20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_1658 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_1658  GTPase-like protein  100 
 
 		 236 aa  483  1e-135  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.374478  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2138  putative GTPase  97.81 
 
 		 290 aa  368  1e-101  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4891  putative GTPase  97.81 
 
 		 290 aa  364  1e-100  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3346  putative GTPase  97.27 
 
 		 290 aa  363  2e-99  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2251  putative GTPase  96.72 
 
 		 290 aa  362  3e-99  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.796861  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1071  putative GTPase  95.63 
 
 		 290 aa  358  5e-98  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0467468 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1393  putative GTPase  95.08 
 
 		 290 aa  354  6.999999999999999e-97  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.139964 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3433  GTP-binding protein HSR1-related  57.61 
 
 		 291 aa  214  5.9999999999999996e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0759  putative GTPase  56.99 
 
 		 291 aa  212  4.9999999999999996e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3353  GTP-binding protein HSR1-related protein  47.28 
 
 		 287 aa  158  6e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1043  GTP-binding protein HSR1-related protein  45.11 
 
 		 287 aa  154  1e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.557877  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0930  GTP-binding protein HSR1-related  45.41 
 
 		 288 aa  150  2e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.518572  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1388  GTP-binding protein HSR1-related protein  39.67 
 
 		 291 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2882  GTP-binding protein HSR1-related  39.13 
 
 		 291 aa  144  1e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3137  GTP-binding protein HSR1-related  41.05 
 
 		 295 aa  127  2.0000000000000002e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3202  putative GTPase  33.51 
 
 		 294 aa  108  5e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4685  putative GTPase  32.43 
 
 		 294 aa  106  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3402  putative GTPase  32.43 
 
 		 294 aa  106  3e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4797  putative GTPase  31.89 
 
 		 294 aa  104  1e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.276697 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3828  GTP-binding protein Era  24.68 
 
 		 305 aa  42.4  0.007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>