More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_0930 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012912  Dd1591_0930  GTP-binding protein HSR1-related  100 
 
 		 288 aa  590  1e-167  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.518572  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3353  GTP-binding protein HSR1-related protein  68.75 
 
 		 287 aa  417  1e-116  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1043  GTP-binding protein HSR1-related protein  68.75 
 
 		 287 aa  407  1e-113  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.557877  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1388  GTP-binding protein HSR1-related protein  53.08 
 
 		 291 aa  314  8e-85  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2882  GTP-binding protein HSR1-related  52.88 
 
 		 291 aa  314  9.999999999999999e-85  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0759  putative GTPase  54.95 
 
 		 291 aa  308  5e-83  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3433  GTP-binding protein HSR1-related  52.38 
 
 		 291 aa  296  2e-79  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2138  putative GTPase  50.85 
 
 		 290 aa  278  1e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1393  putative GTPase  50.85 
 
 		 290 aa  276  4e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.139964 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4891  putative GTPase  50.85 
 
 		 290 aa  275  9e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2251  putative GTPase  50.51 
 
 		 290 aa  273  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.796861  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3346  putative GTPase  50.17 
 
 		 290 aa  271  8.000000000000001e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1071  putative GTPase  50.17 
 
 		 290 aa  271  1e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0467468 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3137  GTP-binding protein HSR1-related  41.02 
 
 		 295 aa  225  7e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4797  putative GTPase  40.43 
 
 		 294 aa  209  4e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.276697 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3402  putative GTPase  40.43 
 
 		 294 aa  209  6e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4685  putative GTPase  40.43 
 
 		 294 aa  207  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3202  putative GTPase  39.13 
 
 		 294 aa  205  6e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1658  GTPase-like protein  45.41 
 
 		 236 aa  150  3e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.374478  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf303  GTP-binding protein EngA  24.24 
 
 		 434 aa  62.8  0.000000006  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.778638  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0519  GTP-binding protein EngA  25.57 
 
 		 433 aa  61.6  0.00000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1758  small GTP-binding protein  29.12 
 
 		 448 aa  57.8  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2380  GTP-binding protein, HSR1-related  35.66 
 
 		 635 aa  57.8  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2632  small GTP-binding protein  31.88 
 
 		 434 aa  56.2  0.0000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0825  tRNA modification GTPase TrmE  26.06 
 
 		 442 aa  56.2  0.0000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2152  GTP-binding protein, HSR1-related  25.41 
 
 		 523 aa  55.8  0.0000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2082  GTP-binding protein Era  33.66 
 
 		 313 aa  55.5  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.592415  normal  0.853182 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0979  tRNA modification GTPase TrmE  26.06 
 
 		 442 aa  55.5  0.000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.523955  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1036  tRNA modification GTPase TrmE  26.06 
 
 		 442 aa  55.1  0.000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.788526  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1042  GTP-binding protein Era  32.63 
 
 		 297 aa  54.7  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.228639 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3778  small GTP-binding protein  24.29 
 
 		 433 aa  53.9  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4307  GTP-binding protein HSR1-related  34.09 
 
 		 650 aa  53.5  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1029  tRNA modification GTPase TrmE  31.39 
 
 		 434 aa  52.8  0.000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.111023  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0134  GTP-binding protein Era  28 
 
 		 299 aa  52.8  0.000007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0819  tRNA modification GTPase TrmE  26.24 
 
 		 452 aa  52.4  0.000008  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0392  tRNA modification GTPase TrmE  34.35 
 
 		 460 aa  52.4  0.000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.379406 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0322  Dynamin family protein  31.39 
 
 		 585 aa  52.4  0.000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1403  hypothetical protein  25 
 
 		 328 aa  52.4  0.000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0916  small GTP-binding protein  26.32 
 
 		 439 aa  52  0.00001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.704291  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0526  tRNA modification GTPase TrmE  30 
 
 		 446 aa  51.6  0.00001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1284  tRNA modification GTPase TrmE  33.1 
 
 		 451 aa  50.4  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5324  tRNA modification GTPase TrmE  28.33 
 
 		 458 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0322996 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0887  GTP-binding protein Era  26.69 
 
 		 311 aa  49.7  0.00005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3073  GTP-binding protein EngA  33.33 
 
 		 435 aa  49.7  0.00005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.348074  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl266  GTP-binding protein Era  27.27 
 
 		 301 aa  49.7  0.00006  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  6.59888e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3751  GTP-binding protein EngA  30.65 
 
 		 449 aa  49.3  0.00007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2045  GTP-binding protein EngA  31.5 
 
 		 464 aa  49.3  0.00007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1344  GTP-binding protein Era  28.41 
 
 		 302 aa  49.3  0.00007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000010527  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2089  small GTP-binding protein domain-containing protein  31.06 
 
 		 637 aa  49.3  0.00008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000643797  unclonable  0.000000212393 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1862  small GTP-binding protein  26.21 
 
 		 398 aa  48.9  0.00009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.803475  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4957  tRNA modification GTPase TrmE  28.24 
 
 		 459 aa  48.9  0.00009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000028541  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1009  GTPase  26.11 
 
 		 442 aa  48.9  0.00009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.369054  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4767  GTP-binding protein HSR1-related  33.83 
 
 		 629 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.049365  hitchhiker  0.000697216 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1390  GTP-binding protein EngA  28.57 
 
 		 443 aa  48.1  0.0001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1329  GTP-binding protein EngA  28.57 
 
 		 443 aa  48.1  0.0001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2315  GTP-binding protein Era  21.67 
 
 		 298 aa  48.5  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0579  GTP-binding protein Era  23.14 
 
 		 298 aa  48.5  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf635  GTP-binding protein Era  30.89 
 
 		 294 aa  48.5  0.0001  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.308582  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0595  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  40.26 
 
 		 200 aa  48.5  0.0001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.232511  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1987  GTP-binding protein Era  25.12 
 
 		 296 aa  48.5  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1904  tRNA modification GTPase TrmE  26.96 
 
 		 472 aa  48.9  0.0001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2791  tRNA modification GTPase TrmE  29.06 
 
 		 459 aa  48.5  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0548  tRNA modification GTPase TrmE  23.53 
 
 		 442 aa  48.5  0.0001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2734  tRNA modification GTPase TrmE  29.06 
 
 		 459 aa  48.5  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0569  tRNA modification GTPase TrmE  28.33 
 
 		 458 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0118  GTP-binding protein EngA  25.98 
 
 		 452 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.132129 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0536  GTP-binding protein EngA  30.16 
 
 		 461 aa  47.8  0.0002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0083  GTP-binding protein EngA  25.16 
 
 		 476 aa  47.8  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04795  GTP-binding protein EngA  25.33 
 
 		 434 aa  47.8  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3931  tRNA modification GTPase TrmE  38.55 
 
 		 437 aa  48.1  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.45905 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5337  tRNA modification GTPase TrmE  27.5 
 
 		 458 aa  47.8  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5165  tRNA modification GTPase TrmE  27.5 
 
 		 458 aa  47.8  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5594  tRNA modification GTPase TrmE  27.5 
 
 		 458 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0320926 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2081  small GTP-binding protein  25.89 
 
 		 416 aa  47.8  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000627073  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0915  small GTP-binding protein  23.91 
 
 		 184 aa  47.8  0.0002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.793666  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5734  tRNA modification GTPase TrmE  27.5 
 
 		 458 aa  47.8  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0392  GTP-binding protein EngA  33.66 
 
 		 494 aa  47.8  0.0002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0296  GTP-binding protein Era  33.71 
 
 		 306 aa  47.8  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0121  GTP-binding protein EngA  25.98 
 
 		 452 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0053  GTP-binding protein EngA  28.28 
 
 		 460 aa  47.8  0.0002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2945  tRNA modification GTPase TrmE  25.68 
 
 		 465 aa  48.1  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0139032  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2272  GTP-binding protein Era  25.12 
 
 		 296 aa  48.1  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4774  tRNA modification GTPase TrmE  29.84 
 
 		 467 aa  48.1  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.149576 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3828  GTP-binding protein Era  23.3 
 
 		 305 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2667  tRNA modification GTPase TrmE  40.68 
 
 		 428 aa  47.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0398705  normal  0.380735 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5226  ribosome-associated GTPase EngA  29.46 
 
 		 435 aa  47.4  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.814163 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5277  tRNA modification GTPase TrmE  27.5 
 
 		 458 aa  47  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5635  tRNA modification GTPase TrmE  27.5 
 
 		 458 aa  47  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5181  tRNA modification GTPase TrmE  27.5 
 
 		 458 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0853003  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0975  small GTP-binding protein domain-containing protein  25.9 
 
 		 440 aa  47.4  0.0003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0600  GTP-binding protein Era  29.9 
 
 		 301 aa  47.4  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1409  tRNA modification GTPase TrmE  27.74 
 
 		 452 aa  47.4  0.0003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1077  Miro domain protein  22.9 
 
 		 444 aa  47.4  0.0003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0562  GTP-binding protein Era  24.19 
 
 		 300 aa  47.4  0.0003  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.204296  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5611  tRNA modification GTPase TrmE  27.5 
 
 		 458 aa  47  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.292564  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5671  tRNA modification GTPase TrmE  27.5 
 
 		 458 aa  47  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2045  GTP-binding protein Era  28.23 
 
 		 308 aa  47  0.0004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1153  hypothetical protein  26.2 
 
 		 614 aa  46.6  0.0004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.9167  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3429  tRNA modification GTPase TrmE  29.17 
 
 		 461 aa  47  0.0004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000224644  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2710  GTP-binding protein Era  22.73 
 
 		 304 aa  47  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.521075  normal  0.585399 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>