More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1208 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_1208  aminotransferase class IV  100 
 
 		 284 aa  578  1e-164  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.621738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3150  D-alanine aminotransferase  67.96 
 
 		 284 aa  412  1e-114  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0153378  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1768  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  63.41 
 
 		 286 aa  369  1e-101  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0536  aminotransferase class IV  61.48 
 
 		 284 aa  369  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0904931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0414  aminotransferase, class IV  62.72 
 
 		 286 aa  365  1e-100  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2484  aminotransferase, class IV  63.07 
 
 		 286 aa  367  1e-100  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0363  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  64.34 
 
 		 285 aa  363  2e-99  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0798  aminotransferase, class IV  62.02 
 
 		 286 aa  362  6e-99  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.193752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3168  aminotransferase, class IV  60.63 
 
 		 286 aa  360  1e-98  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3455  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  57.54 
 
 		 285 aa  354  6.999999999999999e-97  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1218  aminotransferase class IV  59.93 
 
 		 286 aa  352  2.9999999999999997e-96  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2788  aminotransferase class IV  59.57 
 
 		 286 aa  351  7e-96  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4609  aminotransferase class IV  60.35 
 
 		 288 aa  350  1e-95  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.296003  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3100  aminotransferase, class IV  57.19 
 
 		 285 aa  350  2e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.712487 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3425  aminotransferase, class IV  56.49 
 
 		 285 aa  344  8e-94  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1465  D-amino-acid transaminase  55.2 
 
 		 287 aa  334  9e-91  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1405  aminotransferase class IV  56.27 
 
 		 286 aa  330  2e-89  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1427  D-amino acid aminotransferase  55.63 
 
 		 293 aa  326  3e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2868  aminotransferase class IV  55.56 
 
 		 286 aa  324  1e-87  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0480243  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1294  D-amino-acid transaminase  53.05 
 
 		 286 aa  318  6e-86  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0934  D-amino acid aminotransferase  54.23 
 
 		 293 aa  317  1e-85  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0876  D-amino acid aminotransferase  54.23 
 
 		 293 aa  317  1e-85  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01735  putative D-alanine aminotransferase (D-aspartate aminotransferase) protein  54.71 
 
 		 290 aa  313  1.9999999999999998e-84  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5914  D-amino acid aminotransferase  52.84 
 
 		 288 aa  313  1.9999999999999998e-84  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7579  aminotransferase class IV  55.4 
 
 		 282 aa  313  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.241195  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4653  aminotransferase class IV  55.07 
 
 		 290 aa  312  2.9999999999999996e-84  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0520595 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4521  aminotransferase class IV  55.07 
 
 		 290 aa  312  2.9999999999999996e-84  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.419436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3562  aminotransferase class IV  52.92 
 
 		 283 aa  306  4.0000000000000004e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0938  aminotransferase class IV  54.32 
 
 		 285 aa  303  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6843  aminotransferase class IV  55.04 
 
 		 282 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.638263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5636  aminotransferase class IV  52.86 
 
 		 285 aa  302  5.000000000000001e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.931733  normal  0.467738 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1647  D-amino acid aminotransferase  53.5 
 
 		 286 aa  296  2e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0960  aminotransferase class IV  52.88 
 
 		 285 aa  295  4e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.549008 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0997  aminotransferase class IV  52.88 
 
 		 285 aa  295  6e-79  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2359  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  52.31 
 
 		 285 aa  286  2e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.74058  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5171  aminotransferase class IV  51.99 
 
 		 283 aa  276  4e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.623088  normal  0.871234 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1210  aminotransferase class IV  45.23 
 
 		 286 aa  269  2.9999999999999997e-71  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1852  D-alanine aminotransferase  44.09 
 
 		 288 aa  262  4.999999999999999e-69  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.961787  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1447  D-amino acid aminotransferase  48.75 
 
 		 281 aa  260  2e-68  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.614187  hitchhiker  0.000494555 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4394  aminotransferase class IV  47.5 
 
 		 285 aa  254  1.0000000000000001e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.124459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1079  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.65 
 
 		 288 aa  253  3e-66  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0534  aminotransferase class IV  46.62 
 
 		 286 aa  250  2e-65  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1614  D-amino acid aminotransferase  45.26 
 
 		 288 aa  249  5e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2609  D-amino acid aminotransferase  44.6 
 
 		 287 aa  248  9e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.271205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1083  D-alanine aminotransferase  43.46 
 
 		 286 aa  246  3e-64  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2581  D-amino acid aminotransferase  46.76 
 
 		 285 aa  245  4.9999999999999997e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.417434  normal  0.245371 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2552  aminotransferase, class IV  45.65 
 
 		 301 aa  244  9.999999999999999e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0563  D-alanine aminotransferase  39.64 
 
 		 303 aa  243  3e-63  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.63446  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3125  aminotransferase class IV  44.8 
 
 		 285 aa  240  2e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.427478 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1682  D-amino acid aminotransferase  46.24 
 
 		 291 aa  239  2.9999999999999997e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2593  D-amino acid aminotransferase  44.96 
 
 		 285 aa  237  1e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0296387 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1524  aminotransferase class IV  44.21 
 
 		 286 aa  234  1.0000000000000001e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.348617  normal  0.424589 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2879  D-amino acid aminotransferase  46.4 
 
 		 285 aa  232  5e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.483755  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1631  D-amino acid aminotransferase  41.81 
 
 		 287 aa  230  2e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.120446  normal  0.359556 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1171  D-amino acid aminotransferase  41.37 
 
 		 285 aa  229  3e-59  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.762011  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2866  D-amino acid aminotransferase  46.95 
 
 		 285 aa  227  1e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.908947  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1840  D-amino acid aminotransferase  46.24 
 
 		 285 aa  226  5.0000000000000005e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1448  D-amino acid aminotransferase  47.31 
 
 		 285 aa  223  2e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.27212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1094  D-amino acid aminotransferase  40.77 
 
 		 287 aa  222  4.9999999999999996e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1818  D-amino acid aminotransferase  40.42 
 
 		 287 aa  221  8e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.514691  normal  0.0349622 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2706  D-amino-acid transaminase  38.63 
 
 		 285 aa  204  1e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1636  aminotransferase, class IV  34.88 
 
 		 291 aa  189  4e-47  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000322319  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0106  D-amino acid aminotransferase, putative  38.71 
 
 		 283 aa  186  3e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1969  D-amino-acid transaminase  36.1 
 
 		 294 aa  183  3e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2631  D-alanine transaminase  36.3 
 
 		 300 aa  183  3e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4238  aminotransferase class IV  35.69 
 
 		 303 aa  183  4.0000000000000006e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1840  D-alanine aminotransferase  35.66 
 
 		 282 aa  177  2e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1805  D-alanine aminotransferase  35.66 
 
 		 282 aa  177  2e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0290  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  35.27 
 
 		 291 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.736627 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4429  D-amino-acid transaminase  35.97 
 
 		 295 aa  173  1.9999999999999998e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.202975  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1309  D-alanine aminotransferase  34.93 
 
 		 282 aa  173  2.9999999999999996e-42  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00550682  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0664  branched-chain amino acid aminotransferase  34.42 
 
 		 293 aa  171  1e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000154508  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2079  D-amino acid aminotransferase  35.97 
 
 		 291 aa  171  1e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.281204  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0177  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  34.05 
 
 		 286 aa  171  1e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2498  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  35.02 
 
 		 288 aa  170  3e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1735  branched-chain amino acid aminotransferase  36.26 
 
 		 289 aa  168  8e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2039  D-amino acid aminotransferase  36.23 
 
 		 291 aa  168  9e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000658861  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2037  D-amino acid aminotransferase  36.23 
 
 		 291 aa  168  1e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00430829  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0588  branched-chain amino acid aminotransferase  34.64 
 
 		 293 aa  168  1e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000572339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0267  D-alanine transminase  36.76 
 
 		 282 aa  168  1e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.935444 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0630  aminotransferase class IV  35.94 
 
 		 284 aa  167  1e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2249  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  34.52 
 
 		 282 aa  168  1e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00172333  normal  0.406393 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2281  D-amino acid aminotransferase  36.23 
 
 		 291 aa  167  2e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.3532299999999998e-35 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2100  D-amino acid aminotransferase  35.87 
 
 		 291 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0135621  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2256  D-amino acid aminotransferase  35.87 
 
 		 291 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.162413  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3086  D-amino acid aminotransferase  35.25 
 
 		 291 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.10616  hitchhiker  0.00000000000000346975 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1266  aminotransferase class IV  33.94 
 
 		 285 aa  165  8e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0106123  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0312  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  34.86 
 
 		 303 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.381931  hitchhiker  0.00369905 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0677  branched-chain amino acid aminotransferase  33.94 
 
 		 288 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.566486 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2260  branched-chain amino acid aminotransferase  34.01 
 
 		 292 aa  164  2.0000000000000002e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.576365 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0317  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  32.75 
 
 		 300 aa  164  2.0000000000000002e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.560202  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2099  branched-chain amino acid aminotransferase  33.92 
 
 		 291 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104874  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2366  D-amino acid aminotransferase  35.85 
 
 		 291 aa  163  3e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00514849  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1990  aminotransferase, class IV  31.25 
 
 		 286 aa  162  4.0000000000000004e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1306  branched-chain amino acid aminotransferase  35.02 
 
 		 297 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1013  D-amino-acid transaminase  35 
 
 		 286 aa  162  5.0000000000000005e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1467  hypothetical protein  34.67 
 
 		 278 aa  162  8.000000000000001e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5356  D-amino acid aminotransferase  32.7 
 
 		 290 aa  161  1e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000178847  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2285  D-amino acid aminotransferase  34.17 
 
 		 291 aa  160  2e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0817941  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1516  hypothetical protein  35.04 
 
 		 278 aa  160  2e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>