More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_0890 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_0890  DNA protecting protein DprA  100 
 
 		 395 aa  797    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.135631  normal  0.947282 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0474  DNA protecting protein DprA  46.32 
 
 		 367 aa  318  1e-85  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.13893  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1581  DNA processing protein DprA, putative  43.35 
 
 		 425 aa  303  3.0000000000000004e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.301322  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1159  DNA protecting protein DprA  51.39 
 
 		 668 aa  279  5e-74  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.20942 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0771  DNA protecting protein DprA  50.68 
 
 		 553 aa  274  2.0000000000000002e-72  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0319665 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0966  DNA protecting protein DprA  47.89 
 
 		 442 aa  257  3e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2712  DNA protecting protein DprA  40.97 
 
 		 359 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00267536  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0459  DNA protecting protein DprA  37.16 
 
 		 370 aa  243  3.9999999999999997e-63  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000016133  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1528  DNA protecting protein DprA  41.24 
 
 		 359 aa  241  2e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42126e-31 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0890  SMF protein  39.78 
 
 		 358 aa  239  4e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000185705  hitchhiker  0.000000000000633505 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0212  DNA protecting protein DprA  40.05 
 
 		 386 aa  239  6.999999999999999e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00622091  normal  0.258224 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3690  DNA protecting protein DprA  38.5 
 
 		 359 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000216312  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1025  DNA processing protein DprA, putative  39.24 
 
 		 361 aa  232  9e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00128425  unclonable  0.00000000696536 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3661  DNA protecting protein DprA  42.33 
 
 		 365 aa  232  1e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.34529  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0529  DNA protecting protein DprA  38.99 
 
 		 371 aa  232  1e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0102387  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2630  DNA protecting protein DprA  41.38 
 
 		 379 aa  231  2e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.196753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3341  DNA processing protein DprA, putative  38.59 
 
 		 385 aa  229  7e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0395  DNA processing protein DprA, putative  38.95 
 
 		 372 aa  229  8e-59  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1701  DNA protecting protein DprA  35.14 
 
 		 362 aa  228  2e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.237617  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0281  putative SMF protein  41.22 
 
 		 365 aa  227  3e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0175905 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2550  DNA processing protein DprA  38.65 
 
 		 356 aa  226  5.0000000000000005e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.304192  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2471  Smf/DprA family protein  44.86 
 
 		 371 aa  223  6e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3718  DNA protecting protein DprA  39.08 
 
 		 389 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000018591  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0023  filamentous haemagglutinin-like protein  43.01 
 
 		 399 aa  220  3e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2444  DNA protecting protein DprA  35.6 
 
 		 389 aa  219  7e-56  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000433746  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2841  DNA processing protein DprA, putative  39.63 
 
 		 364 aa  218  1e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2324  DNA protecting protein DprA  37.43 
 
 		 388 aa  218  1e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.257169  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2182  DNA protecting protein DprA  37.29 
 
 		 365 aa  217  2e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00480655  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3267  DNA protecting protein DprA  39.62 
 
 		 364 aa  218  2e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000733179  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002059  DNA uptake Rossmann fold nucleotide-binding protein  42.21 
 
 		 369 aa  217  2.9999999999999998e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0653  DNA protecting protein DprA  38.11 
 
 		 373 aa  216  4e-55  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.412317  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2275  DNA protecting protein DprA  43.12 
 
 		 377 aa  215  9e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00463646 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3012  SMF protein  38.98 
 
 		 368 aa  215  9.999999999999999e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_625  Rossmann fold DNA uptake nucleotide-binding protein  36.81 
 
 		 373 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0040  DNA protecting protein DprA  37.76 
 
 		 331 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.529295 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0571  DNA protecting protein DprA  40.77 
 
 		 375 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.607235  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0189  DNA processing protein DprA, putative  44.37 
 
 		 336 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000738349 
 
 
-
 
NC_002936  DET0718  DNA processing protein DprA, putative  36.69 
 
 		 406 aa  211  1e-53  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.269351  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2833  DNA protecting protein DprA  42.42 
 
 		 372 aa  211  2e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0057  DNA protecting protein DprA  45.51 
 
 		 368 aa  211  2e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0068  SMF protein  38.56 
 
 		 401 aa  211  3e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0408  Rossmann-fold nucleotide-binding protein  37.53 
 
 		 366 aa  210  3e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000102128  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4590  DNA protecting protein DprA  36.49 
 
 		 360 aa  211  3e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0839  DNA uptake Rossmann fold nucleotide-binding protein  38.68 
 
 		 362 aa  209  6e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00754519  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1675  DNA protecting protein DprA  36.04 
 
 		 360 aa  209  7e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0238407  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0049  DNA protecting protein DprA  35.5 
 
 		 368 aa  208  1e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00389  nucleotide-binding protein  41.67 
 
 		 369 aa  209  1e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0045  DNA processing protein DprA, putative  41.21 
 
 		 338 aa  208  1e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.064372  normal  0.147365 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0076  DNA protecting protein DprA  39.38 
 
 		 352 aa  208  1e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4546  DNA protecting protein DprA  35.14 
 
 		 369 aa  208  2e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1222  DNA protecting protein DprA  38.36 
 
 		 366 aa  207  3e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0017  DNA processing protein DprA, putative  41.75 
 
 		 365 aa  207  3e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0018  DNA protecting protein DprA  41.75 
 
 		 365 aa  207  3e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.645037  normal  0.109485 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1957  DNA protecting protein DprA  36.04 
 
 		 360 aa  206  5e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2650  hypothetical protein  36.23 
 
 		 361 aa  206  6e-52  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3734  DNA protecting protein DprA  49.06 
 
 		 339 aa  206  6e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.242141  hitchhiker  0.0022522 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3358  DNA protecting protein DprA  44 
 
 		 401 aa  206  7e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.496729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3881  DNA protecting protein DprA  43.24 
 
 		 399 aa  205  9e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.857304  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0085  DNA protecting protein DprA  44.95 
 
 		 365 aa  206  9e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.182517  decreased coverage  0.00000000000000667659 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4084  DNA protecting protein DprA  38.12 
 
 		 399 aa  205  1e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.168592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0085  DNA protecting protein DprA  44.6 
 
 		 365 aa  205  1e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.273214  normal  0.48909 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0348  DNA protecting protein DprA  42.71 
 
 		 379 aa  205  1e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.083083 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1985  DNA protecting protein DprA  37.73 
 
 		 385 aa  204  2e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4641  DNA processing protein DprA, putative  38.36 
 
 		 374 aa  204  2e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3681  DNA protecting protein DprA  44.29 
 
 		 402 aa  204  3e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0382  DNA protecting protein DprA  35.51 
 
 		 382 aa  203  4e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0642748 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0012  SMF protein  51.67 
 
 		 320 aa  202  6e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.143146 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00190  DNA processing protein, DprA (SMF family)  42.86 
 
 		 366 aa  202  6e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0224115  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0193  smf protein  36 
 
 		 375 aa  202  7e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0022  putative DNA processing protein DprA  35.4 
 
 		 383 aa  201  1.9999999999999998e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0034  DNA protecting protein DprA  43.06 
 
 		 389 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3410  SMF protein  35.25 
 
 		 379 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.487064  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0019  SMF protein  42.86 
 
 		 366 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000611984  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2338  DNA processing protein DprA, putative  35.01 
 
 		 382 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1209  DNA processing protein DprA, putative  41.24 
 
 		 360 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4686  DNA protecting protein DprA  36.8 
 
 		 408 aa  201  3e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0175  DNA processing protein DprA, putative  44.26 
 
 		 394 aa  200  3e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0217  SMF protein  37.76 
 
 		 374 aa  201  3e-50  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.396484  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2520  hypothetical protein  35.71 
 
 		 361 aa  200  3.9999999999999996e-50  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0194  DNA processing protein DprA, putative  37.61 
 
 		 377 aa  200  3.9999999999999996e-50  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0835  DNA protecting protein DprA  38.75 
 
 		 405 aa  200  3.9999999999999996e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0077  Smf protein  35.36 
 
 		 369 aa  199  6e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.64141  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0018  DNA protecting protein DprA  36.44 
 
 		 442 aa  199  6e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.256916 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00024  DNA protecting protein DprA  36.62 
 
 		 369 aa  199  7.999999999999999e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.525554  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0034  DNA processing protein DprA, putative  44.64 
 
 		 338 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0019  SMF protein  43.55 
 
 		 358 aa  198  1.0000000000000001e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.108355 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2098  DNA processing protein  46.36 
 
 		 308 aa  198  1.0000000000000001e-49  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00923798  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0168  DNA protecting protein DprA  36.73 
 
 		 360 aa  198  1.0000000000000001e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.208871  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0031  DNA protecting protein DprA  46.12 
 
 		 338 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.912099  hitchhiker  0.00525591 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2080  DNA protecting protein DprA  50.24 
 
 		 229 aa  198  1.0000000000000001e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0103  DNA protecting protein DprA  34.42 
 
 		 365 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0507  DNA protecting protein DprA  35.75 
 
 		 362 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.402405  hitchhiker  0.00180808 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0730  DNA protecting protein DprA  38.52 
 
 		 373 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0026  DNA protecting protein DprA  45.41 
 
 		 340 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07520  DNA protecting protein DprA  33.42 
 
 		 409 aa  197  2.0000000000000003e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.891455  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0029  DNA protecting protein DprA  46.12 
 
 		 338 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0934581 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0037  DNA protecting protein DprA  46.12 
 
 		 338 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000615281 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2057  DNA protecting protein DprA  38.87 
 
 		 374 aa  197  3e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.448378  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0037  DNA protecting protein DprA  38.03 
 
 		 368 aa  197  3e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.249396  normal  0.109899 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0033  DNA protecting protein DprA  44.64 
 
 		 338 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000150023 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>