More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_2559 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_2559  AAA ATPase  100 
 
 		 444 aa  878    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000494228 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1753  ATPase central domain-containing protein  56.88 
 
 		 450 aa  426  1e-118  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.215663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1133  AAA ATPase, central region  58.51 
 
 		 445 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1943  AAA ATPase central domain protein  50.94 
 
 		 619 aa  241  2e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00697304  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1500  AAA ATPase central domain protein  49.81 
 
 		 639 aa  238  2e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0972  AAA family ATPase  48.83 
 
 		 743 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2830  ATPase central domain-containing protein  50.94 
 
 		 657 aa  232  8.000000000000001e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2524  AAA ATPase central domain protein  51.41 
 
 		 656 aa  232  1e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0859  AAA ATPase  51.84 
 
 		 634 aa  231  2e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1952  AAA ATPase central domain protein  47.92 
 
 		 656 aa  230  5e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.248161 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1651  ATPase central domain-containing protein  49.06 
 
 		 653 aa  229  1e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0496762 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1879  AAA ATPase  47.35 
 
 		 787 aa  228  2e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3168  ATPase central domain-containing protein  36.51 
 
 		 434 aa  227  3e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0578626  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4150  AAA ATPase central domain protein  47.37 
 
 		 665 aa  226  6e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1499  AAA ATPase central domain protein  45.45 
 
 		 744 aa  225  9e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2559  AAA ATPase central domain protein  40.82 
 
 		 450 aa  223  4.9999999999999996e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.585202  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3811  ATPase central domain-containing protein  50.57 
 
 		 788 aa  223  8e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.308842 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4356  hypothetical protein  49.21 
 
 		 652 aa  219  8.999999999999998e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00948823  normal  0.0832553 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5978  AAA ATPase central domain protein  46.48 
 
 		 1085 aa  217  2.9999999999999998e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2933  AAA ATPase central domain protein  48.63 
 
 		 689 aa  217  4e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1669  AAA ATPase central domain protein  39.56 
 
 		 450 aa  216  4e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2258  AAA ATPase central domain protein  48.83 
 
 		 680 aa  216  7e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.226213  hitchhiker  0.00277333 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1734  AAA ATPase central domain protein  45.74 
 
 		 697 aa  216  8e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.168086 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2455  putative ATPase  42.4 
 
 		 441 aa  215  9.999999999999999e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0571186  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1893  AAA ATPase central domain protein  45.42 
 
 		 698 aa  209  1e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00103439  normal  0.0680609 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3934  AAA ATPase central domain protein  39.35 
 
 		 450 aa  206  5e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.158027  normal  0.185322 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1049  elongation factor P  42.51 
 
 		 432 aa  202  9.999999999999999e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4120  AAA ATPase central domain protein  35.88 
 
 		 466 aa  201  3e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0052109  hitchhiker  0.000242019 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2996  AAA ATPase, central region  42.19 
 
 		 478 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0755  AAA ATPase central domain protein  46.93 
 
 		 725 aa  199  1.0000000000000001e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0938  ATPase central domain-containing protein  48.39 
 
 		 671 aa  198  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0362  ATPase central domain-containing protein  38.73 
 
 		 448 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0659  AAA ATPase central domain protein  38.81 
 
 		 442 aa  196  7e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0372478  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5393  AAA ATPase central domain protein  48.05 
 
 		 682 aa  195  1e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4397  AAA ATPase central domain protein  46.67 
 
 		 687 aa  196  1e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1819  ATPase central domain-containing protein  46.25 
 
 		 662 aa  196  1e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.760352  normal  0.277502 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1020  AAA ATPase central domain protein  45.34 
 
 		 646 aa  194  3e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5257  AAA ATPase central domain protein  44.18 
 
 		 749 aa  192  1e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3136  AAA ATPase, central region  43.03 
 
 		 478 aa  189  1e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5237  AAA ATPase central domain protein  40.38 
 
 		 459 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.368199  hitchhiker  0.00000000902621 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2009  AAA ATPase central domain protein  42.97 
 
 		 1193 aa  182  9.000000000000001e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0827  AAA ATPase, central region  42.86 
 
 		 697 aa  180  4e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.934037  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3602  AAA ATPase, central region  42.51 
 
 		 448 aa  178  2e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000057004 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1822  ATPase central domain-containing protein  40.38 
 
 		 622 aa  173  5e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1864  AAA ATPase central domain protein  45.81 
 
 		 678 aa  171  3e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3054  ATPase central domain-containing protein  48.65 
 
 		 725 aa  170  4e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000821112 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3668  AAA ATPase central domain protein  50.81 
 
 		 134 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1774  cysteine synthase A  33.21 
 
 		 580 aa  126  9e-28  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0393214  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1833  AAA ATPase  35.8 
 
 		 578 aa  125  2e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.735306  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1667  ATPase, AAA family protein  34.75 
 
 		 569 aa  124  3e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0869  AAA ATPase family protein  36.79 
 
 		 352 aa  120  3.9999999999999996e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000165138  normal  0.784704 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1579  ATPase, AAA family protein  27.59 
 
 		 570 aa  119  7.999999999999999e-26  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0426  ATPase, AAA family protein  27.24 
 
 		 570 aa  119  9.999999999999999e-26  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0853  AAA ATPase  35.91 
 
 		 305 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0401  ATPase, AAA family protein  27.24 
 
 		 570 aa  118  1.9999999999999998e-25  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0172  ATPase central domain-containing protein  37.28 
 
 		 387 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0137  AAA ATPase central domain protein  33.61 
 
 		 577 aa  116  7.999999999999999e-25  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1549  ATPase, AAA family protein  30.4 
 
 		 570 aa  116  1.0000000000000001e-24  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.974713  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4054  AAA ATPase, central region  31.62 
 
 		 299 aa  115  2.0000000000000002e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0357172 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1882  ATPase central domain-containing protein  34.98 
 
 		 617 aa  104  3e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0025  AAA ATPase central domain protein  35.58 
 
 		 443 aa  101  3e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2297  AAA ATPase, central region  36.05 
 
 		 228 aa  99.8  8e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.754524 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10210  AAA+ family ATPase  36.28 
 
 		 336 aa  94  5e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.954892  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3321  AAA family ATPase  36.84 
 
 		 326 aa  92.4  1e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.81305  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1492  26S proteasome subunit P45 family  31.76 
 
 		 405 aa  91.3  4e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3114  ATPase central domain-containing protein  35.26 
 
 		 698 aa  90.9  4e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.020083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3503  AAA ATPase, central region  30.88 
 
 		 348 aa  90.5  5e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.238924 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1642  AAA-family ATPase  35.2 
 
 		 308 aa  90.5  6e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.722719  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0112  ATPase central domain-containing protein  37.04 
 
 		 789 aa  90.1  7e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.181464 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3267  ATPase central domain-containing protein  43.9 
 
 		 795 aa  89.4  1e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.115516 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0522  ATPase central domain-containing protein  32.57 
 
 		 391 aa  88.6  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3559  ATPase central domain-containing protein  34.73 
 
 		 677 aa  88.2  3e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2775  ATPase central domain-containing protein  35.8 
 
 		 325 aa  87.8  3e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.36839  normal  0.706454 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0150  AAA ATPase central domain protein  42.28 
 
 		 775 aa  87.8  4e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.172395  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0165  putative ATPase protein  39.77 
 
 		 772 aa  87.4  4e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4892  AAA ATPase central domain protein  37.5 
 
 		 326 aa  87.4  4e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4276  ATPase central domain-containing protein  41.35 
 
 		 327 aa  87  5e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4417  ATPase central domain-containing protein  41.35 
 
 		 327 aa  87  5e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5123  Adenosinetriphosphatase  31.96 
 
 		 739 aa  87.4  5e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.541256  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1305  AAA ATPase central domain protein  34.95 
 
 		 731 aa  86.7  7e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.596818  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1765  ATPase central domain-containing protein  31.02 
 
 		 655 aa  86.7  7e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.835623  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3392  Adenosinetriphosphatase  32.83 
 
 		 746 aa  86.7  8e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0642335  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1692  putative ATPase  43.61 
 
 		 322 aa  85.9  0.000000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.593174 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2089  ATPase central domain-containing protein  34.15 
 
 		 428 aa  85.9  0.000000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3431  AAA ATPase central domain protein  35.56 
 
 		 477 aa  86.3  0.000000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4803  ATPase central domain-containing protein  35.51 
 
 		 328 aa  85.9  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2275  AAA ATPase, central region  39.72 
 
 		 771 aa  85.9  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0746104  hitchhiker  0.00641076 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2025  Vesicle-fusing ATPase  32.22 
 
 		 601 aa  85.5  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4254  AAA ATPase central domain protein  36.93 
 
 		 332 aa  84.3  0.000000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.656455  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1890  AAA ATPase central domain protein  32.88 
 
 		 367 aa  84  0.000000000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.439906  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0185  proteasome-activating nucleotidase  28.52 
 
 		 405 aa  83.6  0.000000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2215  AAA ATPase central domain protein  35.96 
 
 		 451 aa  83.6  0.000000000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0998186  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2677  ATPase central domain-containing protein  35 
 
 		 328 aa  83.6  0.000000000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.681731 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2640  ATPase central domain-containing protein  38.46 
 
 		 332 aa  83.6  0.000000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.288063  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1958  AAA ATPase central domain protein  35.59 
 
 		 468 aa  83.6  0.000000000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.268075 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1791  AAA ATPase central domain protein  39.26 
 
 		 773 aa  83.2  0.000000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.615211 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1259  AAA ATPase central domain protein  34.88 
 
 		 573 aa  83.2  0.000000000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.636785  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2115  AAA ATPase central domain protein  39.26 
 
 		 773 aa  83.2  0.000000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00930684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0166  AAA ATPase, central region  41.46 
 
 		 789 aa  82.8  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1429  ATPase central domain-containing protein  37.5 
 
 		 464 aa  82.8  0.00000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>