More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2002 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_2002  hypothetical protein  100 
 
 		 320 aa  657    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2157  hypothetical protein  83.44 
 
 		 319 aa  557  1e-158  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2376  hypothetical protein  65.98 
 
 		 319 aa  408  1e-113  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4416  hypothetical protein  60.12 
 
 		 327 aa  403  1e-111  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1958  hypothetical protein  34.06 
 
 		 322 aa  206  3e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.654771  normal  0.486973 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0183  hypothetical protein  32.21 
 
 		 333 aa  170  3e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.248413 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0094  hypothetical protein  31.87 
 
 		 333 aa  167  1e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1047  hypothetical protein  29.49 
 
 		 316 aa  160  2e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0384871  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1767  hypothetical protein  31.85 
 
 		 327 aa  158  1e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0125693  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1404  hypothetical protein  32.91 
 
 		 328 aa  157  3e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7081  hypothetical protein  32.32 
 
 		 319 aa  150  3e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3813  extra-cytoplasmic solute receptor  31.97 
 
 		 325 aa  149  5e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1073  hypothetical protein  30.79 
 
 		 315 aa  149  5e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.988493  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03721  conserved hypothetical protein  29.21 
 
 		 324 aa  148  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4211  periplasmic binding protein  29.21 
 
 		 324 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00352553 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03670  hypothetical protein  29.21 
 
 		 324 aa  148  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5204  hypothetical protein  30.5 
 
 		 335 aa  147  3e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00787806  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5327  hypothetical protein  30.21 
 
 		 322 aa  146  4.0000000000000006e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3575  hypothetical protein  31.49 
 
 		 336 aa  144  2e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.106202 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1059  hypothetical protein  27.54 
 
 		 315 aa  143  4e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0448256  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3513  hypothetical protein  30.48 
 
 		 333 aa  142  5e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0982  hypothetical protein  30.77 
 
 		 326 aa  142  9.999999999999999e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1077  hypothetical protein  29.43 
 
 		 317 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.055057  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0005  hypothetical protein  30.98 
 
 		 323 aa  141  1.9999999999999998e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.736537 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0298  hypothetical protein  29.69 
 
 		 323 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0023  hypothetical protein  30.98 
 
 		 323 aa  140  3e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.908143  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3545  hypothetical protein  28.92 
 
 		 350 aa  140  3e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.874099  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1842  twin-arginine translocation pathway signal  29.15 
 
 		 327 aa  139  4.999999999999999e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00400007  normal  0.117909 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1565  hypothetical protein  29.57 
 
 		 324 aa  139  8.999999999999999e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3032  hypothetical protein  31.62 
 
 		 318 aa  138  1e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1420  twin-arginine translocation pathway signal  30.56 
 
 		 327 aa  137  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00102429  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3386  TRAP-T family transporter periplasmic binding protein  31.62 
 
 		 318 aa  137  2e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2083  hypothetical protein  31.07 
 
 		 332 aa  136  4e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.280461  normal  0.301608 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1696  hypothetical protein  29.94 
 
 		 327 aa  136  5e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.910733  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2348  hypothetical protein  31.05 
 
 		 331 aa  135  8e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3869  hypothetical protein  31.44 
 
 		 332 aa  135  8e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0415956  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5896  hypothetical protein  31.03 
 
 		 332 aa  135  9e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.971815  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4691  hypothetical protein  29.93 
 
 		 324 aa  134  1.9999999999999998e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.23954  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2584  hypothetical protein  31.85 
 
 		 337 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0899321  normal  0.923305 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5795  hypothetical protein  32.74 
 
 		 331 aa  134  3e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0293168 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1719  hypothetical protein  29.76 
 
 		 326 aa  133  3e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0711752  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3931  hypothetical protein  28.08 
 
 		 320 aa  134  3e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1072  hypothetical protein  29.19 
 
 		 316 aa  133  3.9999999999999996e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0296212  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4137  hypothetical protein  30.13 
 
 		 326 aa  132  7.999999999999999e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.864349 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4385  hypothetical protein  30.03 
 
 		 323 aa  131  1.0000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.944912  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4419  hypothetical protein  29.87 
 
 		 321 aa  130  3e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1213  hypothetical protein  30.14 
 
 		 325 aa  130  3e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.421726  normal  0.0620299 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0112  hypothetical protein  29.67 
 
 		 338 aa  130  4.0000000000000003e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.25815  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1904  hypothetical protein  28.75 
 
 		 326 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2124  tripartite tricarboxylate transporter(TTT) family, periplasmic ligand binding protein TctC  29.49 
 
 		 316 aa  129  6e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1906  hypothetical protein  28.33 
 
 		 325 aa  129  7.000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3614  hypothetical protein  30.48 
 
 		 355 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.380289  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0646  hypothetical protein  31.87 
 
 		 334 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1026  hypothetical protein  29.93 
 
 		 333 aa  127  2.0000000000000002e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3420  hypothetical protein  30.87 
 
 		 320 aa  127  2.0000000000000002e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.21089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1719  hypothetical protein  29.68 
 
 		 327 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0287751  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1098  hypothetical protein  29.77 
 
 		 339 aa  127  2.0000000000000002e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3894  hypothetical protein  30.06 
 
 		 327 aa  127  3e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0367386  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1436  hypothetical protein  29.32 
 
 		 318 aa  127  3e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.779932  normal  0.517463 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1383  hypothetical protein  28.52 
 
 		 325 aa  127  3e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.5589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5119  hypothetical protein  27.18 
 
 		 328 aa  127  3e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.111845 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4286  extra-cytoplasmatic solute receptor  30.7 
 
 		 353 aa  127  3e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.85012 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0081  hypothetical protein  27.57 
 
 		 326 aa  126  5e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0795  hypothetical protein  30.07 
 
 		 346 aa  126  5e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4068  hypothetical protein  29.05 
 
 		 315 aa  126  5e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0969  putative lipoprotein  31.41 
 
 		 322 aa  126  6e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.288033  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  30.42 
 
 		 330 aa  126  6e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3508  hypothetical protein  29.41 
 
 		 320 aa  126  6e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.231435 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2796  hypothetical protein  31.21 
 
 		 336 aa  125  7e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.309219  normal  0.544833 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4557  hypothetical protein  30 
 
 		 327 aa  125  8.000000000000001e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.634039  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  30.42 
 
 		 330 aa  125  1e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2912  hypothetical protein  28.04 
 
 		 337 aa  125  1e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2869  hypothetical protein  30.15 
 
 		 329 aa  124  2e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3035  hypothetical protein  27.42 
 
 		 338 aa  124  2e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.208714  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0728  twin-arginine translocation pathway signal  30.54 
 
 		 320 aa  124  2e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0842  hypothetical protein  28.73 
 
 		 331 aa  123  4e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.610001  normal  0.942349 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  32.28 
 
 		 324 aa  123  4e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3084  hypothetical protein  27.7 
 
 		 326 aa  123  4e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.482393  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2356  hypothetical protein  30.15 
 
 		 329 aa  123  4e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.632454  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4625  hypothetical protein  30.08 
 
 		 327 aa  123  4e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0179  hypothetical protein  29.27 
 
 		 328 aa  122  6e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.303741 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1017  hypothetical protein  29.69 
 
 		 304 aa  122  6e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.221773 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3516  hypothetical protein  28.08 
 
 		 318 aa  122  6e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000184229  normal  0.0629404 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  28.26 
 
 		 328 aa  122  7e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4644  hypothetical protein  28.43 
 
 		 321 aa  122  8e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.206487  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5370  extra-cytoplasmic solute receptor  28.04 
 
 		 322 aa  122  9e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.114035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  31.32 
 
 		 327 aa  122  9e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  31.32 
 
 		 325 aa  122  9.999999999999999e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6069  hypothetical protein  32.85 
 
 		 318 aa  122  9.999999999999999e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0116  hypothetical protein  30.3 
 
 		 331 aa  122  9.999999999999999e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3894  hypothetical protein  27.96 
 
 		 321 aa  121  9.999999999999999e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0107663  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6145  hypothetical protein  30.63 
 
 		 332 aa  121  9.999999999999999e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.8095  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  30.86 
 
 		 326 aa  122  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0478  hypothetical protein  29.05 
 
 		 325 aa  121  9.999999999999999e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.606939  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0619  hypothetical protein  28.71 
 
 		 325 aa  122  9.999999999999999e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0099  hypothetical protein  30.3 
 
 		 331 aa  122  9.999999999999999e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.361253  normal  0.47407 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4289  hypothetical protein  30.69 
 
 		 322 aa  122  9.999999999999999e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0170791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4438  extra-cytoplasmic solute receptor  29.87 
 
 		 329 aa  122  9.999999999999999e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000369974  normal  0.285012 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  29.6 
 
 		 328 aa  120  1.9999999999999998e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2138  hypothetical protein  27.57 
 
 		 331 aa  121  1.9999999999999998e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.104945  decreased coverage  0.00594387 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>