More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_1162 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0170  acriflavin resistance protein  41.9 
 
 		 1068 aa  830    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.644504 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2196  acriflavin resistance protein  64.78 
 
 		 1335 aa  1157    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2050  acriflavin resistance protein  37.29 
 
 		 1069 aa  678    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.440026  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2569  integral membrane protein, putative multidrug resistance protein  37.28 
 
 		 1042 aa  721    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0974879  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0987  acriflavin resistance protein  63.97 
 
 		 1267 aa  1581    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.869665  normal  0.972102 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1162  acriflavin resistance protein  100 
 
 		 1189 aa  2374    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0869  acriflavin resistance protein  36.48 
 
 		 1038 aa  629  1e-179  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0434774  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0469  acriflavin resistance protein  30.79 
 
 		 1038 aa  609  9.999999999999999e-173  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0561  AcrB/AcrD/AcrF family protein  29.76 
 
 		 1032 aa  548  1e-154  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.38553  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0192  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  28.17 
 
 		 1025 aa  474  1e-132  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.958952  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2625  acriflavin resistance protein  48.17 
 
 		 1067 aa  448  1.0000000000000001e-124  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4620  AcrB/AcrD/AcrF family protein  44.62 
 
 		 1052 aa  444  1e-123  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1679  acriflavin resistance protein  44.44 
 
 		 1048 aa  436  1e-120  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.906292  normal  0.699127 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03414  hypothetical protein  46.87 
 
 		 1044 aa  425  1e-117  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002594  putative multidrug resistance protein  46.87 
 
 		 1034 aa  424  1e-117  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.018875  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3431  acriflavin resistance protein  28.32 
 
 		 1143 aa  423  1e-117  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.204539  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0619  acriflavin resistance protein  44.65 
 
 		 1045 aa  422  1e-116  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5504  acriflavin resistance protein  28.5 
 
 		 1146 aa  422  1e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.39476  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2742  acriflavin resistance protein  44.4 
 
 		 1041 aa  415  1e-114  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1145  acriflavin resistance protein  27.15 
 
 		 1191 aa  412  1e-113  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000258261  normal  0.148502 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3332  acriflavin resistance protein  41.94 
 
 		 1057 aa  408  1.0000000000000001e-112  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0158  putative multidrug resistance protein  44.31 
 
 		 1039 aa  405  1e-111  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0453777  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01960  multidrug resistance protein, putative  28.21 
 
 		 1165 aa  406  1e-111  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2510  acriflavin resistance protein  42.2 
 
 		 1033 aa  398  1e-109  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00600549  normal  0.198744 
 
 
-
 
NC_002978  WD1320  multidrug resistance protein D  38.84 
 
 		 1024 aa  382  1e-104  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1215  acriflavin resistance protein  35.66 
 
 		 1092 aa  309  2.0000000000000002e-82  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.735499  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0176  acriflavin resistance protein  25.92 
 
 		 1034 aa  307  7e-82  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1782  acriflavin resistance protein  37.58 
 
 		 1043 aa  305  3.0000000000000004e-81  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.849886  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1939  acriflavin resistance protein  23.91 
 
 		 1044 aa  285  4.0000000000000003e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1937  acriflavin resistance protein  25.24 
 
 		 1034 aa  284  6.000000000000001e-75  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.256217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2513  cation/multidrug efflux pump  32.02 
 
 		 1134 aa  278  5e-73  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.422561  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0879  acriflavin resistance protein  33.13 
 
 		 1290 aa  276  1.0000000000000001e-72  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1733  acriflavin resistance protein  27.19 
 
 		 1064 aa  265  3e-69  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00373856  normal  0.683525 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0971  NolG efflux transporter  24.36 
 
 		 1036 aa  265  4e-69  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1648  acriflavin resistance protein  25.87 
 
 		 1082 aa  253  1e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1383  acriflavin resistance protein  25.43 
 
 		 1022 aa  252  3e-65  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4520  acriflavin resistance protein  25.22 
 
 		 1043 aa  252  4e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1829  acriflavin resistance protein  25.85 
 
 		 1086 aa  249  2e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0794172  normal  0.266022 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1477  acriflavin resistance protein  31.83 
 
 		 1124 aa  249  3e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.415294  normal  0.236417 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1780  acriflavin resistance protein  26.51 
 
 		 1102 aa  248  4e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2382  acriflavin resistance protein  25.29 
 
 		 1083 aa  243  1e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0308  acriflavin resistance protein  25.95 
 
 		 1050 aa  239  2e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.514616  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1924  AcrB/AcrD/AcrF family protein  25.57 
 
 		 1091 aa  229  2e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0108  acriflavin resistance protein  25.6 
 
 		 1033 aa  228  5.0000000000000005e-58  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.153145  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1667  acriflavin resistance protein  23.52 
 
 		 1095 aa  226  3e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.954276 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2276  acriflavin resistance protein  25.84 
 
 		 1083 aa  225  4e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.440839  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6348  acriflavin resistance protein  24.5 
 
 		 1121 aa  225  4e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.644425  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1703  acriflavin resistance protein  25.51 
 
 		 1087 aa  223  9.999999999999999e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0752  acriflavin resistance protein  22.93 
 
 		 1071 aa  223  1.9999999999999999e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1637  acriflavin resistance protein  24.25 
 
 		 1173 aa  223  1.9999999999999999e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2515  acriflavin resistance protein  25.68 
 
 		 1085 aa  222  3e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0795793  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1628  acriflavin resistance protein  25.4 
 
 		 1087 aa  222  3.9999999999999997e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1703  acriflavin resistance protein  25.48 
 
 		 1087 aa  221  6e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1829  acriflavin resistance protein  25.51 
 
 		 1085 aa  220  1e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00817457  normal  0.578454 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2522  acriflavin resistance protein  25.51 
 
 		 1085 aa  220  1e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01445  hypothetical protein  24.31 
 
 		 1037 aa  220  1e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2349  acriflavin resistance protein  23.51 
 
 		 1070 aa  219  2e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.253914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2635  acriflavin resistance protein  25.51 
 
 		 1085 aa  220  2e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2982  acriflavin resistance protein  24.37 
 
 		 1028 aa  218  4e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.05054  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0226  acriflavin resistance protein  25.33 
 
 		 1054 aa  218  4e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.38584  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0267  acriflavin resistance protein  24.15 
 
 		 1040 aa  218  4e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.856769 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0902  acriflavin resistance protein  23.63 
 
 		 1029 aa  216  1.9999999999999998e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.621432  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4543  acriflavin resistance protein  24.59 
 
 		 1033 aa  215  4.9999999999999996e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.266065 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3471  acriflavin resistance protein  24.59 
 
 		 1033 aa  215  4.9999999999999996e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0282385  normal  0.0800862 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1779  acriflavin resistance protein  23.03 
 
 		 1025 aa  214  1e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2317  acriflavin resistance protein  24.71 
 
 		 1029 aa  214  1e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.259725 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1993  acriflavin resistance protein  24.87 
 
 		 1025 aa  212  4e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0507  acriflavin resistance protein  30.92 
 
 		 1020 aa  211  7e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.433089  normal  0.988199 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2283  acriflavin resistance protein  23.04 
 
 		 1051 aa  211  1e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2194  acriflavin resistance protein  22.46 
 
 		 1030 aa  209  3e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3232  acriflavin resistance protein  29.45 
 
 		 1029 aa  207  8e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.133576  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4493  multidrug efflux protein  22.38 
 
 		 1009 aa  205  4e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0361963 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0608  acriflavin resistance protein  23.31 
 
 		 1059 aa  205  5e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0300308  normal  0.48397 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4376  acriflavin resistance protein  23.63 
 
 		 1041 aa  204  6e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.980623  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2822  acriflavin resistance protein  22.14 
 
 		 1027 aa  204  8e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000227615  normal  0.366957 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0880  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  22.3 
 
 		 1068 aa  204  8e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.288102  normal  0.231109 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1942  acriflavin resistance protein  28.81 
 
 		 1040 aa  203  1.9999999999999998e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.211904  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3001  cation-multidrug efflux pump  24.83 
 
 		 1025 aa  202  3e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0559  acriflavin resistance protein  23.05 
 
 		 1062 aa  201  9e-50  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0767  acriflavin resistance plasma membrane protein  21.11 
 
 		 1022 aa  199  3e-49  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.450822  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4221  acriflavin resistance protein  23.5 
 
 		 1046 aa  199  3e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.592622  normal  0.234166 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2378  acriflavin resistance protein  25.55 
 
 		 1038 aa  199  3e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1458  acriflavin resistance protein  23.95 
 
 		 1082 aa  199  3e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00370682  unclonable  0.0000576194 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1178  acriflavin resistance protein  23.58 
 
 		 1042 aa  198  5.000000000000001e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1463  RND efflux transporter  24.09 
 
 		 1025 aa  198  5.000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1198  RND efflux transporter  21.11 
 
 		 1022 aa  198  6e-49  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4073  acriflavin resistance protein  23.35 
 
 		 1046 aa  197  8.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16820  putative efflux transmembrane protein  24 
 
 		 1025 aa  197  1e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.522228  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0122  acriflavin resistance protein  22.78 
 
 		 1073 aa  196  2e-48  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00495446  hitchhiker  0.00000000019698 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2321  acriflavin resistance protein  23.95 
 
 		 1052 aa  196  2e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0273304 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1446  acriflavin resistance protein  23.35 
 
 		 1076 aa  196  2e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0138545  hitchhiker  0.0000000120634 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0439  putative multidrug resistance protein  24.05 
 
 		 1036 aa  196  2e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00223634  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1165  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  22.91 
 
 		 1043 aa  196  3e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.749117 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2172  acriflavin resistance protein  23.17 
 
 		 1016 aa  195  5e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.244345  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1103  acriflavin resistance protein  24.01 
 
 		 1072 aa  194  6e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.779489 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8251  acriflavin resistance protein  24.93 
 
 		 1021 aa  194  7e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.236714  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2689  acriflavin resistance protein  23.51 
 
 		 1086 aa  194  9e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.103254  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2369  acriflavin resistance protein  25.85 
 
 		 1050 aa  194  1e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000403174 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0473  acriflavin resistance protein  22.26 
 
 		 1033 aa  194  1e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.239628  normal  0.228728 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0965  AcrB/AcrD/AcrF family protein  29.34 
 
 		 1024 aa  193  2e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00708155  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>