More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_4739 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_4739  carboxyl-terminal protease  100 
 
 
395 aa  793    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3963  carboxyl-terminal protease  49.23 
 
 
383 aa  335  1e-90  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000206146  hitchhiker  0.00000000432275 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3070  carboxyl-terminal protease  46.56 
 
 
383 aa  323  2e-87  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000390096  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0287  carboxyl-terminal protease  42.86 
 
 
377 aa  294  2e-78  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0247  C-terminal processing peptidase-3  43.52 
 
 
387 aa  285  1.0000000000000001e-75  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0474  carboxyl-terminal protease  48.73 
 
 
392 aa  284  2.0000000000000002e-75  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0248  C-terminal processing peptidase  41.64 
 
 
389 aa  277  2e-73  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000014936  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16350  carboxyl-terminal protease  42.26 
 
 
379 aa  267  2e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000563274  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1049  carboxyl-terminal protease  40.51 
 
 
398 aa  250  4e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000950158  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1857  carboxyl-terminal protease  36.67 
 
 
429 aa  245  9.999999999999999e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000520735  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2353  carboxyl-terminal protease  42.47 
 
 
446 aa  238  1e-61  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0201351  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1798  carboxyl-terminal protease  37.63 
 
 
397 aa  235  1.0000000000000001e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2568  C-terminal processing peptidase-3  41.55 
 
 
426 aa  232  9e-60  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.257628  hitchhiker  0.00928405 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2193  carboxyl-terminal protease  39.18 
 
 
476 aa  231  2e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000308451  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0184  carboxyl-terminal protease  38.44 
 
 
442 aa  229  7e-59  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0293  carboxyl-terminal protease  39.67 
 
 
428 aa  227  2e-58  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0636563  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0266  carboxyl-terminal protease  35.15 
 
 
401 aa  226  5.0000000000000005e-58  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000503976  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0044  carboxyl-terminal protease  38.74 
 
 
440 aa  226  6e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1500  carboxyl-terminal protease  41.84 
 
 
444 aa  226  7e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000070609  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1102  carboxyl-terminal protease  40.8 
 
 
418 aa  225  8e-58  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000689115  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3288  carboxyl-terminal protease  41.27 
 
 
432 aa  226  8e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0298  carboxyl-terminal protease  39.13 
 
 
428 aa  225  1e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.201307  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1949  carboxyl-terminal protease  40.96 
 
 
477 aa  224  3e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0712  C-terminal processing peptidase-2  36.87 
 
 
425 aa  223  4e-57  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0280534  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0969  carboxy-terminal processing protease  40.65 
 
 
450 aa  223  4.9999999999999996e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0492  C-terminal processing peptidase  40.12 
 
 
462 aa  223  4.9999999999999996e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0383  carboxyl-terminal protease  40 
 
 
476 aa  219  8.999999999999998e-56  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000063116  normal  0.361886 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0432  C-terminal processing peptidase-2  38.67 
 
 
428 aa  218  1e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0116039  normal  0.127001 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1299  carboxyl-terminal protease  39.35 
 
 
449 aa  219  1e-55  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1654  carboxyl-terminal protease  39.15 
 
 
477 aa  218  2e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.9351 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07911  carboxyl-terminal processing protease  41.83 
 
 
450 aa  217  2.9999999999999998e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.424526  normal  0.0109245 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0799  carboxyl-terminal protease  39.21 
 
 
410 aa  217  2.9999999999999998e-55  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0820  carboxyl-terminal protease  36.98 
 
 
426 aa  216  4e-55  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.00000170776  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1673  periplasmic protease  36.84 
 
 
441 aa  216  4e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.248616  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14351  carboxyl-terminal processing protease  41.5 
 
 
453 aa  216  4e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4255  carboxyl-terminal protease  39.88 
 
 
430 aa  216  5.9999999999999996e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0030  peptidase S41A  39.61 
 
 
439 aa  216  5.9999999999999996e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4316  carboxyl-terminal protease  39.88 
 
 
430 aa  216  7e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000068708  hitchhiker  0.00121166 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0682  carboxyl-terminal protease  40.56 
 
 
482 aa  214  9.999999999999999e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00713841 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5025  carboxyl-terminal protease  39.17 
 
 
429 aa  215  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.849578 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0524  carboxy-terminal peptidase  40.56 
 
 
482 aa  214  9.999999999999999e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.707834  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0250  carboxyl-terminal protease  39.37 
 
 
535 aa  215  9.999999999999999e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1268  carboxyl-terminal protease  33.41 
 
 
423 aa  215  9.999999999999999e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0923  carboxyl-terminal protease  35.14 
 
 
428 aa  215  9.999999999999999e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.315177  normal  0.478971 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2904  carboxyl-terminal protease  36.75 
 
 
415 aa  214  1.9999999999999998e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0010841  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4518  C-terminal processing peptidase-2  39.12 
 
 
430 aa  214  1.9999999999999998e-54  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2869  carboxyl-terminal protease  39.39 
 
 
515 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.274998 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0264  carboxyl-terminal protease  36.2 
 
 
530 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0692  carboxyl-terminal protease  37.43 
 
 
418 aa  214  2.9999999999999995e-54  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0346506  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2244  carboxyl-terminal protease  39.39 
 
 
515 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.939746  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2858  carboxyl-terminal protease  39.39 
 
 
515 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0738688  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3606  carboxyl-terminal protease  36.62 
 
 
418 aa  213  3.9999999999999995e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000172646  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4182  peptidase S41A  39.49 
 
 
526 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0533  carboxyl-terminal protease  39.49 
 
 
522 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.639363  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04640  carboxyl-terminal protease S41A  39.76 
 
 
439 aa  213  5.999999999999999e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.900151  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2453  carboxyl-terminal protease  35.73 
 
 
455 aa  213  5.999999999999999e-54  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000493491  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6187  peptidase S41A  38.01 
 
 
515 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0415  carboxy-terminal protease  39.61 
 
 
521 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07321  carboxyl-terminal processing protease  41.2 
 
 
444 aa  213  7e-54  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.587372  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1437  carboxyl-terminal protease  37.64 
 
 
429 aa  212  7.999999999999999e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00028594  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3168  carboxyl-terminal protease  37.65 
 
 
468 aa  212  7.999999999999999e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0352  putative carboxy-terminal processing protease transmembrane protein  38.86 
 
 
549 aa  212  1e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.77017  normal  0.100187 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3158  carboxyl-terminal protease  38.08 
 
 
433 aa  212  1e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0549247 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2931  carboxyl-terminal protease  40.48 
 
 
445 aa  212  1e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.870363  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2392  peptidase S41A, protease  38.22 
 
 
468 aa  212  1e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.605927 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0445  carboxyl-terminal protease  39.66 
 
 
515 aa  212  1e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.271211  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5329  carboxyl-terminal protease family protein  40.95 
 
 
445 aa  211  2e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4887  peptidase S41A, C-terminal protease  40.48 
 
 
445 aa  211  2e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2775  carboxyl-terminal protease  39.39 
 
 
511 aa  211  2e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07301  carboxyl-terminal processing protease  40.86 
 
 
444 aa  211  2e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4248  carboxyl-terminal protease  39.58 
 
 
438 aa  211  2e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00499045 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3209  carboxy-terminal protease  39.11 
 
 
524 aa  210  3e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0661  C-terminal processing protease-3  39.11 
 
 
530 aa  210  3e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.860766  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2414  carboxyl-terminal protease  37.96 
 
 
494 aa  210  3e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0107427  normal  0.156061 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0496  carboxyl-terminal protease  39.11 
 
 
530 aa  210  3e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1410  carboxy-terminal protease  39.11 
 
 
524 aa  210  3e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2837  carboxy-terminal protease  39.11 
 
 
524 aa  210  3e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2913  carboxyl-terminal protease  39.11 
 
 
513 aa  210  3e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0477  carboxyl-terminal protease  39.11 
 
 
524 aa  210  3e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.811957  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0182  carboxy-terminal protease  39.11 
 
 
524 aa  210  3e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2868  carboxyl-terminal protease  36.07 
 
 
423 aa  210  4e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.11568  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5869  putative carboxyl-terminal protease  41.74 
 
 
436 aa  210  4e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.673071  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0227  carboxyl-terminal protease  38 
 
 
550 aa  210  4e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000791174 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67810  putative carboxyl-terminal protease  41.74 
 
 
436 aa  210  4e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.859493  normal  0.405059 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07501  carboxyl-terminal processing protease  40.07 
 
 
433 aa  209  7e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0490  carboxyl-terminal protease  36.81 
 
 
400 aa  209  7e-53  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1781  carboxyl-terminal protease  37.76 
 
 
439 aa  209  8e-53  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0677  carboxyl-terminal protease  40.86 
 
 
444 aa  209  9e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.994343  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1232  C-terminal processing peptidase S41A  40.8 
 
 
440 aa  208  1e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00731341  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3509  carboxyl-terminal protease  37.57 
 
 
461 aa  208  1e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0208  carboxyl-terminal protease  37.64 
 
 
538 aa  208  1e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.582164  normal  0.210036 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5058  carboxyl-terminal protease  40.06 
 
 
438 aa  207  2e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0303  peptidase S41A, C-terminal protease  38.97 
 
 
532 aa  207  2e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.955856  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4931  carboxyl-terminal protease  40.06 
 
 
438 aa  207  2e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0299  C-terminal processing peptidase-2  34.99 
 
 
431 aa  207  3e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3859  C-terminal processing peptidase-3  37.86 
 
 
479 aa  207  3e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.850584 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2533  carboxyl-terminal protease  37.01 
 
 
441 aa  206  4e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0896  carboxyl-terminal protease  37.8 
 
 
443 aa  206  4e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.0000020194  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2713  peptidase S41A, C-terminal protease  40.23 
 
 
457 aa  206  4e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3063  carboxyl-terminal protease  39.16 
 
 
438 aa  206  4e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0122157 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>