More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_1194 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_1194  NLP/P60 protein  100 
 
 		 176 aa  361  2e-99  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0132  NLP/P60 protein  41.77 
 
 		 175 aa  116  9.999999999999999e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00548523  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3253  NLP/P60 protein  36.54 
 
 		 257 aa  68.9  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000111899  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00222  predicted lipoprotein and C40 family peptidase  34.83 
 
 		 249 aa  63.2  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0271  NlpC/P60 family protein  34.83 
 
 		 257 aa  63.2  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.677165 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0239  NlpC/P60 family protein  34.83 
 
 		 249 aa  63.2  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0255  NlpC/P60 family protein  34.83 
 
 		 269 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00226  hypothetical protein  34.83 
 
 		 249 aa  63.2  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0261  NlpC/P60 family protein  34.83 
 
 		 269 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0223  YafL  34.83 
 
 		 249 aa  63.2  0.000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3380  NLP/P60 protein  34.83 
 
 		 234 aa  62.8  0.000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3393  NLP/P60 protein  34.83 
 
 		 208 aa  62.8  0.000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0175  cell wall endopeptidase, family M23/M37  38.38 
 
 		 1048 aa  62.8  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.131665  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1388  NLP/P60  35.96 
 
 		 303 aa  58.5  0.00000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.297937  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0396  NLP/P60 protein  29.69 
 
 		 150 aa  58.2  0.00000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3043  NLP/P60 protein  34.69 
 
 		 274 aa  57  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.166608  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2197  NLP/P60 protein  40 
 
 		 273 aa  57  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.369734  hitchhiker  0.00000685507 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3095  NLP/P60 protein  28.43 
 
 		 452 aa  56.2  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.378956 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2683  NLP/P60 protein  30.61 
 
 		 232 aa  56.2  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.65308e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01906  outer membrane lipoprotein  34 
 
 		 221 aa  56.2  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.211693  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8043  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  41.43 
 
 		 210 aa  56.2  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.433259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1279  NLP/P60 protein  27.34 
 
 		 150 aa  54.3  0.0000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31170  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  29.06 
 
 		 270 aa  54.7  0.0000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.000817725  normal  0.0993098 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0973  Lytic transglycosylase catalytic  34.09 
 
 		 318 aa  54.3  0.0000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1792  NLP/P60 protein  34.88 
 
 		 256 aa  54.3  0.0000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.851858  normal  0.0301658 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3552  NLP/P60 protein  29.63 
 
 		 297 aa  53.5  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.01109  normal  0.684862 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1742  NlpC/P60 family protein  26.56 
 
 		 273 aa  53.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000022854  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5317  NLP/P60  33.96 
 
 		 205 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.378858 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1655  Lytic transglycosylase catalytic  31.11 
 
 		 368 aa  53.9  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5001  NLP/P60 protein  29.09 
 
 		 204 aa  53.9  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.132684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1757  NlpC/P60 family lipoprotein  36.47 
 
 		 283 aa  53.9  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000156191  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2570  NlpC/P60 family lipoprotein  36.47 
 
 		 283 aa  53.9  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.117101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1864  NLP/P60 protein  36.67 
 
 		 283 aa  53.5  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.617955  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01625  predicted lipoprotein  34.41 
 
 		 271 aa  53.1  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.712982  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1985  NLP/P60 protein  34.41 
 
 		 271 aa  53.1  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.778309  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1602  NlpC/P60 family protein  26.56 
 
 		 273 aa  53.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1852  NlpC/P60 family protein  34.41 
 
 		 271 aa  53.1  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000302623  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2940  NLP/P60 protein  33.7 
 
 		 265 aa  53.5  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000104581  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01615  hypothetical protein  34.41 
 
 		 271 aa  53.1  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.749344  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1734  NlpC/P60 family protein  34.41 
 
 		 271 aa  53.1  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.252215  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1543  NlpC/P60 family protein  34.41 
 
 		 275 aa  53.1  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.179042 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1974  NLP/P60 protein  34.41 
 
 		 271 aa  53.1  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00117191 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0573  NLP/P60 protein  33.01 
 
 		 388 aa  53.5  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.774962  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2387  NLP/P60 protein  36.47 
 
 		 283 aa  53.1  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.05451  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1542  NlpC/P60 family protein  26.56 
 
 		 273 aa  53.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0237599  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1528  NlpC/P60 family protein  26.56 
 
 		 273 aa  53.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2367  NlpC/P60 family protein  34.41 
 
 		 271 aa  53.1  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00414236  normal  0.27776 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1911  NlpC/P60 family protein  26.56 
 
 		 273 aa  53.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.569551  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1868  NlpC/P60 family protein  34.41 
 
 		 271 aa  53.1  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000206609  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1654  hypothetical protein  27.03 
 
 		 177 aa  52.4  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1658  hypothetical protein  29.47 
 
 		 287 aa  52.8  0.000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.110646  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2022  NLP/P60 protein  26.49 
 
 		 242 aa  52.4  0.000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.321386 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1605  NLP/P60 protein  29.47 
 
 		 279 aa  52.4  0.000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0018  NLP/P60 protein  34.21 
 
 		 188 aa  52.4  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2224  NLP/P60  32.98 
 
 		 309 aa  52  0.000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.231098  hitchhiker  0.0000179311 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4708  NLP/P60 protein  31.63 
 
 		 214 aa  52  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.341111  normal  0.0906731 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8103  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  37.18 
 
 		 393 aa  52  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3233  NLP/P60 protein  34.72 
 
 		 279 aa  51.6  0.000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.534878  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4208  NLP/P60 protein  32.99 
 
 		 281 aa  51.6  0.000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.200815  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2671  NLP/P60 protein  34.48 
 
 		 283 aa  51.2  0.000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.179494  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48800  hypothetical protein  29.25 
 
 		 205 aa  51.2  0.000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.040428  hitchhiker  0.0000000044472 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4180  hypothetical protein  29.25 
 
 		 193 aa  50.8  0.000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.000520752  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4965  NLP/P60 protein  27.68 
 
 		 208 aa  50.8  0.000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2420  NLP/P60 protein  31.68 
 
 		 207 aa  50.8  0.000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2037  NLP/P60 family protein  28.43 
 
 		 426 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000532667  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0373  NLP/P60 protein  32.65 
 
 		 208 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0480  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  25.89 
 
 		 390 aa  50.8  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2262  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  31.63 
 
 		 388 aa  50.4  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2819  NLP/P60 protein  36.46 
 
 		 159 aa  50.8  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5142  NLP/P60 protein  32.65 
 
 		 208 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0699781  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2059  putative cell wall peptidase, NlpC/P60 family  28.43 
 
 		 426 aa  50.4  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000850665  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5004  NLP/P60 protein  30.94 
 
 		 347 aa  50.8  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.549544  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2888  NLP/P60 protein  30 
 
 		 234 aa  50.8  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.215701  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1717  NLP/P60 protein  26.96 
 
 		 324 aa  50.8  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00794283  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19170  hypothetical protein  26.13 
 
 		 198 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.545233 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3369  putative cell wall peptidase, NlpC/P60 family  28.43 
 
 		 432 aa  50.4  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000232864  unclonable  2.00404e-25 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1755  NLP/P60 protein  35.05 
 
 		 255 aa  50.4  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3041  NLP/P60 protein  28.97 
 
 		 288 aa  50.8  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.241785  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5092  NLP/P60 protein  32.65 
 
 		 207 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1812  NLP/P60 family protein  28.43 
 
 		 420 aa  49.7  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000382267  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1127  NLP/P60 protein  28.57 
 
 		 286 aa  50.1  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.111374 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1787  NLP/P60 family protein  28.43 
 
 		 420 aa  49.7  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000289825  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1769  NLP/P60 family protein  28.43 
 
 		 420 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000165376  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0670  NLP/P60 protein  28.57 
 
 		 207 aa  50.1  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.160252 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1988  putative cell wall peptidase, NlpC/P60 family  28.43 
 
 		 420 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  3.1332199999999997e-59 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1638  NLP/P60  32.08 
 
 		 178 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.52996  normal  0.0475001 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2022  NLP/P60 family protein  31 
 
 		 206 aa  50.1  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1952  NLP/P60 family protein  28.43 
 
 		 420 aa  49.7  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000344583  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11930  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  29.2 
 
 		 176 aa  49.7  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.39384 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1159  NLP/P60 protein  28.67 
 
 		 210 aa  50.1  0.00002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.944138  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4179  putative lipoprotein  33.33 
 
 		 197 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.000450162  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1821  NLP/P60 protein  29.29 
 
 		 430 aa  50.1  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000102093  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1684  NLP/P60 protein  32.14 
 
 		 356 aa  48.9  0.00003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1828  lipoprotein, NLP/P60 family  30.95 
 
 		 188 aa  48.9  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.996382  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3683  NLP/P60  30.69 
 
 		 181 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00454661 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0105  NLP/P60  35.11 
 
 		 278 aa  48.9  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0978  NLP/P60 protein  32.97 
 
 		 384 aa  48.9  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0625  NLP/P60 protein  27.27 
 
 		 466 aa  49.3  0.00003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00171515  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2413  NLP/P60  33.75 
 
 		 337 aa  49.3  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000144369  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1504  NLP/P60 protein  30.95 
 
 		 188 aa  48.9  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0399794  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>