More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_3306 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009436  Ent638_3306  peptidase M23B  100 
 
 
248 aa  501  1e-141  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02698  Tetratricopeptide repeat transcriptional regulator  78.49 
 
 
251 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.686613  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0827  Peptidase M23  78.49 
 
 
251 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02660  hypothetical protein  78.49 
 
 
251 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.649815  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0843  peptidase M23B  78.49 
 
 
251 aa  398  9.999999999999999e-111  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.325004  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2998  M23B family peptidase  78 
 
 
250 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.310031 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3025  M23B family peptidase  78.49 
 
 
251 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00328229  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3190  M23B family peptidase  77.56 
 
 
251 aa  392  1e-108  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3304  peptidase, M23B family  77.56 
 
 
251 aa  392  1e-108  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4155  peptidase, M23B family  77.56 
 
 
251 aa  392  1e-108  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0947828 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3272  hypothetical protein  76.98 
 
 
250 aa  382  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3373  hypothetical protein  76.98 
 
 
250 aa  382  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.507543  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3206  YgeR  76.98 
 
 
250 aa  382  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.317836 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3193  LysM domain/M23 peptidase domain protein  75.4 
 
 
250 aa  365  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.561609  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3268  hypothetical protein  74.6 
 
 
250 aa  366  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0299  peptidase M23B  56.4 
 
 
249 aa  271  6e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000319427 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3294  lipoprotein NlpD  46.21 
 
 
327 aa  215  7e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3426  lipoprotein NlpD  46.21 
 
 
327 aa  215  7e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0796777  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0959  lipoprotein NlpD  46.59 
 
 
327 aa  214  9e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1502  lipoprotein B  44.21 
 
 
290 aa  210  2e-53  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.176009  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02592  predicted outer membrane lipoprotein  45.42 
 
 
379 aa  206  3e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3132  lipoprotein NlpD  45.42 
 
 
363 aa  206  3e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2880  lipoprotein NlpD  45.42 
 
 
379 aa  206  3e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.704845  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3043  lipoprotein NlpD  45.42 
 
 
379 aa  206  3e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0970  lipoprotein NlpD  45.42 
 
 
379 aa  206  3e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.957286  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02557  hypothetical protein  45.42 
 
 
379 aa  206  3e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3213  lipoprotein NlpD  43.35 
 
 
374 aa  203  2e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.160012 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3050  lipoprotein NlpD  43.77 
 
 
377 aa  202  5e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3114  lipoprotein NlpD  43.77 
 
 
377 aa  202  5e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.378129  normal  0.89385 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3075  lipoprotein NlpD  43.77 
 
 
377 aa  202  5e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.567477  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3234  lipoprotein NlpD  43.77 
 
 
377 aa  202  5e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3131  lipoprotein NlpD  43.77 
 
 
377 aa  202  5e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.143103 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3863  peptidase M23B  39.93 
 
 
272 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.826682  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03726  hypothetical lipoprotein NlpD  39.24 
 
 
289 aa  190  2e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002515  membrane protein  41.33 
 
 
307 aa  185  7e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1244  Peptidase M23  38.36 
 
 
298 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  unclonable  0.00000000000297961 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3129  peptidase M23B  38.36 
 
 
298 aa  182  3e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.365869  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1228  peptidase M23  47.03 
 
 
230 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3120  peptidase M23B  38.01 
 
 
298 aa  181  1e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0792  peptidase M23B  42.13 
 
 
257 aa  179  2e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.814248  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0871  Peptidase M23  57.69 
 
 
401 aa  180  2e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0831  lipoprotein NlpD  63.64 
 
 
328 aa  180  2e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0680895 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0676  peptidase M23B  40.25 
 
 
285 aa  180  2e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.208838  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1202  peptidase M23B  48.02 
 
 
230 aa  180  2e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3272  peptidase M23B  37.67 
 
 
298 aa  179  4.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.601855  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3349  lipoprotein NlpD  65 
 
 
344 aa  178  7e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0164165  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1078  putative lipoprotein NlpD  38.6 
 
 
283 aa  177  1e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0803  lipoprotein NlpD, putative  48.78 
 
 
233 aa  177  1e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1711  peptidase  48.78 
 
 
296 aa  177  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.651895  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0553  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  48.78 
 
 
233 aa  177  1e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1542  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  48.78 
 
 
233 aa  177  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1320  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  48.78 
 
 
233 aa  177  1e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0602  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  48.78 
 
 
296 aa  177  1e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.469429  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1212  peptidase M23B  41 
 
 
310 aa  177  1e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3506  lipoprotein NlpD  65 
 
 
345 aa  177  2e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1043  lipoprotein NlpD  39.92 
 
 
296 aa  175  6e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.859563 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0840  Peptidase M23  65.25 
 
 
404 aa  173  1.9999999999999998e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.250204  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1176  peptidase M23B  40.75 
 
 
285 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.534318  normal  0.430733 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1511  peptidase  47.6 
 
 
236 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0946  Peptidase M23  64.41 
 
 
379 aa  171  7.999999999999999e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0564272  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2867  lipoprotein NlpD  64.41 
 
 
379 aa  171  7.999999999999999e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1296  peptidoglycan-binding LysM/peptidase M23B  43.27 
 
 
238 aa  171  7.999999999999999e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.775372  normal  0.108769 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2577  peptidase M23B  43.38 
 
 
301 aa  171  7.999999999999999e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0480337  hitchhiker  0.00120984 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3993  lipoprotein NlpD  64.41 
 
 
363 aa  171  9e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1192  peptidase M23B  37.68 
 
 
296 aa  171  9e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03518  hypothetical protein  62.71 
 
 
307 aa  171  1e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1123  peptidase M23B  39.08 
 
 
298 aa  171  1e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1059  peptidase M23B  34.55 
 
 
309 aa  171  1e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17470  hypothetical protein  44.35 
 
 
297 aa  171  1e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2750  peptidase M23B  40.78 
 
 
294 aa  170  2e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2752  lipoprotein NlpD, putative  46.34 
 
 
295 aa  170  2e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.112943  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1564  lipoprotein NlpD, putative  39.64 
 
 
288 aa  169  3e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0899  peptidase M23B  40.55 
 
 
240 aa  169  5e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.159864 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3343  peptidase M23B  38.37 
 
 
298 aa  169  6e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0875471  unclonable  0.00000001454 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1122  peptidase M23B  38.31 
 
 
298 aa  168  7e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1193  peptidase M23B  38.31 
 
 
298 aa  168  7e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.8562  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2839  Peptidase M23  41.91 
 
 
236 aa  168  8e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.882621  normal  0.16298 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5027  peptidase M23B  43.53 
 
 
292 aa  168  9e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4155  peptidase M23B  40 
 
 
262 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.647334  normal  0.0748574 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1622  peptidase M23B  40.47 
 
 
262 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.752531  normal  0.248121 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3433  lipoprotein NlpD  39.08 
 
 
298 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3021  peptidase M23B  42.98 
 
 
293 aa  166  4e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000191073 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1285  Peptidase M23  39.18 
 
 
246 aa  166  5e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.780134  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1990  peptidase M23B  50.5 
 
 
239 aa  165  6.9999999999999995e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0061  lipoprotein NlpD  62.71 
 
 
311 aa  165  8e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4053  peptidase M23B  38.49 
 
 
285 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000777294 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0330  peptidoglycan-specific endopeptidase, M23 family  40.57 
 
 
230 aa  163  3e-39  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1373  peptidoglycan-binding LysM:peptidase M23B  39.55 
 
 
288 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.142196  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1862  putative lipoprotein NlpD  40.57 
 
 
230 aa  162  4.0000000000000004e-39  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65030  hypothetical protein  47.31 
 
 
231 aa  161  8.000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.195389  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3059  peptidase M23B  39.41 
 
 
318 aa  160  1e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.430429  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00162  lipoprotein  44.61 
 
 
263 aa  160  2e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.989449  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5650  hypothetical protein  47.85 
 
 
231 aa  160  2e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1299  peptidase M23B  47.8 
 
 
233 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.132462  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1759  peptidase M23B  36.21 
 
 
295 aa  160  2e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.125432  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1317  peptidase M23B  47.8 
 
 
233 aa  159  3e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0929  peptidase M23B  40.08 
 
 
261 aa  159  3e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4460  peptidase M23B  48.29 
 
 
233 aa  159  3e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.561403  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1297  peptidase M23B  36.05 
 
 
304 aa  159  3e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.353225  hitchhiker  0.00000000164338 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0836  peptidase M23B  47.8 
 
 
233 aa  159  3e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0155509  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>