More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_0423 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_0423  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 311 aa  654    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000736171  hitchhiker  0.000000152275 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0296  transcriptional regulator  65.93 
 
 		 135 aa  201  1.9999999999999998e-50  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00196972  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1148  transcriptional regulator, AraC family  34.04 
 
 		 309 aa  72.4  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2043  transcriptional regulator, AraC family  29.36 
 
 		 330 aa  72  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.437  normal  0.109712 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5964  transcriptional regulator, AraC family  33.94 
 
 		 134 aa  71.2  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.194078  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7634  transcriptional regulator AraC family  32.98 
 
 		 304 aa  70.1  0.00000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.63081  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4005  hypothetical protein  55.93 
 
 		 67 aa  70.5  0.00000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7695  transcriptional regulator  32.46 
 
 		 324 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.529732 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1650  AraC family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 316 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3628  transcriptional regulator, AraC family  32.98 
 
 		 156 aa  68.2  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2469  AraC family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 361 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3482  AraC family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 299 aa  67.4  0.0000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.675068  normal  0.589184 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3653  helix-turn-helix domain-containing protein  31.18 
 
 		 240 aa  66.6  0.0000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5388  transcriptional regulator, AraC family  29.13 
 
 		 298 aa  66.6  0.0000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.769805 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4827  transcriptional regulator, AraC family  27.45 
 
 		 319 aa  65.1  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2090  AraC family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 261 aa  65.9  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00753492 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6068  AraC family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 287 aa  65.5  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2499  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  29.79 
 
 		 156 aa  65.5  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.401459  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1602  transcriptional regulator  29.25 
 
 		 330 aa  65.5  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2058  transcriptional regulator, AraC family  27.88 
 
 		 286 aa  65.1  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5155  AraC family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 348 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.976904 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0804  transcriptional regulator, AraC family  23.71 
 
 		 145 aa  64.7  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1284  AraC family transcriptional regulator  26.72 
 
 		 168 aa  64.3  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4809  transcriptional regulator  29.73 
 
 		 331 aa  64.7  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.193614  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0584  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  26.73 
 
 		 164 aa  64.7  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2463  transcriptional regulator, AraC family  27.55 
 
 		 162 aa  65.1  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.400735  normal  0.926275 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2638  transcriptional regulator, AraC family  29.59 
 
 		 282 aa  64.7  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2224  AraC family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 278 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000575993  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2762  transcriptional regulator, AraC family  29.46 
 
 		 332 aa  63.9  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0171097 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3042  putative transcriptional regulator, AraC family, isolated domain protein  27.55 
 
 		 141 aa  63.9  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.319564  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5245  AraC family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 328 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.608948  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3497  AraC family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 198 aa  63.5  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.27794  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5245  AraC family transcriptional regulator  25.95 
 
 		 312 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1459  Ada regulatory protein/6-O-methylguanine-DNA methyltransferase  33.33 
 
 		 198 aa  63.2  0.000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000164097 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3203  transcriptional regulator  27 
 
 		 343 aa  63.5  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.123314  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0758  AraC family transcriptional regulator  28.75 
 
 		 299 aa  63.2  0.000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3942  AraC family transcriptional regulator  27 
 
 		 336 aa  63.5  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.466068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1687  AraC family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 345 aa  63.5  0.000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0447832  normal  0.915417 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1481  transcriptional regulator, AraC family  27.1 
 
 		 321 aa  63.2  0.000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2066  AraC family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 338 aa  62.8  0.000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.623235  normal  0.45327 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4788  AraC family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 344 aa  62.8  0.000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.139915  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3417  AraC family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 299 aa  62.8  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.138414  normal  0.441033 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0315  transcriptional regulator, AraC family  25.51 
 
 		 168 aa  62.8  0.000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3508  AraC family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 196 aa  62.8  0.000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0210792  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1399  helix-turn-helix domain-containing protein  29.29 
 
 		 324 aa  62.4  0.000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.953379  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0134  AraC family transcriptional regulator  25 
 
 		 322 aa  62.8  0.000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1365  AraC family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 353 aa  62.8  0.000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.122979  normal  0.036458 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3612  helix-turn-helix domain-containing protein  25.44 
 
 		 144 aa  62.8  0.000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.812981  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0227  AraC family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 324 aa  62.4  0.000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.583389 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5215  helix-turn-helix domain-containing protein  30.43 
 
 		 331 aa  62.4  0.000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1284  transcriptional regulator, AraC family  29.17 
 
 		 150 aa  62  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00113344 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2946  transcriptional regulator, AraC family  29.29 
 
 		 324 aa  62  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3772  Ada regulatory protein/6-O-methylguanine-DNA methyltransferase  31.58 
 
 		 198 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4587  AraC family transcriptional regulator  25.87 
 
 		 291 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.213128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3070  helix-turn-helix domain-containing protein  29.52 
 
 		 131 aa  62  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.362329  normal  0.0397869 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6617  transcriptional regulator, AraC family  28.46 
 
 		 287 aa  62  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.131937 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1225  AraC family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 249 aa  62  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.615855  normal  0.0441463 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2693  helix-turn-helix domain-containing protein  26 
 
 		 261 aa  61.6  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.129803  normal  0.168058 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3740  helix-turn-helix domain-containing protein  26.37 
 
 		 301 aa  62  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.436963  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3751  Ada regulatory protein/6-O-methylguanine-DNA methyltransferase  32.46 
 
 		 198 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000128468 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2139  transcriptional regulator, AraC family  29.29 
 
 		 282 aa  62  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.669919  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1408  helix-turn-helix domain-containing protein  29.29 
 
 		 324 aa  62  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3232  transcriptional regulator, AraC family  32.97 
 
 		 296 aa  61.6  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0599312  hitchhiker  0.0000105754 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4119  transcriptional regulator, AraC family  25.71 
 
 		 262 aa  62  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.840918  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5000  AraC family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 305 aa  62  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3305  two component transcriptional regulator, AraC family  26.56 
 
 		 513 aa  62  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1435  AraC family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 324 aa  62  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3578  AraC family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 314 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.54425 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5860  AraC family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 305 aa  62  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.499461  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3788  Ada regulatory protein/6-O-methylguanine-DNA methyltransferase  32.46 
 
 		 198 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2383  AraC family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 281 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.499508  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02043  transcriptional regulator transcription regulator protein  27.72 
 
 		 334 aa  61.2  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6995  AraC/XylS family transcriptional regulator  25 
 
 		 255 aa  61.2  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00467693 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0027  AraC family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 299 aa  61.2  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.618912  normal  0.0626425 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0932  AraC family transcriptional regulator  27.55 
 
 		 291 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1733  transcriptional regulator, AraC family  27.88 
 
 		 322 aa  61.2  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3129  AraC family transcriptional regulator  27.47 
 
 		 299 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2981  AraC family transcriptional regulator  22.68 
 
 		 305 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4617  transcriptional regulator, AraC family  30.77 
 
 		 296 aa  61.2  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.107807 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3840  Ada regulatory protein/6-O-methylguanine-DNA methyltransferase  32.46 
 
 		 198 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0091  AraC family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 278 aa  61.6  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2300  AraC family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 274 aa  61.2  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.457981  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6275  transcriptional regulator, AraC family  27 
 
 		 330 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1432  transcriptional regulator, AraC family  29.03 
 
 		 387 aa  61.6  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.185359  normal  0.618503 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0522  hypothetical protein  49.09 
 
 		 91 aa  61.2  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1098  AraC family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 327 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0600  helix-turn-helix domain-containing protein  27.18 
 
 		 297 aa  61.6  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2736  AraC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 154 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.66637 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1506  helix-turn-helix domain-containing protein  27.96 
 
 		 240 aa  61.2  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3778  AraC family transcriptional regulator  26.89 
 
 		 329 aa  61.6  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2718  two component transcriptional regulator, AraC family  27.36 
 
 		 259 aa  61.6  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1145  AraC family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 326 aa  61.2  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.480921  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4318  AraC family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 305 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00219342 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3312  AraC family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 281 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.403912 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1989  AraC family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 277 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.753386  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1788  AraC family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 350 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.432014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3244  AraC family transcriptional regulator  26.39 
 
 		 301 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.432164 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0579  two component AraC family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 531 aa  60.5  0.00000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2634  AraC family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 204 aa  60.5  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3162  AraC family transcriptional regulator  24.61 
 
 		 285 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>