More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2635 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2635  ABC transporter related  100 
 
 		 445 aa  885    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.182564  normal  0.318501 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4887  ABC transporter related  74.84 
 
 		 455 aa  425  1e-117  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.98231  normal  0.130468 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2301  ABC transporter related protein  75.95 
 
 		 264 aa  370  1e-101  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00393831  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0799  ABC transporter related  70.45 
 
 		 266 aa  356  3.9999999999999996e-97  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0396  ABC transporter related protein  69.67 
 
 		 262 aa  345  8.999999999999999e-94  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0709854  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2351  ABC transporter related  72.61 
 
 		 255 aa  340  2.9999999999999998e-92  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.234031  normal  0.139824 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7899  ABC transporter related  69.83 
 
 		 277 aa  339  5.9999999999999996e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2234  ABC transporter related  72.05 
 
 		 255 aa  338  9.999999999999999e-92  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.184169  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0950  ABC transporter-like protein  70.25 
 
 		 247 aa  333  4e-90  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.256342  normal  0.361687 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4480  ABC transporter related protein  67.08 
 
 		 256 aa  329  5.0000000000000004e-89  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.269764  normal  0.77881 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1745  efflux ABC transporter, lipoprotein translocase (LPT) family, ATP-binding protein  69.01 
 
 		 256 aa  328  8e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.357481 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1179  ABC transporter related  64.63 
 
 		 253 aa  323  5e-87  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.515909  normal  0.937486 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4473  ABC transporter related protein  64.29 
 
 		 291 aa  321  1.9999999999999998e-86  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.204662  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8290  ABC transporter related  67.54 
 
 		 253 aa  321  1.9999999999999998e-86  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2271  ABC transporter related  62.06 
 
 		 258 aa  321  1.9999999999999998e-86  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000137949 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5675  ABC transporter related  65.97 
 
 		 250 aa  320  5e-86  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.216475  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3961  ABC transporter related  66.67 
 
 		 255 aa  317  2e-85  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.538851  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2392  ABC transporter related protein  65.18 
 
 		 277 aa  317  3e-85  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00600237  hitchhiker  0.00131217 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1349  ABC transporter related  61.96 
 
 		 258 aa  310  2.9999999999999997e-83  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4858  ABC transporter related protein  65.94 
 
 		 261 aa  310  2.9999999999999997e-83  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2118  ABC transporter related  62.45 
 
 		 259 aa  310  2.9999999999999997e-83  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.36781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4490  ABC transporter related protein  70.35 
 
 		 257 aa  309  6.999999999999999e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0673  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  59.76 
 
 		 263 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.263791  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8137  ABC transporter related  64.41 
 
 		 258 aa  301  2e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1847  peptide ABC transporter ATPase  66.23 
 
 		 252 aa  301  2e-80  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.838866  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32340  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  63.14 
 
 		 264 aa  300  3e-80  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.442827 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1885  ABC transporter related protein  64.58 
 
 		 247 aa  299  8e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.999319  normal  0.0695851 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0641  ABC transporter, ATP-binding protein  59.03 
 
 		 279 aa  298  1e-79  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.202535 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2603  ABC transporter related protein  61.51 
 
 		 271 aa  297  2e-79  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.159465  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2824  ABC transporter related  63.48 
 
 		 268 aa  297  3e-79  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.266622  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08480  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  62.92 
 
 		 274 aa  296  5e-79  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.363174  normal  0.516344 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21930  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  61.44 
 
 		 280 aa  291  1e-77  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.17909  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2782  ABC transporter related protein  62.5 
 
 		 255 aa  291  2e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.283122 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4185  ABC transporter related  67.78 
 
 		 258 aa  291  2e-77  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.348554 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3716  ABC transporter related protein  64.73 
 
 		 244 aa  290  4e-77  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1874  ABC transporter related  61.8 
 
 		 258 aa  289  6e-77  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.265297  normal  0.39521 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3230  ABC transporter related protein  66.11 
 
 		 312 aa  288  1e-76  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.1961  normal  0.0782588 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0090  ABC transporter related protein  59.91 
 
 		 243 aa  286  7e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.197502  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0458  ABC transporter related  60.74 
 
 		 288 aa  283  4.0000000000000003e-75  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.186138  normal  0.029508 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3006  ABC transporter related  61.13 
 
 		 257 aa  283  6.000000000000001e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.829082  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0346  ABC transporter related protein  57.09 
 
 		 302 aa  278  1e-73  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3057  ABC transporter related protein  62.66 
 
 		 255 aa  275  1.0000000000000001e-72  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4049  ABC transporter related  62.33 
 
 		 250 aa  272  1e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0191001  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0692  ABC transporter related  58.97 
 
 		 252 aa  272  1e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7746  ABC transporter related protein  57.76 
 
 		 266 aa  272  1e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2697  ABC transporter related  56.92 
 
 		 279 aa  271  2e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.136885  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2759  ABC transporter related  58.33 
 
 		 256 aa  262  6.999999999999999e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000159269  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2760  ABC transporter related  55.65 
 
 		 269 aa  262  6.999999999999999e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.335106  hitchhiker  0.0095726 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0270  ABC transporter related protein  56.44 
 
 		 243 aa  262  8.999999999999999e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20470  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  59.82 
 
 		 245 aa  262  8.999999999999999e-69  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0202995  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4457  ABC transporter related  55.41 
 
 		 253 aa  262  1e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0849  ABC transporter related protein  52.44 
 
 		 271 aa  258  2e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.235229  normal  0.0970289 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2643  ABC transporter related protein  55.08 
 
 		 245 aa  253  6e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.189012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0530  ABC transporter related  59.66 
 
 		 277 aa  251  1e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.103758  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0848  ABC transporter related  60.33 
 
 		 249 aa  251  2e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4066  ABC transporter related  56.65 
 
 		 293 aa  249  5e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.376431 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3510  ABC transporter related protein  55.74 
 
 		 255 aa  249  5e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.513623  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4659  ABC transporter related protein  58.01 
 
 		 241 aa  249  5e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4608  ABC transporter related protein  56.15 
 
 		 249 aa  244  1.9999999999999999e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.310251  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2719  ABC transporter related protein  52.48 
 
 		 255 aa  244  1.9999999999999999e-63  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4413  ABC transporter related protein  54.35 
 
 		 244 aa  243  3.9999999999999997e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.14097  normal  0.0308412 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4405  ABC transporter related  59.41 
 
 		 224 aa  239  5.999999999999999e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00499909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1914  ABC transporter related  55.51 
 
 		 272 aa  238  1e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2247  ABC transporter related protein  52.92 
 
 		 247 aa  233  4.0000000000000004e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.687068  normal  0.0553292 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21590  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  53.22 
 
 		 269 aa  231  2e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0459464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1963  ABC transporter related  53.68 
 
 		 248 aa  228  2e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1516  ABC transporter related  47.91 
 
 		 230 aa  227  3e-58  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1151  ABC transporter related  48.39 
 
 		 228 aa  223  4e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.023193  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2605  ABC transporter related  51.06 
 
 		 239 aa  222  9.999999999999999e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0199755  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0646  ABC transporter related protein  49.57 
 
 		 279 aa  221  3e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.904243  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0278  ABC transporter related protein  50.22 
 
 		 252 aa  219  5e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0970  ABC transporter, ATPase subunit  51.12 
 
 		 240 aa  218  1e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.253892 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4805  ABC transporter related protein  54.73 
 
 		 249 aa  216  5e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.318308  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02550  ABC transporter related  45.73 
 
 		 266 aa  216  5.9999999999999996e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00397831  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0287  ABC transporter related  45.81 
 
 		 240 aa  214  1.9999999999999998e-54  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0557  ABC transporter related  49.53 
 
 		 225 aa  214  1.9999999999999998e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2628  ABC transporter related  47.21 
 
 		 241 aa  214  2.9999999999999995e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0354  ABC transporter related  48.43 
 
 		 249 aa  211  2e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.774428  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2457  ABC transporter related protein  53.7 
 
 		 247 aa  211  2e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0887865  hitchhiker  0.00000290657 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0841  ABC transporter, ATP-binding protein  43.25 
 
 		 255 aa  211  3e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.598404  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1917  ABC transporter, ATPase subunit  39.34 
 
 		 286 aa  209  9e-53  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3116  ABC transporter related  48.91 
 
 		 248 aa  208  1e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3004  ABC transporter related  48.91 
 
 		 248 aa  208  1e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2148  ABC transporter related  47.39 
 
 		 225 aa  207  2e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.357033  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  46.98 
 
 		 230 aa  207  2e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1243  ABC transporter related  46.7 
 
 		 229 aa  206  5e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0892  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  49.53 
 
 		 251 aa  206  7e-52  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0252  ABC transporter related  47.03 
 
 		 244 aa  205  1e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.229432  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0119  ABC transporter  41.63 
 
 		 256 aa  204  2e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.393598  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3266  ABC transporter related  44.94 
 
 		 259 aa  204  3e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0118  ABC transporter, ATP-binding protein  41.22 
 
 		 256 aa  204  3e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0814  ABC transporter related  46.45 
 
 		 231 aa  204  3e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  46.51 
 
 		 225 aa  203  4e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0836  peptide ABC transporter ATPase  45.49 
 
 		 251 aa  204  4e-51  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.506405  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0539  ABC transporter related protein  43.52 
 
 		 227 aa  204  4e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0632704  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2297  ABC transporter related  48.37 
 
 		 225 aa  203  5e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0492  ABC transporter related  44.59 
 
 		 238 aa  203  5e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.925941  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0743  ABC transporter related  43.52 
 
 		 226 aa  203  6e-51  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0731  ATPase  48.17 
 
 		 249 aa  202  7e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.79044  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0896  ABC transporter, ATPase subunit  46.79 
 
 		 229 aa  202  8e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00595939  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>