More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_2238 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_2238  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 354 aa  717    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0515  Elongator protein 3/MiaB/NifB  40.13 
 
 		 309 aa  242  7e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.84475  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1562  Radical SAM domain protein  40.38 
 
 		 401 aa  241  1e-62  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2966  Radical SAM domain protein  43.54 
 
 		 344 aa  241  2e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0294152  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2540  radical SAM domain-containing protein  44.18 
 
 		 340 aa  235  1.0000000000000001e-60  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.093156 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1501  radical SAM domain-containing protein  37.1 
 
 		 341 aa  207  2e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.166226  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0182  Radical SAM domain protein  37.11 
 
 		 401 aa  204  2e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.534223  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1971  radical SAM domain-containing protein  31.25 
 
 		 357 aa  197  2.0000000000000003e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.144867  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1689  radical SAM domain-containing protein  31.25 
 
 		 357 aa  197  2.0000000000000003e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0776794  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1944  Radical SAM domain protein  36.72 
 
 		 374 aa  195  9e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0450295  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0875  radical SAM domain-containing protein  37.43 
 
 		 359 aa  195  1e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0930  radical SAM family protein  33.44 
 
 		 338 aa  194  2e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000118017  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2316  radical SAM family protein  37.8 
 
 		 346 aa  193  4e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1719  radical SAM domain-containing protein  30.99 
 
 		 354 aa  192  1e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.219309  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1777  radical SAM domain-containing protein  38.82 
 
 		 352 aa  186  5e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.112435  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1061  Radical SAM domain protein  35.48 
 
 		 343 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.8315700000000001e-19 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0688  Radical SAM domain protein  36.13 
 
 		 336 aa  183  4.0000000000000006e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3202  Radical SAM domain protein  36.66 
 
 		 342 aa  181  2e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00235958  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1160  Radical SAM domain protein  31.49 
 
 		 341 aa  181  2.9999999999999997e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.276403  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2227  radical SAM domain-containing protein  36.22 
 
 		 342 aa  179  4.999999999999999e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.775407  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1713  radical SAM domain-containing protein  35.82 
 
 		 317 aa  179  5.999999999999999e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0660  Radical SAM domain protein  35.58 
 
 		 359 aa  178  1e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.142353  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1640  radical SAM domain-containing protein  34.7 
 
 		 317 aa  177  2e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1404  radical SAM protein, putative histone acetyltransferase  34.64 
 
 		 345 aa  170  4e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000266579  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0774  ELP3 component of the RNA polymerase II complex  32.41 
 
 		 362 aa  169  5e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000160735  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3151  radical SAM domain-containing protein  33.96 
 
 		 351 aa  159  6e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0207208  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0787  radical SAM domain-containing protein  29.02 
 
 		 317 aa  153  5e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1179  radical SAM domain-containing protein  28.62 
 
 		 314 aa  142  6e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1085  histone acetyltransferase, ELP3 family  29.25 
 
 		 514 aa  101  2e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.707697  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0579  ELP3 family histone acetyltransferase  25.1 
 
 		 527 aa  92  1e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1318  ELP3 family histone acetyltransferase  26.67 
 
 		 510 aa  92.4  1e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.340377 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0824  ELP3 family histone acetyltransferase  25.1 
 
 		 541 aa  91.7  2e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.318054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0088  radical SAM domain-containing protein  27.27 
 
 		 477 aa  91.3  2e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0202426 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1832  ELP3 family histone acetyltransferase  24.7 
 
 		 541 aa  90.9  3e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1093  ELP3 family histone acetyltransferase  25.1 
 
 		 541 aa  90.9  3e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.108771  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1460  histone acetyltransferase, ELP3 family  26.35 
 
 		 473 aa  88.2  2e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0898  ELP3 family histone acetyltransferase  28.69 
 
 		 512 aa  85.5  0.000000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.589047  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0586  ELP3 family histone acetyltransferase  25.54 
 
 		 459 aa  85.1  0.000000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000912711  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0122  radical SAM domain-containing protein  27.27 
 
 		 483 aa  84.7  0.000000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_551  radical SAM superfamily  25.54 
 
 		 459 aa  83.6  0.000000000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0398241  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1133  ELP3 family histone acetyltransferase  26.02 
 
 		 522 aa  80.9  0.00000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1167  radical SAM domain-containing protein  27.57 
 
 		 469 aa  80.9  0.00000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.413437  normal  0.627812 
 
 
-
 
NC_002936  DET0612  ELP3 family histone acetyltransferase  24.1 
 
 		 459 aa  80.5  0.00000000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.125099  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0889  ELP3 family histone acetyltransferase  23.89 
 
 		 541 aa  80.9  0.00000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1956  ELP3 family histone acetyltransferase  26.56 
 
 		 526 aa  79.7  0.00000000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.724461 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0279  ELP3 family histone acetyltransferase  22.09 
 
 		 563 aa  79.3  0.00000000000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2046  ELP3 family histone acetyltransferase  26.75 
 
 		 530 aa  77.8  0.0000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK00950  Pol II transcription elongation factor, putative  24.79 
 
 		 557 aa  76.3  0.0000000000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.110026  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1755  ELP3 family histone acetyltransferase  29.27 
 
 		 547 aa  75.1  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.668163  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2082  coproporphyrinogen III oxidase  24.88 
 
 		 375 aa  74.3  0.000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0475  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase, putative  29.35 
 
 		 376 aa  73.9  0.000000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2357  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  28.82 
 
 		 466 aa  73.6  0.000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0972265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2239  coproporphyrinogen III oxidase  30.38 
 
 		 409 aa  73.6  0.000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.167009  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_50848  predicted protein  24.56 
 
 		 544 aa  73.2  0.000000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.104715  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1480  histone acetyltransferase, ELP3 family  23.89 
 
 		 585 aa  72.8  0.000000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.761791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27329  predicted protein  25 
 
 		 555 aa  71.6  0.00000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.072078  hitchhiker  0.00552121 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1304  hypothetical protein  27.13 
 
 		 520 aa  71.6  0.00000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3661  putative radical SAM protein  24.88 
 
 		 319 aa  70.9  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0261  Radical SAM domain protein  24.8 
 
 		 564 aa  70.9  0.00000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0572  conserved hypothetical radical SAM protein  23.53 
 
 		 325 aa  70.9  0.00000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2936  hypothetical protein  26.63 
 
 		 319 aa  70.5  0.00000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.971153  hitchhiker  0.00000000000000717489 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0872  histone acetyltransferase, ELP3 family  22.38 
 
 		 556 aa  70.5  0.00000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1989  ELP3 family histone acetyltransferase  23.19 
 
 		 548 aa  70.1  0.00000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11040  histone acetyltransferase  29.88 
 
 		 666 aa  70.1  0.00000000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.142131  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02294  histone acetyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G06140)  22.86 
 
 		 574 aa  68.9  0.0000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0038  conserved hypothetical radical SAM protein  23.86 
 
 		 318 aa  69.3  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_42410  predicted protein  23.67 
 
 		 558 aa  68.6  0.0000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0664  hypothetical protein  24.29 
 
 		 318 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.08613e-26 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0651  conserved hypothetical radical SAM protein  24.76 
 
 		 318 aa  68.6  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2192  histone acetyltransferase, ELP3 family  22.22 
 
 		 576 aa  68.2  0.0000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4306  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  26.53 
 
 		 375 aa  67.8  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0329595  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1363  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  27.23 
 
 		 389 aa  67.4  0.0000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2706  histone acetyltransferase, ELP3 family  20.19 
 
 		 553 aa  66.6  0.0000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1553  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  25.1 
 
 		 423 aa  65.5  0.000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2223  coproporphyrinogen III oxidase  25.48 
 
 		 396 aa  65.5  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0582  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  27.15 
 
 		 388 aa  65.9  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6524  Coproporphyrinogen dehydrogenase  30.33 
 
 		 431 aa  65.9  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1976  coproporphyrinogen III oxidase  28.57 
 
 		 409 aa  65.5  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000234846 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1326  hypothetical protein  29.57 
 
 		 309 aa  64.7  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19920  coproporphyrinogen III oxidase  29.32 
 
 		 458 aa  64.7  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1304  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  28.71 
 
 		 381 aa  64.7  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17330  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  27.27 
 
 		 389 aa  64.3  0.000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.395345  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2930  histone acetyltransferase, ELP3 family  24.68 
 
 		 554 aa  64.3  0.000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.281817  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1177  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  23.58 
 
 		 372 aa  63.9  0.000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0804  putative radical SAM protein  23.61 
 
 		 334 aa  63.9  0.000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.768446  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0055  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  24.64 
 
 		 365 aa  63.9  0.000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.60035 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0384  coproporphyrinogen III oxidase  27.08 
 
 		 452 aa  63.9  0.000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0852  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  26.57 
 
 		 436 aa  63.5  0.000000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13360  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  27.68 
 
 		 418 aa  63.5  0.000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.186133  normal  0.0883125 
 
 
-
 
NC_002950  PG1087  radical SAM family protein  24.88 
 
 		 311 aa  63.2  0.000000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.447962 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0887  coproporphyrinogen III oxidase  26.34 
 
 		 453 aa  62.4  0.00000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00571678  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0159  coproporphyrinogen III oxidase  25.1 
 
 		 453 aa  62.4  0.00000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.219729  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2413  radical SAM domain-containing protein  28.3 
 
 		 437 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3411  coproporphyrinogen III oxidase  28.31 
 
 		 401 aa  61.2  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.102052 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0997  hypothetical protein  25.23 
 
 		 368 aa  61.6  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.961706  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0739  radical SAM family protein  22.75 
 
 		 332 aa  61.6  0.00000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.974352  normal  0.805342 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2882  radical SAM family protein  22.94 
 
 		 311 aa  61.2  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2563  radical SAM family protein  22.94 
 
 		 311 aa  61.2  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2950  putative radical SAM protein  25.69 
 
 		 322 aa  61.2  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.474173  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07700  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  26.79 
 
 		 368 aa  60.8  0.00000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.7688 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>