98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_3047 on replicon NC_008741
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008741  Dvul_3047  hypothetical protein  100 
 
 		 439 aa  885    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.836021  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0665  protein of unknown function DUF201  63.74 
 
 		 386 aa  512  1e-144  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0668  ATP-grasp protein-like protein  35.29 
 
 		 393 aa  222  9.999999999999999e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2200  ATP-grasp protein-like protein  31.16 
 
 		 390 aa  195  2e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3050  hypothetical protein  37.45 
 
 		 457 aa  162  1e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2335  hypothetical protein  28.95 
 
 		 404 aa  94.7  3e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2376  hypothetical protein  29.49 
 
 		 404 aa  93.6  6e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1598  ATP-grasp enzyme-like protein  26.22 
 
 		 383 aa  92  2e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.116073  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0384  ATP-grasp enzyme-like  23.86 
 
 		 346 aa  84  0.000000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0958371 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3434  ATP-grasp protein-like protein  25.87 
 
 		 439 aa  79.7  0.00000000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0127  hypothetical protein  24.38 
 
 		 404 aa  79.7  0.0000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2016  ATP-grasp protein-like protein  26.95 
 
 		 427 aa  79  0.0000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.943806 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0711  hypothetical protein  28.2 
 
 		 356 aa  71.2  0.00000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.283238 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2618  carbamoylphosphate synthase large subunit (split gene in MJ)-like  22.22 
 
 		 387 aa  71.6  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0724  protein of unknown function DUF201  28.2 
 
 		 356 aa  71.2  0.00000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.255037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2958  hypothetical protein  21.05 
 
 		 387 aa  69.7  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0760444  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0698  protein of unknown function DUF201  24.92 
 
 		 467 aa  69.7  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3248  hypothetical protein  20.08 
 
 		 387 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3002  hypothetical protein  20.08 
 
 		 387 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3017  hypothetical protein  20.08 
 
 		 360 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0773038  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0421  hypothetical protein  19.78 
 
 		 321 aa  67.8  0.0000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2939  hypothetical protein  19.7 
 
 		 387 aa  65.1  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0637  hypothetical protein  24.22 
 
 		 484 aa  63.9  0.000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.110504  normal  0.0645726 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0684  protein of unknown function DUF201  25.27 
 
 		 356 aa  63.5  0.000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.401732 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1349  ATP-grasp protein-like protein  31.3 
 
 		 525 aa  62  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.971756  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0753  carbamoyl phosphate synthase-like protein  21.83 
 
 		 326 aa  62  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.564232 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3531  hypothetical protein  23.84 
 
 		 397 aa  60.8  0.00000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0189  hypothetical protein  26.35 
 
 		 391 aa  60.5  0.00000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1574  protein tyrosine phosphatase  23.15 
 
 		 695 aa  60.5  0.00000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.354937  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4379  protein of unknown function DUF201  22.26 
 
 		 323 aa  59.3  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2881  ATP-grasp protein-like protein  21.94 
 
 		 399 aa  58.5  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000202032  hitchhiker  0.00373255 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1270  protein of unknown function DUF201  26.69 
 
 		 322 aa  58.9  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.462862 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1350  ATP-grasp protein-like protein  23.9 
 
 		 440 aa  57.8  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1176  hypothetical protein  23.82 
 
 		 418 aa  58.2  0.0000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.356654  hitchhiker  0.00556122 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3856  hypothetical protein  20.61 
 
 		 458 aa  55.5  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.930196 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3255  protein of unknown function DUF201  22.43 
 
 		 327 aa  55.5  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0146  hypothetical protein  22.4 
 
 		 382 aa  55.8  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2070  protein of unknown function DUF201  22.65 
 
 		 355 aa  54.7  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22630  biotin carboxylase  25.64 
 
 		 333 aa  55.1  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.405302 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3620  carbamoyl phosphate synthase large subunit  23.1 
 
 		 1073 aa  54.3  0.000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.830394  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0709  carbamoyl phosphate synthase large subunit  22.47 
 
 		 1073 aa  53.5  0.000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0416816 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8506  hypothetical protein  31.92 
 
 		 379 aa  53.5  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.412944  normal  0.0307347 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4589  carbamoyl phosphate synthase large subunit  22.47 
 
 		 1055 aa  53.1  0.000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.387511  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4724  carbamoyl phosphate synthase large subunit  22.47 
 
 		 1073 aa  53.5  0.000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4723  carbamoyl phosphate synthase large subunit  22.47 
 
 		 1073 aa  53.1  0.000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00575089 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0579  ATP-grasp enzyme-like protein  21.54 
 
 		 339 aa  53.1  0.000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62910  carbamoyl phosphate synthase large subunit  22.78 
 
 		 1073 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3357  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  26.25 
 
 		 1112 aa  52  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5476  carbamoyl phosphate synthase large subunit  22.78 
 
 		 1073 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.783479  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1549  hypothetical protein  23.3 
 
 		 413 aa  52.4  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0139  hypothetical protein  24.13 
 
 		 410 aa  50.8  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2876  hypothetical protein  25.78 
 
 		 734 aa  50.4  0.00006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4191  carbamoyl phosphate synthase large subunit  22.47 
 
 		 1073 aa  50.1  0.00008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.725714  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4501  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  22.47 
 
 		 1073 aa  49.7  0.00009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1888  protein of unknown function DUF201  26.32 
 
 		 441 aa  50.1  0.00009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.205911  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0402  pyruvate carboxylase  25.09 
 
 		 1147 aa  49.7  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0164  ATP-grasp enzyme-like  22.12 
 
 		 416 aa  48.5  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1462  protein of unknown function DUF201  23.24 
 
 		 318 aa  48.5  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.127358  normal  0.969827 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4057  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  25.23 
 
 		 1113 aa  48.1  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1077  D-alanine--D-alanine ligase  28.08 
 
 		 338 aa  47.8  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0742794  normal  0.822876 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4702  protein of unknown function DUF201  27.31 
 
 		 346 aa  47.4  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0701331  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3423  D-alanine--D-alanine ligase  28.32 
 
 		 346 aa  47  0.0006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.206359  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3289  protein of unknown function DUF201  23.32 
 
 		 361 aa  46.6  0.0008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0509227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1967  carbamoyl phosphate synthase large subunit  21.86 
 
 		 1076 aa  46.6  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004478  carbamoyl-phosphate synthase large chain  21.84 
 
 		 1077 aa  45.8  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02243  carbamoyl phosphate synthase large subunit  21.54 
 
 		 1073 aa  45.8  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2485  pyruvate carboxylase  24.83 
 
 		 1145 aa  46.2  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0767  carbamoyl phosphate synthase large subunit  21.84 
 
 		 1073 aa  45.8  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.256868  normal  0.1584 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0555  carbamoyl phosphate synthase large subunit  22.4 
 
 		 1074 aa  45.4  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.770872  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0823  D-alanine--D-alanine ligase  25.7 
 
 		 334 aa  45.1  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.595745 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3840  carbamoyl phosphate synthase large subunit  23.08 
 
 		 1074 aa  45.4  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0714  carbamoyl phosphate synthase large subunit  22.71 
 
 		 1074 aa  45.4  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.278068 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3722  urea carboxylase  25.7 
 
 		 1176 aa  45.4  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.848646  normal  0.673189 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0593  carbamoyl phosphate synthase large subunit  22.71 
 
 		 1074 aa  45.8  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.820402  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0033  carbamoyl phosphate synthase large subunit  22.71 
 
 		 1073 aa  45.4  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0586  carbamoyl phosphate synthase large subunit  22.83 
 
 		 1076 aa  45.8  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.221423  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3622  carbamoyl phosphate synthase large subunit  22.71 
 
 		 1073 aa  44.7  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.443028 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00036  hypothetical protein  22.71 
 
 		 1073 aa  44.7  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4600  ATP-grasp protein-like protein  24.58 
 
 		 399 aa  45.1  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.215683  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0037  carbamoyl phosphate synthase large subunit  22.71 
 
 		 1073 aa  44.7  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0034  carbamoyl phosphate synthase large subunit  22.71 
 
 		 1073 aa  44.7  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0036  carbamoyl phosphate synthase large subunit  22.71 
 
 		 1073 aa  44.7  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3566  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  22.71 
 
 		 1073 aa  44.7  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0036  carbamoyl phosphate synthase large subunit  22.71 
 
 		 1073 aa  44.7  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00037  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  22.71 
 
 		 1073 aa  44.7  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1919  hypothetical protein  22.73 
 
 		 284 aa  44.7  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.57396 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3748  protein of unknown function DUF201  22.14 
 
 		 388 aa  44.3  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.277412  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4985  hypothetical protein  24.07 
 
 		 395 aa  43.9  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.076001  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0630  hypothetical protein  23.38 
 
 		 408 aa  44.3  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4034  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  21.52 
 
 		 1071 aa  44.3  0.005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00188727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19040  carbamoylphosphate synthase large subunit  25.44 
 
 		 291 aa  44.3  0.005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.327123  normal  0.127791 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3647  carbamoyl phosphate synthase large subunit  22.71 
 
 		 1074 aa  43.9  0.005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6118  pyruvate carboxylase  21.6 
 
 		 1165 aa  43.9  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.410789 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2251  phosphoribosylglycinamide synthetase  24.03 
 
 		 418 aa  43.5  0.008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000511987 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3839  pyruvate carboxylase  21.6 
 
 		 1154 aa  43.5  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3453  carbamoyl phosphate synthase large subunit  22.08 
 
 		 1077 aa  43.1  0.009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.755127  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3582  carbamoyl phosphate synthase large subunit  22.08 
 
 		 1077 aa  43.1  0.009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4017  urea carboxylase  25.39 
 
 		 1176 aa  43.1  0.009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.877001  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>