More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_1043 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_1043  GTP-binding protein HSR1-related protein  100 
 
 		 287 aa  592  1e-168  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.557877  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3353  GTP-binding protein HSR1-related protein  82.58 
 
 		 287 aa  503  1e-141  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0930  GTP-binding protein HSR1-related  68.75 
 
 		 288 aa  407  1e-113  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.518572  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0759  putative GTPase  52.23 
 
 		 291 aa  311  1e-83  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3433  GTP-binding protein HSR1-related  53.68 
 
 		 291 aa  309  4e-83  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1388  GTP-binding protein HSR1-related protein  51.89 
 
 		 291 aa  308  5e-83  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2882  GTP-binding protein HSR1-related  51.71 
 
 		 291 aa  302  4.0000000000000003e-81  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2138  putative GTPase  49.83 
 
 		 290 aa  277  1e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4891  putative GTPase  49.83 
 
 		 290 aa  274  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3346  putative GTPase  49.83 
 
 		 290 aa  273  3e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1393  putative GTPase  49.48 
 
 		 290 aa  272  5.000000000000001e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.139964 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2251  putative GTPase  49.14 
 
 		 290 aa  271  1e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.796861  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1071  putative GTPase  49.48 
 
 		 290 aa  271  1e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0467468 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3137  GTP-binding protein HSR1-related  43.01 
 
 		 295 aa  226  3e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4685  putative GTPase  36.4 
 
 		 294 aa  193  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3402  putative GTPase  36.4 
 
 		 294 aa  192  6e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4797  putative GTPase  36.04 
 
 		 294 aa  190  2e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.276697 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3202  putative GTPase  35.34 
 
 		 294 aa  188  9e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1658  GTPase-like protein  45.11 
 
 		 236 aa  154  1e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.374478  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1036  tRNA modification GTPase TrmE  29.21 
 
 		 442 aa  65.1  0.000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.788526  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0979  tRNA modification GTPase TrmE  29.21 
 
 		 442 aa  65.5  0.000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.523955  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0825  tRNA modification GTPase TrmE  28.89 
 
 		 442 aa  64.3  0.000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf303  GTP-binding protein EngA  35.11 
 
 		 434 aa  63.9  0.000000003  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.778638  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1758  small GTP-binding protein  27.18 
 
 		 448 aa  63.5  0.000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0526  tRNA modification GTPase TrmE  32.26 
 
 		 446 aa  58.5  0.0000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0548  tRNA modification GTPase TrmE  31.15 
 
 		 442 aa  58.5  0.0000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3828  GTP-binding protein Era  24.57 
 
 		 305 aa  57  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2710  GTP-binding protein Era  24.14 
 
 		 304 aa  56.6  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.521075  normal  0.585399 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2380  GTP-binding protein, HSR1-related  33.57 
 
 		 635 aa  56.2  0.0000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4307  GTP-binding protein HSR1-related  32.61 
 
 		 650 aa  55.8  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1833  tRNA modification GTPase TrmE  28.69 
 
 		 444 aa  54.3  0.000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1904  tRNA modification GTPase TrmE  29.85 
 
 		 472 aa  53.9  0.000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2632  small GTP-binding protein  33.07 
 
 		 434 aa  53.5  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0018  tRNA modification GTPase TrmE  25 
 
 		 438 aa  52.8  0.000006  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1753  ribosome-associated GTPase EngA  34.69 
 
 		 477 aa  53.1  0.000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0569  tRNA modification GTPase TrmE  30.33 
 
 		 458 aa  52.8  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0536  GTP-binding protein EngA  31.65 
 
 		 461 aa  52.4  0.000008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0134  GTP-binding protein Era  34.95 
 
 		 299 aa  52.4  0.000009  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1625  tRNA modification GTPase TrmE  28.93 
 
 		 441 aa  52.4  0.000009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.834042  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6368  tRNA modification GTPase TrmE  27.23 
 
 		 455 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0654  tRNA modification GTPase TrmE  42.37 
 
 		 466 aa  52  0.00001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2081  small GTP-binding protein  25.64 
 
 		 416 aa  52.4  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000627073  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2180  tRNA modification GTPase TrmE  25.11 
 
 		 472 aa  51.2  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0392  GTP-binding protein EngA  37.76 
 
 		 494 aa  51.6  0.00002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0318  small GTP-binding protein domain-containing protein  30.39 
 
 		 402 aa  51.2  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03489  tRNA modification GTPase TrmE  35.58 
 
 		 446 aa  50.8  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73400  tRNA modification GTPase TrmE  27.23 
 
 		 455 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000503354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1403  hypothetical protein  21.05 
 
 		 328 aa  50.4  0.00003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0916  small GTP-binding protein  31.97 
 
 		 439 aa  50.4  0.00004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.704291  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3526  GTP-binding protein EngA  34.65 
 
 		 494 aa  50.1  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.928011 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0555  tRNA modification GTPase TrmE  27.05 
 
 		 438 aa  50.1  0.00004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2082  GTP-binding protein Era  30.3 
 
 		 313 aa  50.4  0.00004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.592415  normal  0.853182 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1361  small GTP-binding protein  26.37 
 
 		 396 aa  49.7  0.00005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.311924  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1344  GTP-binding protein Era  28.42 
 
 		 302 aa  50.1  0.00005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000010527  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0191  tRNA modification GTPase TrmE  26.35 
 
 		 460 aa  50.1  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.377202  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1201  hypothetical protein  27.61 
 
 		 455 aa  49.7  0.00005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00128445 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0053  GTP-binding protein EngA  30.07 
 
 		 460 aa  49.3  0.00006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2519  tRNA modification GTPase TrmE  28.44 
 
 		 462 aa  49.7  0.00006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190608 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1339  GTP-binding protein EngA  30.33 
 
 		 463 aa  49.7  0.00006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2152  GTP-binding protein, HSR1-related  26.46 
 
 		 523 aa  49.7  0.00006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02091  tRNA modification GTPase TrmE  26.35 
 
 		 460 aa  49.7  0.00006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.146144  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1322  small GTP-binding protein  32.65 
 
 		 531 aa  49.3  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0975  small GTP-binding protein domain-containing protein  31.37 
 
 		 440 aa  49.3  0.00007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3751  GTP-binding protein EngA  30.33 
 
 		 449 aa  49.3  0.00007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1351  small GTP-binding protein  32.65 
 
 		 531 aa  49.3  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000851094 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0121  GTP-binding protein EngA  25.61 
 
 		 452 aa  49.3  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0118  GTP-binding protein EngA  25.61 
 
 		 452 aa  49.3  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.132129 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52440  tRNA modification GTPase TrmE  28.19 
 
 		 455 aa  49.3  0.00008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1186  GTP-binding protein EngA  30.71 
 
 		 461 aa  49.3  0.00008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02071  tRNA modification GTPase TrmE  26.35 
 
 		 460 aa  49.3  0.00008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.214831  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0579  GTP-binding protein Era  23.85 
 
 		 298 aa  48.9  0.00009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09700  small GTP-binding protein domain/GTP-binding conserved hypothetical protein  35.56 
 
 		 438 aa  48.9  0.00009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.253075  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4263  tRNA modification GTPase TrmE  33.72 
 
 		 454 aa  48.5  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.226045  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4957  tRNA modification GTPase TrmE  31.09 
 
 		 459 aa  48.5  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000028541  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1077  Miro domain protein  30 
 
 		 444 aa  48.9  0.0001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1153  hypothetical protein  24.88 
 
 		 614 aa  48.5  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.9167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1009  GTPase  33.66 
 
 		 442 aa  48.9  0.0001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.369054  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1042  GTP-binding protein Era  31.58 
 
 		 297 aa  48.5  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.228639 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18431  GTPase SAR1 and related small G proteins  30.39 
 
 		 440 aa  48.9  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.491382 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0042  small GTP-binding protein  26.39 
 
 		 400 aa  48.1  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3463  GTP-binding protein Era  23.32 
 
 		 299 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.720109  normal  0.032958 
 
 
-
 
NC_002950  PG0876  tRNA modification GTPase TrmE  26.45 
 
 		 518 aa  47.8  0.0002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.588217 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl266  GTP-binding protein Era  26.05 
 
 		 301 aa  48.1  0.0002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  6.59888e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4041  tRNA modification GTPase TrmE  36.36 
 
 		 449 aa  47.8  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.934487  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1862  small GTP-binding protein  25.13 
 
 		 398 aa  47.8  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.803475  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1326  small GTP-binding protein  32.65 
 
 		 529 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3778  small GTP-binding protein  26.9 
 
 		 433 aa  48.1  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4013  tRNA modification GTPase TrmE  30.58 
 
 		 456 aa  48.1  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.205295  normal  0.289015 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0008  tRNA modification GTPase TrmE  35 
 
 		 453 aa  47.8  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.185087  hitchhiker  0.000721309 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1990  small GTP-binding protein  33.33 
 
 		 411 aa  47.8  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02181  tRNA modification GTPase TrmE  28.35 
 
 		 461 aa  47.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0683  small GTP-binding protein  39.08 
 
 		 408 aa  47.8  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00203334  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3931  tRNA modification GTPase TrmE  38.55 
 
 		 437 aa  48.1  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.45905 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1172  small GTP-binding protein  27.71 
 
 		 438 aa  47.8  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5165  tRNA modification GTPase TrmE  25.81 
 
 		 458 aa  47  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5734  tRNA modification GTPase TrmE  25.81 
 
 		 458 aa  47  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0562  GTP-binding protein Era  25.2 
 
 		 300 aa  47.4  0.0003  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.204296  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0392  tRNA modification GTPase TrmE  32.12 
 
 		 460 aa  47  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.379406 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3610  tRNA modification GTPase TrmE  30.56 
 
 		 475 aa  47.4  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf635  GTP-binding protein Era  29.75 
 
 		 294 aa  47.4  0.0003  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.308582  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>