150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2735 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2735  HipA protein  100 
 
 		 418 aa  825    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9054  hypothetical protein  45.13 
 
 		 414 aa  322  6e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7391  hypothetical protein  44.07 
 
 		 415 aa  320  3.9999999999999996e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0477  HipA domain-containing protein  43.34 
 
 		 415 aa  317  3e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5344  HipA domain-containing protein  43.42 
 
 		 415 aa  312  9e-84  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.71584 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0226  HipA-like protein  42.48 
 
 		 415 aa  305  1.0000000000000001e-81  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0237  HipA domain protein  41.45 
 
 		 415 aa  295  1e-78  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0949  HipA domain protein  41.69 
 
 		 414 aa  263  3e-69  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0266  HipA domain protein  40.98 
 
 		 414 aa  262  6e-69  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.506615  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2057  HipA domain protein  40.31 
 
 		 421 aa  256  4e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3419  HipA domain protein  38.28 
 
 		 425 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3690  HipA domain protein  38.08 
 
 		 414 aa  219  6e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.325167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5437  HipA domain-containing protein  38.44 
 
 		 423 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1056  hypothetical protein  39.83 
 
 		 405 aa  208  2e-52  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4942  HipA domain-containing protein  34.84 
 
 		 434 aa  196  4.0000000000000005e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1974  hypothetical protein  35.12 
 
 		 410 aa  187  2e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4200  hypothetical protein  37.41 
 
 		 414 aa  187  4e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.250516 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2229  hypothetical protein  34.43 
 
 		 433 aa  186  7e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1557  HipA domain protein  35.82 
 
 		 435 aa  184  3e-45  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6228  uncharacterized protein related to capsule biosynthesis enzyme-like  35.19 
 
 		 441 aa  181  2e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.707965  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2079  hypothetical protein  34.31 
 
 		 410 aa  176  5e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6144  hypothetical protein  35.23 
 
 		 412 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0864  HipA domain-containing protein  31.84 
 
 		 435 aa  163  5.0000000000000005e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2868  hypothetical protein  38.22 
 
 		 430 aa  160  5e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4145  HipA-like  33.68 
 
 		 407 aa  160  6e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.713937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5216  HipA domain-containing protein  35.41 
 
 		 420 aa  159  6e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.939418  normal  0.517526 
 
 
-
 
NC_009795  CCC13826_0620  HipA domain-containing protein  27.09 
 
 		 390 aa  157  4e-37  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00496781  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2093  HipA domain-containing protein  31.63 
 
 		 412 aa  155  8e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.244247  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4338  HipA domain-containing protein  32.84 
 
 		 460 aa  154  2.9999999999999998e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.850917 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3717  HipA domain protein  34.84 
 
 		 435 aa  151  2e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.880345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2931  hypothetical protein  33.14 
 
 		 419 aa  147  4.0000000000000006e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.431501  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2399  hypothetical protein  32.46 
 
 		 387 aa  145  1e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2039  amidophosphoribosyl transferase  31.07 
 
 		 404 aa  145  1e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1983  HipA domain-containing protein  34.65 
 
 		 420 aa  142  9e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.435879  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0896  HipA domain-containing protein  32.91 
 
 		 409 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0263  HipA domain-containing protein  33.25 
 
 		 430 aa  139  7.999999999999999e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0325  HipA domain protein  32.05 
 
 		 430 aa  134  3.9999999999999996e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0226  HipA domain protein  32.99 
 
 		 417 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4463  HipA domain-containing protein  34.08 
 
 		 440 aa  126  6e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7006  HipA domain protein  30.11 
 
 		 440 aa  126  8.000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2365  HipA domain-containing protein  32.47 
 
 		 411 aa  122  9.999999999999999e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0940993  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1246  hypothetical protein  36.95 
 
 		 387 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2958  HipA domain-containing protein  29.79 
 
 		 431 aa  117  3e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00079  Amidophosphoribosyl transferase  28.61 
 
 		 330 aa  114  3e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3279  HipA domain protein  34.57 
 
 		 420 aa  108  1e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.153165  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0261  HipA domain protein  39.16 
 
 		 152 aa  102  1e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4128  HipA domain-containing protein  29.18 
 
 		 431 aa  102  2e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.871834  normal  0.173226 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0522  hypothetical protein  28.18 
 
 		 408 aa  100  4e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1566  HipA-like  28.57 
 
 		 405 aa  98.2  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2229  HipA domain protein  27.09 
 
 		 429 aa  95.1  2e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4918  HipA domain-containing protein  28.88 
 
 		 429 aa  94.4  4e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.53112 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4311  HipA domain-containing protein  27.74 
 
 		 418 aa  92.8  1e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.340239  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03320  hypothetical protein  30 
 
 		 407 aa  89.7  9e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.79257  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3781  hypothetical protein  24.66 
 
 		 430 aa  89.4  1e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.42028 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0495  HipA domain-containing protein  26.49 
 
 		 411 aa  89  2e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0092  hypothetical protein  26.51 
 
 		 432 aa  86.7  7e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4190  hypothetical protein  32.5 
 
 		 295 aa  86.7  7e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.196944 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1315  hypothetical protein  26.22 
 
 		 434 aa  85.5  0.000000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0101  hypothetical protein  22.65 
 
 		 433 aa  84.3  0.000000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.292641  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1137  hypothetical protein  27.11 
 
 		 418 aa  79.3  0.0000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.185234  normal  0.0419305 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0159  HipA domain protein  27.27 
 
 		 380 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4363  HipA domain-containing protein  28.38 
 
 		 449 aa  78.2  0.0000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0212485  normal  0.0590338 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4376  HipA domain-containing protein  30.75 
 
 		 429 aa  77  0.0000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0338797  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2599  HipA domain-containing protein  28.61 
 
 		 444 aa  76.6  0.0000000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04069  HipA domain protein  27.44 
 
 		 424 aa  76.6  0.0000000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2426  HipA-like protein  28.07 
 
 		 430 aa  74.7  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.833222 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1474  HipA domain protein  27.78 
 
 		 426 aa  74.7  0.000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.738708  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2264  HipA domain-containing protein  24.23 
 
 		 435 aa  70.1  0.00000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0153  HipA domain protein  28.29 
 
 		 305 aa  70.1  0.00000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0109  HipA domain protein  26.76 
 
 		 435 aa  69.7  0.00000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0628  HipA domain-containing protein  28.8 
 
 		 392 aa  69.3  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000875188 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2033  HipA domain-containing protein  25.98 
 
 		 435 aa  68.2  0.0000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.420759 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0494  hypothetical protein  24.86 
 
 		 318 aa  66.6  0.0000000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0465  HipA domain-containing protein  29.2 
 
 		 419 aa  65.9  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2924  hypothetical protein  29.3 
 
 		 431 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000413391  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2664  hypothetical protein  22.62 
 
 		 439 aa  63.9  0.000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.309565  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1467  HipA domain protein  23.84 
 
 		 433 aa  63.5  0.000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00227623  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0139  HipA N-terminal domain protein  28 
 
 		 460 aa  61.2  0.00000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.388131 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3588  HipA domain-containing protein  28.09 
 
 		 391 aa  60.1  0.00000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.252568  normal  0.492905 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2955  HipA N-terminal domain protein  31.35 
 
 		 432 aa  59.3  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2637  HipA domain-containing protein  23.8 
 
 		 433 aa  59.3  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000320909  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4226  hypothetical protein  59.62 
 
 		 141 aa  58.9  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0247  HipA domain-containing protein  32.26 
 
 		 318 aa  58.2  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0210  HipA domain protein  32.26 
 
 		 318 aa  57.8  0.0000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5391  HipA domain-containing protein  27.55 
 
 		 440 aa  56.6  0.0000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0326211  hitchhiker  0.00843465 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2281  protein related to capsule biosynthesis enzymes, HipA-like  34.65 
 
 		 430 aa  56.2  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.207014 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5805  HipA domain-containing protein  29.81 
 
 		 413 aa  56.2  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0420791 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1629  hypothetical protein  28 
 
 		 443 aa  55.8  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1275  hypothetical protein  27.23 
 
 		 425 aa  55.5  0.000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.370797  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1548  HipA domain-containing protein  31.34 
 
 		 413 aa  55.8  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0470095 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0292  HipA N-terminal domain protein  31.13 
 
 		 414 aa  55.5  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2649  HipA-like  31.12 
 
 		 447 aa  54.7  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.354329  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3753  HipA domain-containing protein  28 
 
 		 419 aa  54.7  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0511  HipA-like  29.95 
 
 		 422 aa  53.9  0.000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0104648  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6255  HipA domain-containing protein  30.99 
 
 		 434 aa  53.9  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2292  hypothetical protein  26.49 
 
 		 312 aa  53.9  0.000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1252  HipA-like  25.4 
 
 		 434 aa  53.5  0.000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6580  HipA domain-containing protein  25.4 
 
 		 434 aa  53.5  0.000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0403  HipA domain-containing protein  33.85 
 
 		 430 aa  53.5  0.000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.173425  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0502  hypothetical protein  32.46 
 
 		 430 aa  52.8  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>