98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_0754 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_0754  hydrolase  100 
 
 
240 aa  504  9.999999999999999e-143  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00261595  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0172  hydrolase  49.07 
 
 
243 aa  211  9e-54  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0542  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  42.67 
 
 
242 aa  202  3e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.657376 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2094  hydrolase  42.42 
 
 
283 aa  192  3e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000451147  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2046  hypothetical protein  38.98 
 
 
235 aa  181  8.000000000000001e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2947  HAD superfamily hydrolase  35.93 
 
 
247 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1690  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  39.17 
 
 
237 aa  156  4e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18050  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  43.3 
 
 
208 aa  149  3e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2074  hydrolase  38.77 
 
 
235 aa  149  5e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0658329  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0982  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  37.76 
 
 
269 aa  146  3e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.367355 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3082  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  33.05 
 
 
231 aa  145  6e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.378821  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07140  predicted phosphatase  34.18 
 
 
239 aa  127  1.0000000000000001e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.580043 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12620  predicted phosphatase  36.51 
 
 
298 aa  123  3e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0996  HAD family hydrolase  35.58 
 
 
200 aa  103  2e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.196077  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1134  HAD family hydrolase  35.1 
 
 
200 aa  102  7e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0624  hydrolase  25.76 
 
 
208 aa  80.9  0.00000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0704  haloacid dehalogenase-like hydrolase  30.1 
 
 
231 aa  59.3  0.00000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.463246  normal  0.864545 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4417  HAD family hydrolase  23.08 
 
 
232 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.155896  normal  0.156136 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1621  HAD family hydrolase  25.36 
 
 
231 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0638141  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0264  hypothetical protein  32.69 
 
 
211 aa  53.5  0.000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.247484 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4503  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  23.12 
 
 
224 aa  52.8  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1937  HAD family hydrolase  26.54 
 
 
234 aa  52.4  0.000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.67763  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0027  HAD superfamily hydrolase  26.42 
 
 
235 aa  52.4  0.000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0174  HAD family hydrolase  21.84 
 
 
215 aa  50.8  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2484  HAD family hydrolase  25 
 
 
233 aa  50.8  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2426  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  23.74 
 
 
224 aa  50.1  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0132517 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0033  HAD family hydrolase  25.6 
 
 
228 aa  50.1  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.144848  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2149  HAD family hydrolase  23.74 
 
 
224 aa  48.5  0.00009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.376936  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4954  pyrophosphatase PpaX  24.07 
 
 
215 aa  48.5  0.00009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4850  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  25.38 
 
 
229 aa  48.1  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0298674  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0822  HAD family hydrolase  22.11 
 
 
224 aa  48.1  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.923988 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1296  phosphoglycolate phosphatase  23.74 
 
 
233 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0205291  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2109  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  23.23 
 
 
224 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.546495 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2476  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  25.37 
 
 
225 aa  47  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00341069  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1642  HAD family hydrolase  26.92 
 
 
225 aa  47.4  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3704  pyrophosphatase PpaX  25.36 
 
 
212 aa  47.4  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2000  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  20 
 
 
247 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1576  HAD family hydrolase  26.92 
 
 
225 aa  47.4  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4164  HAD family hydrolase  28.29 
 
 
193 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0540485  normal  0.889807 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1514  phosphoglycolate phosphatase  22.33 
 
 
243 aa  47.8  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00414525  decreased coverage  0.0000736152 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2025  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  20 
 
 
247 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1639  Haloacid dehalogenase domain-containing protein hydrolase  32.14 
 
 
231 aa  47  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.189012  normal  0.175401 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5246  pyrophosphatase PpaX  29.79 
 
 
216 aa  47  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2007  HAD family hydrolase  21.26 
 
 
222 aa  47  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1783  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  23.48 
 
 
222 aa  46.6  0.0004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1170  HAD family hydrolase  24.41 
 
 
238 aa  46.6  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.382676  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19180  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  24.04 
 
 
218 aa  46.2  0.0005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.143986  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0954  phosphoglycolate phosphatase  23.08 
 
 
233 aa  46.2  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6944  phosphoglycolate phosphatase  25 
 
 
257 aa  45.8  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0220  HAD family hydrolase  26.09 
 
 
238 aa  45.8  0.0007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.208784 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0513  HAD family hydrolase  40 
 
 
262 aa  45.4  0.0008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.227881 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1175  HAD family hydrolase  22.66 
 
 
241 aa  45.4  0.0008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.542362  normal  0.617727 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4249  HAD family hydrolase  22.61 
 
 
224 aa  45.4  0.0008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4411  HAD family hydrolase  22.39 
 
 
224 aa  44.7  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.981308  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2746  HAD family hydrolase  21.43 
 
 
240 aa  45.1  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.906764  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5265  pyrophosphatase PpaX  28.72 
 
 
216 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4445  phosphoglycolate phosphatase  25.13 
 
 
234 aa  45.1  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0670358  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2790  HAD family hydrolase  21.43 
 
 
240 aa  45.1  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0667  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  24.29 
 
 
232 aa  45.1  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2776  HAD family hydrolase  21.43 
 
 
240 aa  45.1  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.223588  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2233  phosphoglycolate phosphatase  22.49 
 
 
238 aa  44.3  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.25252  normal  0.513173 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0925  phosphoglycolate phosphatase  23.11 
 
 
224 aa  44.3  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5322  pyrophosphatase PpaX  28.72 
 
 
216 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4839  pyrophosphatase PpaX  28.72 
 
 
216 aa  43.9  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4854  pyrophosphatase PpaX  28.72 
 
 
216 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0179  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  23.67 
 
 
233 aa  43.9  0.002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.31745 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6102  HAD family hydrolase  22.39 
 
 
224 aa  44.3  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.524869  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2034  HAD family hydrolase  24.89 
 
 
216 aa  44.3  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.645104  normal  0.0672621 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0689  HAD family hydrolase  23.5 
 
 
229 aa  44.3  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.319596 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0615  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  29.17 
 
 
262 aa  43.5  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0072  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.58 
 
 
230 aa  43.5  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5010  pyrophosphatase PpaX  28.72 
 
 
216 aa  43.9  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5390  pyrophosphatase PpaX  28.72 
 
 
216 aa  43.9  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1780  HAD family hydrolase  25.41 
 
 
225 aa  43.5  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.587654  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3310  HAD family hydrolase  21.84 
 
 
232 aa  43.5  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1995  HAD family hydrolase  22.33 
 
 
215 aa  43.5  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.273033 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1492  HAD family hydrolase  23.11 
 
 
217 aa  43.5  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.210059  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7037  HAD family hydrolase  22.39 
 
 
224 aa  43.5  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.927677 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6309  HAD family hydrolase  21.5 
 
 
224 aa  42.7  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.403057 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0371  HAD family hydrolase  23.86 
 
 
242 aa  43.1  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0577  HAD family hydrolase  29.41 
 
 
216 aa  43.1  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2083  phosphoglycolate phosphatase  23.04 
 
 
226 aa  43.1  0.004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.609164  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2060  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  25 
 
 
225 aa  42.7  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.750609  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1687  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  22.3 
 
 
248 aa  42.7  0.005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0106556 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1317  HAD family hydrolase  21.5 
 
 
224 aa  42.7  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.716581  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6512  HAD family hydrolase  21.5 
 
 
224 aa  42.7  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2152  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  25.2 
 
 
225 aa  42.7  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1880  HAD family hydrolase  25.26 
 
 
230 aa  42.4  0.006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.615565  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0023  HAD family hydrolase  28.3 
 
 
228 aa  42.4  0.006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.922489 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4194  phosphoglycolate phosphatase  25.73 
 
 
225 aa  42.4  0.006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1750  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26 
 
 
237 aa  42.4  0.007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00428028  normal  0.0347073 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2972  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  30.11 
 
 
257 aa  42.4  0.007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4626  HAD family hydrolase  23.22 
 
 
213 aa  42.4  0.007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.317625  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1142  HAD family hydrolase  23.19 
 
 
218 aa  42  0.008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0265  phosphoglycolate phosphatase  24.76 
 
 
232 aa  42  0.009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.210779  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0545  histidinol-phosphate phosphatase family protein  27.35 
 
 
191 aa  42  0.009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0426  HAD family sugar phosphatase  21.86 
 
 
212 aa  41.6  0.01  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0044369  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6883  phosphoglycolate phosphatase  27.78 
 
 
219 aa  42  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>