More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_0187 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_0187  cupin 2 domain-containing protein  100 
 
 		 277 aa  567  1e-161  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.778643  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4615  helix-turn-helix domain-containing protein  32.81 
 
 		 281 aa  141  9.999999999999999e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00567057  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5635  transcriptional regulator, AraC family  29.3 
 
 		 282 aa  138  1e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0154737  normal  0.936217 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4328  transcriptional regulator, AraC family  27.14 
 
 		 310 aa  132  6e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.11303 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4136  transcriptional regulator, AraC family  32.72 
 
 		 278 aa  129  4.0000000000000003e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.322145  normal  0.588482 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2635  transcriptional regulator, AraC family  26.77 
 
 		 285 aa  123  3e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.82539 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3850  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  28.07 
 
 		 275 aa  123  3e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.427371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2143  transcriptional regulator, AraC family  27.4 
 
 		 278 aa  122  9e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2509  transcriptional regulator, AraC family  27.45 
 
 		 277 aa  119  7.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4858  response regulator receiver protein  27.03 
 
 		 279 aa  105  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00250208  normal  0.0726035 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1518  transcriptional regulator, AraC family  25.56 
 
 		 288 aa  103  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10188  transcription regulator  30.33 
 
 		 275 aa  100  2e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4681  transcriptional regulator, AraC family  24.66 
 
 		 277 aa  88.6  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.399866  hitchhiker  0.000374446 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5736  transcriptional regulator, AraC family  23.99 
 
 		 302 aa  73.6  0.000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.458087  normal  0.0804567 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2212  AraC family transcriptional regulator  23.72 
 
 		 302 aa  72.4  0.000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2939  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  22.53 
 
 		 289 aa  70.9  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0806864  normal  0.433201 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0388  transcriptional regulator, AraC family  23.83 
 
 		 290 aa  69.7  0.00000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.75747  normal  0.230203 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1597  AraC family transcriptional regulator  25.29 
 
 		 310 aa  68.9  0.00000000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4971  transcriptional regulator, AraC family  20.77 
 
 		 290 aa  68.6  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0504817  hitchhiker  0.0000000000361988 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27420  transcriptional regulator MtlR (AraC family)  24.45 
 
 		 299 aa  67  0.0000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.467419  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2139  transcriptional regulator, AraC family  26.84 
 
 		 282 aa  66.2  0.0000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.669919  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4009  helix-turn-helix domain-containing protein  21.4 
 
 		 309 aa  66.2  0.0000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.125602  normal  0.35131 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1001  transcriptional regulator, AraC family  22.73 
 
 		 307 aa  65.9  0.0000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2813  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  24.18 
 
 		 290 aa  65.1  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1711  AraC family transcriptional regulator  21.03 
 
 		 309 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.311162  normal  0.0412412 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0125  transcriptional regulator, AraC family  21.9 
 
 		 300 aa  64.3  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2506  transcriptional regulator, AraC family  23.38 
 
 		 294 aa  63.9  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.108721 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5348  transcriptional regulator, AraC family  22.01 
 
 		 291 aa  62.8  0.000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.650952  normal  0.226075 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4762  transcriptional regulator, AraC family  22.18 
 
 		 311 aa  62.8  0.000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0640871  normal  0.0124247 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2237  AraC family transcriptional regulator  22.43 
 
 		 310 aa  62  0.000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3483  transcriptional regulator, AraC family  20.23 
 
 		 296 aa  61.6  0.00000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2329  transcriptional regulator, AraC family  33.61 
 
 		 773 aa  62  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34440  transcriptional regulator MtlR  27.41 
 
 		 301 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000688741  normal  0.560291 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2042  AraC family transcriptional regulator  20.82 
 
 		 301 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2926  transcriptional regulator MtlR  27.41 
 
 		 287 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.795893  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3696  helix-turn-helix domain-containing protein  28.28 
 
 		 188 aa  60.8  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2642  transcriptional regulator, AraC family  22.38 
 
 		 304 aa  60.5  0.00000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3777  transcriptional regulator, AraC family  21.11 
 
 		 294 aa  60.1  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.15946 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1732  AraC family transcriptional regulator  20.66 
 
 		 286 aa  60.1  0.00000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1886  transcriptional regulator, AraC family  21.09 
 
 		 289 aa  59.7  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3988  transcriptional regulator, AraC family  21.64 
 
 		 291 aa  59.3  0.00000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00119398  normal  0.630817 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4043  transcriptional regulator, AraC family  22.93 
 
 		 303 aa  59.3  0.00000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0180  AraC family transcriptional regulator  22.22 
 
 		 223 aa  59.3  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0224  response regulator receiver protein  28.45 
 
 		 537 aa  58.9  0.00000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2752  transcriptional regulator, AraC family  22.43 
 
 		 294 aa  58.9  0.00000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.612701  hitchhiker  0.00970108 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2093  AraC family transcriptional regulator  22.3 
 
 		 287 aa  58.9  0.00000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.369123  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4301  transcriptional regulator, AraC family  20.62 
 
 		 286 aa  58.9  0.00000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.220521  normal  0.797318 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5603  AraC family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 409 aa  58.2  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3119  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  23.13 
 
 		 293 aa  58.2  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00676861  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0919  two component AraC family transcriptional regulator  28 
 
 		 356 aa  58.2  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0508  transcriptional regulator, AraC family  20.34 
 
 		 295 aa  58.5  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.3342  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3842  transcriptional activator RhaS  24.52 
 
 		 273 aa  57.8  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0740  transcriptional activator RhaS  24.52 
 
 		 273 aa  57.8  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0791489 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5971  transcriptional regulator, AraC family  24.28 
 
 		 297 aa  57.4  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.965071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3754  transcriptional activator RhaS  24.52 
 
 		 273 aa  57.8  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2413  AraC family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 305 aa  57.4  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3253  AraC family transcriptional regulator  23.35 
 
 		 289 aa  58.2  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2161  helix-turn-helix domain-containing protein  21.51 
 
 		 294 aa  57.8  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2701  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  24.45 
 
 		 292 aa  57.4  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.485012  normal  0.370839 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5280  transcriptional regulator, AraC family  20.68 
 
 		 280 aa  57  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4378  transcriptional regulator, AraC family  21.4 
 
 		 281 aa  57  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0103943  hitchhiker  0.00146244 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6092  AraC family transcriptional regulator  19.92 
 
 		 310 aa  57  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.391074  normal  0.394917 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0147  two component transcriptional regulator, AraC family  27.55 
 
 		 525 aa  56.6  0.0000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3555  AraC family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 273 aa  57  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.152356 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0027  transcriptional regulator, AraC family  23.05 
 
 		 412 aa  56.6  0.0000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1958  response regulator receiver protein  27.72 
 
 		 530 aa  56.2  0.0000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000471781  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0385  AraC family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 766 aa  56.2  0.0000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4704  putative DNA-binding protein  31.07 
 
 		 274 aa  56.2  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000153171  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1548  transcriptional regulator, AraC family  22.22 
 
 		 276 aa  56.2  0.0000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3095  AraC family transcriptional regulator  20.31 
 
 		 313 aa  55.8  0.0000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.570459 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1856  transcriptional regulator, AraC family  27.84 
 
 		 793 aa  55.8  0.0000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.1682  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3608  transcriptional activator RhaS  20.6 
 
 		 278 aa  55.8  0.0000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1012  transcriptional regulator, AraC family  25.61 
 
 		 345 aa  55.8  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3262  response regulator receiver protein  30 
 
 		 257 aa  55.8  0.0000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2932  transcriptional regulator, AraC family  20 
 
 		 293 aa  55.5  0.0000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0628  AraC family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 319 aa  55.5  0.000001  Brucella suis 1330  Bacteria  decreased coverage  0.000338841  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0932  AraC family transcriptional regulator  19.37 
 
 		 291 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3305  two component transcriptional regulator, AraC family  26.04 
 
 		 513 aa  55.1  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4467  AraC family transcriptional regulator  21.3 
 
 		 301 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1402  transcriptional regulator, AraC family  19.64 
 
 		 288 aa  55.1  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.283594  normal  0.8016 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3156  two component transcriptional regulator, AraC family  27.08 
 
 		 515 aa  55.1  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.949308  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2461  AraC family transcriptional regulator  23.13 
 
 		 277 aa  55.1  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2033  transcriptional regulator, AraC family  28.57 
 
 		 267 aa  54.7  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1213  transcriptional regulator, AraC family  18.75 
 
 		 291 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2535  transcriptional regulator, AraC family  28.08 
 
 		 408 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2197  transcriptional regulator, AraC family  22.81 
 
 		 282 aa  53.9  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0818  AraC family transcriptional regulator  20.23 
 
 		 293 aa  54.3  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1667  transcriptional regulator, AraC family  19.93 
 
 		 281 aa  54.3  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002640  transcriptional regulator AraC family  28.28 
 
 		 241 aa  54.3  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.632133  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0517  helix-turn-helix domain-containing protein  27.96 
 
 		 180 aa  54.3  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.970363 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2789  transcriptional regulator, AraC family  19.62 
 
 		 295 aa  53.9  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.221879 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0702  AraC family transcriptional regulator  20.68 
 
 		 293 aa  53.5  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.737092  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3237  AraC family transcriptional regulator  28.75 
 
 		 276 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0744536  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0027  AraC family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 299 aa  53.5  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.618912  normal  0.0626425 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4375  AraC family transcriptional regulator  24.36 
 
 		 348 aa  53.1  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3484  transcriptional activator RhaS  20.83 
 
 		 281 aa  53.5  0.000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0886  transcriptional regulator, AraC family  24.39 
 
 		 332 aa  53.1  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3991  AraC family transcriptional regulator  24.36 
 
 		 348 aa  53.1  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2788  transcriptional regulator, AraC family  32.29 
 
 		 408 aa  53.1  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000435011  hitchhiker  0.0000000035636 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2198  AraC family transcriptional regulator  20.23 
 
 		 292 aa  53.1  0.000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.983823  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>