63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1508 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_1508  hypothetical protein  100 
 
 		 949 aa  1880    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.144952  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0802  hypothetical protein  40.19 
 
 		 957 aa  533  1e-150  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.627232 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0786  hypothetical protein  40.22 
 
 		 938 aa  525  1e-147  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.447385 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0732  hypothetical protein  39.78 
 
 		 953 aa  516  1.0000000000000001e-145  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.40961  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1102  hypothetical protein  41.23 
 
 		 903 aa  469  1.0000000000000001e-131  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.181448  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1094  hypothetical protein  35.13 
 
 		 902 aa  467  9.999999999999999e-131  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0433151  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5166  hypothetical protein  37.58 
 
 		 939 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.095267  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1987  Protein of unknown function DUF2339, transmembrane  35.07 
 
 		 973 aa  443  1e-123  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0361094  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3483  membrane protein-like protein  39.78 
 
 		 989 aa  431  1e-119  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.736371  normal  0.107925 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5173  membrane protein-like protein  36.49 
 
 		 1124 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.747728  normal  0.0847519 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5106  membrane protein-like protein  36.49 
 
 		 1130 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0951295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3194  membrane protein-like  36.49 
 
 		 1155 aa  406  1e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1674  membrane protein-like protein  35.7 
 
 		 1093 aa  402  9.999999999999999e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.956677 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4568  membrane protein-like protein  38.82 
 
 		 1139 aa  392  1e-107  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.95183 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5093  membrane protein-like protein  38.52 
 
 		 1133 aa  387  1e-106  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.161035 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2460  hypothetical protein  32.67 
 
 		 946 aa  377  1e-103  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0453  membrane protein-like  37.77 
 
 		 1133 aa  368  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.201937  normal  0.0526268 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1901  membrane protein-like protein  36.95 
 
 		 1146 aa  364  4e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.95592  normal  0.876478 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2804  membrane-like protein  35.42 
 
 		 941 aa  332  2e-89  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.195505 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5847  hypothetical protein  40.38 
 
 		 1200 aa  315  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.227793  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67530  hypothetical protein  47.33 
 
 		 1201 aa  302  3e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.311173  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0350  hypothetical protein  41.45 
 
 		 1198 aa  290  6e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3218  hypothetical protein  42.76 
 
 		 891 aa  278  3e-73  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.311466  normal  0.319436 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02114  hypothetical protein  41.91 
 
 		 774 aa  260  8e-68  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.283131  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4945  hypothetical protein  40.31 
 
 		 1128 aa  260  1e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.451104 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0505  membrane protein-like protein  44.47 
 
 		 1207 aa  251  3e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1537  hypothetical protein  41.58 
 
 		 1242 aa  240  1e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.896798  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2282  membrane protein-like  30.07 
 
 		 1045 aa  149  3e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.650605  normal  0.0137094 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1663  membrane protein-like protein  29.04 
 
 		 600 aa  149  3e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0094657 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1743  hypothetical protein  26.24 
 
 		 778 aa  139  3.0000000000000003e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0602624  normal  0.707761 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2238  hypothetical protein  24.72 
 
 		 824 aa  131  5.0000000000000004e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2975  membrane protein  22.82 
 
 		 833 aa  129  4.0000000000000003e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1764  membrane protein  28.67 
 
 		 587 aa  124  9e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.923243 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1520  membrane protein-like protein  23.44 
 
 		 823 aa  118  3.9999999999999997e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.115215  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2493  membrane protein-like protein  25.34 
 
 		 921 aa  105  3e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0413775  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0315  membrane protein-like protein  28.87 
 
 		 1312 aa  98.2  7e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.170493  normal  0.126351 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0104  membrane protein-like  27.78 
 
 		 934 aa  71.2  0.00000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1751  putative integral membrane protein  24.16 
 
 		 954 aa  71.2  0.00000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1640  putative integral membrane protein  24.16 
 
 		 954 aa  70.5  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0723  hypothetical protein  24.38 
 
 		 573 aa  60.5  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00206833  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0606  hypothetical protein  20.86 
 
 		 573 aa  58.2  0.0000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000211502  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4612  hypothetical protein  23.67 
 
 		 573 aa  57.8  0.0000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000184306  normal  0.241609 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000728  putative integral membrane protein  23.61 
 
 		 884 aa  57  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.472428  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1194  hypothetical protein  24.06 
 
 		 856 aa  57  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000186085  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0914  hypothetical protein  24.45 
 
 		 850 aa  55.8  0.000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04921  hypothetical protein  26.87 
 
 		 906 aa  54.7  0.000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2913  membrane protein-like  24 
 
 		 847 aa  53.9  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.992887  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0678  hypothetical protein  25.76 
 
 		 915 aa  53.9  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2332  hypothetical protein  26.06 
 
 		 915 aa  53.5  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.741682 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1232  hypothetical protein  26.11 
 
 		 899 aa  53.1  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0602  hypothetical protein  20.14 
 
 		 573 aa  53.1  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.139247  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0691  hypothetical protein  18.52 
 
 		 573 aa  52.8  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00673286  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0746  hypothetical protein  18.86 
 
 		 573 aa  52.8  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000103771 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0657  hypothetical protein  18.52 
 
 		 573 aa  52.8  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0416794  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0601  hypothetical protein  19.05 
 
 		 573 aa  52.4  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000191529  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2614  membrane protein-like  22.69 
 
 		 939 aa  52.4  0.00004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.284738  normal  0.14506 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0819  hypothetical protein  19.19 
 
 		 573 aa  51.6  0.00007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000546296  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0760  hypothetical protein  18.86 
 
 		 573 aa  50.8  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00101969  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2369  hypothetical protein  29.83 
 
 		 894 aa  50.1  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.518364  normal  0.262094 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0933  hypothetical protein  23.77 
 
 		 1063 aa  48.9  0.0004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3866  hypothetical protein  23.1 
 
 		 1013 aa  48.5  0.0005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0438741 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1250  hypothetical protein  27.91 
 
 		 893 aa  47  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.373819  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3151  hypothetical protein  20.56 
 
 		 1064 aa  45.1  0.007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>