More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0348 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_0348  Triose-phosphate isomerase  100 
 
 		 251 aa  503  1e-141  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0212974 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1410  Triose-phosphate isomerase  68.53 
 
 		 251 aa  356  1.9999999999999998e-97  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1989  triosephosphate isomerase  63.35 
 
 		 250 aa  308  5e-83  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0880  triosephosphate isomerase  60.71 
 
 		 251 aa  298  4e-80  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1549  triosephosphate isomerase  58 
 
 		 252 aa  290  1e-77  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.42091  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1176  Triose-phosphate isomerase  59.29 
 
 		 255 aa  290  2e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.46526  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1948  triosephosphate isomerase  50 
 
 		 251 aa  223  2e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000540949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2059  triosephosphate isomerase  46.8 
 
 		 251 aa  222  4e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000160979  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1333  triosephosphate isomerase  46.18 
 
 		 252 aa  221  9.999999999999999e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000254673  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1356  triosephosphate isomerase  45.42 
 
 		 246 aa  217  1e-55  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.688667  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2338  triosephosphate isomerase  47.79 
 
 		 251 aa  216  2e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000215074  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3813  triosephosphate isomerase  48.18 
 
 		 254 aa  215  5.9999999999999996e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.491163 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1882  triosephosphate isomerase  47.39 
 
 		 251 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1618  triosephosphate isomerase  47.41 
 
 		 251 aa  213  1.9999999999999998e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000123397  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1628  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  49.19 
 
 		 654 aa  212  5.999999999999999e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00657054  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0991  triosephosphate isomerase  47.37 
 
 		 254 aa  211  7.999999999999999e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1122  triosephosphate isomerase  45.88 
 
 		 251 aa  211  1e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000274179  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2059  Triose-phosphate isomerase  46.99 
 
 		 254 aa  210  1e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0304  Triose-phosphate isomerase  46.59 
 
 		 257 aa  209  4e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0927  triosephosphate isomerase  47.01 
 
 		 250 aa  209  5e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.908857 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2989  Triose-phosphate isomerase  44.22 
 
 		 250 aa  207  2e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.292891  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0875  triosephosphate isomerase  41.77 
 
 		 253 aa  203  2e-51  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000476682  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0499  Triose-phosphate isomerase  47.37 
 
 		 251 aa  202  4e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1133  triosephosphate isomerase  42.17 
 
 		 249 aa  202  6e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1532  triosephosphate isomerase  46.96 
 
 		 253 aa  201  7e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.743336  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0151  Triose-phosphate isomerase  42.11 
 
 		 252 aa  201  7e-51  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0274  Triose-phosphate isomerase  43.6 
 
 		 265 aa  200  1.9999999999999998e-50  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.340442  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3825  Triose-phosphate isomerase  44.62 
 
 		 256 aa  199  3e-50  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0712505  normal  0.267182 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1444  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  46.22 
 
 		 655 aa  199  3.9999999999999996e-50  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2049  triosephosphate isomerase  45.45 
 
 		 257 aa  198  5e-50  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1115  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  46.03 
 
 		 687 aa  197  1.0000000000000001e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0990546  normal  0.111384 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0264  triosephosphate isomerase  45.78 
 
 		 249 aa  196  3e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1153  triosephosphate isomerase  42.57 
 
 		 250 aa  196  3e-49  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10411  triosephosphate isomerase  41.3 
 
 		 241 aa  195  5.000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1476  triosephosphate isomerase  44.98 
 
 		 249 aa  195  6e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0764  triosephosphate isomerase  50.6 
 
 		 246 aa  194  8.000000000000001e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.641907 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0241  Triose-phosphate isomerase  45.38 
 
 		 243 aa  194  1e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1464  triosephosphate isomerase  44.22 
 
 		 250 aa  194  1e-48  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.11594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1885  triosephosphate isomerase  45.6 
 
 		 255 aa  194  1e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000744734  normal  0.534473 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2003  triosephosphate isomerase  46.22 
 
 		 256 aa  193  2e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0534929  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3268  triosephosphate isomerase  43.55 
 
 		 257 aa  192  3e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0193189 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0971  triosephosphate isomerase  41.37 
 
 		 241 aa  193  3e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10411  triosephosphate isomerase  40.89 
 
 		 241 aa  192  3e-48  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0717  triosephosphate isomerase  45.45 
 
 		 251 aa  193  3e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.119458 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1695  triosephosphate isomerase  42.51 
 
 		 251 aa  192  4e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00252562  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09041  triosephosphate isomerase  40.08 
 
 		 241 aa  192  5e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.535393  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1615  triosephosphate isomerase  44.86 
 
 		 255 aa  191  8e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2423  triosephosphate isomerase  47.37 
 
 		 253 aa  191  9e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00789739  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2335  triosephosphate isomerase  47.37 
 
 		 253 aa  191  9e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.549293  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1261  triosephosphate isomerase  43.9 
 
 		 263 aa  191  1e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.40678  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2769  Triose-phosphate isomerase  47.08 
 
 		 262 aa  190  2e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.216684  hitchhiker  0.00002221 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1236  triosephosphate isomerase  42.46 
 
 		 250 aa  190  2e-47  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000124491  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2280  triosephosphate isomerase  43.95 
 
 		 253 aa  190  2e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.815023  normal  0.394565 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1670  triosephosphate isomerase  42.13 
 
 		 251 aa  190  2e-47  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.895843  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_7124  predicted protein  46.15 
 
 		 245 aa  190  2e-47  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000000122567  normal  0.0110543 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1520  triosephosphate isomerase  45.02 
 
 		 248 aa  190  2e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.436921 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1562  triosephosphate isomerase  44.14 
 
 		 252 aa  190  2e-47  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000611161  hitchhiker  0.000778836 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1308  triosephosphate isomerase  41.37 
 
 		 248 aa  189  2.9999999999999997e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0239  Triose-phosphate isomerase  43.64 
 
 		 243 aa  189  2.9999999999999997e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2544  triosephosphate isomerase  41.37 
 
 		 250 aa  189  2.9999999999999997e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1852  triosephosphate isomerase  42.23 
 
 		 249 aa  189  4e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1825  triosephosphate isomerase  41.7 
 
 		 248 aa  189  5e-47  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3135  triosephosphate isomerase  41.43 
 
 		 253 aa  188  5.999999999999999e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0830  triosephosphate isomerase  42.51 
 
 		 243 aa  188  8e-47  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.292321  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1923  triosephosphate isomerase  43.6 
 
 		 250 aa  188  8e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4184  triosephosphate isomerase  44.84 
 
 		 251 aa  188  9e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0562  Triose-phosphate isomerase  43.43 
 
 		 254 aa  187  9e-47  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.525761 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4716  triosephosphate isomerase  45.45 
 
 		 251 aa  187  1e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4715  triosephosphate isomerase  45.06 
 
 		 251 aa  186  2e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.151784  hitchhiker  0.00871946 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4581  triosephosphate isomerase  45.06 
 
 		 251 aa  186  2e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.299699  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1067  triosephosphate isomerase  45.82 
 
 		 256 aa  186  3e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.331655  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4494  triosephosphate isomerase  45.63 
 
 		 251 aa  186  3e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.321001  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2060  triosephosphate isomerase  44.22 
 
 		 250 aa  185  5e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.183985  normal  0.399765 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1947  triosephosphate isomerase  46.03 
 
 		 245 aa  184  9e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_91105  Triosephosphate isomerase (TIM) (Triose-phosphate isomerase)  46.44 
 
 		 248 aa  184  1.0000000000000001e-45  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0598  Triose-phosphate isomerase  45.82 
 
 		 245 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.441113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0134  Triose-phosphate isomerase  40.64 
 
 		 250 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3504  triosephosphate isomerase  40.48 
 
 		 250 aa  183  2.0000000000000003e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.449389  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3935  triosephosphate isomerase  41.11 
 
 		 251 aa  183  3e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00010757  normal  0.914781 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0794  triosephosphate isomerase  41.18 
 
 		 252 aa  183  3e-45  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0343  Triose-phosphate isomerase  45.42 
 
 		 245 aa  183  3e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_50738  triosephosphate isomerase  43.08 
 
 		 290 aa  182  4.0000000000000006e-45  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0775  triosephosphate isomerase  43.25 
 
 		 251 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000354266  normal  0.0202698 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4666  Triose-phosphate isomerase  44.26 
 
 		 254 aa  182  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5129  Triose-phosphate isomerase  44.26 
 
 		 254 aa  182  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.246161 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3096  Triose-phosphate isomerase  46.03 
 
 		 263 aa  182  5.0000000000000004e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.119937  normal  0.0717859 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3166  Triose-phosphate isomerase  42.13 
 
 		 250 aa  182  6e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.136531  normal  0.155629 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2078  triosephosphate isomerase  46.61 
 
 		 247 aa  182  6e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3104  Triose-phosphate isomerase  45.31 
 
 		 253 aa  182  6e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.275124  normal  0.622943 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5206  Triose-phosphate isomerase  43.37 
 
 		 254 aa  182  6e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0056  triosephosphate isomerase  40.94 
 
 		 253 aa  181  7e-45  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0738  Triose-phosphate isomerase  43.32 
 
 		 243 aa  181  9.000000000000001e-45  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000147069  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3323  Triose-phosphate isomerase  45.24 
 
 		 263 aa  181  9.000000000000001e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000945528 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15810  Triose-phosphate isomerase  39.02 
 
 		 250 aa  181  1e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.187277  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0100  triosephosphate isomerase  40.56 
 
 		 249 aa  181  1e-44  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1889  triosephosphate isomerase  44.67 
 
 		 252 aa  181  1e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.193197  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1380  triosephosphate isomerase  41.94 
 
 		 241 aa  181  1e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5400  Triose-phosphate isomerase  45.49 
 
 		 253 aa  181  1e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.344896 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13911  triosephosphate isomerase  42.11 
 
 		 243 aa  180  2e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.303825 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15890  triosephosphate isomerase  42.63 
 
 		 261 aa  180  2e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.388365  normal  0.839835 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>