  35.53 
 
 		 146 aa  40.8  0.007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.338763  normal  0.879303 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0555  NUDIX hydrolase  35.48 
 
 		 149 aa  40.8  0.008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00430973 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3653  mutT/nudix family protein  25.56 
 
 		 147 aa  40.8  0.008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3976  NTP pyrophosphohydrolase MutT family  45.45 
 
 		 135 aa  40.8  0.008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.495493  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>