More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3630 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_3630  signal-transduction protein  100 
 
 		 122 aa  241  1.9999999999999999e-63  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.30892 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1100  signal-transduction protein  77.69 
 
 		 152 aa  193  7e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1905  putative signal transduction protein with CBS domains  60.68 
 
 		 139 aa  150  4e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5000  signal-transduction protein  62.5 
 
 		 130 aa  151  4e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000125843 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4486  CBS domain-containing protein  61.67 
 
 		 129 aa  149  8.999999999999999e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0214678 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6392  putative signal transduction protein with CBS domains  68.38 
 
 		 133 aa  149  1e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0532  signal-transduction protein  60.83 
 
 		 126 aa  149  2e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.392409  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1395  putative signal transduction protein with CBS domains  56.9 
 
 		 138 aa  139  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.319409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1395  signal-transduction protein  40.59 
 
 		 141 aa  72.8  0.000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0871644 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3725  signal-transduction protein  40 
 
 		 143 aa  70.5  0.000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0705  putative signal transduction protein with CBS domains  41.82 
 
 		 124 aa  69.3  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.108789  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1745  hypothetical protein  33.63 
 
 		 144 aa  69.3  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.87888 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1108  signal-transduction protein  36.28 
 
 		 144 aa  68.9  0.00000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1597  signal-transduction protein  33.63 
 
 		 141 aa  67.4  0.00000000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2537  putative signal transduction protein with CBS domains  37.84 
 
 		 143 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.482232 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0876  signal-transduction protein  36.94 
 
 		 141 aa  66.2  0.0000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2262  CBS domain-containing protein  37.84 
 
 		 143 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.175418 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0628  signal-transduction protein  37.61 
 
 		 141 aa  65.9  0.0000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0410  putative CBS domain-containing signal transduction protein  42.99 
 
 		 124 aa  65.9  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.269207  normal  0.258379 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0417  signal transduction protein  34.26 
 
 		 139 aa  65.9  0.0000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.694858  normal  0.0742839 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0633  signal-transduction protein  34.58 
 
 		 141 aa  65.9  0.0000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.96504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2880  signal-transduction protein  35.9 
 
 		 145 aa  66.2  0.0000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.982708  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0415  signal-transduction protein  38.24 
 
 		 145 aa  65.1  0.0000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.682078  normal  0.0782148 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5476  putative signal transduction protein with CBS domains  34.58 
 
 		 145 aa  65.1  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2219  putative signal-transduction protein with CBS domains  37.17 
 
 		 143 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0827472 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1915  signal-transduction protein  32.76 
 
 		 144 aa  64.3  0.0000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.414103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1217  CBS domain-containing protein  34.55 
 
 		 143 aa  63.5  0.0000000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2797  signal-transduction protein  35.19 
 
 		 146 aa  62.8  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.182223  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2374  signal-transduction protein  37.72 
 
 		 146 aa  63.2  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.425597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1568  cyclic nucleotide-binding protein  33.62 
 
 		 634 aa  63.5  0.000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0253  signal-transduction protein  32.41 
 
 		 140 aa  62.8  0.000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.00276555  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0527  CBS domain containing protein  28.33 
 
 		 147 aa  62.4  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3542  putative signal transduction protein with CBS domains  39.05 
 
 		 140 aa  62.8  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.329551  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0498  CBS domain-containing protein  31.62 
 
 		 279 aa  62  0.000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.235797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1938  CBS domain-containing protein  33.64 
 
 		 143 aa  62  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.704039  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0914  putative signal transduction protein with CBS domains  30.43 
 
 		 131 aa  61.6  0.000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.0000312526  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5213  hypothetical protein  39.64 
 
 		 142 aa  61.2  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.995327  normal  0.0487848 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4635  signal-transduction protein  34.21 
 
 		 143 aa  61.6  0.000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.574258  normal  0.318433 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2362  signal-transduction protein  38.74 
 
 		 143 aa  61.2  0.000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.67854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1479  signal-transduction protein  35.96 
 
 		 238 aa  60.8  0.000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.543565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0663  signal-transduction protein  38.3 
 
 		 127 aa  60.8  0.000000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1580  signal-transduction protein  33.64 
 
 		 143 aa  60.5  0.000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0967784 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0255  signal-transduction protein  33.01 
 
 		 142 aa  60.5  0.000000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0155982  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06340  putative signal-transduction protein with CBS domains  33.93 
 
 		 141 aa  60.5  0.000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000465197  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1387  CBS domain containing protein  27.5 
 
 		 148 aa  60.1  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0339  CBS domain-containing protein  30.77 
 
 		 279 aa  59.7  0.00000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.436853  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0804  putative signal transduction protein with CBS domains  32.46 
 
 		 129 aa  59.3  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3744  signal transduction protein  37.96 
 
 		 148 aa  58.9  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0771  signal-transduction protein  30.83 
 
 		 164 aa  59.3  0.00000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.411579  normal  0.0544722 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0345  signal-transduction protein  34.23 
 
 		 150 aa  58.9  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0188  signal-transduction protein  37.23 
 
 		 128 aa  58.5  0.00000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.885258  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0637  signal-transduction protein  39.62 
 
 		 140 aa  58.5  0.00000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3231  signal-transduction protein  36.04 
 
 		 143 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00933533  normal  0.19525 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1885  signal-transduction protein  30.97 
 
 		 145 aa  58.2  0.00000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1488  signal-transduction protein  31.53 
 
 		 142 aa  58.2  0.00000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.661715 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1425  signal-transduction protein  36.45 
 
 		 144 aa  57.8  0.00000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.316039 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0420  signal-transduction protein  34.29 
 
 		 158 aa  57.8  0.00000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1474  signal transduction protein  35.65 
 
 		 128 aa  57.8  0.00000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1421  CBS domain-containing protein  30.77 
 
 		 279 aa  57.4  0.00000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.351959  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0939  signal-transduction protein  35.59 
 
 		 135 aa  57.8  0.00000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.120432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1394  signal-transduction protein  33.64 
 
 		 135 aa  57  0.00000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.136388 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2052  putative signal transduction protein with CBS domains  33.33 
 
 		 144 aa  57  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0447  signal-transduction protein  29.2 
 
 		 145 aa  57  0.00000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.285729  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0004  signal-transduction protein  32.14 
 
 		 142 aa  57  0.00000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0964  putative signal transduction protein with CBS domains  30.43 
 
 		 132 aa  56.2  0.0000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3209  putative signal transduction protein with CBS domains  30.77 
 
 		 136 aa  56.6  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0239  signal transduction protein  29.31 
 
 		 128 aa  56.2  0.0000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.371768 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2229  CBS domain-containing protein  35.25 
 
 		 313 aa  56.6  0.0000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0389  signal-transduction protein  34.45 
 
 		 150 aa  56.2  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0416  signal-transduction protein  33.03 
 
 		 130 aa  56.2  0.0000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.498724  normal  0.0778746 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4551  putative signal transduction protein with CBS domains  36.54 
 
 		 154 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.610614  normal  0.0178706 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1339  signal-transduction protein  33.64 
 
 		 160 aa  56.2  0.0000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.44426 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4418  putative signal-transduction protein with CBS domains  36.54 
 
 		 154 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.577015  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0338  signal-transduction protein  29.91 
 
 		 145 aa  57  0.0000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0354  CBS domain-containing protein  36.11 
 
 		 645 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.466174 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3328  putative signal transduction protein with CBS domains  31.71 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2661  signal-transduction protein  36.04 
 
 		 177 aa  56.2  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.63207  normal  0.665873 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1107  signal-transduction protein  33.64 
 
 		 143 aa  55.5  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3268  CBS domain-containing protein  34.48 
 
 		 142 aa  55.8  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0818  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  35.9 
 
 		 603 aa  55.5  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.410169  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0380  CBS domain-containing protein  36.11 
 
 		 645 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.488205  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0656  CBS domain containing protein  30.36 
 
 		 142 aa  55.8  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1225  signal-transduction protein  36.17 
 
 		 127 aa  56.2  0.0000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.276884  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2834  signal-transduction protein  33.33 
 
 		 145 aa  55.1  0.0000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.316088  normal  0.231791 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0770  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  35.9 
 
 		 603 aa  55.1  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.461269  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0100  putative signal transduction protein with CBS domains  34.71 
 
 		 143 aa  55.1  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0620  signal-transduction protein  36.27 
 
 		 144 aa  55.5  0.0000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0397  putative signal transduction protein with CBS domains  28.57 
 
 		 142 aa  54.7  0.0000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0148627  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0051  cyclic nucleotide-binding protein  35.04 
 
 		 629 aa  54.7  0.0000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0822  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  35.9 
 
 		 603 aa  55.1  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0382  CBS domain-containing protein  35.64 
 
 		 645 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.263171 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1229  signal-transduction protein  31.78 
 
 		 136 aa  54.7  0.0000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1141  signal-transduction protein  34.51 
 
 		 150 aa  54.7  0.0000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.403559  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2115  putative signal transduction protein with CBS domains  43.68 
 
 		 148 aa  54.7  0.0000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2203  hypothetical protein  31.82 
 
 		 144 aa  54.7  0.0000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2480  CBS domain-containing protein  30.43 
 
 		 639 aa  54.7  0.0000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.218166  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0597  signal transduction protein  30.97 
 
 		 145 aa  54.3  0.0000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0040  CBS  32.73 
 
 		 146 aa  53.9  0.0000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.847902  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2080  signal-transduction protein  33.93 
 
 		 141 aa  53.9  0.0000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4974  putative signal-transduction protein with CBS domains  30.97 
 
 		 147 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0816417 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>