75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_2274 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009801  EcE24377A_1284  phage tail domain-containing protein  93.34 
 
 		 1137 aa  1706    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2274  Prophage tail fibre domain protein  100 
 
 		 1120 aa  2240    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.817873  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0873  side tail fiber protein  77.93 
 
 		 441 aa  570  1e-161  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2111  prophage tail fibre domain-containing protein  88.52 
 
 		 1007 aa  506  1e-141  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0810598  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2098  Tail Collar domain protein  76.43 
 
 		 320 aa  359  1.9999999999999998e-97  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0113464  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1643  prophage tail fibre domain protein  69.58 
 
 		 516 aa  351  5e-95  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1478  phage protein  75.4 
 
 		 536 aa  344  5e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0833  phage tail collar domain-containing protein  71.75 
 
 		 281 aa  343  2e-92  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.643406  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00752  hypothetical protein  80.68 
 
 		 401 aa  331  6e-89  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_10056  Tail fiber protein  80.68 
 
 		 401 aa  331  6e-89  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1637  L-shaped tail fiber protein  80 
 
 		 1258 aa  304  7.000000000000001e-81  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0096  putative phage tail protein  63.39 
 
 		 962 aa  302  2e-80  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.12465e-28 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1096  side tail fiber protein  67.21 
 
 		 411 aa  296  1e-78  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1427  side tail fiber protein  57.72 
 
 		 805 aa  278  4e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.214924 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2794  side tail fiber protein  57.72 
 
 		 790 aa  278  5e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1090  side tail fiber protein  58.54 
 
 		 463 aa  278  5e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.422026  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1123  side tail fiber protein  58.54 
 
 		 569 aa  277  7e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1160  side tail fiber protein  57.09 
 
 		 791 aa  270  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0463923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2230  tail fiber protein  63.97 
 
 		 407 aa  267  8e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000293165 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1203  tail fiber protein  63.56 
 
 		 451 aa  265  3e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2165  tail fiber protein  63.56 
 
 		 437 aa  264  6e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.468721  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2871  tail fiber protein  63.16 
 
 		 437 aa  263  2e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0235495 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0915  tail fiber protein  63.01 
 
 		 438 aa  262  2e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3118  tail fiber protein  63.56 
 
 		 437 aa  261  7e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.145222 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2758  tail fiber protein  63.16 
 
 		 439 aa  258  3e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.204827  normal  0.264951 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1804  tail fiber protein  62.35 
 
 		 434 aa  257  7e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.982324  hitchhiker  0.00650595 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4381  gp19  57.01 
 
 		 580 aa  249  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0427744  hitchhiker  0.000225609 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1206  putative prophage side tail fiber protein  64.14 
 
 		 845 aa  247  9.999999999999999e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.116414 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00513  conserved hypothetical protein  89.09 
 
 		 198 aa  219  2e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0710  side tail fiber protein  49.06 
 
 		 892 aa  214  7.999999999999999e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.116846  normal  0.0178865 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2015  side tail fiber protein  68.85 
 
 		 442 aa  174  9e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.478107 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1577  Tail Collar domain protein  39.02 
 
 		 682 aa  118  5e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1941  gpH  47.79 
 
 		 570 aa  115  3e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1042  putative phage tail fiber protein  45.08 
 
 		 469 aa  87.4  0.000000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4031  Tail Collar domain protein  46.43 
 
 		 485 aa  84.7  0.000000000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4025  Tail Collar domain protein  45.88 
 
 		 371 aa  82.8  0.00000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3818  Tail Collar domain protein  45.26 
 
 		 557 aa  82.8  0.00000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1039  hypothetical protein  43.68 
 
 		 304 aa  82.8  0.00000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3474  phage tail fiber repeat  62.86 
 
 		 670 aa  81.6  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0858569  hitchhiker  0.000000311784 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2783  phage tail fiber repeat-containing protein  62.86 
 
 		 670 aa  81.6  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.572485  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2731  tail collar domain-containing protein  48 
 
 		 259 aa  80.9  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.594625  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3484  phage tail collar domain-containing protein  46.91 
 
 		 340 aa  80.5  0.0000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0918027  normal  0.0437256 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2427  side tail fiber protein  76.36 
 
 		 280 aa  80.5  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.220934 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00854  hypothetical protein  47.44 
 
 		 180 aa  79.3  0.0000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3816  Tail Collar domain protein  50 
 
 		 498 aa  79.3  0.0000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00848  bacteriophage tail fiber protein  47.44 
 
 		 179 aa  79.3  0.0000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1823  Tail Collar domain protein  31.31 
 
 		 401 aa  78.6  0.0000000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.112044  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1819  Tail Collar domain protein  39.62 
 
 		 166 aa  78.6  0.0000000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.597378  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1476  tail collar domain-containing protein  47.3 
 
 		 259 aa  78.2  0.0000000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.736982 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4027  Tail Collar domain protein  45.21 
 
 		 646 aa  76.6  0.000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2736  Tail Collar domain protein  35.51 
 
 		 689 aa  75.1  0.000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2594  hypothetical protein  37.4 
 
 		 468 aa  74.7  0.000000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2492  Tail Collar domain protein  38.33 
 
 		 262 aa  74.7  0.000000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.136013  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2758  tail collar domain-containing protein  38.95 
 
 		 177 aa  73.2  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3032  tail Collar domain protein  37.11 
 
 		 176 aa  70.5  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000835332 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1537  Tail Collar domain protein  38.04 
 
 		 621 aa  67  0.000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1014  putative prophage tail fiber protein  41.38 
 
 		 352 aa  65.9  0.000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2198  tail collar domain-containing protein  34.71 
 
 		 402 aa  65.9  0.000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.23854  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4341  putative phage tail fiber protein  45.45 
 
 		 673 aa  65.9  0.000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0213021 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2097  Tail Collar domain protein  50.98 
 
 		 183 aa  62.4  0.00000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3508  tail fiber protein  26.87 
 
 		 645 aa  61.6  0.00000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.283696 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0875  phage tail fiber repeat protein  63.83 
 
 		 172 aa  60.8  0.0000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.872815  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1372  phage-related tail fiber protein  32.71 
 
 		 762 aa  60.8  0.0000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2207  tail fiber family protein  35.45 
 
 		 336 aa  58.5  0.0000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.837708  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5071  putative tail fiber protein  33.33 
 
 		 654 aa  57.4  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.795659  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0685  putative tail fiber protein  33.33 
 
 		 654 aa  57.4  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.906879  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01348  hypothetical protein  26.98 
 
 		 501 aa  56.2  0.000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.106689  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01518  hypothetical protein  45.03 
 
 		 642 aa  55.5  0.000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.43941  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0940  tail fiber domain-containing protein  78.38 
 
 		 583 aa  53.5  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1058  large adhesin  32.55 
 
 		 2906 aa  53.5  0.00002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4537  gp19  40.19 
 
 		 493 aa  50.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1714  hypothetical protein  32.09 
 
 		 891 aa  48.5  0.0006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.804907 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5676  tail collar domain-containing protein  25.47 
 
 		 414 aa  46.6  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.204656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2219  hypothetical protein  25.89 
 
 		 717 aa  45.8  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1045  tail fiber protein  32.7 
 
 		 690 aa  46.2  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>