182 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_3508 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011353  ECH74115_3508  tail fiber protein  100 
 
 
645 aa  1231    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.283696 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2758  tail fiber protein  82.76 
 
 
439 aa  361  2e-98  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.204827  normal  0.264951 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3118  tail fiber protein  81.03 
 
 
437 aa  354  2.9999999999999997e-96  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.145222 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2165  tail fiber protein  99.42 
 
 
437 aa  352  1e-95  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.468721  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2871  tail fiber protein  95.93 
 
 
437 aa  340  5e-92  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0235495 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1203  tail fiber protein  96.51 
 
 
451 aa  339  7e-92  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1804  tail fiber protein  94.77 
 
 
434 aa  328  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.982324  hitchhiker  0.00650595 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0915  tail fiber protein  92.44 
 
 
438 aa  325  2e-87  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2230  tail fiber protein  90.21 
 
 
407 aa  236  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000293165 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1882  tail fiber protein  98.91 
 
 
92 aa  194  5e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0362623 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3184  tail fiber protein  98.91 
 
 
92 aa  194  5e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000807909 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5544  tail fiber protein  95.65 
 
 
92 aa  186  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2389  triple helix repeat-containing collagen  44.67 
 
 
842 aa  178  2e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00549275  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2569  hypothetical protein  47.74 
 
 
442 aa  172  1e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3477  triple helix repeat-containing collagen  41.71 
 
 
936 aa  168  2e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00171179  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3456  triple helix repeat-containing collagen  44.72 
 
 
1168 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00439724  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3739  hypothetical protein  42.33 
 
 
1147 aa  166  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0102662  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3469  triple helix repeat-containing collagen  41.62 
 
 
748 aa  164  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3721  collagen triple helix repeat protein  38.9 
 
 
706 aa  161  3e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.98705e-33 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3470  triple helix repeat-containing collagen  39.73 
 
 
813 aa  155  2e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.943395  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1549  group-specific protein  46.04 
 
 
512 aa  154  7e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000333718 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1618  group-specific protein  44.2 
 
 
643 aa  154  7e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.747405  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4476  collagen-like protein  37.16 
 
 
815 aa  152  2e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.957246  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4844  collagen triple helix repeat domain protein  39.82 
 
 
1219 aa  150  9e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4635  collagen triple helix repeat domain protein  40 
 
 
459 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.179421  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4458  collagen-like protein  36.34 
 
 
1055 aa  149  2.0000000000000003e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1339  collagen-like protein  43.99 
 
 
712 aa  148  3e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3360  hypothetical protein  41.54 
 
 
835 aa  147  8.000000000000001e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.888871  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1581  hypothetical protein  42.69 
 
 
585 aa  143  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.322632  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1866  hypothetical protein  42.25 
 
 
835 aa  143  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4654  hypothetical protein  38.53 
 
 
462 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3386  hypothetical protein  40.96 
 
 
867 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.12938  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3811  collagen triple helix repeat protein  37.4 
 
 
1451 aa  137  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00707911  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1027  triple helix repeat-containing collagen  56.96 
 
 
403 aa  133  1.0000000000000001e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.155494  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1632  large adhesin  55.62 
 
 
2914 aa  133  1.0000000000000001e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4557  triple helix repeat-containing collagen  38.9 
 
 
934 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4838  collagen triple helix repeat domain protein  37.69 
 
 
1297 aa  131  3e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0444265  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4862  collagen triple helix repeat domain protein  38.2 
 
 
1170 aa  130  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3124  Collagen triple helix repeat protein  42.55 
 
 
1580 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2697  hypothetical protein  48.33 
 
 
382 aa  129  2.0000000000000002e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4868  triple helix repeat-containing collagen  38.67 
 
 
1321 aa  127  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3387  hypothetical protein  36.04 
 
 
835 aa  127  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.265829  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0397  phage tail Collar  40.11 
 
 
1873 aa  125  3e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1304  Collagen triple helix repeat protein  42.55 
 
 
319 aa  124  4e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.174683  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0398  collagen triple helix repeat domain protein  39.46 
 
 
951 aa  124  7e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.178342  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0682  triple helix repeat-containing collagen  38.94 
 
 
542 aa  123  9.999999999999999e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1865  collagen triple helix repeat domain protein  36.84 
 
 
838 aa  121  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.224261  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3403  triple helix repeat-containing collagen  48.6 
 
 
582 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000154784 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1202  triple helix repeat-containing collagen  36.07 
 
 
400 aa  120  7.999999999999999e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000183423  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4912  collagen triple helix repeat protein  33.07 
 
 
524 aa  117  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4578  Collagen triple helix repeat protein  37.83 
 
 
444 aa  115  4.0000000000000004e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.567616 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0713  Collagen triple helix repeat protein  41.11 
 
 
322 aa  113  9e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1704  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  46.79 
 
 
689 aa  111  4.0000000000000004e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3557  hypothetical protein  42.42 
 
 
481 aa  110  9.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.285889  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3361  hypothetical protein  35.46 
 
 
835 aa  110  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1924  triple helix repeat-containing collagen  38.27 
 
 
466 aa  109  2e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1426  triple helix repeat-containing collagen  45.62 
 
 
473 aa  109  2e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.937607  normal  0.524919 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0586  Collagen triple helix repeat protein  40.57 
 
 
606 aa  108  4e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4370  triple helix repeat-containing collagen  45.37 
 
 
344 aa  106  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.324657  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3684  triple helix repeat-containing collagen  46.67 
 
 
468 aa  106  2e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2406  collagen triple helix repeat protein  42.93 
 
 
300 aa  104  4e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3841  hypothetical protein  42.19 
 
 
478 aa  102  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000174288  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13970  collagen triple helix repeat protein  62.14 
 
 
523 aa  100  1e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1608  collagen triple helix repeat protein  50.3 
 
 
1101 aa  99.8  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.712053 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0478  cell-surface large adhesin  55.26 
 
 
2851 aa  98.2  4e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1925  triple helix repeat-containing collagen  38.56 
 
 
492 aa  96.7  1e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3686  triple helix repeat-containing collagen  43.85 
 
 
587 aa  96.3  2e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0025  triple helix repeat-containing collagen  40.38 
 
 
366 aa  96.3  2e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.123658  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0148  collagen triple helix repeat protein  35.71 
 
 
639 aa  95.1  3e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8979  hypothetical protein  36.13 
 
 
307 aa  93.6  9e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3685  triple helix repeat-containing collagen  45.16 
 
 
493 aa  92.4  2e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1380  triple helix repeat-containing collagen  37.85 
 
 
474 aa  89.7  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0453849  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4113  Collagen triple helix repeat  48.03 
 
 
212 aa  88.6  3e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.366844  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1926  triple helix repeat-containing collagen  38.68 
 
 
582 aa  87.8  6e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3152  BclA protein  46.76 
 
 
347 aa  86.7  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0005  BclA protein  46.76 
 
 
347 aa  86.7  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2925  collagen triple helix repeat protein  38.07 
 
 
252 aa  85.1  0.000000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00742867 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2599  triple helix repeat-containing collagen  45.35 
 
 
222 aa  84.3  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0118729  normal  0.173421 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4978  triple helix repeat-containing collagen  48.21 
 
 
469 aa  82.4  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4655  collagen triple helix repeat domain protein  32.73 
 
 
426 aa  81.6  0.00000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4623  triple helix repeat-containing collagen  48.21 
 
 
647 aa  81.3  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1008  Collagen triple helix repeat protein  43.51 
 
 
380 aa  80.9  0.00000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3121  mucin 17-like protein  28.53 
 
 
1788 aa  80.1  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2465  BclA protein  49.57 
 
 
348 aa  77.8  0.0000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3227  triple helix repeat-containing collagen  50 
 
 
274 aa  77.4  0.0000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1479  triple helix repeat-containing collagen  46.81 
 
 
717 aa  77  0.0000000000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.289213  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5054  Collagen triple helix repeat protein  43.21 
 
 
298 aa  75.9  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0339954  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5836  Collagen triple helix repeat protein  46.83 
 
 
1426 aa  73.9  0.000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.278516  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2240  hypothetical protein  50 
 
 
258 aa  72  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3402  triple helix repeat-containing collagen  51.65 
 
 
253 aa  72  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000301368 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5064  Collagen triple helix repeat protein  38.92 
 
 
839 aa  70.5  0.00000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.18046  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4263  triple helix repeat-containing collagen  46.67 
 
 
390 aa  69.3  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1338  group-specific protein  53.91 
 
 
436 aa  69.7  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00783091  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2641  collagen triple helix repeat protein  33.44 
 
 
497 aa  67.8  0.0000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4914  Collagen triple helix repeat protein  46.46 
 
 
283 aa  67.8  0.0000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.209024  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2011  triple helix repeat-containing collagen  55.95 
 
 
308 aa  67  0.0000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.160641 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4285  Collagen triple helix repeat protein  42.46 
 
 
648 aa  67  0.0000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.275713  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0878  triple helix repeat-containing collagen  50.5 
 
 
303 aa  65.9  0.000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0304216 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1262  BclA protein  53.95 
 
 
295 aa  65.9  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0600  collagen triple helix repeat domain protein  39.68 
 
 
300 aa  64.7  0.000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.952581  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>