48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_2152 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_2152  GTP-binding protein, HSR1-related  100 
 
 		 523 aa  1060    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0656  GTP-binding protein HSR1-related protein  31.77 
 
 		 512 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.53051  normal  0.190619 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1599  GTP-binding protein, HSR1-related  28.34 
 
 		 500 aa  123  8e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2089  small GTP-binding protein domain-containing protein  27.25 
 
 		 637 aa  102  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000643797  unclonable  0.000000212393 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4133  GTP-binding protein HSR1-related protein  30.72 
 
 		 840 aa  95.5  2e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1153  hypothetical protein  22.77 
 
 		 614 aa  93.6  9e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.9167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2380  GTP-binding protein, HSR1-related  24.86 
 
 		 635 aa  92.8  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4767  GTP-binding protein HSR1-related  25.58 
 
 		 629 aa  89  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.049365  hitchhiker  0.000697216 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4307  GTP-binding protein HSR1-related  26.17 
 
 		 650 aa  86.3  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0759  putative GTPase  24.48 
 
 		 291 aa  60.5  0.00000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2882  GTP-binding protein HSR1-related  25.68 
 
 		 291 aa  60.1  0.00000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1388  GTP-binding protein HSR1-related protein  28.49 
 
 		 291 aa  57.8  0.0000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0930  GTP-binding protein HSR1-related  25.41 
 
 		 288 aa  55.8  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.518572  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3137  GTP-binding protein HSR1-related  24.75 
 
 		 295 aa  54.7  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2138  putative GTPase  27.78 
 
 		 290 aa  53.9  0.000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1393  putative GTPase  27.78 
 
 		 290 aa  53.5  0.000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.139964 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2251  putative GTPase  27.78 
 
 		 290 aa  53.5  0.000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.796861  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3346  putative GTPase  27.78 
 
 		 290 aa  53.5  0.000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4891  putative GTPase  27.78 
 
 		 290 aa  53.5  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4685  putative GTPase  23.33 
 
 		 294 aa  52.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1071  putative GTPase  27.78 
 
 		 290 aa  52.4  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0467468 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3353  GTP-binding protein HSR1-related protein  24.47 
 
 		 287 aa  51.6  0.00004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3433  GTP-binding protein HSR1-related  28.17 
 
 		 291 aa  50.4  0.00008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1043  GTP-binding protein HSR1-related protein  26.46 
 
 		 287 aa  49.7  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.557877  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2152  small GTP-binding protein  29.63 
 
 		 409 aa  48.9  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1458  GTP-binding protein EngA  34.07 
 
 		 445 aa  48.9  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000548717  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3402  putative GTPase  24.65 
 
 		 294 aa  48.5  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4797  putative GTPase  24.65 
 
 		 294 aa  48.1  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.276697 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1303  GTP-binding proten HflX  28.28 
 
 		 449 aa  47.8  0.0004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3787  GTP-binding protein Era  24.65 
 
 		 468 aa  47.8  0.0006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.574606  normal  0.0434052 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0681  tRNA modification GTPase TrmE  28.78 
 
 		 450 aa  47.4  0.0007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.570227  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0657  tRNA modification GTPase TrmE  28.99 
 
 		 450 aa  46.6  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3622  tRNA modification GTPase TrmE  36.17 
 
 		 456 aa  46.6  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_5011  tRNA modification GTPase TrmE  28 
 
 		 490 aa  46.2  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.323736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1231  tRNA modification GTPase TrmE  28.67 
 
 		 469 aa  46.2  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  unclonable  0.0000000119996  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3202  putative GTPase  23.36 
 
 		 294 aa  45.4  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0692  GTP-binding protein EngA  26.32 
 
 		 470 aa  45.4  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3941  tRNA modification GTPase TrmE  32.74 
 
 		 458 aa  45.1  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2373  tRNA modification GTPase TrmE  22.38 
 
 		 473 aa  44.7  0.004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2390  GTP-binding protein EngA  28.85 
 
 		 441 aa  44.7  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000149599  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44250  predicted protein  31.25 
 
 		 632 aa  44.3  0.005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.755773  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4384  tRNA modification GTPase TrmE  36.92 
 
 		 479 aa  44.3  0.005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000178893 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1231  GTP-binding proten HflX  27.03 
 
 		 370 aa  43.9  0.006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1077  Miro domain protein  27.6 
 
 		 444 aa  43.9  0.006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2303  GTP-binding protein Era  30.16 
 
 		 306 aa  43.9  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3495  tRNA modification GTPase TrmE  28.68 
 
 		 467 aa  43.9  0.008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4138  tRNA modification GTPase TrmE  28.68 
 
 		 486 aa  43.5  0.008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.619376  normal  0.415942 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2929  tRNA modification GTPase TrmE  28.66 
 
 		 446 aa  43.5  0.008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>