More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_0656 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_0656  GTP-binding protein HSR1-related protein  100 
 
 		 512 aa  1015    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.53051  normal  0.190619 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1599  GTP-binding protein, HSR1-related  60.89 
 
 		 500 aa  572  1.0000000000000001e-162  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2152  GTP-binding protein, HSR1-related  30.12 
 
 		 523 aa  137  6.0000000000000005e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1153  hypothetical protein  30.67 
 
 		 614 aa  115  1.0000000000000001e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.9167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2089  small GTP-binding protein domain-containing protein  28.34 
 
 		 637 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000643797  unclonable  0.000000212393 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2380  GTP-binding protein, HSR1-related  29.95 
 
 		 635 aa  110  5e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4307  GTP-binding protein HSR1-related  28.88 
 
 		 650 aa  108  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4133  GTP-binding protein HSR1-related protein  26.65 
 
 		 840 aa  94  6e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4767  GTP-binding protein HSR1-related  28.9 
 
 		 629 aa  92.8  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.049365  hitchhiker  0.000697216 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1458  GTP-binding protein EngA  32.56 
 
 		 445 aa  64.7  0.000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000548717  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1987  GTP-binding protein Era  29.32 
 
 		 296 aa  63.5  0.000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3346  putative GTPase  28.63 
 
 		 290 aa  63.2  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4891  putative GTPase  29.26 
 
 		 290 aa  62.4  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2251  putative GTPase  28.63 
 
 		 290 aa  62  0.00000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.796861  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2138  putative GTPase  28.63 
 
 		 290 aa  62  0.00000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2272  GTP-binding protein Era  28.57 
 
 		 296 aa  61.6  0.00000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1071  putative GTPase  28.09 
 
 		 290 aa  58.9  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0467468 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0593  GTP-binding protein Era  33.33 
 
 		 354 aa  58.5  0.0000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1393  putative GTPase  28.63 
 
 		 290 aa  58.2  0.0000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.139964 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3772  hypothetical protein  31.18 
 
 		 350 aa  58.2  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000473871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2045  GTP-binding protein Era  29.77 
 
 		 308 aa  57  0.0000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17220  GTP-binding protein Era  33.59 
 
 		 313 aa  57  0.0000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00402768  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3137  GTP-binding protein HSR1-related  24.1 
 
 		 295 aa  56.6  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0861  GTP-binding protein Era  32.84 
 
 		 353 aa  56.2  0.000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1348  GTP-binding protein Era  30.41 
 
 		 315 aa  56.2  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.136623  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1662  GTP-binding protein EngA  31.11 
 
 		 465 aa  55.8  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.908743  normal  0.0937106 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1325  GTP-binding protein EngA  35.51 
 
 		 511 aa  55.8  0.000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.359502  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3510  hypothetical protein  24.83 
 
 		 419 aa  54.7  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.376537 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1806  GTP-binding protein Era  36.28 
 
 		 297 aa  54.3  0.000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0584484  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0686  GTP-binding protein EngA  32.98 
 
 		 473 aa  53.9  0.000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1966  GTP-binding protein Era  35.51 
 
 		 319 aa  53.9  0.000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000219392 
 
 
-
 
NC_002620  TC0076  GTP-binding protein EngA  30.22 
 
 		 490 aa  53.5  0.000008  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0791238  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1616  GTP-binding protein EngA  29.86 
 
 		 471 aa  53.5  0.000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.207628  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1378  GTP-binding protein Era  28.79 
 
 		 300 aa  53.5  0.000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.0000347783  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1360  small GTP-binding protein  35.48 
 
 		 445 aa  53.1  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.508315  hitchhiker  0.00000394324 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01058  GTP-binding protein EngA  32.09 
 
 		 465 aa  53.1  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.189601  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06108  GTP-binding protein EngA  32.09 
 
 		 465 aa  53.1  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0692336  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0397  GTP-binding protein Era  24.44 
 
 		 303 aa  52.8  0.00001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0296  GTP-binding protein Era  29.27 
 
 		 306 aa  52.8  0.00001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1338  GTP-binding protein EngA  30.22 
 
 		 439 aa  52  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.53279  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0759  putative GTPase  25.89 
 
 		 291 aa  52  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0400  GTP-binding protein EngA  37.08 
 
 		 436 aa  52.4  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.758155  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1438  GTP-binding protein EngA  31.93 
 
 		 471 aa  52.4  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.432419  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3066  GTP-binding protein Era  26.87 
 
 		 300 aa  52.8  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000674548  decreased coverage  0.0000000895367 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0656  GTP-binding protein EngA  31.91 
 
 		 480 aa  52.4  0.00002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01071  GTP-binding protein EngA  31.45 
 
 		 498 aa  52.4  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1029  GTP-binding protein Era  26.92 
 
 		 302 aa  52.8  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0733  GTP-binding protein EngA  33.33 
 
 		 500 aa  52.8  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2229  GTP-binding protein Era  37.08 
 
 		 318 aa  52.8  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00352178  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0908  GTP-binding protein Era  27.08 
 
 		 303 aa  52.4  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1339  GTP-binding protein EngA  27.94 
 
 		 463 aa  52.8  0.00002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1543  GTP-binding protein Era  34.86 
 
 		 314 aa  52.4  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2016  GTP-binding protein EngA  29.32 
 
 		 435 aa  52  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1294  GTP-binding protein EngA  34.04 
 
 		 489 aa  52  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.237221  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1662  GTP-binding protein Era  37.08 
 
 		 305 aa  52  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.438796  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3751  GTP-binding protein EngA  42.37 
 
 		 449 aa  51.6  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1719  GTP-binding protein EngA  37.08 
 
 		 445 aa  52  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.576586 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5109  GTP-binding protein EngA  37.08 
 
 		 445 aa  52  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.314704  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2373  GTP-binding protein EngA  36.63 
 
 		 466 aa  52  0.00003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.537703  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1832  GTP-binding protein EngA  37.08 
 
 		 445 aa  52  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.519459 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2279  GTP-binding protein EngA  33.33 
 
 		 460 aa  51.6  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0830899  normal  0.567814 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1614  GTP-binding protein EngA  39.08 
 
 		 499 aa  51.6  0.00003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00106208 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004345  GTP-binding protein EngA  33.33 
 
 		 498 aa  51.6  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3535  GTP-binding protein Era  34.29 
 
 		 324 aa  52  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6271  GTP-binding protein EngA  37.08 
 
 		 445 aa  52  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1438  small GTP-binding protein domain-containing protein  36.73 
 
 		 437 aa  51.6  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000421865  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1120  GTP-binding protein EngA  31.91 
 
 		 488 aa  51.6  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1746  GTP-binding protein EngA  37.08 
 
 		 445 aa  51.6  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1808  GTP-binding protein EngA  37.08 
 
 		 445 aa  52  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0671  GTP-binding protein Era  25 
 
 		 301 aa  51.6  0.00004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.584741  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2126  GTP-binding protein EngA  29.92 
 
 		 449 aa  51.6  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.127058  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1813  GTP-binding protein EngA  28.46 
 
 		 436 aa  51.2  0.00004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.18548  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0900  GTP-binding protein EngA  31.16 
 
 		 487 aa  51.2  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000256408 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2082  GTP-binding protein Era  31.2 
 
 		 313 aa  51.2  0.00004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.592415  normal  0.853182 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1548  GTP-binding protein EngA  32.98 
 
 		 488 aa  51.6  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1759  GTP-binding protein EngA  32.04 
 
 		 473 aa  51.2  0.00004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000739039 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1122  GTP-binding protein EngA  32.11 
 
 		 497 aa  51.2  0.00004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.827994  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2203  ribosome-associated GTPase EngA  29.17 
 
 		 567 aa  51.2  0.00004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2361  GTP-binding protein EngA  31.91 
 
 		 488 aa  51.2  0.00004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.596104  normal  0.591266 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02403  GTP-binding protein EngA  32.98 
 
 		 490 aa  50.8  0.00005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000560332  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1157  small GTP-binding protein  32.98 
 
 		 490 aa  50.8  0.00005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000141762  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3735  GTP-binding protein EngA  32.98 
 
 		 490 aa  50.8  0.00005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0134821  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4247  GTP-binding protein EngA  26.85 
 
 		 498 aa  51.2  0.00005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2662  GTP-binding protein EngA  32.98 
 
 		 490 aa  50.8  0.00005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000307508  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2185  GTP-binding protein Era  37.08 
 
 		 319 aa  50.8  0.00005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.646134  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1972  GTP-binding protein Era  26.36 
 
 		 289 aa  50.8  0.00005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02365  hypothetical protein  32.98 
 
 		 490 aa  50.8  0.00005  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00134909  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1166  GTP-binding protein EngA  32.98 
 
 		 490 aa  50.8  0.00005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000585661  normal  0.0127623 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2663  GTP-binding protein EngA  32.98 
 
 		 490 aa  50.8  0.00005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.194974 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2045  GTP-binding protein EngA  33.02 
 
 		 464 aa  50.8  0.00005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12310  GTP-binding protein Era  32.06 
 
 		 321 aa  50.8  0.00005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.378657  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2795  GTP-binding protein EngA  32.98 
 
 		 490 aa  50.8  0.00005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000215643  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2886  GTP-binding protein EngA  32.98 
 
 		 490 aa  50.8  0.00005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000684219  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0738  GTP-binding protein Era  27.69 
 
 		 301 aa  50.8  0.00005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.979215  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1467  GTP-binding protein EngA  45.61 
 
 		 445 aa  50.8  0.00006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.496612  normal  0.453892 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2457  GTP-binding protein Era  28.68 
 
 		 306 aa  50.8  0.00006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1271  GTP-binding protein Era  32.31 
 
 		 307 aa  50.8  0.00006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.17253 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1260  GTP-binding protein EngA  31.91 
 
 		 491 aa  50.8  0.00006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00475437  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1752  GTP-binding protein Era  42.7 
 
 		 312 aa  50.8  0.00006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.295037  normal  0.389985 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1118  GTP-binding protein Era  26.67 
 
 		 303 aa  50.8  0.00006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>