77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1482 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_1482  hypothetical protein  100 
 
 		 134 aa  271  3e-72  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0778117  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1725  protein of unknown function UPF0150  65.12 
 
 		 135 aa  172  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1218  hypothetical protein  42.74 
 
 		 133 aa  98.6  3e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2667  hypothetical protein  42.19 
 
 		 132 aa  95.5  2e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000207573  normal  0.619713 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1157  hypothetical protein  36.59 
 
 		 132 aa  91.7  3e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2537  hypothetical protein  36.29 
 
 		 132 aa  89  2e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00219291  n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0034  hypothetical protein  36.72 
 
 		 134 aa  88.6  3e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.586089  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2675  protein of unknown function UPF0150  39.69 
 
 		 131 aa  86.7  1e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.295889  normal  0.250044 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5077  CopG family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 134 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2885  hypothetical protein  32.06 
 
 		 137 aa  81.6  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2645  hypothetical protein  36.76 
 
 		 137 aa  74.7  0.0000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.645056  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6579  hypothetical protein  35.07 
 
 		 137 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000147434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3827  hypothetical protein  33.33 
 
 		 131 aa  73.9  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.539898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2076  protein of unknown function UPF0150  33.08 
 
 		 142 aa  73.2  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.297925  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1076  hypothetical protein  33.33 
 
 		 145 aa  70.5  0.000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.293636  normal  0.176904 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0135  CopG family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 136 aa  70.1  0.000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.617767 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0567  hypothetical protein  36.67 
 
 		 130 aa  68.2  0.00000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0046  hypothetical protein  37.5 
 
 		 130 aa  67  0.00000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00000235341  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3799  protein of unknown function UPF0150  32.09 
 
 		 136 aa  67  0.00000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3342  hypothetical protein  34.43 
 
 		 131 aa  66.6  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.589243  normal  0.0213598 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2933  hypothetical protein  32.58 
 
 		 137 aa  66.2  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4060  protein of unknown function UPF0150  35.16 
 
 		 131 aa  65.5  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.685217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2095  hypothetical protein  33.33 
 
 		 134 aa  65.9  0.0000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.391448  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1324  protein of unknown function UPF0150  32.06 
 
 		 136 aa  65.1  0.0000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1998  hypothetical protein  32.82 
 
 		 138 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0136867  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1407  hypothetical protein  35.29 
 
 		 131 aa  63.5  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2748  CopG family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 131 aa  62.8  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5266  hypothetical protein  32.59 
 
 		 150 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5593  hypothetical protein  32.59 
 
 		 150 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0171  hypothetical protein  29.77 
 
 		 136 aa  62  0.000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1332  hypothetical protein  31.01 
 
 		 150 aa  60.8  0.000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.80599  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3439  hypothetical protein  32.33 
 
 		 135 aa  60.5  0.000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0972  hypothetical protein  32.33 
 
 		 135 aa  60.5  0.000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3308  hypothetical protein  32.33 
 
 		 135 aa  60.5  0.000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1396  hypothetical protein  33.08 
 
 		 137 aa  60.1  0.00000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000372603  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2545  protein of unknown function UPF0150  30.47 
 
 		 130 aa  59.3  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.22981  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0138  protein of unknown function UPF0150  31.75 
 
 		 138 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00419198  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2608  protein of unknown function UPF0150  31.75 
 
 		 135 aa  56.2  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.20418  normal  0.169023 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1712  hypothetical protein  29.1 
 
 		 171 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.615969  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2018  hypothetical protein  30.71 
 
 		 129 aa  53.5  0.0000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.176449  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4420  hypothetical protein  28.46 
 
 		 140 aa  53.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1635  hypothetical protein  28.68 
 
 		 134 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2305  hypothetical protein  30.77 
 
 		 139 aa  50.8  0.000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2770  hypothetical protein  31.4 
 
 		 145 aa  50.4  0.000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.507789  normal  0.689762 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1660  hypothetical protein  31.97 
 
 		 135 aa  49.3  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3887  hypothetical protein  29.29 
 
 		 149 aa  48.9  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1450  protein of unknown function UPF0150  34.62 
 
 		 133 aa  49.3  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2907  hypothetical protein  28.24 
 
 		 99 aa  48.5  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1588  hypothetical protein  25.78 
 
 		 134 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.20098  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2881  protein of unknown function UPF0150  46 
 
 		 67 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0217093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3760  hypothetical protein  31.07 
 
 		 140 aa  46.6  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3237  protein of unknown function UPF0150  46 
 
 		 67 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0564  toxin-antitoxin system, antitoxin component, HicB family  40.43 
 
 		 147 aa  45.8  0.0002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00598996 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1959  hypothetical protein  29.41 
 
 		 130 aa  44.7  0.0004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1016  protein of unknown function UPF0150  29.03 
 
 		 138 aa  44.7  0.0004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1661  protein of unknown function UPF0150  39.58 
 
 		 74 aa  44.3  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1679  protein of unknown function UPF0150  39.58 
 
 		 74 aa  43.9  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.80579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2363  hypothetical protein  36.73 
 
 		 72 aa  43.9  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.555585  normal  0.0574979 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4214  hypothetical protein  30.43 
 
 		 68 aa  43.9  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2353  hypothetical protein  36.73 
 
 		 72 aa  43.9  0.0008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0592921  normal  0.0104315 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1738  hypothetical protein  30.47 
 
 		 128 aa  43.5  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.429659  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0078  toxin-antitoxin system, antitoxin component, HicB family  25.55 
 
 		 139 aa  43.1  0.001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000322202 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4567  protein of unknown function UPF0150  44 
 
 		 67 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.312088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2356  hypothetical protein  26.67 
 
 		 139 aa  42.7  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5735  protein of unknown function UPF0150  29.23 
 
 		 130 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1684  hypothetical protein  33.87 
 
 		 133 aa  42  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.690218 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0455  protein of unknown function UPF0150  36.21 
 
 		 71 aa  42  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000544534  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1425  protein of unknown function UPF0150  40.62 
 
 		 135 aa  42  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000416258 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0600  hypothetical protein  37.31 
 
 		 70 aa  41.6  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4320  hypothetical protein  34.38 
 
 		 68 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.736754  normal  0.351765 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2449  hypothetical protein  35.29 
 
 		 138 aa  41.2  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4633  protein of unknown function UPF0150  38.33 
 
 		 68 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4470  protein of unknown function UPF0150  38.33 
 
 		 68 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0452  hypothetical protein  36.76 
 
 		 70 aa  40.8  0.006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.332121  n/a   
 
 
-
 
NC_008263  CPR_A0010  hypothetical protein  27.78 
 
 		 86 aa  40.8  0.006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.324673  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2778  hypothetical protein  38 
 
 		 72 aa  40.4  0.008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1957  protein of unknown function UPF0150  30 
 
 		 70 aa  40  0.01  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.516123 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>